EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-04278 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr20:45963200-45965750 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr20:45963989-45964001AAACAAACAAAC-6.32
Gfi1bMA0483.1chr20:45965040-45965051AAATCTCAGCA+6.32
PAX6MA0069.1chr20:45965458-45965472TTCACGCATGATCT+6.33
ZfxMA0146.2chr20:45963597-45963611CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00095chr20:45962072-45963498Adipose_Nuclei
SE_00095chr20:45963657-45965784Adipose_Nuclei
SE_00869chr20:45962970-45964304Adrenal_Gland
SE_00869chr20:45964807-45966297Adrenal_Gland
SE_01611chr20:45964857-45965929Aorta
SE_02247chr20:45962448-45966052Astrocytes
SE_03145chr20:45963826-45965882Brain_Angular_Gyrus
SE_03876chr20:45961146-45966084Brain_Anterior_Caudate
SE_04804chr20:45954990-45966079Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05803chr20:45956897-45968313Brain_Hippocampus_Middle
SE_06701chr20:45961330-45966060Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07732chr20:45954917-45966079Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08787chr20:45964265-45965833Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09835chr20:45962350-45963608CD14
SE_11646chr20:45961399-45963728CD20
SE_13328chr20:45959060-45965708CD34_Primary_RO01536
SE_23112chr20:45962445-45963461Colon_Crypt_1
SE_23112chr20:45965361-45965752Colon_Crypt_1
SE_25778chr20:45956523-45966326Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26545chr20:45961657-45965920Esophagus
SE_27632chr20:45962412-45966030Fetal_Intestine
SE_28550chr20:45958957-45965993Fetal_Intestine_Large
SE_29696chr20:45962519-45963459Fetal_Muscle
SE_29696chr20:45964039-45965964Fetal_Muscle
SE_31391chr20:45961791-45964313Gastric
SE_31391chr20:45964825-45965912Gastric
SE_34754chr20:45961528-45964659HeLa
SE_35374chr20:45961431-45965337HepG2
SE_35897chr20:45961441-45966053HMEC
SE_36972chr20:45959392-45966625HSMMtube
SE_37954chr20:45959303-45966054HUVEC
SE_38929chr20:45963566-45965784IMR90
SE_39842chr20:45965087-45965753K562
SE_40611chr20:45962430-45966075Left_Ventricle
SE_41650chr20:45965366-45965746LNCaP
SE_42101chr20:45961467-45966004Lung
SE_44197chr20:45962443-45965951NHDF-Ad
SE_44778chr20:45962494-45966077NHLF
SE_45711chr20:45962384-45966138Osteoblasts
SE_46779chr20:45965072-45965383Ovary
SE_47133chr20:45943044-45970225Panc1
SE_48090chr20:45957178-45966081Psoas_Muscle
SE_48577chr20:45962680-45963496Right_Atrium
SE_48577chr20:45963530-45965934Right_Atrium
SE_50080chr20:45963687-45965916Sigmoid_Colon
SE_51255chr20:45962511-45963624Skeletal_Muscle
SE_51255chr20:45963630-45966076Skeletal_Muscle
SE_51968chr20:45962455-45965832Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52348chr20:45958334-45965923Small_Intestine
SE_53302chr20:45962290-45965529Spleen
SE_54500chr20:45954940-45966079Stomach_Smooth_Muscle
SE_55653chr20:45958443-45966511u87
SE_58471chr20:45963902-45990518Ly1
SE_60596chr20:45964041-45990207DHL6
SE_62444chr20:45963837-45990735Tonsil
SE_63759chr20:45962431-45965968HSMM
SE_65346chr20:45965065-45966408Pancreatic_islets
SE_67460chr20:45958443-45966511u87
SE_68673chr20:45964909-45965950H9
