EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-01783 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr12:94179100-94181740 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10859580chr1294180616hg19
rs4144502chr1294181328hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr12:94179618-94179628GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr12:94179618-94179628GTCACGTGAC-6.02
CDX2MA0465.1chr12:94180508-94180519AAGCAATAAAA+6.32
MITFMA0620.2chr12:94179614-94179632ACAAGTCACGTGACCCTT+7.13
MITFMA0620.2chr12:94179614-94179632ACAAGTCACGTGACCCTT-7.13
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:94181552-94181567TGGCCTATTGACCTC-6.67
RARAMA0729.1chr12:94179621-94179639ACGTGACCCTTTGGCCTT-6
SOX10MA0442.2chr12:94181301-94181312GTCTTTGTTTT-6.14
USF1MA0093.2chr12:94179618-94179629GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr12:94179616-94179632AAGTCACGTGACCCTT-6.11
USF2MA0526.2chr12:94179614-94179630ACAAGTCACGTGACCC+6.13
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_25671chr12:94176332-94184180DND41
SE_26363chr12:94177242-94181249Duodenum_Smooth_Muscle
SE_37545chr12:94177297-94181267HSMMtube
SE_38748chr12:94176913-94181179HUVEC
SE_45022chr12:94177271-94181124NHLF
SE_45022chr12:94181150-94181984NHLF
SE_45716chr12:94176237-94185389Osteoblasts
SE_52028chr12:94177414-94181867Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_63834chr12:94177345-94181881HSMM
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I093782chr129417628394181893
Enhancer Sequence
TCCTCTGACG AACATCCGAA ATGAAAATAA AAATTGTGTC TACTCCAAAG GGTAGTGGCT 60
TGAGTCACCC ACTGGTATGT GTGACCTATG AGTCACTCAC TGGTATGCGT CTTCCCGATC 120
CCCTGGCCTA TGGGTTAGAA GTCAAAGATG CTCCACTGGG GCTTCCTTTG TAGCTTCTTT 180
TCCCCTTCAG TATTCAACCA CAGCTACTGC TGGCAGCTCC TGGCAGAACA GGAATGGGAG 240
ACCAAGGAGA GGATATGTGG AAGCTGAGTG ATTTATTTAT AGGGGACTTT TGGCAAATGA 300
AAGAAAATAG ATGTGAAGTC TTAGCAGTTC CAGCATGTTC ATCAGAAATG CAAGCTCATG 360
ATAGTCATTT CAAAGGGAAT TGTGGAAGAA TGGTGTTACC CTACTTCACA GGCCATTAAA 420
TCATATATAT GTTTGGTTGC CAGTGAGAAT CTGAGTAGCA GAGCAGACAA GAATAAGGAC 480
GTATGGGATC GAGGCCTGTA GCTTGTGACC ATGAACAAGT CACGTGACCC TTTGGCCTTA 540
AATTCACCAT AAAGTCGTGT ACTTGATCTC AGTGATTGTA TCTTACTTCA TCAAAATGGT 600
ATGATTCTAA ATTCCTGTGG GATATACAGG TAAGACAGGA CTGGTGGAGC ATTAGGTTTG 660
GTTTTTCCTT TAAAAGAAAG TGTTGGGGAG GCAGCAGGGA ATAGCAAAGG TCACAGACTC 720
