EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-00429 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr1:144926850-144930580 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:144930019-144930030CTAATTAATAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:144928098-144928116GGAAAGAAGGAAAGAAAA+6.33
IRF1MA0050.2chr1:144929296-144929317AAAGAAAAAGCAAAAGAAAAG-6.15
NFIL3MA0025.1chr1:144929113-144929124TTATGTAACGT+6.32
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.13
RFX2MA0600.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.1
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA-6.15
RFX5MA0510.2chr1:144929714-144929730TGTTGCTATAGAAACA+6.16
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00089chr1:144920722-144935091Adipose_Nuclei
SE_02777chr1:144927291-144928120Astrocytes
SE_02777chr1:144928561-144933593Astrocytes
SE_03153chr1:144927381-144928053Brain_Angular_Gyrus
SE_03153chr1:144929095-144933474Brain_Angular_Gyrus
SE_04539chr1:144925659-144934489Brain_Anterior_Caudate
SE_07393chr1:144926819-144933846Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07793chr1:144927003-144934899Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18717chr1:144921453-144938014CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_25738chr1:144924693-144933482DND41
SE_26266chr1:144920766-144933796Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27974chr1:144920641-144928497Fetal_Intestine
SE_27974chr1:144929716-144933812Fetal_Intestine
SE_28939chr1:144920546-144928637Fetal_Intestine_Large
SE_28939chr1:144929130-144933757Fetal_Intestine_Large
SE_38811chr1:144927061-144933285HUVEC
SE_45013chr1:144926640-144933471NHLF
SE_45547chr1:144921475-144934798Osteoblasts
SE_48047chr1:144930173-144934034Psoas_Muscle
SE_51073chr1:144925786-144934585Skeletal_Muscle
SE_55722chr1:144923321-144933760u87
SE_63039chr1:144924738-144942083Tonsil
SE_63706chr1:144927180-144928854HSMM
SE_63706chr1:144929163-144933352HSMM
SE_64855chr1:144928560-144933682NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1144927217144927550
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120551chr1144925161144933968
Enhancer Sequence
CATTGCCTAC CATAATGCCG GGAATACTGC AGAGATCAAA AGTTTTTGTT TAATGAACAA 60
ATAAGAACAA TAAAAACAAA CAAAAACGAG CCTTTAGTGG CTCTCTTAGA AATAAGACTG 120
TATATAACAT ATATTCGAAC AGCAACTTTA AAGCCAAAGA ATGCCACAGG AAAATACATA 180
ATGTATTTGA ATCTCATATG AATCAATCTT GACATGAATA ATAATAAGAA ACCTCTTTTT 240
CTATAAATAA TGTACTGACC TAAAAGTTGG AAGATATTTG TTTCTTCTTT ATTTGTAATA 300
ATTTACTATT TTGCATCTCA GAAAAATGTC CTTGCAGGTA ACAGTCTGCT GAAAGAGCAC 360
TTAGCAAGTC CCACTAAGCC AACAACATAA TGAATTCTTG TGAAGTATCA AGTACATAAA 420
ACAGTCACTC CTACAATGAT AGTGTAGCCC ATGAAATAAG TAATACCTGA TTTGGTAGAA 480
TCAGTGTTAC TCTCTAGACA CTCAGGTACT AAAATCATGT GGAAATGATA ATATAATTTT 540
AAATTAAGTC ACTTTTGACT CAGAATTAGG ACAAAGGCTT TCCAGTATCA GAAAAGAGAA 600
CCGCTTCCAG GCCTAGTGTT GCACAATATG AGACTTTTTT TTAGGCTAAG GCCAGTTTTT 660
AGACTTTTTG TGTTAACAGC AGTTTTCTTG GCACTTTCTA GTCCTCACAG TAGTGAGTTA 720
TAGATCTCAA ACTGCTATAA TTGTCAACCC TATTGTTAAT AATAGGAGAC AGACAAGAAC 780
CATTGACTAC CATAAAATTA AAGGCCTAAT CTTTTACCAG CATCTAATGC CAACATCTTC 840
CAAAGGGCCT GATCCACTTC ACATAACTAA AATAAGAGTG GGATAAATTT ACCATAGTCA 900
CAAAGGAGCA GACCTTGGCA TTGCAAGGTT TAAGGCAAAG ATCTTCTGTT CTTTGAATTT 960