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I047313chr204594242945970421
Enhancer Sequence
AGGCACAGAA AGTAGACTGG TACTTGCCAG GCACAGGGGT AACGGGGGAA TGGGAAGTGA 60
CTGCTAATGA GTATGAAGTT TCTTATTGGG GGTGATGAAA ATCTACAACT GATTGTGCTG 120
TTGGCTGCAC AACTCTGTGA AAAAAAAAAA TATATATATA TATATATATA TTTTAGGCAG 180
TCTTGCTCTG TCACCCGGGC TGGAGTACAG TGGCACGATC TTGGCTCACT GCAACCTCCA 240
CGTCCCACGT TCAAGCAATT CTCCCGCCTC AGCCTGCTGA GTAGCTGGGA TTACAGGCAC 300
ACGCCACCAC ACTCAGCTAA TTTTTTGTAT TTTTAGTGGA GACAGGGTTT CACCATGTTG 360
GCCAGGCTGG TCGGAACTCC TGACCTCAGG TGATCCACCC GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC 420
TGGGATTACA GGCGTCAGCC ACCACACCCG GTCTCCGTGA AAATATATTA AAAACCATCA 480
AACTATTCAC TTTAAATGGA GAACTGGGCC CAGGAGTGGT GGCTCACACC AGCAATCCCA 540
GCACTTTGGG AGGCCAAGAC AGGAGGATCG CTTGAGCCCA GGAGTTCAAG ACCAGCCTGG 600
GCAACATAGT GAAACCTCAT CTCTACAAAA AAATATAAAC ATTAGCCAGG GGTGGTAGTG 660
CACACCTGTA GTCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGCAGTGGGA GGACTGCTTG AGCCAGGAAA 720
TCAAAGCTGC AGTGAGCCGA GATCGTCCCA CTGCACTCCA GCTTGGGCGA CAGAGAGAGA 780
CCCTGTCTCA AACAAACAAA CAAAAAAAAA GGAGAATTGT ATGGTATGTG AATTATATGT 840
CAATAAAGGT ATTTTTTTTT TAAGTCTATA AAGCGCTGGA TCTCTAGGTT CCCAGGAAAG 900
CCCAGGATAG GTGAGGGGAG TCACAGGAAG TTGAAGGGGG CTTATTATCA TTCCACTCAC 960
CCTCACCCCC CCACAGCCAT GACACCTGGT CTTTCCAAAC TGATCACCTC AAGTCATCGG 1020
TAAAGGATCC ACTATCAATA GAGAACAATG AAGGAATGAC GACTTTAATA AGGCAATAAA 1080
AAGTACCCAG ATCTCTAAAA GGCCTCAGCC CTGATATGCT TATTCTACAG GCATTTAGAG 1140
AGGAAAAAGA AGAGATGGTT CTTTTTAAAC TAAGCTTGAA ACGGTCGATT TTAGATCACA 1200
GTCTTCTAGA ATAATAATAG TCACACAAAC ATATAACGTG GGTCATGCTT CAAAAATGGG 1260
GCAAACACAA GGTTTGCATG AGTGAACCAC AAAGCTAAAT TGCACAGACA CTGCCGACAG 1320
GATTCCATGA ACAGATGCAC AGTAGAGACG ATGCTGGCCA AGAGAAGGTA GAAGATTTCT 1380
CATTTGCAAA ACCATAATCA GACATCTTCA GAGTTCTGGG ATATTTTAGA CCTTGTTAGG 1440
AGAGGAACAA TCTGGTAGTC ATCTAACTCA CAAATAAATT CTTTCCACTG CACAGTACAC 1500
GGATGGCACT TCTTGGGCTG TCAGAGATAG AGAGGAGCCA AAATACGGTT AAAAATACTG 1560
ATGCTCATTT TTTGAAAGAA AAATTCTCAG CACTTCTGCA TCGCGCTGTG ATTTAAAAGT 1620
GTTTGTGGTT ATATTTTCTG AAAGAGTTTC CTTGAAAAAT GACAGAAGGT CTCTATCTCA 1680
CAGCCGTCCT CATAAACAAT CCCTTTGTGA AAGTCTTAAT TTACATACAA CAGTGAGAAC 1740
AAGGATCCTG TGCTAATTAA GGTCTGGGGC TGGTTAGCAA ATTGCTATAA TTGTACATTC 1800
TCTAGCATCC TGTCTCTGAA AACACATCCA TACCCCCAGC AAATCTCAGC AAGAATGATA 1860
CTGTTCAAGA TTTTAATATC CTGGGCTTCC GCTGCATCTG TGCGTGTTTC CAAGTCGTTC 1920
ATTCCCTTGT GCCGGTGACA TTACACAGAC ATTTTTAAAA ATGGTTTCAG CTTTGGCAGG 1980
CTGGCATCCA CACACCACAA GCACTACCAC AAAACGCACA CATGGCAGGA TCAAGACGCA 2040
AGCAGCCCAA ACAGGGGAGC CTTTGTATGG AGACGTGAAT TCAACCCGCG GAGTACATCA 2100
TTTCTCAGGC TGCAAATCCC TGGCCTTCAA GGCGCTTGTT CTGACTCACG CATGGTGAGG 2160
CCAAATTCTG CAATGAATTG TGCCTTGGCC AGTCTCGCAC AGGGAATGCA AAATGACAGC 2220
CCTCGGCTTC TTCTGACCCG GAAATGCGTT TTGTTGGGTT CACGCATGAT CTTTAGAGAA 2280
GCCAGTCTAC ACAGACCACA TTTCTAAATG AGGCAGTTTT ACAGGGGAAA AGAAAATCCC 2340
AGCTGGCCAC AGCGGATGAG CCATATTCCT GCTGGTCAGC AATCAGATGG AGGCACCCTC 2400
CCCACTTTGG CACACTCTCC CATTCACCAA AGCTCCCCTT CCCCCTGCAT CCCCAGATGC 2460
CAGCCACAAT CACTGATCTA CCTGCTGGGC CCTTCAGGCA TTTGACTTGC AACCCTTGGA 2520
ATACAGGTCA TGGTTAAGTA CAAAGGTTTA 2550