EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS110-02400 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
KATO3 
Coordinate
chr19:39181260-39186550 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs34105297chr1939184669hg19
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39186290-39186308CTTTACTCCCTTCCTTCT-6.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184056-39184074GGAAGGCAGGAAGAAAAG+6.98
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184712-39184730ACATCCTTCCTTCCTCCC-7.11
Foxd3MA0041.1chr19:39182542-39182554AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39182546-39182558AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39184184-39184196GAATGTTTGTTT+7.22
IRF9MA0653.1chr19:39182019-39182034AACAAAAGTGAAACT+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39181299-39181314TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39185118-39185133TGAACTCCTGACCTC-6.22
RUNX1MA0002.2chr19:39184668-39184679CTCTGTGGTTT+6.14
ZNF263MA0528.1chr19:39186013-39186034CTTTTTGCCTTTCCCTCCTCC-6.12
ZfxMA0146.2chr19:39185143-39185157CCCGCCTCGGCCTC+6.01
ZfxMA0146.2chr19:39185758-39185772CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 81             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39182076-39185083Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39185510-39187918Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39180666-39181982Aorta
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_02408chr19:39181342-39185560Astrocytes
SE_02946chr19:39182825-39183824Bladder
SE_03166chr19:39182673-39184911Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39185728-39189384Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39182386-39185093Brain_Anterior_Caudate
SE_03903chr19:39185394-39193508Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39182350-39185068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39185423-39189876Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39182428-39185106Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39182077-39185225Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07777chr19:39185584-39193917Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_13194chr19:39183611-39184401CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39182874-39185111CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39183423-39184854CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39182491-39185050CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_20865chr19:39183372-39185109CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39182731-39184965Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39185726-39186655Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39183074-39184903Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39185750-39186483Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39182754-39183899Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39183955-39185064Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39185730-39186728Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39181947-39185064Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39185825-39186549Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39182626-39185071Gastric
SE_31384chr19:39185422-39186593Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34681chr19:39184216-39184943HeLa
SE_35430chr19:39183365-39184979HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_38896chr19:39182466-39184917IMR90
