EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS117-00426 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LHCN-M2 
Coordinate
chr1:144535800-144541730 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr1:144536450-144536464GTAATATTGATATT+6.13
Foxd3MA0041.1chr1:144537062-144537074AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:144537066-144537078AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr1:144537014-144537025AATAAACAATG-6.02
Gata1MA0035.3chr1:144536427-144536438TCCTTATCTCT+6.02
IRF1MA0050.2chr1:144536771-144536792AAGATAAAAATGAAAGAAAAG-6.64
MyogMA0500.1chr1:144538163-144538174AACAGCTGCAG+6.02
NR2F1MA0017.2chr1:144538321-144538334CAGGGGTCAAGGG+6.22
Nkx3-2MA0122.3chr1:144537351-144537364CTTAAGTGGTTAA-6.5
Tcf12MA0521.1chr1:144539129-144539140AACAGCTGCTG+6.32
Tcf12MA0521.1chr1:144538163-144538174AACAGCTGCAG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_11964chr1:144533110-144541143CD3
SE_14561chr1:144532565-144541703CD4_Memory_Primary_7pool
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SE_17054chr1:144533071-144540733CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17469chr1:144532743-144541930CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17945chr1:144532487-144542116CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18607chr1:144532729-144543281CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20383chr1:144533123-144541014CD56
SE_20952chr1:144532595-144542049CD8_Memory_7pool
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SE_22023chr1:144532818-144542018CD8_Naive_8pool
SE_22494chr1:144532830-144542021CD8_primiary
SE_30007chr1:144533029-144541934Fetal_Muscle
SE_36968chr1:144532904-144548195HSMMtube
SE_51650chr1:144532611-144541131Skeletal_Muscle
SE_51711chr1:144534690-144547240Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_63499chr1:144534641-144547240HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1144536131144536394
chr1144536201144536370
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I149155chr1144540821144541855
Enhancer Sequence
CCTTTGCACA AAATATTGTG CTAGCCTTTG CCAGGAGACA GAAATGAGGA GTCATGGGCT 60
GTGTTCTTCA GGAGTGTTGA GTTCTCCCGA GAGTGTGAGA ATACACAGGT AAGCCCAATA 120
GAAAGCAAAA GTCAGGGCCG GGCATGGTGG CTTATGCCTG TATTCCCAAC ACTTTAGGAG 180
