EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS113-00912 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Keratinocyte 
Coordinate
chr1:39621990-39628680 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs67758468chr139622588hg19
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT+6.22
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT-6.22
Foxq1MA0040.1chr1:39624109-39624120TATTGTTTATT+6.62
Hnf4aMA0114.3chr1:39624505-39624521GTGGTCAAAGTCCAGT+6.51
IRF1MA0050.2chr1:39622615-39622636TATTACTTTCCCTTTCCATTA+6.36
IRF1MA0050.2chr1:39627603-39627624CTATAGTTTCAGTTTCAGCTA+6.5
IRF2MA0051.1chr1:39622614-39622632TTATTACTTTCCCTTTCC-6.46
IRF8MA0652.1chr1:39627607-39627621AGTTTCAGTTTCAG-6.86
KLF4MA0039.3chr1:39625567-39625578ACAGGGTGTGG-6.14
Lhx3MA0135.1chr1:39627542-39627555TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr1:39627539-39627552AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:39627538-39627551AAATTAATTAATT+6.92
Nkx3-2MA0122.3chr1:39625399-39625412AATAAGTGGTTTT-6.14
POU6F1MA0628.1chr1:39627540-39627550ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:39627544-39627554ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:39627540-39627550ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:39627544-39627554ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:39625134-39625155TGGGGAGGAGGGTGGAGGGAG+6.03
ZNF263MA0528.1chr1:39625137-39625158GGAGGAGGGTGGAGGGAGGAA+7.19
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02052chr1:39623700-39625273Aorta
SE_06399chr1:39623194-39625443Brain_Hippocampus_Middle
SE_08441chr1:39623554-39625364Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_14598chr1:39623413-39625353CD4_Memory_Primary_7pool
SE_25799chr1:39623252-39625649Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30410chr1:39623509-39626362Fetal_Muscle
SE_32006chr1:39623632-39626196Gastric
SE_35822chr1:39623459-39627010HMEC
SE_36947chr1:39622990-39632657HSMMtube
SE_37973chr1:39623508-39626483HUVEC
SE_42256chr1:39623665-39625283Lung
SE_42256chr1:39625384-39626180Lung
SE_45768chr1:39623568-39627263Osteoblasts
SE_47164chr1:39622875-39627546Panc1
SE_51765chr1:39623560-39625373Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39623552-39625824Small_Intestine
SE_54583chr1:39623552-39625585Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39623442-39625404HSMM
SE_64261chr1:39623623-39625416NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr13962394539625358
chr13962649939626706
chr13962634439626656
chr13962377339626200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039157chr13962297839627255
Enhancer Sequence
TATTTTATAA GAATTTGGGG GCTTGGCATG GTGGCTTACG CCAGGCCCCC AGCACTTTTG 60