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39181143-39185634NHDF-Ad
SE_44797chr19:39181919-39184905NHLF
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_46686chr19:39182759-39183893Ovary
SE_46686chr19:39184055-39184894Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39182677-39185005Pancreas
SE_47461chr19:39185655-39186661Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39181288-39181899Right_Atrium
SE_48555chr19:39182415-39185026Right_Atrium
SE_48555chr19:39185073-39190229Right_Atrium
SE_49449chr19:39182454-39184953Right_Ventricle
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39182066-39185548Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39181511-39182336VACO_400
SE_56725chr19:39182441-39185071VACO_400
SE_56725chr19:39185122-39189741VACO_400
SE_57359chr19:39183289-39184322VACO_503
SE_57359chr19:39184333-39185048VACO_503
SE_58038chr19:39182547-39184962VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39182024-39185548HSMM
SE_64225chr19:39181233-39181937NHEK
SE_64225chr19:39182411-39185099NHEK
SE_64225chr19:39185744-39186682NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39182386-39185068H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 9             
ChromosomeStartEnd
chr193918259439182977
chr193918203739182274
chr193918414839184440
chr193918132139181446
chr193918154339181788
chr193918563039186442
chr193918249139184907
chr193918194839182010
chr193918557039186200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CTAAGAACAA AGACCCACCG GTAACAGCCA GGCTGGTCTT GAACTCCTGA CCTCGTGATC 60
TGCCCGCCTT GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACCTT GCCTAGCCTT 120
GTTCTGGAAT TAGTGGTGAT TGTTGCACGA TCTTGTGAAT ATACTAAAAC TCCCTGAATT 180
TTATGTAAAA GGGTGAATTT TTTGGTATGT TATGTGAATT ACATTTCAAT TTTTAAAAAT 240
TGATTCTCCA AATTATGTAC ATATTTAAAG AGTACATGAA AGAGAGGGAG AGAAAGAAAA 300
GCTGGATGCG AGATGCCGCA ACCTGATTCC ACTCACTCCT AGATTTGTTG AGTACCTGCT 360
ATGTGAAAGG TACCAGTCCA GGCAGTGGGT TCCCACAGCA AACAGAACCC TCCTCTGGGG 420
AGCTTATGCT GCACTTGGGA GGGAGACTGG TTATGAACAA AGAACATAGT TTTTGATGAT 480
GAAAAGTGCA GTGAGTAAAA CAATGCAGTG TGAGGCCGGG TGTGTTGGCT CACGCCTGTA 540
ATTCCAGCAC TTTGGGAGGC CGAGGTGGGC GGATCACCTG AGGTTGGGAG TTCGAGACTA 600
GCCTGACCAA CATGGAGAAA CTCCGTCTCT ACTAAAAATA AAAAATTAGC CAGGCCTGTA 660
ATCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGCCAGA GAATAGCTTG AACTCAGGAG GCAGAAGTTG 720
CGTTGAGCTG AGATCATGCC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAAAAGTGA AACTCCGTCT 780
CAAAAAAAAA AAAACAAAAA AAACAAAAAA AAAAACCCAA CAACGCAGAG TGGAGTGATA 840
GCCTAGGGGA GATGACAGAG TCCAGGAAGG CCTCCTGGGT TGCTGACATT TGAGGCAAGT 900
CCTGAGTGAT GAGACAAAAC CAGCTCTATA AAGAGCTAGA CGAAAGTCTT AGACCAGTAT 960
TTCTCATGAG GAGGAGACAG CACTCCAAAA TCCATCCTTT GGCCTGGCGC GGTGGCTCAC 1020
GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCTGA GGCGGGTGGA TTACCTGAGA TCAGGAGTTC 1080
GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGCAGAAACC CGTCTCTACT GAAAATATAA AAATTAGCCG 1140
GGTGTGATGG TGGGTGCCTG TAATGCCAGC TACTCGGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCACT 1200
TGAACCCGGG AGGTGGAGGC TGCAGTGAGC CGAGATCATG CCACCGCACT CCAACCTGGC 1260
GACACAGCGA GACTCTGTCT CAAAACAAAC AAACAAACAA AATCCGTCCT TTGCAGCAGC 1320
AACACGCACG CTTTCTGGCA CCTCAAAGGG GATTGTCCAA GACTGGAACA CTGGCTGCAG 1380
GGAGGGGGCC GGGTGCAAAG AGCTGGTTTC TGGGTGGACA CGCAGGACCT TTGGAATGCT 1440
CGCTACCCCA CTCAGCAGTA TTTATACCTC TTCTCCAACT GCGAAGTCAG AGCTTTTTCA 1500
