EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS113-03414 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Keratinocyte 
Coordinate
chr1:218669130-218673410 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1015275chr1218670141hg19
rs622912chr1218670357hg19
rs72738842chr1218672807hg19
rs11118112chr1218673257hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:218670944-218670956AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:218670948-218670960AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:218672251-218672272AAGTGCTTTCTCTTTCTTTCT+6.35
NFAT5MA0606.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFICMA0161.2chr1:218670753-218670764TGTGCCAAGTA-6.32
STAT1MA0137.3chr1:218671728-218671739TTTCCTAGAAA-6.14
TCF7L2MA0523.1chr1:218672834-218672848TTCCTTTGAAGTTG-6.16
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218668940-218673595Astrocytes
SE_34115chr1:218670708-218673590HCC1954
SE_36549chr1:218669094-218673670HMEC
SE_37059chr1:218667317-218675140HSMMtube
SE_38564chr1:218669211-218673648HUVEC
SE_45788chr1:218669012-218673879Osteoblasts
SE_51738chr1:218669025-218673706Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218667886-218673684u87
SE_63527chr1:218668917-218674335HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218671355218673056
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218493chr1218667158218673741
Enhancer Sequence
AAACAAGGTA GGTCAGATCA TTTCTTTATG GCCAGGTTTT ACACAGAAAG GGAGAGGGAA 60
AATGAGAATA ATATTTTTAG GTCTTATGGC TGGCTTTGGG GCAAAGGGGT TTTGTCCTGG 120
AGACCCGCTA GAAAAGAGGG ATTCCAGTTT CTATGCTAGC CTTAGGAGAG AATAAGAGTG 180
AGACAGGAGG GCAGGAGAAG GTCAGAGAAA AACGTCTGCT TTCTGAGGCT GTTGCTGAGG 240
CTGTCGTTTT GGGGTATTCT TTCTTGAGGC CCAACATCTA TACAGATTTC AGTAGATAAC 300
ATGTGTCAAC TGAAAATGCT TTTCACGTGA AAATTCCAAT GACAGGTCAT TTAAGAATTC 360
TAAAAATACT GTCTATCTTC TCTTATGCAT TCTTTCTTGG GGACACATTT TTGTAAGAAA 420
ATGTGAACTC AATAGGAAAG TTAGACACAA GTAAGTTAGA AGAGTTAGAT ATGTAATGAA 480
GTCAAAGGAG AGGCAAAAAA CTATCTGTAT TTTTTGTTGG TATTCAACCA ACAAAAAAGC 540
TAAAAGTATA ACAAAATAAA AACAAAAATC TTAGAAGATA GTGTCTTTAT CATCCAGAGT 600
GGTCAAGCTG TAATCTTGGC CAAAGAAGTA AAGGTGCATT AGAATGGAAT ATTACCTTGT 660