GAAGCCAAGG TGGGATGATC ACTTGAGTCC AGAAGTTCGA GACCAGCCTG GGCAACATGG 120
TGAAACACTG TCTCTACAAA AAATACAAAA ATTAGCGAGG CATAGTGATG TGTGCCTGTA 180
GTCCCAGCTA CTTGGGGGGC TGAGGTGGGA GTATCGCTTG AGCCTGGGAG GTCAAGGCTA 240
TGGTGAGCCA AGATTGTGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGTG ACAGAACAAG ACCCTGTCTC 300
AAAAACAACA AAAAAAGAAT TTGGGGCTCC TGCCTCATAT AACTAGTTAG TGGCAAAGTT 360
GAGATAGACT CTGAAATCCT GGGATTGACT CTACAAGAAT CTATATTTGT GTTTTTTACT 420
ATATCCTACT GTCTAATTTA CGGTCTTTAA GCACTAAACT CCTTTTTAAC CTGTTAATCT 480
TGCCTATCAA GTTGCATTTT GAGAAAAATG AACCATGTAT TTGTGTTTCT CCATAACTCC 540
TAATACTCAC ATCTGCACAA AGTAGTACCT TGCTGGTTCT GTTGACTGAC TAGTAGCATT 600
GGAAGGCACA AAAGCTTGGG TTGGTTATTA CTTTCCCTTT CCATTATCTT TTTTTTTTTT 660
TTTTCCTCTA AGTTGGGGTC TTGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGCAATCAC 720
AGCTCACTGT AGCCTCAACT TCCTGGGCTC AAGTGATCCT CCCACCTTAG CCTCCCCAGT 780
AGCCAGGACT ACAGTCATGG GACAGCACAC CTAGTTAACA TTTTTAGTTT TTGTAGAGAT 840
GAGGTCTCAC TATATTGCCC AGGCAGGTCT CAAACTTCTG AGCTCAAGCA GTCCGCCCAC 900
CTTACCCTCC CAAAGTATTG GGATTACAGG TGTGAGCCAC CACACCCAGC CCCTTTCCAT 960
TATCTTAGCA GCTGTCACAA TTATTTAGCC TGATCTTTTT AGGTGGGCAT ACTCCCTTTT 1020
CTCTCTGTTT TTACAATGCT ACTTACACAG TTTCTCCACC TGCATCCAAT CTGTAATTGG 1080
GAGTTTTGCA GAGCAGTGTA TTTGGTATGC TGTGAACTCT TCCCTAGGTC ACCCAATGGC 1140
ATCTTGTGAG CCAGGTTGTC TGAAAAACTT CAAATCTTGG TGGCAGTGTG GTGGGTGTAT 1200
CTCCCATATG AGGGATTGTT CCAGGGATCT GACTCAATTG ACAGCTCCTG AATTTCTAAT 1260
ATGCCAAGGC TTTTGTGGTA AGATGAGCAA GAATTTTTCA AGCTCAGATT TGGGGAACAT 1320
AGCTTCTTGC CATGCTATCT CATTGGCATG ATGTGTGACT TTTGGGCAGA TTACTTAACC 1380
TCTGTCTATT TACTTTTTCT TTTTTTGAGA CAGGGCCTCA CTTTGTCACC AAGGCTAGAG 1440
TGCAGTGGTG TGATCTTGGC TCACTGCAGC CTCAACTTCC CAGGTTCAAG CGATCCTTCA 1500
TCCTCAGCTC CCCAAGTAGC TGGGACTGCA GGAACGTACC ACCACACCCA GCTAATTTTT 1560
TGGAGTTTTT GTAGAGACGG GGTTTTGCCA TGTTGCTCAG GCTGGACTTC TGTCTGTTTT 1620
CTCATCTGAT AATGAAAAGT TGCAATTATT TTCACAAGAT ACTTTCAAAG ATGAGTCTAA 1680
TAATGCAGAT GAGCCATTTT GAGTTCCTTA CAACAAAGAT GCTGTGGAAA TTTCAGGATT 1740
TTCCCCCTTT AGTTATAATA TGGGTAGCTT ATCCTAAGAA CCTGTGACTA TTGGGATGGT 1800
CATCTTTTTG AGGCCAGCAG TAGAAAGAAA TTTGCAGTAG TGACTGACAC ATTAAAGCAA 1860
CCCCGAAACA AATCAGAGTG AAATAGTGTC CTGGAGTTGG GGATATGTGG GTGATATCTG 1920
GGCTGCATTT TCTCTCTAGG TATCCATGGA GAGGGTCCTG TCTCCCTGAA TGGTTGTGCT 1980
TTCAACAGTT AGGGAATGAG CTTGACAGTT TCTGCTTCTT CCCTCCCCTT GCCTTGAACT 2040
GCCTTGATAT GCAGTGCCTC CTCTGTTGTG TGGCTGTATT CCAGTCCGTA AACATGACTG 2100
CTGTAAGGAG AGTACAGAGT ATTGTTTATT TTGTAAAACT TGTCTCATTG CCATGTAATA 2160
TTTGCTCAAG AGCTCCTGTT GTGGTGATAT TCTTGTGGTG AGCATGGCCC TTTAAAGATT 2220
TTGTTCTCAA ATGTTAAATG AGCCCCTGAC TGGTGTCCTG AAAAGCATTT AAGCTTCTCT 2280