GCCGAGGTGG GCAGATAACT TGAGGTCAGG AGTTCGAGAC CAGCATGGCC AACATGGTGA 240
AACCCCATCT CTACTAAACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 300
AATTAGCTGG GTGTGGTGGG ATATACCTAT AATCCCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGGAGG 360
AGAATCACTT GAACCAAGGA GGCAAGGGTT GCAGGAGGCA GTGATTGTGC CACTGCACTC 420
CAGCCTGGGT GACAGAGCAA GACTCTTGTC TCAAACAAGC ACAAAAACCA AAAACAAAAG 480
TCAGATGACT AAGGCAGTGA TGATTGCCAC ATCCTGTGCG GGGCAGCCTC TGGGATTTGT 540
CTCAAAACAC ACTCGATCTA GTTCTTGACG CCCATTGAGA TGGATGCTAG GCTATAGGCA 600
GTTACATAAG ATCTTCGAGC CTCAGTTTCC TTATCTCTGA AGTGAGAAAA GTAATATTGA 660
TATTGTTAAA AAGGCATGAG ATTTAGATAT AAGTAAAATA CTTGTATTTT ACTTAGTACC 720
TACTTAATCT TCATGAGTGA GTCAAAGAAA GCAAGTAGAA TTAGGCAGGG TTGTGGGGAT 780
GGGGAGAGGC AAGCTGTGCT AAAGACAGGG GAAATGGGCA GATAGAATGC AGGGCTAAAC 840
ACAGATACCT ACAACCTGCA GCAGAGGCAA CTTACTGAGC TTAACATAGA GAATACAAGT 900
CACTTTAAAA TGTACAGCTC TATGTTACTT TTCACCCCAC AATAAAATCG GTCCTTACCT 960
AGAAAAAAGT AAAGATAAAA ATGAAAGAAA AGAGGAGTGG GGGAAGTAAC ACACATGTGT 1020
ACACATTCAG ACCTTTGGCA TGCTTACATC AGAGAAAGAA CACTTTTGCA AGTTTTCTTG 1080
GCACAACGAA TGGTAATAAT TTTTAAGTCT ATTGTGTCTG TCATCTATTC ATATATTCTG 1140
AAACTGCTGA CCTCTCATTG ACAACAGTAT GCCTCTTTTT CTAAGATTAG AAATTTTAAA 1200
ATGTAATTGC TGATAATAAA CAATGGACAT TATGCTAAGC GAAGTGAGCC AGTCAAAAAA 1260
ATAAACAAAC AAACAAACAA ATAAATACTA CATGATTCAA CTCATTTTAG GTTGGTGCGA 1320
AGTTATTGTG GTTTTTGCCA TTAAAAGTAA TATAAAGTAC CTGGAATAGT CAAATGTATA 1380
GCAAGAGAAA ATAGAATGGT GCTTGCCAGG GGCTGGAGGG AAGGAGAAAT GGGGTTGTTG 1440
TTCAGTGGGT GCAGGGTTTG AATTTTGCAA GATGAAAGGG TTCTGTGGCT GGATGGTGGT 1500
CATGGCTTCA CAGCACTGTC AACGTGCATG ATGCCACTGA CCTGCGCACA TCTTAAGTGG 1560
TTAATGATCA ATTTTATGTC ATATGTATTT TTTCACATTT GAAAACACTT TTAAAAACCA 1620
TTCTTGTTAG TATTTAAAGA ACTGCAAGAT AAAAAAGAGA CATTTTTAAA GTGTGAAGTC 1680
GTGTGCACAG GTTCATCGTC TAGGTGTGTA CTCATGAAAA CAAATCTCTT GTGTTGCAGA 1740
TAGCGCTCGT TAAGGTTGAT TTCTGCATAT CAGTGAGAGT TCAGTGATCT TACATTCAAC 1800
ATAAATATGA CAACTTTACA AACATCCCCC CTTTCATCCA CTGAGTGAGT TTATCAGGAA 1860
AACCCAACAA AATCCTTCCA GGCCTCCCTG GGGGAAGGTA CACAGTCCCC TGCTCTGGAG 1920
GAGGACATGG AGGCTCACGC TGGTTAAGGG AGTTTTCCAA AGTCACCAGC AGCAAGGAAC 1980
CTTCTGAAAC TGCTGACAAG TCCGTGCTTT TCCCACGTCC ACTTACATTA TTTAGGCAAG 2040
ACCCACTTGG GAATCTATTT TTTCAAGGCA TGATCGGGAC TAGGTTCAGG ATGGTAGAGC 2100