AAAAGCATTA ACTGCCGGGC CTATGAAGAC ACGAATGATG TAGGTTTGAT ATAATGGAGG 780
TACAAATCCA TGTTTTATGC AAAACCTCAT ATTTCTAAAC TTTGGCAATT CATTCATGTT 840
TATCAAATCA CTGTTTTAGG CCCCCTTTGG CTGGCCAGTG GGCCCTCTGC TTTAGACTTC 900
TGGAATAAAC TCCACAGTTG AGAGATGAAG GACAGACCTG GATTCTAACA GACCTAAATT 960
TGAACCTTAG CTCTGCCCTC TAAGGAATGT GTAAACGTAT ACATCTGTAT TTAACTTCTC 1020
AAAGCTTCAA GTTTCTTTAT CTGTAGAAAT GAGAATGATA ATACCTCTTT TGTAGGATTT 1080
CCTGAAGACT GCGGGTACTA TGTATTAAGT ATACATAGTA GGCACATCCT CAAAGGGAAT 1140
TCCATTACCT TTTCTATGGA GGTAGATCCT GTATAATTTT TAAATTTTTG TCTTGATGGC 1200
CAGTTGCTCA CAGTTTTTAA AAGTGTAGTA GATGCCAGCG CTTCTTTATA GATTCTGAAA 1260
TCCCTTCAAT TTACATTTTA GTTGTTTTAA AATAAAGATT TCTTTAAGAG ACAACATTCA 1320
GAGGGATAAG TTTTCTACTT GCCAGTAGAG GTAGAAGGCA GTAAAACCAA ATAGATCTGT 1380
CAGTTACTGT CTTGAGGTAG AGCCCCTAAA GCAATAAAAC CCACCTTTGA CAATGAGGAA 1440
ACACGAGACA TCATTTTCTC CTTAGGACAA AAGTCTAGTG AGTAATGGCC CTTCTGTGAC 1500
TAATGGTAAT TCTGTACTTT ATTCCCATAG AAAATCTAAT TTTGAAAACA TTTGCTGCAT 1560
GCCCTACTAT GTACTAGGCA CTATGCCAGG GGAATAATGT AAAGATGACC AAAACATAAT 1620
GGAATTGTTG CCTACAAGTA TGTTTCGGCT ATTTAAGGAT TTATATTGCA GTTTGTGCAA 1680
ATTGTGTATG AGTCCACTTT GAGAGGTTAT ACATATCTTC CAATAATGTT GCTATTGCTC 1740
AAAATATCTT TGAAGTCTCT CTTTGGAATT TACTTTTAGA GCCCTTAGCA CATTCTGCTG 1800
AAGATTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTAC CCTAGTGGTA TTTATTCTTA GAAGGTGGAT 1860
TTGATGTCAG GGACTGGCCA AGAGTTGTTC ATCACTAAGT CAGCCTCATG GGTGGTGGTT 1920
AAACTGGCTA GAGTAATTTT TCGTTAAAAA CGAGCCAGGA CTGTAAAGTA GTATGACAGG 1980
GTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTAATA TCACATCAAC TGATTGTAGA GAAAAAGATA 2040
GTTCCAAAAA GGCATTCTGC ACATTTTTTG CCCCAAACCA GTATCACTGG AATATATTTG 2100
TAGCTCCCTA ACAGGCTAAC TTTGAAATAA GTGGTGCTCA CATGTGCATG TGTTGTAGTA 2160
CGTCTGCTGA ACCTTGTACT TAACCTCTTA GCAAACTCAG TGTCTTTGTT TTTTCCTTTG 2220
AAATGTTGTT TTTTCAAGTT CAGGGATAGA TTTTCTCCAA GAAAATGAAA CAAATAAGAT 2280
CCACTCTCAA AGGACCTTAA TGGAAAGAAA TACATGCTTA TACCAAGTTC TTTAAAACTA 2340
TCCAAACTGG AAAGGATTGC CTCATAGCTG ACTGTGATTA TTCTGCCATG ATTTAGGGAC 2400
AGATAATTTC CTATCAGCAT GTTTAACATG AGAATTAAAG AGTTCTGTAG TGTGGCCTAT 2460
TGACCTCATT TGTTCATTCC ACAAACATCT TTTGGAGTCC ACTGTATGGC AGGCATTATC 2520
ACTTACCATG GTGAGGATGG TGAGGCCATG AGCATGCTTC ACCTAAGGAA GCCTGATCTT 2580
CAAGAATGCA AACTCACTCA ACAAGAAACT TGAGAGTAAT TAATAGTAGT GTTGGTAATT 2640