EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS110-02997 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
KATO3 
Coordinate
chr20:30281760-30287500 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77962418chr2030283169hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JUN(var.2)MA0489.1chr20:30284057-30284071AGGAAATGACTCAG+6.73
Number of super-enhancer constituents: 127             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30281696-30285303Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30285914-30290417Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30281733-30283797Aorta
SE_01656chr20:30286536-30289005Aorta
SE_02627chr20:30286460-30288538Astrocytes
SE_03109chr20:30286419-30287781Bladder
SE_03156chr20:30281999-30283103Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30286548-30288932Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30281567-30283497Brain_Anterior_Caudate
SE_03894chr20:30286146-30289176Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30281270-30284805Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04818chr20:30285752-30290530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30281178-30285014Brain_Hippocampus_Middle
SE_05813chr20:30285526-30290713Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30281314-30284637Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06739chr20:30286157-30289233Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30281635-30284666Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07749chr20:30285525-30290582Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30286618-30287903Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30282048-30283284CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30286373-30288569CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30281409-30284791CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14426chr20:30285971-30289231CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30281400-30284483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18483chr20:30286164-30289073CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30282128-30282868CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19226chr20:30286373-30288645CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30281650-30283580CD56
SE_20456chr20:30286524-30287948CD56
SE_20764chr20:30281711-30283729CD8_Memory_7pool
SE_20764chr20:30286371-30287968CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30281489-30283485CD8_primiary
SE_22440chr20:30286355-30289018CD8_primiary
SE_23622chr20:30281755-30283243Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30286599-30287706Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30281085-30284597DND41
SE_25330chr20:30285768-30289021DND41
SE_25933chr20:30282095-30284805Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25933chr20:30285935-30289194Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30285884-30288535Esophagus
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30280920-30284601Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30286335-30288967Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30281639-30284593Gastric
SE_31430chr20:30286060-30288986Gastric
SE_33407chr20:30278956-30284610H2171
SE_33407chr20:30286348-30287887H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30283535-30284639HMEC
SE_35852chr20:30285817-30288911HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30282089-30285312HUVEC