TCTGTCTATA AATTGTTTTA TTTTTTTTTT CTTTGGATGA GATCAGATAC TTCTTAGAAC 720
ACAACTTGAT GAGGTCTTGT TAGAATAGAG AGGAATGGAG AAGCAGAGGG CATTAGGATA 780
TTGGAAAACA TTGCAAGACC CAGCAGTTTT AAAAGCACTT TTTTCCCCAT CCCTATAAAA 840
AAAAAAAAAA AAAAGAGAGA GAGAGAGAGG GAGCGAGAGG GAGATGATCT CATTCGATCC 900
TGTGAAGGAC TGCTACTCAG TAAGGAAGAA GTCCTGGGCA GTGTGAATCA GTTCAAGTCA 960
ACATCAGTGA TGACTTATGT TCTGGGCATT TAGGGGAGGG TGGAATTCCA GACCATCCTG 1020
CTGGTAACCT CAGAAGGCTT GTGCTCACAG TGACTGTATC CCTTAAGGCA GTTAGAGGCT 1080
GAGAATGTAG ATGGAGTAAT GATGATACAA ATGTTACTAA ACTTTGTCCT CTGAGAGGAG 1140
CCTGGAGTGT TGCAGTATAG GAAGCTGTTG ATTATCAAAT GATTTTTCCC TCTTGGAACC 1200
TTAAGAAGAA AACACTAGTG TGTGTCTTCA GTAAGTCCTC TGATTTATAG GGCGCTGATA 1260
ATTGATTCAA GAAAAAGAAA GTATAGATTT ATATATACAC ACACATATAA TACCTATGCA 1320
TGTATATCAT ATGTATATGC ATGTTTATGT ATGCTTTGTG TATGTGTAAA CATCTTTTGG 1380
TAAAACTTAT TAATGAAATA TGAAGTTGAT GTAAATATCT TTGGGCTGAA AACAGTTCAT 1440
ATATATATAA CAATTAATAA GGGCATAATT TTTCACTTTG CAAAACATTT TTTTCCTTCA 1500
CAAAATGATT CCTCACAAGA TTATAAATGA ATGAACTAAT AAACTTCCAC ATGTCTCTTA 1560
AAATAGGATT TGCTATATTA GTATTTATTA TAATAATAAT AAAATTAACA TTTTTAAACC 1620
TTTTGTGCCA AGTACTGAGC TGAGGGCTTT ATGTGAACTA CCTCATTTCT GTCTCCCAGT 1680
CACGCTAGGA TGTAAGGTAA CATCATTATC CTCTGCATTT GAAAACTTGA GGTTTACACC 1740
TGTTCCCAAA AATCTATTGA AATAAAATAA AAATTAAAAA AATTTTAAAA AGATATTCAG 1800
CCTAGTTGAA AAGCAAACAA ACAAACAAAC CCTTGAGGTT TAGAAAATTT CATAACTCTC 1860
CCAGAGTCAC ACCTTAATAA GAGATGTAGC TGGGATTCTG ACCCCATAGC CTGTACCTCC 1920
CTCTTCTCAA CAGTATTTCT ATATTTTGGG ATACCATGAC TCTTATGCAA AGCAACTCAT 1980
CTGTACAAAT AGCTTGGGCC AAAGCAATCA ATCATGTAAC AAAGGTGTAA ATAGAAATAA 2040
AAATATTAAC CCTTGGCTTG GATCCAAATG TCATTCATTT TAGCCAATGT TTTCCTTTCC 2100
ATCATTAAGA ATTCTGCTTT TTTTTTTTTT AAGTTTGGGA AAATCTGATA TCAAATAAAT 2160
TCATTGCATT CTTTCTGCAT AACCATGTGG TAAATGCTAG TCCCGGGCAT GGAAAGACAG 2220
GCACAGTAAG CAAAGACAGA ATGAGGAAAA ACTGTGAATC TAGATTTTTT CCTCTGTGTA 2280
AGAAAGTATA GTTCCCTTGG TAGAGAATGC AGAGACTAAA GCCTTTGACT ATTGGACAAG 2340
AAACTGTTGA CATTGCTGTA GTGAATCATC CGTCATACAC AGCTCTTAAT GGGGATGGGA 2400
CAAATTACAG CATTTCATGA TGCTGCCCAA AGATAATTCA GTCTAGCACC TGGATTGTTT 2460
