EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-04219 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr20:30282160-30283940 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77962418chr2030283169hg19
Number of super-enhancer constituents: 65             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30281696-30285303Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30281733-30283797Aorta
SE_03156chr20:30281999-30283103Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30281567-30283497Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30281270-30284805Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30281178-30285014Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30281314-30284637Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30281635-30284666Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30282752-30282975Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30282048-30283284CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30281409-30284791CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30281400-30284483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30282128-30282868CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30281650-30283580CD56
SE_20764chr20:30281711-30283729CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30281489-30283485CD8_primiary
SE_23622chr20:30281755-30283243Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30281085-30284597DND41
SE_25933chr20:30282095-30284805Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30280920-30284601Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30281639-30284593Gastric
SE_33407chr20:30278956-30284610H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30283535-30284639HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30282089-30285312HUVEC
SE_39443chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_39443chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_39853chr20:30282007-30284720K562
SE_40644chr20:30281708-30285386Left_Ventricle
SE_42121chr20:30281738-30285363Lung
SE_43515chr20:30277822-30284499MM1S
SE_44365chr20:30281743-30284710NHDF-Ad
SE_44995chr20:30282790-30284602NHLF
SE_45708chr20:30282527-30285331Osteoblasts
SE_47264chr20:30281358-30285573Panc1
SE_48182chr20:30282429-30283232Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30282722-30283493Right_Atrium
SE_50155chr20:30281748-30284675Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30282135-30284696Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30282308-30284717Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30281728-30285346Small_Intestine
SE_53471chr20:30281646-30284749Spleen
SE_55108chr20:30281743-30283556Thymus
SE_55770chr20:30281854-30284727u87
SE_56767chr20:30281105-30284651VACO_400
SE_57375chr20:30281767-30282407VACO_503
SE_57375chr20:30282804-30283747VACO_503
SE_57919chr20:30281815-30282417VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30282201-30284731HSMM
SE_65412chr20:30281477-30282819Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_66334chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_66898chr20:30278956-30284610H2171
SE_67146chr20:30277822-30284499MM1S
SE_67821chr20:30281854-30284727u87
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
TGGGCTCAGA TACCAAGGGA GGGTGGTGGG ATTAGCACCT GCTGAGAATG AGATTAGGTT 60
TCTTGGGAAG GGCTCATCTA TCTAATGCTC CCCGAAAGCT GTCTCCCTGT GGCTTTTCTC 120
TGCTGGACAG ATGGTGTCTG AGCTGCCTCT TGGAGGGCGG GCTCCTTGAG GGGGTGGTGG 180
AGGTGGAGTG TGACCTGCTG CCTGCTTTCC AGAGGACCTT GAGGCCCTGG GACTTCTTGT 240
CTTCCAACAA TAGTAATAAG GATTAGAGCT AACTCTTACT GAAGGTTTAC CATATGCCAG 300
GCATTGTCCT AAGCCCTTCA TACAAATTAC CCTCATTTAG TTTTCACAGC ACCCAACTGC 360
CTATCATCTA GACAGTAGGC TTACATTGAA GGAAACTAAG GCTTGGCAAA GTCAAACACT 420
TGCTCAAAGT CAAACAGTAA GCAGGGCCTG GTGGCGTACC TATAATCCCA GGAAGATAGA 480
GGCGGGAGGA TCACTTGAGC CCAGGAGTTC GAGACAAGCA CAGGCAACAT AGTGAGACCT 540
CATCTCAAAA CAACAACAAA AACAAAACAG TAAGCAAACT AGGACTTGAA TGCAGGCAGT 600
TCAACTCCAC AGCCCTAGCA GGAAATCACT ATCAGCCAAG GCATCTTCCC CTTATTAAAT 660
GGCAGTAAGG ACTTTCCAGT TTCTTAAGCC AAAAACCTGG ACTCCTTTCT CTCTCACCTC 720
TTATCCAGCA AACATCAGCA AATCCAGTTG GTCCAACCTT CAAATTGTAT TGAAGCTCTG 780
ACCACTGCTC GCCACTTCCA CCACCCATCC ACCCTGGTAT AAACTGCTGT TATCACCCAC 840
CTGGCTTCTC ACTGGTCTCC TGCTCCCGCT CTTACCCATA GAGTTTGTTC TCCACATCAG 900
AGAGATCCTT CTAAAACCTG TCACTTCTTT GCTTAAAAAT CCTCCATGCC TTTCCACTGC 960
CCTTAAAGCA AGGTCCCATG TGGCCCTACA AGACCTGGCC CCTGGTGACG TCTCAGACCT 1020
GATTCCTACC ACTGGCTTAC TCTACTCTGG CCATACTGGC CAACTTGCTG TACTTTAAAT 1080
ATGTTGGAGA GTCTTTTTTT GTACTTGCTT TATTTTTTAA TTTTTTTGAA ACAAGGTCTT 1140
GCTCTGTCAG CCAGACTAGA GTGGAGGGAC AGGATCATAG CTCACTGCAG CCTCAAACTC 1200
CTGGATTTAA GCCATCTTCC TGCCTCAGTG TCCCGAGTAG CTAGCTAGGA CTACAGACAT 1260
GCACCACTAT GCCCAACTAA ACTCTGGCTT TGTCGCTCTG GCTGATCTCA AACTCTCAGC 1320
ATCAAGTGAT CCTCCTGCCT TGGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTATAGGCG TGAGCCACTG 1380
CATCTGGCTT TTTTTTGTTT TACGGCTTGC TGTTCTCTAT GCCTACAACA CTATTCCCCC 1440
ATATATCCGC ACAGCTCATG CCCTCACTGC ATTCAGATCC AATGTCACTT TATCAGAGAG 1500
GCCTTCCTAA CTACCCTACC CTTCCTTTTC CCATCCCTAA TCCCTTTTCT CTGCTTTATT 1560
TTTCCCTATA TCACTAAATA CTACCTCACA TGTTATTTAT TTTTTAGAGG TGGGTTGTCA 1620
CTATGTTGCC CAGGTTGGTC TCGAACTCCT GGGCTCAAGC AATACTCCCA CTTCAGCTTC 1680
CCAAAGTGCT AGAATTAAAG GCGAGAGCCA CCATGCCTAG CCCTGACATG TTAATTTACT 1740
TAAAATCTGT CACCCACCTT GGAATGTCCA CTGGGTGAGA 1780