EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS113-14468 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Keratinocyte 
Coordinate
chr16:75278040-75281890 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF13MA0657.1chr16:75278245-75278263GGGCCACGCCCCCTTGGG+7.49
KLF14MA0740.1chr16:75278246-75278260GGCCACGCCCCCTT+8.42
KLF16MA0741.1chr16:75278247-75278258GCCACGCCCCC+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr16:75278739-75278750AGGCACTCAAG+6.14
SP3MA0746.2chr16:75278246-75278259GGCCACGCCCCCT+6.82
SP4MA0685.1chr16:75278244-75278261AGGGCCACGCCCCCTTG+6.04
SP8MA0747.1chr16:75278247-75278259GCCACGCCCCCT+6.92
SRFMA0083.3chr16:75279072-75279088TTCCCAAATATGGTCT+6.32
TFAP2CMA0524.2chr16:75278286-75278298TGCCTTGGGGCA-6.62
Number of super-enhancer constituents: 48             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00570chr16:75276969-75289512Adipose_Nuclei
SE_01027chr16:75277543-75283394Adrenal_Gland
SE_01598chr16:75276707-75289650Aorta
SE_02331chr16:75277330-75288808Astrocytes
SE_03331chr16:75277794-75279566Brain_Angular_Gyrus
SE_03331chr16:75279976-75284560Brain_Angular_Gyrus
SE_04059chr16:75276795-75285478Brain_Anterior_Caudate
SE_04972chr16:75276672-75285465Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05893chr16:75276685-75293501Brain_Hippocampus_Middle
SE_06838chr16:75276719-75289390Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08020chr16:75276651-75285142Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08845chr16:75278346-75278969Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08845chr16:75278986-75279485Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08845chr16:75280135-75281229Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08845chr16:75281436-75282063Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_23565chr16:75277694-75286461Colon_Crypt_1
SE_24249chr16:75278194-75278843Colon_Crypt_2
SE_24249chr16:75278900-75280038Colon_Crypt_2
SE_24249chr16:75280860-75285680Colon_Crypt_2
SE_25238chr16:75277412-75279870Colon_Crypt_3
SE_25238chr16:75280237-75286799Colon_Crypt_3
SE_28412chr16:75277642-75281186Fetal_Intestine
SE_29781chr16:75277382-75282803Fetal_Muscle
SE_31474chr16:75277027-75287880Gastric
SE_33688chr16:75278516-75280561H2171
SE_34439chr16:75277172-75286899HCT-116
SE_37603chr16:75277242-75282365HSMMtube
SE_38117chr16:75276613-75293188HUVEC
SE_38990chr16:75277480-75289033IMR90
SE_40740chr16:75276822-75289706Left_Ventricle
SE_41632chr16:75277509-75279861LNCaP
SE_41632chr16:75280179-75281571LNCaP
SE_42251chr16:75276953-75289666Lung
SE_44368chr16:75276813-75285577NHDF-Ad
SE_44884chr16:75277338-75285598NHLF
