EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-00916 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr10:65026690-65028420 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10995485chr1065026858hg19
rs10761731chr1065027610hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr10:65028025-65028040AAAGAACAAAGTCCA+6.36
IRF2MA0051.1chr10:65027024-65027042GAAAAATGAAAGGCAAAC+6.02
TEAD1MA0090.2chr10:65027664-65027674CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00727chr10:65014644-65030215Adipose_Nuclei
SE_11171chr10:65014720-65030739CD20
SE_12909chr10:65024693-65030001CD34_Primary_RO01480
SE_13393chr10:65023813-65030359CD34_Primary_RO01536
SE_14262chr10:65024949-65030096CD34_Primary_RO01549
SE_14534chr10:65024250-65030163CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16047chr10:65024607-65029830CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16654chr10:65024807-65030144CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18712chr10:65023894-65030237CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_21027chr10:65024003-65030175CD8_Memory_7pool
SE_21755chr10:65024563-65030161CD8_Naive_7pool
SE_26320chr10:65024526-65029935Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29437chr10:65023977-65030121Fetal_Intestine_Large
SE_30034chr10:65024285-65030089Fetal_Muscle
SE_32895chr10:65025844-65029727H1
SE_58599chr10:65001138-65035511Ly1
SE_60138chr10:65015127-65035361Ly4
SE_61804chr10:64995154-65034173Toledo
SE_62580chr10:64984951-65034388Tonsil
SE_64796chr10:65024753-65030005NHEK
Enhancer Sequence
CAAGCCGACC AATGATTTAA ATTATTCTAA GTTAATTTGA AAAAAGGATT TCTAAGCTAA 60
AAAAATTCTC ACGTTTTAAG ATGTCTCATT GAAAGCCAAG TAAAATTTGG CTACCAGAAA 120
TCTAAGAAAA CTAGCTGACA ATGATCAAAT TTGAATACTC TTACAAGGAC ATGAGTACTT 180
ATAATCATTT ACAAGTGGAA GTCCAAAGTA TATCATGCTT CTTAAATAGC AAATAAAAAG 240
TGCTGATAAA TACTTTTATA GTATTTGTTA AAAGAAATGT TTCAATATTT ATTAAATGAG 300
AAACAGTGAA TATGTGTGAC TGCTCTACTT TAAGGAAAAA TGAAAGGCAA ACAACATATG 360
AAGTGATATT AAAATACACC CCGGTTTTTT TAACTGGCAA AACAACCATG TTAAGTATTG 420
CTAATTTTTG TATTAGTCTA GTACATTTCA AAGGAACATT ATAAGTTTAA AAATAATAAA 480
AAACATATTT AAATAAAAAC AAATGGGTCC TACAGCTGGT ATGATGAAAT TTGTAGTAAA 540
TAGTTCATGG GTCTAGGTGC ACTGGAATGT AAAGAAACTA GAACTCATGC ATAACTAATT 600
CAACACTCTA AAGATATATC ATTCTATGAG TAACTTCCAC AGCCTAAAGG GAAGCAATGA 660
GCTAACATCT GATGAAAGTC ACAGTAGAAT ATGGCCCTAA TCACAAAAGA CTATCATTCA 720
AATGCTCTAA AAAGCCTTTG AAAACCAAAA TGAAAATTAC TAACACTAAA TGTTCAGTTG 780
AAACAAAATG CTTTTTCAAT TTTATTAGAG TGAGAGTTTT TTTTAAGGTC ATTTATCAGT 840
GTTAAACATA CTTTTTAAAA ATAGTCTACG GCCAAAATAA ATATAGTTGA GAGCCTGCAT 900
TTCTAGTAGG GCCTACCAAA CTATAGGAAG AATGCTTAGA ACAACTGTAT CCTGTTTGGG 960
GCTCCATGCT GCACCACATT CCATTCACAT GAGGAAGACG CGAACAGATG AGCCCTCCCC 1020
GAAAAACATT TTTAAAATAA ATCAGCTACA GCTCTTAAAC ACAACTCAGC TGCTCAAACA 1080
AACGATGTTA AAGCTCACCA TTTCACATTT AACAGGAAAT TCAAGGAGCT TATGTCTGCA 1140
GTCTTAGTTT CTAACAATCT CCGGTTAACA GTTAACAATT CCAAGTTAAA AAAAAAAACA 1200
GGCTTATTAA CTGCAAAAAT ACTAATATAA ATCTCACCAA AGGTAAATAC TAAAGCAGAA 1260
AACAACCTAA GCAACATTTT AGAAGTTAAG ATTTAGTCTA CCAAAAAAAA AAAAAAAAAG 1320
GACTGGAGTG ACTTGAAAGA ACAAAGTCCA AATTCCCACC CAAGCAGGTC TATTGAAAAA 1380
CACGATACTG TTAGAAAACA AGTTGGGGGT GGGGAAGGGA ATAACCAAAA AAAAACCTTA 1440
CAAAACAAAT ACCCCCACTT TCCTTGAAAC ACTAGTCTGA AAATCCTAAT TTGAAGCACT 1500
TCTGCCATAA TACTTTAAAC AATTAAACTC GTTTTTTAAC ATTTACAGTT ATTAAATTAC 1560
TACAAACACA ATAAACCTTT TTAAACAAAT GAAAGTTAAA AATTCTTAAA ACTAAAAACA 1620
TTGAGGCCAG ATCTTTTATA AAAGGCAGTG ACCTTAATTT CTCAGGCTGA GAAGAAAAAC 1680
CAAATGTAAA TTAAGACAAA AGAAAAAGGA AGCAGAAAAA TACAAACCGT 1730