CCCTAGAGTT TAAGCAAGAG GAGCAGTAAT CCCAGTGGAG CCTGGGCTGG GGTCTAGAGA 2340
GAAGGTGGCA GATGAGGTGG CAGATGACAG GCAGGGGCGG TTGTGGTCCC GTAGCTCATT 2400
TGCACAAAGG AGGGGCTGGC CTCTCCTGGG GAGGTATTTC CGCTCACTGG AACAAATGAG 2460
GGCGCTCAAA AGGCTGTAAT GTAATGAGGC TTCTCTGGTG ACGTCACTTG TAAATGTGGT 2520
CAAAGTCCAG TTCTTGGGGG CTAGTAGAAG CGGGAGTAGA GATCATTCGG TTTGCATGCT 2580
TTCACTTCTC AGCTGTCACT GTGCCATGGT GCCTACTTTC AGCCAGTGAA CCAACTCAAC 2640
TGGGCCGGGC ATGAACGCTT ACAAGTATCA GAAGTTCCTG GAGGGACTCA ACAACCTTAG 2700
AGGTATTACA AGGCTTCAGG CTCCCTACCC TTTGTCCTTG CTGATCGTGT GAGCACTTAT 2760
TATGGTGTGT ATTGTATAGG GTCTGTAAAA CCCTCCTGCT CTGAGCTGGC CCTATTTTTT 2820
ATGCGTTTAG GCAATTAAAC AGAAGGGATA GAGTTTGTAA ATGCAATCCT AAGTGAGTAG 2880
GAGAGAATCT CCTTAGGTAC TTCAGCAACA GCCTGTTGTC TTGCTTGAAC GGACAAGTAA 2940
GAAATGTCCC CTGTATTCTT GAGCTCAGAG GGCTCAGGGC ACTCCCTGTT TTCTTTGAGG 3000
TGGCCAGACA GTGTGGGTGG AGGGCTCTTG CCATAGGGCC CTGCAGCCTC ACCTAGGTGT 3060
AGTTATGTTT CTTGGGCCAG GTTTTCCAGT TGCTTGTGTC TACAGTGAGT CAGAGTCCCA 3120
TTTGGAGAGA ACTGGAGTTG GGAGTGGGGA GGAGGGTGGA GGGAGGAATG CAGGTTGATG 3180
GGCTATTTGT AAGCCCATTG TAAAGTAAGC CTTTGTAAAG AGTAAAACAA TGACTTTGAA 3240
AGAGGAAGCT TTTTATTAAA GTTTTAAAGG AAATAGTGTT TTCTTTGCAT CATGGGCAAA 3300
TTCTTCACTG ACCAGACATG AGAAGAATGT ACTCAGATGT GATGTAGGAC TCTTTTTGGA 3360
TATTAAAGAG AAAAATGAAT GAAATCTTTT TACTTTCCCT TCTCTAATTA ATAAGTGGTT 3420
TTATTTCCAT TTGCAGAGGA GGGTGCTTAA ACCATTTTTC TTTCATCAGT AGTTAGGATT 3480
CTGGACCCAG AGCAACCATG GGGTGTGGAG AGAGTGGGAG GGGGTAGAGG GAGGAAAGGA 3540
GTAAACTGGG TTTTTTCAGG GATGAGGAAA GTGGCAGACA GGGTGTGGGC AGGAGATCTG 3600
TACTCCCTTC TTGCCAGGGT ATGTAGATGT TTTACTTTCT TTCACTATCT GTTGAAGAAC 3660
TCTGGTTCTA AGAAATATAT ATGGAGAGCT TTGTATGCTA TAAAGGGATA TACAGGTCGG 3720
GCATGGTGGC TCGCACTCGT AATCCCAACA CTTTGGGAGG CTGAGATGGG AGGATCGCTT 3780
GAACCCAGGA GTTCTAGACC AGCCTGGGCA ACATAATGAG ACCCCCATCT CTACAGAAAT 3840
GTTAAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGATATG CACCTGTACC CTTAACTACT TGGGAAGCTG 3900
AGGTGGAAGG ATCACTCTGA GTTCATCTTA GAGGTACAGA ACCCAAATAA CACAGCAAAG 3960
AGCCCCAGAG TCTGGAGTGA GAAGAGTGCT GCTCTCTGGT GCTAGAGACC ATGTGAAGAA 4020
GGGAAGAATA CCCACATCTG ACTAAGCATA TGTGTAAATG CACCTTCCTC TCTGAGACAA 4080
AGAGCTGTAG TATGGGGCTT TAGAGTGAAG GTAATAGATC TTTTCTCTCC ACACTACTAC 4140
TCACCTTGAA TGGAGTTCTG TTTTCTAATC TTTCATTCAC TATTGTTTGC TTCATTCACT 4200
TATATACACT GTATAATAGT CTTTATAGCA TAAAACATAC AATATATAGC AGTTTCTCTT 4260
GTTGACCCAA AGAAAGGATC AGATTTAAAC TCTTCTTTGC TCCTGCAACC TGAGTCTTTT 4320
TCAGGTGGGA GAAGTTCCTG GAAAGAGGAC ATGTAGTTTT TTTGGTTTAG TCCTTATCAT 4380
TTTTTGGAAT GTTGCTATAG GTCTTAGACA ACTATTCCCC CAATTCTGGG CTGCCAGGCA 4440
GAGAGTTAGA TACAAACCAT TGCCTTTGTC AAATCCTCCT GTGGGTTGAG TTTCACCCAC 4500