SE_45996chr16:75276807-75289541Osteoblasts
SE_46799chr16:75277552-75279864Ovary
SE_46799chr16:75279888-75282294Ovary
SE_48179chr16:75277426-75289729Psoas_Muscle
SE_48896chr16:75277444-75289469Right_Atrium
SE_49519chr16:75277465-75278773Right_Ventricle
SE_49519chr16:75278810-75285584Right_Ventricle
SE_50683chr16:75277468-75289255Sigmoid_Colon
SE_51439chr16:75277246-75292299Skeletal_Muscle
SE_53062chr16:75277701-75287465Small_Intestine
SE_53350chr16:75276945-75293185Spleen
SE_65559chr16:75276622-75285571Pancreatic_islets
SE_68707chr16:75277484-75289754H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr167527898875279894
Enhancer Sequence
CCCCACCAGC CTGGCCTCAG CTCTGGGCTG CCCTGCAAGG TCCCTCCTCA GAGTCTCCTG 60
GCGTCTTAGA TGTGCAGCCT GGTCGAGACT CTGACTCGGA AATGGGACCT GGGTTCTGGC 120
CAGCCAGTAG CTGTGTGACC ATCCCCACTT GGGCCCAAGT CCCACTTTCT GGACTCCATC 180
TGCAAGGAGT GAAACAAGGA AGAAAGGGCC ACGCCCCCTT GGGCAGAAAC AGGAAGCAGG 240
AGCCTGTGCC TTGGGGCAGA GGAGTGGGGG TGAGGCCTCT TTCAAGTCCC TAGGGCCCAC 300
CCTCCTCCCC TATATGAGCA GGGGCTGGAC AGTGCCCCTC TGAGCGCCAT CTCCCTGGCC 360
GGCATCAGAG GGCGATGGCA TACCAGGCAG CGGCCTGGGT AGGCAGTAGT TGCCCCAGGT 420
CCCAGGATCA GACATTCAGA CCCCATGGTT CACTTGCCCT GGGTGGACAT CATCAGCAGG 480
GAGCCCATTT CTCCAGAGCA GCTAGGAGCC TCCAGTCCCT AAAAGGGCCA GAGGCTGGAG 540
TGTGGAGAGC CAGGAGGAGC AAGGCCCAAG GGAGGGGCCA GGGGGCAGCT AGGAGAGGGC 600
AGGCCCAGGT GGAGTCATAT TGGAGCCAAG GTGAGCACAA GGGCAGAGGC CCTGGATGGC 660
TGCAACACTG TCCACACCAT GATTACAACA AAATGAAAAA GGCACTCAAG TGAAAAGCAC 720
ATCTCAAGAA AATGTCCTGT GAAACGTAAA GACAAGAGAG GGTCAGGAAG ACACCAGAGA 780
TGTCTGAGAC AATGGAGATA GTTTCTCTTC CTGTTTTTCA GGAATGAGTG TTTCTTGCTT 840
TGGGGCTGAA AAACTACACA AAAAGAAAAA AAAAGAAAAC GGTGGACTAT GTCCCAGGCT 900
CTGAGGCAGG ACGGGACAGG CAGTGCGGCA GGTCTAGGGG CCAGAGCCCC ACAGAGGAGC 960
GGGAGGGCGG GGGCTGTCCT GCAGCCCACC GGGCTCAGGG CCCCCATCCC AGGCGGCCAG 1020
CAAGACAAGC ATTTCCCAAA TATGGTCTGC AGCCTGCCTC TGGGAATCAC AGCCCATCGG 1080
GGGCGGGCCA CCCTTCCCCA GTGACCCTAC ACACCACAGA GCTGCCCCTC CGGGTCCCCC 1140
AGCCCCTGCC CTGGTGACCA CAGGAAGTGC CAGCAGAGTG AGTCACAGGA AAATTCCCCT 1200
CCAGCCAAGT CAGAGAAGGT GGGGGTTTAG ACAGAGGGGA CCGCCCCGCG AAGGCCCCTC 1260
ACCTCCTAGG AGGGTGGCCC AGGAAAGGCT GGCAGAGGCC CCATCAGGCA GGGCCAGGCA 1320
CTCAGAGAGG CTGAGGGAGC ACAGGCAGGG AGGCCGGGGG CTCTGTGGAG GGAAGGGCCC 1380
TGCAGGGAGG GAAAGCCCGG CCCAGGTGAG CGGCTGGGGC CTCTGGCCTC ACAGCCCAGC 1440
CCTGCCAGGC ATGAGCTCAC TGATCGGCCA CAGCCCAGTC TGGGGCCGCT GAAGCCAGGC 1500
TGGGAAGCAT CTCACAGGCT GGGCACGTGG CACCAGGCGC CTGGCACCAG GAGCTTCCCC 1560
GCCTGCGTCA GCTGGTGTGC CCCCGCCCAG CCTGAGCTCT GGACGCTGCT GGTACACAAC 1620
CGACCACTCC AGCTGGCCAG GGCCCCCGCC TCTCCGGGCC TCTCTGCCTC CTGTTCTGTT 1680