SE_38141chr20:30285416-30289224HUVEC
SE_39144chr20:30286359-30288952IMR90
SE_39443chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_39443chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_39853chr20:30282007-30284720K562
SE_39853chr20:30286529-30288860K562
SE_40644chr20:30281708-30285386Left_Ventricle
SE_40644chr20:30285851-30288970Left_Ventricle
SE_41648chr20:30286800-30287453LNCaP
SE_42121chr20:30281738-30285363Lung
SE_42121chr20:30285414-30289018Lung
SE_43515chr20:30277822-30284499MM1S
SE_43515chr20:30284537-30290340MM1S
SE_44365chr20:30281743-30284710NHDF-Ad
SE_44365chr20:30285831-30288996NHDF-Ad
SE_44995chr20:30282790-30284602NHLF
SE_44995chr20:30285926-30288667NHLF
SE_45708chr20:30282527-30285331Osteoblasts
SE_45708chr20:30285814-30288971Osteoblasts
SE_47264chr20:30281358-30285573Panc1
SE_47264chr20:30285629-30288991Panc1
SE_47861chr20:30286630-30287685Pancreas
SE_48182chr20:30282429-30283232Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30285753-30288791Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30282722-30283493Right_Atrium
SE_48890chr20:30283773-30284597Right_Atrium
SE_48890chr20:30286555-30288558Right_Atrium
SE_49684chr20:30286541-30287553Right_Ventricle
SE_49886chr20:30286550-30288884RPMI-8402
SE_50155chr20:30281748-30284675Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30285869-30288969Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30282135-30284696Skeletal_Muscle
SE_51509chr20:30285595-30290402Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30282308-30284717Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51884chr20:30286350-30288800Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30281728-30285346Small_Intestine
SE_52373chr20:30285428-30288947Small_Intestine
SE_53471chr20:30281646-30284749Spleen
SE_53471chr20:30285965-30288824Spleen
SE_55108chr20:30281743-30283556Thymus
SE_55108chr20:30285903-30286551Thymus
SE_55108chr20:30286561-30288235Thymus
SE_55770chr20:30281854-30284727u87
SE_55770chr20:30284749-30285388u87
SE_55770chr20:30285683-30288979u87
SE_56767chr20:30281105-30284651VACO_400
SE_56767chr20:30285910-30286508VACO_400
SE_56767chr20:30286579-30288939VACO_400
SE_57375chr20:30281767-30282407VACO_503
SE_57375chr20:30282804-30283747VACO_503
SE_57375chr20:30286582-30288547VACO_503
SE_57919chr20:30281815-30282417VACO_9m
SE_57919chr20:30286762-30287447VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30282201-30284731HSMM
SE_63683chr20:30286344-30288924HSMM
SE_64478chr20:30286331-30288179NHEK
SE_65412chr20:30281477-30282819Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30285884-30289501Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_66334chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_66898chr20:30278956-30284610H2171
SE_66898chr20:30286348-30287887H2171
SE_67146chr20:30277822-30284499MM1S
SE_67146chr20:30284537-30290340MM1S
SE_67821chr20:30281854-30284727u87
SE_67821chr20:30284749-30285388u87
SE_67821chr20:30285683-30288979u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203028176830282654
chr203028617630286226
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
AAAAAAGTGT ACTGAAACAG TGCAATACTC TGAGCCAGAA CTGTAACAAC TAACTCAACA 60
TATGCAGTGT CCGAAGGGTT AAGCCTGTTT CTCTGCCTGT GGGTGGGAGG GCAGGCAGCA 120
GCTGGGGCAC AGTGGGAGTT CCTGGCTCCA GCTGGCTCCA GCCTGGATCA AGCACCACGC 180