GGAAATCCAC TGGATCCCTC CTTGACTCTC ACATGCTCAT CCTGCATATA CACTCCTTGT 2520
ATAGCAACAA GCATGAGATT GAGCGATAGA GTTGGACAAA TGACCAATAT TTATTCAGTT 2580
AATAAAATAC AGAGTTGTTT TCCTAGAAAC ACCAGCAAGG CAAAGGGAAA CAGAGAGAGG 2640
AATCCTGCTC CTACCAGAGA GATGAATGGG TGTGAGAAAA TGTGAGGGAG ACTCATTGCA 2700
TAAACATAAC TGAGGCTAAA GATCGCTGCA GCCCCAGCCA GGCTAAAACA TGGAGAAGAT 2760
GACCATGCGA GGCTGGGCAA GTGGGGTGCT ATCTACCGAG GAGTGGGTAG GACAAGGGGT 2820
CCAGGCCCCA TGCTTATCTA TTAGGTGAAG TTTTGATCTC AAGGCTGGGA AAGACATGGC 2880
CAGAAATAAA TGTTTAGGAC ATAACATTCT TTCCATGTTA GGACACCACA TTCTTGCTAT 2940
TTGGTGACAA ATGACTGAAC CGGGAGCTTG GTCCCATTTA TGATCTAATT CTATAAAAAT 3000
GAAATCCCGG GCATCTGGTT CAGAGCATTC CAGGAAAGAG TTAAAGCCCA ATATTGCTGC 3060
CTCACTCTGT TCTTCCTTTT TGGTGAATGA TAGGCTAGGA CGTGAACTTG CTGCCTTCTG 3120
GAAGTGCTTT CTCTTTCTTT CTGTGGATTT TATTTTCTGC CTTCTATGGG AGAGAACAGC 3180
TCTCTTGCCT TTCCACTTCC CCTGGGCTTG AAAACACTCA TAGTAGAACA TATACCTTCT 3240
ATCTGAAGAC AACATATAGA AGGTAAAAGA AATGGAAAAT CATCTGCATA AAGAAGAAAA 3300
ACAGAGAGTG AGTGAGCATA TGGGCGTGTC TGAGTGTGCG TGTTCAGTGT AGGAAGTGTC 3360
TGAAGAGAAG TCCAGCTACA AGAACTTGCT GCAATAATTC TCTAACAGCA TGAACAAAGA 3420
CTCCAATAAT AAATGGTGAC ATTTACACAA ATATTTGTGG TTGTGCTTTC CATTTCTTCT 3480
TATAGGAAAC AAGTAAGATT TTTAAATGCT TTAGTGATGT GATCAGTAGA CAGTAGTGGG 3540
AAAGAATTTC CCTGAAACCT GACTTGCAAT CAAAATAAGG AAGGAAGATC TGAGAGAATT 3600
GAGAATATTT CAGCTAATCA GGATATGGCA CTTTCCGGCA TCTGGGTGTC CAAACAAGTG 3660
TTTTGAATTC AATACTGTTA ACATGTGTCA CTTTAATGAA TATTTTCCTT TGAAGTTGAT 3720
TGGATGGTTA CATTTTTGGC AATAATCTTG TGGTCTGTTG CTTACATTAC CTGACCCACA 3780
GTCCATTTTC CTTGTGTTGG CTGTGGGAAA GAAAAAGAGT GAAAAATATC TCAGAACCTG 3840
GGAAACAGCA CTGAGAATGC GACTCATCTT TTAGTTAAAC CACTTCAGAT AGAAGCTCTC 3900
TAAGGATTGC CTCCTCACTG TCTGTGATAT GTGTAACCAA AAAAAAGAAA TAAGTTCCCC 3960
CGGTGTCAAA AAGATAAGGG GAAAAATCCA CAAAATGAGA TGAGGCTATT TTTCTTTTTT 4020
AAGCCTGAAA TAGGAGGTCA GTCCTTTGCA CTCTTCCTTT TGACTTCTAA CAAAACCAAT 4080
CACAGTCAAG CTATTCTCTT GAGTTAAAAA GTGTTTTCAG GAAGTCCATA ACATGTTCTA 4140
ATTGATTATT TAAAAATCCC CACACAGGAA CATCCCCTCA TGGTCTGAAT GTCTTTTTAG 4200
CCCTCTGCTA TTTGCAGAAC CTTAAACAAA TTGTAAGAGA GAGTCCTTGG CTAACTCCAA 4260
GGACCTTTAT GAGGAGTGGG 4280