EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-01872 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr12:122580940-122583480 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr12:122582757-122582768GCAGGGTGTGG-6.62
LMX1BMA0703.2chr12:122582182-122582193TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr12:122582175-122582188TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:122582176-122582189AATTAATTAATTA-6.78
Nr5a2MA0505.1chr12:122582471-122582486CCTGGCCTTGGCCTT-6.14
Nr5a2MA0505.1chr12:122582477-122582492CTTGGCCTTGACCTT-6.31
POU6F1MA0628.1chr12:122582177-122582187ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:122582177-122582187ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr12:122583383-122583404GGGGGTGGGCTGGGAGGAGGA+6.01
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23525chr12:122580589-122584918Colon_Crypt_1
SE_24216chr12:122580637-122584825Colon_Crypt_2
SE_32300chr12:122580554-122584921Gastric
SE_41952chr12:122580843-122584857LNCaP
SE_48379chr12:122580532-122585538Psoas_Muscle
SE_50423chr12:122580542-122584898Sigmoid_Colon
SE_52993chr12:122580633-122584989Small_Intestine
Enhancer Sequence
TTTCATAGCC CTGGTTGGCT ACTTTCTCTG AAAATGTCTG CTTCCTCCTC CTTCCTGATA 60
GGAGCCTTTA CCCTGGGAAG CTTTCAAGTC TCTAAAAATG GCAGCAATTC TTATCACCAC 120
TTTAGGCACC CCTCCTTGTC CCACTGTCCC ACCCTCCCAG GACAGGTGTG TCTAGGGGAA 180
TGGTGGTCAG CAGGCGCGGA GCTGAACGGT GGCCTGTTTA TTCTGAGTCC GGGAGTGGAA 240
GCTCCTGCGC TTTCACATTT GTCCAGCAGC CTGCTGTGGG GCAGGGGTAG AACGCACAGT 300
CAGCAGCATG CCCGCAGGAC TGATGCCGCA GCTTGCATGC CTTGTGGTGC TCTGCTGACA 360
GACCCCCGAG GCTGTGACCG CGGTGTCCCC GAGGTGACTC CTGCCCTTGG CTGTTTGTTG 420
TGCCTGAGGT AGGGAGAGCA AGGCTCTGTG AAAGTTGTGA TTCCAGGTGT GAGTCCCCCC 480
AGCTGGCGTG AGCTCTCACG TGGAACTGGA ATGCTGCGGG TACATGTCCC TGCAAGTTAC 540
AAAACTGGGG AATGACTTGG TACATGGAAG GAAGAGCTGA CTCAACGCTC TGAAAAATGA 600
TTTAAGTATT TTTTGTCAGA TTGAGTCCGG AGATGCCGCT GTCTGGCTTG GCAGCCTTGC 660
TTCTCAGCTG CTCGCTTGTG GTGCTTCCGT GGGCCTGTCT GTCCTAACAC TTGCATTGTC 720
AGAAGAGTGC TCGGCAGAGG AGCTTTTGGC CGAAGGCATG AGGACTTTGG TTATGGGTGT 780
TTTTTTTGGG CGGACAGGGT CTCGCTCTGT CACCCAGGCT GGAGTGCAAT GGTGTGATCA 840
CAGCTCACTG CAGCGTTGAA CCCCTGTGCT TAAGCAGTCC TGTCACCCTG GCCTCACTAC 900
AGGTGTGAGC CACTGCACCC AGCCTTAATT TTAAAACATA ACCAGGGCCA GGTTTGGTGG 960
CTCACGCCTG TAATCACAGC ACTTTGGGAG GCTGACGTGG GAGGATCACT TGAACCCAGG 1020
AGTTCCATAT CATCCTGGGC AACATAACGA GACCCTATTT TTACAAAAAC TAAAAAATTA 1080
GCCAGGTGTG GTGGCTCACA CCTGTAGTCC CAGCTGCTCA GGAGGCTGAG GCGGGAGGAT 1140
CTCTTGAGAC CAGAAGTTGG AGGCTGCTGA ACTATGATCA CTGCACTCCC GCCTGGGTGA 1200
CAGAGTGAGA CCCTGCCTCT AAAAAAAAAA AAAAGTAATT AATTAATTAA AATTGCTCAG 1260
GCCCAGCTGT GTGAAGGCCG GTGTCCCCAC ACTGCCCACC ATCCCCCTGC TGTGTTCTTG 1320
CTGAGAGTTC CTTACTGAGG GCTCCATTTC CTGGCCCGGT GGAATGCCTG CTCCCAGCTC 1380
CCTACTCTCC CAGGCTGCTC CCTTATCTAT TGGGCCAGTC TCTGTTTCCC TTTAGTTTTG 1440
GAATCCATGG GTTCCCCCTC CCCACAAGAA ACCTTGGCAG AAGGCTTTGT CCATAGGGAA 1500
GCAAAGAACC CAGTTAGCAG CTCAGCTCTG GCCTGGCCTT GGCCTTGACC TTTCACAGTA 1560
CTGTGAGCCA GCAGGTAGGT AAGCTCACTG GTGCTATGCA CGGCCTCCTT CAGATCCTTC 1620
TCAGGGCAGC CTACCAGAGA CTGTATTTGC AGAGGAGCTG GCAGGGCCTG TGTGGAGCCA 1680
GCTGCGCTGC GCCTGATAAG TTTGTTTGCT TATCTTTGTT TGTGTGCTTG TTGCTGGCTC 1740
CTTGGAGCTA TGGGTGTGTT TGTGGGGTGT TGGAGATGAC TGACCCTGAT TGGTAAAATA 1800
GGGATGAAGC GAGCAGGGCA GGGTGTGGTG TGAGAAATAA TGTCATCTAT TCTTCCGGTG 1860
CCCCCCACTT CTTCCCCACA GAGAGATTTT CCTTCTGTTC CCTGTCCTAG AGGGCCCTGG 1920
GGCAGCAGCT TTTAGGTTCT TGGAAAGATG GGGAGCAGCC ACCCCCGCTG AGCAACTCAG 1980
ATTGAGGTTG GGGTGTGCTG CCCTCCCAGA CGACTGGAAG ATTGACACAG CAGCGCTCTT 2040
TCAGTTCTTT GTTCTTTGTT GGCTGGGATC ACTGGAAATA TATCAGTGAG ACTTAAATGT 2100
GTCCTGGGAG CTTGAGCTGC CCAGTAGGCG ACCCATGGCT GCAGAACAGC CAGCTCCAGC 2160
AATGTGTCAT CCTGGAAGGG CAGCTGGCCT GCCTTCTGTC AGGTCACATG GGTTGGCTGA 2220
TGTTGGTTTC TGTGTAATTT TTTTCCTCCT TTTTAACATG GTGCCTCAAA GTCACGGGGA 2280
CTTGAGGGTA GAAATTAGGA GGGAAGGGCA GGTTTTTCAG CTGGCTCTTG GGCTGTGCTT 2340
GACAAAGCCA TCATTGTTTT GAATAAAGTG CCAGTTGGTG TGGTTTGCGT CGCTCCGGTG 2400
CTCTGAAATT GGCTTCTCTT CTTCCACCTC TGCTGCTGAT CCTGGGGGTG GGCTGGGAGG 2460
AGGACCACTG GTTCCAGAGA AGAAACCACT TCCCTTTGCC TCCCTGCTCA GCAGGAGCAG 2520
CGGGAACAGC GTCTTAGGAC 2540