AGGGCTGTTT TTGAAAGGCG GTCTCTTTCT CTTTGCACCA AGCTTTCCGT AAGTGTGTGG 2160
GTGACCCTCC CAACTTCCTC CTCTCTCCCA CAACCACCGC CCTCGCTGCT TCTCTCAGCT 2220
TCTCTCCCCG ACACCTGGAT GACTCCTCTT GGCTACCTGG GGGCTGGCAT TGTGGGAGGC 2280
AGCCGACGCC AGTGGGTGCT GCTGGGATCC CTGCCCACAC CCAGCAGTTG CCTGGAGATG 2340
GAGGTATGCC AGGTATGTGG GCCAACAGCT GCAGAGTTGC CACTGACAGG CCGGAGGAGG 2400
ATTCTTTGTC AGTGACCGCA CCAGCCCGAG CCCCTGCCAG CTGTCCCACT CAGTATGCCC 2460
TGGCTTCCAG GACCCCAGCC AAGGAAGGGT GTGGACATGT GATACAGTGG TGGCCACAAG 2520
GCAGGGGTCA AGGGGAAGGC AGGCCGATAC TAGCAACAGA GGAAATGACA TTTCAGAAGC 2580
GTCCTCTCTT ACAAACAAGA GCAACTGTGT GTGTCCCAGT GAGTATGGGA AGCTCAGTCT 2640
CCTAACATCA TTCAAGGGTC TCCAAGTGAC TGTGCATACA GTTTTAAAAA TATCACCGAA 2700
CTTGTTTTTC TTACCCCAGC CATTTTTTAT AACTATATCT AGGGAATGGG TTGGTTGACT 2760
CTAAAGAGCA AGGAACTAAA GAAAAGATAA ACATGGAAAC TTCAGGTTTT CCAGAATCTT 2820
GCATATTTCC CTCCTGTTTC CCTATTATAA TTTACATTTA AAATGGAGAG ATATGCAGTT 2880
TAAGCCAAAT GTTTTGAGTC ATGAAAACAA GTGAAACTCT TTTGCCTGTT CATGATAAAC 2940
CTTCAGATTT GGTGACTTCT TTCCACCAAG GCAAGATAGG TTTCACTGGG GAGAACTGAA 3000
CTGGTGTGGT GTTTTCTGCC TTCAGCCATC TGTGTGTACA CTGTGACAAT ATGGTTCTGT 3060
GCTGGATGAG ACGCCTACTA TTTTTTCATC TCACTAAAGA GCCTCAAGTT TCTCAGCTAC 3120
AACCTGGAGG AAGTGTCTGA AAGCTGATTT TCTGATGCCC AGCCCCAGGC CTCCTTTTCC 3180
ACCGCACAAG ATCAGACCTG CTTTTCTCTA AATCAGAATT AGGCACGCCA CTCCAGATGA 3240
AAGAGCCCTG TCGTTGAAAT GCCTTTCTTT GGCCCACACT AAGTATAATT TCTGCTCCCG 3300
TTTGAACTCA AATATCACAT GTATATTTTA ACAGCTGCTG CTCTCTAAGC AAACTGATTC 3360
ACATAGAAAA TCCAGGATTG TGACTACTTA TTTTTTCCTC TCTACACATG AAACAGATTC 3420
CCTGGAAACA CAGTTATCTT AAGTAGCTGG AATTGTCTAA CTTCGGTTAC TTTATTATTT 3480
ACAAATCAGC CAGGTGAGAA CAAGAAAGTG AAAAGCAGGA AACAAGATAG GCAGAGAAAC 3540
AAAGGGCTCG ATCGCAAGAG TAGCAAGATG CCTGAGCAGA CCCACAGGGT TCTCAGGGCT 3600
GCAGCAAAAA TCAAAGAACA GTCGTGGTCT CAGGACTCGC CATAGATCAG ACCACAGCTT 3660
CCAACCATGC CACAGGCTGT CTGTGTGTTC CCTGCACACC ATTCATTTTT GTCCTTCTAT 3720
TTTAATGATC TGAAACCAAG TTTGGGCCAT GTGTAGACAG GCCATTCGGA GGAGGCTTCG 3780
GGAAGGAGGG TGCATCTGAG ACTAGTTGTA AAAGATGAGG AGGATTTCCA CAATCGCTCG 3840
AAGGAAAGGG GCATTTCAGA AAGAGAGAAG AGCACGTTCA CGTGAGCCCA GATAGGAGCA 3900
CGGGGCACAC GCAGGAAACT TCCTGATGCT GGAGTTCATG CGCACGGTGG ACGCAGGCTT 3960
GGCAGCCCGC AAGGCAGAAG GGGAGGTGGT GCGGGAACCG TGGCTGCTCT AGCAAACTTG 4020