TGTGCCCCCT GATTAAGGTG AATGGTTACT TCCCTTCTTC TTTTCACTTA ATATCTTTGT 4560
GTATTCCAGA AGGGCTGATG GAAAGAGGTA ATTGGCTCCC CTCTTCATTT AGTTACTGAC 4620
TGTTGCTTTT CTTGGCATGG TTCAGCTTGT AGACATTCCT CCATCTAGTG GGTAACTGTT 4680
GAAGGGAATC CAGTGGGAGA ATAGAGACAT TGTACAAGTT TTTGAAGTTC TGATCCCCAA 4740
ATTCCTATGA ATTTTTGGTG TTTTGATCCA GAATTGGGGT GCAATATTTT CCACTGCTCG 4800
TGCTTTTTCT GGAGGGCTTT AACTTATATT TCTCAAGCCT GTCAAAAACC TTAGTTATTG 4860
GGGTGATTTC TGGCCAGATG GACCTCTCTC ATGGGTATGA CAGGCTGAAC TATTGGCCCG 4920
AGTCCTGATT TTTGGCAGAG TCCAGACCTG TGCCATGACT GGGATAAGTA GGTAATTAGG 4980
GATTAATTAG GGAAGCAGAG AGGTAGGTGA AGTAGAGTGG TGAGAAAGTG GTTCACTAGC 5040
CTTTACTAAG AAAAATTTAT GATAGGACTA TGAGATAACT GACTTTTAAA ACAGAAATAT 5100
AATGGCCAGG TGCAGTGTCT CATGACTGTA ATCCCAGTGC TTTGGGAAGC TGAGGCAGGA 5160
GGATCAGTTG AGGCTAGGAG TTTGAGACCA TCCTGGGCAA CAGTAGCAAA ACCCTGTCTC 5220
TAAAAACAAG CAAACAAACA AAAAAACAAT ACAAAAACTA GCCGGTGGCT GGGCACGGTG 5280
GCTCACACCT GTAATCCTAG CACTTCAGGA GGCTGAGGCG GGCGGATCAC AACGTCAGGA 5340
GTTTGAGACC AGGCTGGCCA ATATGATGAA ACTCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAAAT 5400
TAGCCAGGCG TGGTGGCGGG CGCCTGTAGT CCCAGCTACT CAGGAGGCTG AGGCAGGAGA 5460
ATGGTGTGAA CCCGGGAGGC AGAGCTTGCA GTGAGCAGAG ATCGTGCCAC TGCACTCCAG 5520
CTTGGGCGAC AGAGCGAGAC TCTGTCTCAA ATTAATTAAT TAATAATAAA ATAAATTAAA 5580
AAAAAAAAAC TAGCCGGGCA TGATGGTGTG CGCCTATAGT TTCAGTTTCA GCTACTCAGG 5640
AGGCTGAGGT GGGAGGATTA CTTCAGCTGG GGGTTTCAAG GCTGGAGTGA GCTATGATCA 5700
TGCCACTGCA CTACAGCCTG GGTGACAGAG TACACCCTGT CTCTCTGTCT TTTTTTTTTG 5760
CAATCTCCGC CTCCCGGGTT CAAGCAATTC TTGTACCTCA GCCTCCTGAG TAGCTGAGAT 5820
TACAGGCATG AGCCACTGTG CCTGGCTAAT TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC 5880
GCCATGTTGG CCAGGCTGGT CTCAAACTCC TGACCTCAAG TGATCTGCCC GCCTTGGCTT 5940
CCCAAAGTGC TGGGATTACA GGCGTGAGCC ACTGTGCTCG GCCTCTGTCG CTTAAGTAAA 6000
TAGATAGATT AAAAACAAAA AAGAAGTATA CCCCAACATA CCTATGTAAT TTTACCCTTC 6060
TCTTCCTTTG CATATACTGT CTTATTTCCT CTGCCTGGAA TCCCATTATT TTTTTCTCTT 6120
TGTACCAAAT TTCTGCTCAT CTTTCAATGC CTAGCTCAAG TCTCACTTTC CTTCCGTAAG 6180
TTTTGTTTTT GTTTTTGTAT TCCCAGTAGA ATTATTCTCT CTCCCTCATC TATGTTGCCA 6240
TGGCACTTTA AACATACTTG TTTTAGAGCA TATCACATTA TGTTTTAGTT ATTTTATTAA 6300
ACATTTGATT TTCCTGCTAG TCTTTACTGC TTGGTCAAGT TTTCTATAAC TTTCATAGGC 6360
TTCAGTTTTT TCATTTGTAA GAAAGGGGAT GATAGAATTT ACTTTACAAG ATGTTGTGGG 6420
GATTAAATGA GATAGTGAAT ATAACATCTG ATGCAGACTA GGAGCCTGAT AGATGTTAGC 6480
GATACTGTTT CTAAAGGCGG GAACTGTGTC TCATTTATCC TTGAGTCTCC TTTACCTAGC 6540
ATAGTGCCTG GCACATAGTA AGCATAAAAA GAGTATTTGG GGGAATTGAA TTGAACTAAA 6600
CTCATATATT TAAATGTCCT TCAGTAGTCA CCATAGGAGG TTAAAAAAAT ATTCTAACAA 6660
TGGTGCCTAT GCTGCATACT TTTATTTAAG 6690