CCAGGAACTG GCACCTGTAG GGGGGGCTTC TGGACAGGTG GCACCTGTAG CCCTTGGTGA 240
CCTGATACAT GTGAGAGGCT GGGCCCAGTC AGATGGGTGG TGGGCTTCTG TCAGAGCCCC 300
TCCATCTGGT AAGGAAGTTT GCTGGTGGCA GCTTGGAGCT GGTGAGAAGG GGAAGAGGGT 360
CTAGGACACA GGATGGGGGT GGGGAAGGAA GTGGGTGGGC TGGGCTCAGA TACCAAGGGA 420
GGGTGGTGGG ATTAGCACCT GCTGAGAATG AGATTAGGTT TCTTGGGAAG GGCTCATCTA 480
TCTAATGCTC CCCGAAAGCT GTCTCCCTGT GGCTTTTCTC TGCTGGACAG ATGGTGTCTG 540
AGCTGCCTCT TGGAGGGCGG GCTCCTTGAG GGGGTGGTGG AGGTGGAGTG TGACCTGCTG 600
CCTGCTTTCC AGAGGACCTT GAGGCCCTGG GACTTCTTGT CTTCCAACAA TAGTAATAAG 660
GATTAGAGCT AACTCTTACT GAAGGTTTAC CATATGCCAG GCATTGTCCT AAGCCCTTCA 720
TACAAATTAC CCTCATTTAG TTTTCACAGC ACCCAACTGC CTATCATCTA GACAGTAGGC 780
TTACATTGAA GGAAACTAAG GCTTGGCAAA GTCAAACACT TGCTCAAAGT CAAACAGTAA 840
GCAGGGCCTG GTGGCGTACC TATAATCCCA GGAAGATAGA GGCGGGAGGA TCACTTGAGC 900
CCAGGAGTTC GAGACAAGCA CAGGCAACAT AGTGAGACCT CATCTCAAAA CAACAACAAA 960
AACAAAACAG TAAGCAAACT AGGACTTGAA TGCAGGCAGT TCAACTCCAC AGCCCTAGCA 1020
GGAAATCACT ATCAGCCAAG GCATCTTCCC CTTATTAAAT GGCAGTAAGG ACTTTCCAGT 1080
TTCTTAAGCC AAAAACCTGG ACTCCTTTCT CTCTCACCTC TTATCCAGCA AACATCAGCA 1140
AATCCAGTTG GTCCAACCTT CAAATTGTAT TGAAGCTCTG ACCACTGCTC GCCACTTCCA 1200
CCACCCATCC ACCCTGGTAT AAACTGCTGT TATCACCCAC CTGGCTTCTC ACTGGTCTCC 1260
TGCTCCCGCT CTTACCCATA GAGTTTGTTC TCCACATCAG AGAGATCCTT CTAAAACCTG 1320
TCACTTCTTT GCTTAAAAAT CCTCCATGCC TTTCCACTGC CCTTAAAGCA AGGTCCCATG 1380
TGGCCCTACA AGACCTGGCC CCTGGTGACG TCTCAGACCT GATTCCTACC ACTGGCTTAC 1440
TCTACTCTGG CCATACTGGC CAACTTGCTG TACTTTAAAT ATGTTGGAGA GTCTTTTTTT 1500
GTACTTGCTT TATTTTTTAA TTTTTTTGAA ACAAGGTCTT GCTCTGTCAG CCAGACTAGA 1560
GTGGAGGGAC AGGATCATAG CTCACTGCAG CCTCAAACTC CTGGATTTAA GCCATCTTCC 1620
TGCCTCAGTG TCCCGAGTAG CTAGCTAGGA CTACAGACAT GCACCACTAT GCCCAACTAA 1680
ACTCTGGCTT TGTCGCTCTG GCTGATCTCA AACTCTCAGC ATCAAGTGAT CCTCCTGCCT 1740
TGGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTATAGGCG TGAGCCACTG CATCTGGCTT TTTTTTGTTT 1800
TACGGCTTGC TGTTCTCTAT GCCTACAACA CTATTCCCCC ATATATCCGC ACAGCTCATG 1860
CCCTCACTGC ATTCAGATCC AATGTCACTT TATCAGAGAG GCCTTCCTAA CTACCCTACC 1920
CTTCCTTTTC CCATCCCTAA TCCCTTTTCT CTGCTTTATT TTTCCCTATA TCACTAAATA 1980
CTACCTCACA TGTTATTTAT TTTTTAGAGG TGGGTTGTCA CTATGTTGCC CAGGTTGGTC 2040
TCGAACTCCT GGGCTCAAGC AATACTCCCA CTTCAGCTTC CCAAAGTGCT AGAATTAAAG 2100
GCGAGAGCCA CCATGCCTAG CCCTGACATG TTAATTTACT TAAAATCTGT CACCCACCTT 2160
GGAATGTCCA CTGGGTGAGA ATAGGGACTT TGGTTCGTTC AGACTGTATG TCCAACCTTT 2220
AGCTCAGTCC CTGATATATG ACAGGAATGC AATAAATACT TGTTAATGAA CAAATGAATG 2280
AATGACCAAT ATCCCTCAGG AAATGACTCA GACTCAAAGG GGAGTAAGGC TGCCTGAGTG 2340
TCCTTGGCTT TCACAGCCCT GATGACCTTT GGTACCCCAT GGCAGCGGTC AACGTCCTTC 2400
CCTATTATGA AATGTCCTGG GTGCATAGCA TCACCACTGT GTCATCTACT TGTGCCTGCA 2460
CCCATGCAAA CACACAGGGA CACAAAGCTG GAAAAGGGCT GGTTTTGAGA AGGAGTAAGC 2520
CTGGGCAGTT GAAACCCAGG TTCGGTGTAC TCTAGGGCAC TTACTTCTAG GTGACTGTCC 2580
TTGCCACTGC TGGCGTACCA AGGTCTCCCA GTCATATGCC CATGCACTGT ATACATTTTG 2640
GCATTTATTC TCATGAATAA AGTGTCATTA GAGGCCAGAC ACTGCTGGCT AACGCCTGTA 2700
ATCGCAGCAC TTTGGGACGT CAAGGTGGGA GGACTGCTTG AGCCCAGGAG TTAGAGACCA 2760
GTCTGGACAA CACAGTGAGA CCTTGTCTCT ACTAAAAATT TAAAAATAAG CTAGTCGGCC 2820
GGGTGTGGTG GCTCACACCT GTAATCCTAG CACTTTGGGA AGCCGAGGCG GGTGGATCAT 2880
CTGAGGTCAG GAGTTCGAGA CGAGCCTGGC CAACGTGGTC AAACTCTGTC TCTACCAAAA 2940
ATACAAAAAT TAGCTGGGCA TGGTGGTGGG TGACTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG 3000