CCCTAAGGAC ATGCACTCCT TCTTCCTCAC TAGGCAGACT CAGACCTGGG CCCGGCTGTG 1740
GGACTTTGGG CAAATCCCTT AGCCTCTCTG AGCATCTAGA TCCTCTCTGC TGGATGACAG 1800
CCCTCATTTC ATAGGATTGT TCTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACTGGG 1860
TTCTGCTCTA TTGCCCAGTA GCGCGATCAT GGCTCTCACT GCAACAACCT CCCAGGCTCA 1920
AGTGATCCTC CCACCTCAGC CACCTCCCAC CTTAGCCTCC CAAGTAGCTA GGACTACAGG 1980
CATACACCAC CACGCCCAGC TAATTTTGTG TAGAGATGGG TTCTCCTTAT GTTGCCCAGG 2040
GTGGTCTCAA ACTCTTGGGC TCAAGTGATC CTCCAGCTTC GGACTCCCAA AGTGCTGGGA 2100
TTACAGGCGT GAGCCACTGT GCCCAGCGCG CATTGTTCTT TTAACAAAAG ATTCGCCTGG 2160
CCCCTGCTTT GGCTGGGCTC CGCAGAGATA GCGCAGGCCT AGTGGACAAG GCCTCTGTCT 2220
GAACCGGGCC TATACTGTAG TGGGACAGAA AGACACCAAA CAATTTGCTT TCACGGGGAA 2280
GAAAGTGGGG TGCCAAAAAT AATGTGGGAG AAGGCCTTTG CATACAGGGT CAGAGACGGC 2340
CTCCCCAAAG AGATGACATT CCACAGGATT CCTGTCTGAG AAGAGCATGG GGCAGAGGAA 2400
GGGCCTCAGC CAGGGGGCTG GAGCAGGGAG GCAGGCTGTG ACCCTGGAGC GGCAAAAGGA 2460
CTCACACCGC AGACTCCATG GATGATGCGT GCACAGCTCA GTGAACGTCA TCCGCACAAC 2520
CAGCTTCCCC ACGGCCAGAT AAGCCCAGAC GAGCAAAGCA CACACCACCC CAAGCATTCC 2580
TGCTCTGGAC ATGCTCGCAG GCCCCCCAGC AGCCTCCCCC GGAACCCCTG CCATGCTTCA 2640
AACTGGAGGA GAGGCCAGCC TCCCCAAGCC TACTTTCCTG GCCTCCCGCA CTGCTGGGCC 2700
TAGGGCATGA CCCAAGCTGG GCCAGTCAGG TGCTCCTGCC CAAGTTTTCA AGGGACACAA 2760
CTGTGACCTC AGAAGGGGTG CAAAGCCAGT CCAGGTGGAC ACTGTCAGCC ACCTGTGTCC 2820
AAGGCGCAGT GGAGGCTGCT GCCTGACTCA CTCATTCTCT GGTACCCTAC TCCTGCCGCA 2880
CCCTACTCCC ACTTCAGAAC ATGCTGGACT ATCATCCCCT CCAGGAAGGC TCCTCCTGGG 2940
ACACCTTCTC CCCTCTGCCC CCACCTCACA GTACTGCCCA GCATATCTTG ACATAGCCCA 3000
ATTCACACCC CTGCACCCCA GGCACCCAGG ACAGGAGGAC AAGTCTACCT CCTTCAGAAG 3060
GGTAACTCCA GGGCACGTGC ACCAGAGGAA CCCAGGAAGG CCTTTGGGGG CTTGCTCATC 3120
CCAAAGGGCA GGGCCAGAGG AGGAGAGCCC CAGCCTGATG CCAGCACTCC CTAAACAATA 3180
TCCCAGCTGT TGCACATAGG ACTGACAGGA CTGCCCCACA CGCTCTGCCT GGCTCTGAGA 3240
ATGGCCCTCA TTGTGTCCCC GGGGCCCGCC TGGGCACCAT ATCCACCCGG GCTGGGCAGG 3300
CAGGCCCTGA GAAGCACAGC GGCTGGGACC AGGGCTGCGG GTGACACACG TCAGGGAGAG 3360
CTGCAGCCGT CGGATGGGTG TTGGGGTCTC CTCATTGGCT CTGCCAGCTG CCTTGGGAGC 3420
CCTGGACGTG CTGTGGCTGT CCCCAAACTC CTTCTCTGGG TCAGGCGGAA GCTGGTGTCG 3480
GCGAGTGGTA AGGGGAGATG CTGCTGCTCC AAGGAGCCTT CCCTGGTTGC CTGAAGGGAC 3540
AACCCAGGAG TTCTCAGGAG CAGGGCCAGC CCAAACCAAC TGCAGAGAAC ACTGCAGGTA 3600
TCACTGCTGA CCAAAACCCT CTCTGCCAGG CCTGGCTCAT ATCTGGCCTG CACCCTTTCA 3660
CCCAGCAAAT ATGACCTCAG CACCCGCAAG CCAGCACAAG GTGGGAGCTG GGAGAAAATG 3720
GCAAGAACTC CTGTTCTCTG CCCAAGACCC CAGGGTTGGG GGCAGACAAG GAAATGGGTA 3780
ATAGTGCCAC ACTTGTCACT AAGTTCACAA TAATAAGAAC AGCACAGTTC CTCCCTGCGG 3840
GAGGCAGAGC 3850