AGCTCCATTC TGCAGGCTCA AGGAGACATG GAGTAAGAGG AAGGACTCCT TGGGTGCATT 4080
GTTCATGGGA GGACAAATTA GAAAGGGGAT TATCTCATGG CAGGCAGCCA CTTCCAAGTA 4140
GGGAAGTTGG AGAACTTGTT GTCAGGTGGA AGAAAAGAGA AGACCCTTGA AAAGTCATCC 4200
AGGAATGGGT GTGCACAAAC ATGGAGTGTG TTCCTCATGC CGTAATTCTG ATCCAGGTCC 4260
TTGACTTAAC TGCATTGCCA TTAAGCTTGT GAAAGGAGGG GAAAGCCGGT ACCAGACATT 4320
GGTTATATGT CCAATATCTG TTTGACTCTT TGTTAGAGGT ATTACCTAAG TTATCTTACA 4380
ATACTCTAAA AGCAATTCTA CAAAGCCCAT TGCTATTTTA CAGAAATGAA ATCTGAAAAT 4440
GAAGAGGGTC AAGTAAACTA AGAAGTCTAC GCATAACTAA GAAGTGGGGC TGCCTGACCC 4500
CAATCCTGCA CTCTTGGCTC TTTATGACTT CACTTGTGAG CATACTGAAC TCAAAGTGTT 4560
CTGGACGTCT CCAGGTAGAG GGCTCTAGGA GGCAGCTGAG TACGTGAGTC TGGAACTTAG 4620
GAGAGTTCCA AGCAGGGCTG TGGGTGTGGG ATGGGGTGCA TGGGAAGGAG GTTGTCAAAG 4680
CAAAGCAATG CGCAGCTGCT TAGGGAGGGG GCACAGGAGA GTGCCCTGGC CCTTCTTAGA 4740
TCATTGTCAA CTCAACTTGT CTAAATGGCT TTTAAGACCT CAGTTATCAC CTGTATTAAT 4800
TCTGGCCTAT GGTATTTTGC AGCTCTTCGG GAAATAGTGA TCCTTTGTTT CTGACAAATT 4860
TCTTCTTAAA GGGTTTATTG TCTTATTTAC TAGGAATCAT GGGGAATAGA GTGTTACACA 4920
ATGTAATTTT TTCCCTAACA AATGAAGCTT ATTTTTATAA ATTCCAGGGC TTTTAATTTG 4980
AATCATGCTT AACTATTTTT CTATATTTTA TTACATTGTT TGCTTCCTCC CTAAAGACAG 5040
TATATTTTAG TATTTTCACA GAAAAATGAG AAGCCCTCAT TATGAACATA CCTGATTAAA 5100
TTGAGCATTT CCAAGTGATG TCCACATCAT TGCTCAAGTG TTATGAGGCC ACAGGATGAA 5160
CTACTGCCCC CCGAATGATG CTAGAATGCT GTGCCTTTAT TTATTTCATT GGACAACTCA 5220
TTCAACATAT ATTTATCAAG TGACTCCTAT AAGAGTAACT AAAATAGAAT TTCCTGCTTT 5280
TGTAGACCTT ACACTATAGT TGATTCCATA GTGTCTAGTG TTTCATGAAA TTATACAAAA 5340
TGTCACTAAA TCTAAAATGC CATTGGTAAT GACATACACT TTTTAATGCA CTAATATTAA 5400
ATAATGCTGA AATTAAGTTA TGCTTATCTA ATGTAAGATA CATTGCAGTT TCAGATACTA 5460
AAATTTGAAC AAGTAGACAA ACGTTTCTCT TGAAATCAGT GAAATCTCTA TCTAAATCCC 5520
TTAGAATAGG GTTAGCACAT AGTATTCCAG GAAAGCAAAG CTCTAATTAT TATTGTTGGA 5580
TTGTACCCAG ATTATGTTAC TATTTAAGTT TCTACTTTAT GTAAAGCACT TTTTCATATG 5640
GATATTCTTT ATCCTAACAA TAGTCCATTT GTTACACCAG AAGTAACACC AGATACTTCT 5700
GAATAATAAT GGCAGTTAAA TCTGTGGTTT TGTGGAATTT TGCTTATATA CGTCACTGTT 5760
GATTCAAACA ATATAGCAGC TCTAAGAACA TCTGTGCCTC CAGCCTCTGC ATTTCAACCA 5820
TGAGAGCGTC ATTTCTCTCC ATGATGCTTA AATTAAAAAT CTAAATATTT GGTAAATTTT 5880
ACGCTTTTCT AGAATATGTT TTGTTACTAT TATATTCTAG TAAAAACAAA 5930