AGATAGAAAG GGAAATTGCA CATGGGCCAG AGCTCATTGC TGTTTACTAA GGGACCACAT 1020
CCCTCCCATC ATAGCTTTTC TAGTTCAGGG CCAGACAATA AAGAAGGGAA TTACCAGCTA 1080
GAAGAAGGCT TCAAACCTTT CTTTAGATAT CTGAACAGCC TTAGGTCCTC ATACATAAAT 1140
TCTGTAGAAG GGAAATAAAT TACTTTGTAT AATATCAGAA TATCAGTAAG CAGAACTACA 1200
CTGTTGCTAT TTTTCTTTAA TAAATAAGAA AGGAACAAAG AAAAAGACGG AAAGAAGGAA 1260
AGAAAAAAAA GAGGAAAAGC AATCAGGAGG AATCCTGATG TCAATATTTA ATAGTGCATA 1320
AAATATGGTA AGTGGAGGAT TAAACAAAGG AATCAAAATA ACCTTACAGA ACAATCTTGC 1380
TCTTTAAGAT AAAAGGTTTT CTCCATATTT GTGGCAGAAC TGAACTAAAG GAAACATTTT 1440
TTTCTTTCAT GGTTTCGTGT TTCTACAAAC TAAAAAAGAG AACTACCAAA AAAAATTATA 1500
TTATTTCTAT TCTTTCCATA TTTGTTCAGA GAAATAGACA AAAACCAGTC TGCCATTGTC 1560
CCATCTAGCA CTGGTTTTGT CATAAGGCTC TTAAGGAGCT TAAAAGTAAC CAGATTTAAA 1620
CAATAGATAC ACCGCCCATT TTATTTACAA ACATGTTGGG CCCAATTCAT CTATTTTCCC 1680
TGACATCCTA AATTATTAGA GAAAATGGCA TAATAATTAA ATGCCACATT TCTTGAAGCT 1740
GAATGACATT TTCTCCCACC TCCTAATTTT TGTTTTTCTA GAAACAGTAA ACAATGTAAG 1800
TCAAGTCACA GCAGAAAGGT CATACACTAC CATCTTAAAG CTCTAATGTC CAAATTTAGT 1860
GAAGTAAAGG GACTTGACCT GAAGATACAG TTACCATAGT TTATATGTGT TCATTCAGAT 1920
GACAATTTTT TTCACATAAT CTCTAAAGAA TCCTCCGAGC ATCCTTAGGT TAGAGAAAGA 1980
GGGCTCCTGG TTTAAAATAA GTACTTACTT AAATTAATAT ACTTCAGACA ATGGGGTTTA 2040
ATGTATAGAA TTAAAGTGTC TTGCCTGAGA ATGGTCAGAA ATCTTTGTCT CTGCATGGGC 2100
TACGTTAGTT AAACAAGGAA CTTTCCATAT CTCCAAATTG AGAGACTGCC TGAAGATGAT 2160
CTTTAAAATC CTTCTCCACT CCAAAATCCA GTCACCAAAA TATAGTATTT TATTTAAATA 2220
CGGAGAAAAA AAGATCTTGT TTTGGCTGTT ATTTTCTCAG TCTTTATGTA ACGTTCTACA 2280
ATATTGGTCA TATTTGGTGG CGGGCTGGGG GGACGAGTTT ATTTCCCATC CATCCTGGCC 2340
CAACTAATTT TAGACCCTAA TATGAAAACA CCATGTTTAA TTTGTAACAC CTATGTCTAG 2400
TCACAGAAAT ACTGTAAAGC CCAAATTTAG CTGCGAGGCT CCACTGAAAG AAAAAGCAAA 2460
AGAAAAGAAG TACACAGTGT TAAGCATACA GTGCTTAACA TTTTATACAA AATGAAAATG 2520
CACTGACTTT TTACCTTTCA TGACACTTTC ATCTATGCTG TTTCTCATCT ATGCTGCTTC 2580
TCATAATTTT GTGTAAATTT AAAAACTTTT CTCCTGTTTT CTGCTTAGGT TCTTATTGTG 2640
ATAGACAGTA TACATACCAT AGAACTACTT TCCAAAAATT TCAAGTGGCC ATCAACAATG 2700
TCACTTATCA AGCTCTAAAT TTCTGGAATG ACGTTGACCA GTAGCAGGCT TTCTAAAAAA 2760
TGCCTTCTAG ATCACATCTA CCTTTGTGAC AGTATTGTTA AATAAGTTGT ATCAAGTGGA 2820
ACATGCCAGA ATGTTTCACA AAGTTTATTG AAGCTAGCAT TTACTGTTGC TATAGAAACA 2880
AACTACCATA GTTGAATTTA AAAGGTTGGT ACAGAATCAA TTGGGCAGAC ACGAATAGCT 2940
CAAATTAAGC AATTAAGAAT TCAAGACTAT AATGAATGAA ACTCTCCTCT GATCCAATAA 3000
TGGGTTAATC CTTTCTTAAT ATCAAATATC TTCCAGTAGA ACTCAGTAGA GTTCTGGCTG 3060
TGAACAGTTT ATGCCTTAAT CTTTTGACTG ACAATACTGT ACTTGAATAC TTGAATTCCT 3120
GTCTCTTTTA TGAATGAGTC ATCACTAATC CTCAAATGAA CTATTAATTC TAATTAATAT 3180
GGTCCAGATG TTATAATACT TTACTGGTGG ATTAATAGGC TTTCCCCAAA CCTTTTACCT 3240
TATGCTCTAA TCATTTACAG GCATTTTGCG GATGAAGGCT TTAATGCTCC AGGAAGAACT 3300
AACTAGAGAA CTAACTGCCT TACAGAAAAC CATTGGGAGG AAACGTCTAT AAATCTGAAA 3360
ACAAGAACAA ATTTTAAAAG TTGGAAAAAA AAAAGAGGTA AGAGGAAAAG TTCTAGTGCC 3420
AGAAATGAGA TTAAATGTCT TCTTTTTATA GGAAAAAAGT GAAGTAGGAA TCTTTACCTT 3480
TTTGTTTTAA AAGGTATACA ATTTTGATAA TGGGAAAGTC AACAGATTTT ACAAAAAGGA 3540
TTGTGAAAAT CAAATTATCT GAGTGCAAAT CACGTTTACT AAATGAGACA GAGCAAAAGG 3600
TGCAGCAAAA ATGGGGTCAT GACTAATTTT CTCAAGTCCA GAATATTTCT AACCTCCACC 3660
TAGACCGAAA TCACGTGAAG CCAGAGGCCA GCTAGCTATA ATCAGAAAGG CACTATGTAG 3720
CCGTTTTGTA 3730