AGGCAGGAGA ATCACTTGAA TCCAGGAGGC GGAGGCTGCA GTGAGCCGAG ATCAAGCCAC 3060
TCCAGCCTGG GCAACAGAGC AAGACTCTAT CTCAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAATTAGC 3120
TAGGCATGAT GGCATGTGCC TATATTTTAG CTTCACTATT TTCACATGTA AAATGGATGT 3180
CACAGGGCAT ATGGCTCCTT GGAATATTAC ATGAGATAAC ATATTTAAAT CATTCAGCAG 3240
TATACTTAGC ACCCATGGAG TGCTCAATGG ATGGTAGCTC TGTAGATCAG CTCTCAATAG 3300
AGGGACAGGC CATTAGATAA GCTTGGGGAA GGCTTCCTGG AAAAGACTGG CTTGGTACTG 3360
GACTTTGGAG CCTGGATAGA ATATACATGA ATGTTGGCTG GAAGGAGCCT ATTCAAATGG 3420
AAGAGGGAAG AGGACAGGCT TTGGATGCTG GCAGTTTGCT GTGTAATCTT TAACAGGTGA 3480
CTTTCTTTTT TTTTTTTTTA GACGGAGTCT CGCTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG 3540
CACGATCTTG ACTCACTGCA ACCTCCACCT CCCGGGTTCA TGCCATTCTC CTGCCTTAGC 3600
CTCCCAAGTA GCTGGGACTG CAGGTGCCCG CCACCACGCC CGGCTAATTT TTTGTATTTT 3660
TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC CGTGTTAGCC AGGATGGTCT CAAACTCCTG ACCTCATGAT 3720
CTGCCCACCT CATCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACTG TGCCCGGCCT 3780
AACAGGTGAC TTTACCTCTC AAAGTCTCAG TTTTCTTCTC TGTAGAATGT GGATACCACT 3840
AGAGCATACC TCATAAAACT GTTGGGAGGA TTAATGAGGT GCTATACTGA TAAGTGGAAA 3900
CCACTGAACA GAATCCTCAG CATGTGCTGT TGCTGTTTTT TTTTTTTTGA GACGGAGTCT 3960
CGCTTTGTTG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CACAATCTCA GCTCACTGCA ATCTCCACCT 4020
CCCGGGCTCA AGCAGTTTTC CTGCCTCAGC CTCCTGAGTA ACTGGGATGA TAGGCACACG 4080
CCATCATGCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTTCACC ATGTTGGCCA 4140
GGCTAGTCTT AAACTTCTGA CCTCAAGTGA TCTGCCTGCC TCGGCCTCCC AAAGTGCTGG 4200
GATGACAGGC GTGAACCATC GTGCCCAGCC TGGTGATCCT TTAAAAATGT ATGTCGGACT 4260
GTCATTTCTT GGTTCAAAAC CCTCCAATGA CTCTTTTTTC TGAGACAGGA TTTTGCTCTG 4320
TCGCCCAGGT TGGAGTTCTG TGAGATGTGT TCATAGCTCA CTGCAGCCAT GAACTCCCAG 4380
GCTCAAGTGA TCCTCCCACC TTAGCCTCCT GAGTAGCCAA GATTATTGGC ATGTGCCACC 4440
ATGCCTGACA AATTTTTTGT AGAGATGGAG GTCTCACTGT ACTGCTCAGG CTGATGTTGA 4500
ATTCCTGGGC TCAAGTGATC CTCCCACCTC AGACTCCCAA AGTTTTGGGA TTACAGGCAT 4560
GAGCTACTGG ACCCAGTCGA TTTTCCTTCT TTTTTTTTTT GGAGACGGTC TCGCTTTGTC 4620
ACCTAGGCTG GGGTATAGTG GTGTGAACAT GGCTCACTGC AACCTTGACC TCCTGGACTC 4680
AAGTGTTTCT CCCATCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGAAT ACAGGTGCGA AACACCACAC 4740
CCGGCTAATT TTTGTATTTT TTTGTAGAGA CAGAGTTTCG CCATGTTGCC CAGGCTGGTC 4800
TCAAACTCCT AAGCTCAAGC AATCTGCCTG CCTCAGCCTC CTAAAGTGCT CAGATTACAG 4860
GCATGAGCCA CCACACCTGC CCTTTTTTGC TTTTCAATTA GTGAGTCAAG GGGAGATCTC 4920
CAATATATCT CCAATAGTGT GGTGGCTGGT CTGCTCTGAA ATGTAAGCAG TTTTTTTTTG 4980
TCCCCTTGAC CAGACTCTAA AAGTCTTAAG GTCAAAAAGT CCACAAATAA CGTTTTGTTT 5040
ACCCATCCTA CAGTGCTAGG CCTAAGCCTC GGACTTAGGC AAAGGAGATC AGAAGGGTCA 5100
TATGGCTAAA TGTAGGTGGA CAAGAGGGAG TCGGGGAGGG CCTTCCTGTG AATCCTCCTG 5160
CCTCTCAAGG ACGCTCTGTT CCCTTAGCTT GAGAAGCCTT GAGGAAAGCT TTTTCCATGA 5220
ACAAGCTTTT AAAAACCTTT TAGCTCTTTA AAAGCAGCAA GTACCATTCC AGTCATGACC 5280
CTGCAGACAG GTGGAACACC CATACTCCAG CCTCATTCTG AAGAGACTTG CAGAGCAGGA 5340
AGGAAGGGGT AATGACTTTC AGTTCCAGTA ATGTATCTAG AAGCAGCAGC TGATTCAGCT 5400
AGATGATGTC ACCTTCCCAA ACCTCCTGAC CAGCAGCTGA GATGGTAAAA GCAGGAAACA 5460
GGGGATACTC AGCTGGCTAA GTCCGAACAT GCCTCTGGCA AAGGCCTACA GTAACCCCAG 5520
GCTCTGGAGG CATCCTCCTG AAGATGAGGA GAAAGAGTCC TCTCAGCTGG GAGTACAGTA 5580
GGTGTCCTTC AAGACCCTCA AACCAAGATG CTTCTCCAAC TCTCCTTTTG CTAAGCAGCT 5640
TTCTGCATAT CCTGAACCAA CAATCCTTCA TTTATTCCAA GAGTGGAGCA GGGGAAAGAA 5700
GCCTGGCTTT AGAGCCAGCC CAATCTAGGT CCAAATCCAG 5740