TGCAGGCTGA GAAAACTCCG AATAAGGCAA CTTCAGGCCA GGACATAAGA CGCATTCCAT 1560
ATTTCACTGT AATTGCTTTC AAATTAGGTT ATGTCGTCAT GTAACAGGCA CACACAGTGC 1620
ACTTGCTTTG CCCCTGGCTG GGGTTGGGTC CTGGACAGGC TGCCCCGTGT GTCGCTGAAC 1680
TGCCGCAGTG CTAGCCCTGA TTGCCTGGGC AGTAGGGCTG TCTGCGTCCC ACGTTGCTGC 1740
ACCCATCTAA TTTGTGGCTG TGTTATTGTG ACCTGCTCGT TTTCTGTTCT TTCAACCTGC 1800
TTCCTGGCTT TTATCTCCTT CAGAATCTGG TGGCAGTGGA TCTTCAAAAA GTGCTCAGGT 1860
GTGCAGTCTC ACAGGCCAGA GGCTCCACGG GCCCCCTTGC CAGGGCGAGC ATCTCTGCCT 1920
GTGCCGCTGG TAACCCAGAT TCCAGAAGGC TTAGCCGTCT GGCCCTGAAA GCGCCTTTAT 1980
AGTTGGTGAT GAAGCCCATG GGCTGGGGAG CCGTTTCTGC TTTCAGGAAC TGAAAAGATG 2040
CCCCAGTGGG GCTAGGCCTT GCCTGAGGTC TGGCAATAGC CTGCCAGATG GGTGATAAGA 2100
AGGCCTACCC AGGTGATAAG CCTACCCAGG AATAAATAGC TGTACCTCCC CTGTGTCCAA 2160
GCCCTGGACA CCCTTCCCTA GGACCCATGG AAGCAGGAAC CATGGGCAGC GTCAGAGGCC 2220
ACAGCAGGCA AGGTGGAAGT TCAGGAGGTG GGACGGCGCC CTCCCCCTCA AAGCAACTGA 2280
TGCCCCAGCG GAGCGACAAA CCCTACACGG TATTTCAGAG CCAAGGTTTG AAAACTCCCA 2340
GGGTGCTAGG GAGCTCCGTC TGGCCTCCGG GTACCTGGGG TTGGGGCTGG CTGTGGCCAG 2400
TTGCAGTCAA CCCTGAGCCT GGGCAAAATG CATGCAGGCT GGTCCTCCTG GGTGATATCC 2460
TGCTAGGCGG GTGGGCAGTG TACACGGCAG AAGAGGGTTG CGGCATGAGG CAGCAAACGT 2520
TTTTTTCTAA AATCTTGTCA AGCGTGGGGT CCGTGGAATC CACATGTGAG CATCAGCCTG 2580
GTGGGTGGGG AGAGTGAAGC CTGCGATCCA GTCTGGATCA TGTGCTACAC AGTGCAGAGC 2640
CGGCATGCTC ACCCCTCCTG AGGGATCGCT CGAGCCTATT TCTAGGCCCA AAGCGACTTT 2700
GCAAGAGACT CCCTTTATTC TGGGCTTAGT GGAATTCCAG CTTCCAACAG CCATTTCCCT 2760
CCACCCCCTT CAGTTCTGAG AACATGTTTT GTAACAGGAA GGCAGGAAGA AAAGAGAAGG 2820
CGAGTTTGTT CAGCTGGGTC AGCCGCATCC CACCAAGGCC CTTTCTTCCC TCCAGCTCAC 2880
CATCGCTCTG CCCACTGGAA CCACTCGGTT GCCCTGTGTC TGCCGAATGT TTGTTTCTTA 2940
ATCAGCGCCC CAGAGTAGAG AGGGCTTTGC CTCTTCGGGT TGAGGGAGGG AATCATTGAT 3000
GAATGGCTCA TTAAAGCCCA CTGCTGCCAC ATTCCTGGGT GCTTAGGTCA CCTCCTGAAC 3060
AATATCCATC ATTCATTCAC CTACCGCCCC ACATCCTGGC GGCTGGGAGG GGTCCCTGTG 3120
ACGCAGGAAG GACTTTATGA CCAGAGATGC TAGGTCTCCG TCTCCCTCCT GCAGCCCACA 3180
GTGACAAAGC AGAAACTGCT CTTGGGGCCC CCTGAAGCCC GCCTTAGCTG GGTCACCATG 3240
GGCCTTGGCA CACGGAGGGG TGACAGTGGA TCCCAACTCA ACTGACAAGC TTGCCTTTCT 3300
CTGTTCTTCC ACCCCCCTTC CCCGCACTCA CACCCTGTGC TATTTTAGCA ACCAGAGAAG 3360
CCTCTTTAAT AGGCTGCCCG TGTGCAGGGG CAAGCTCTGA AGCCTCCTCT CTGTGGTTTG 3420
GTTCACATGT GTTCTCAAAG ACAGATGAGT CCACATCCTT CCTTCCTCCC TAGATAGGTC 3480
AAGGGCTGGG TGCAGGCTGC CTTCACAGGA GGGCCAGGGA CAGGCTGGGA GGAGCGGGGC 3540
CACCTTTTGC GAAGCGGGTG ATCTGCTGGG GCGTTGCTCT GCCTGCCTGC CTTGTTCTCT 3600
GAGTTTACCT CTAGCTTGGG GACCAAGGGT GGGCTGGGGC CTTCTTTTTT TTTTTTTGAA 3660
ACCGAGTCTT ACTCTGTCTC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC GCGATCTTGG CTCACTGCAA 3720
CCTCTACCTC CCAGGTTCAA GCGATTCTCC TGTCTCAGCT TCCCGAGTAG CTGGGTTTAT 3780
AGGAGCCCGC CACCACGCCC AGGTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGA GGTTTCACCA 3840
TGTTGGCCAG GCTGGTCTTG AACTCCTGAC CTCAAGTGAT CCGCCCGCCT CGGCCTCCCA 3900
AAGTGCTGGG ATTACAGGTG CGAGCCACTG CGCCCGGCCC TGGCTGGGGG CTTCTTGACC 3960
TGACTCTGCT GTCTCTCCCT CACTGGCCAG CACCTCCCAT TCTACTCAGA CATCGTGGAA 4020
TGAATGCCCA CCCCGTGTTT GTATGTATCA TCTGTGTCTG TGTGACATTA AGCAAGTCAC 4080
TGAACCTCTC CCTGCCTCAG TTTCCTCATC AAATGGAGAT ATATCGCATG TGATCATGGG 4140
GTTGGAGGTT TTAAAGAGTT GCTAATGTGT AAATAGTAAG AACTAGCAAT TAGCCGTTAT 4200
AGCATAATTA CCTTTAATAT GTCATGCCCC CCGCACCCCC GTGCTGAATG TAATTTTGCG 4260
GGGGGGCGGG TTGAGACAGG GTCTGGCTCT GTCACCGAGG CTGGAGTGCA CTAACACAAT 4320
CTCAGCTTAC TGCAACCTCT GCCTCTCAGG CACAAGCTGT CTTCCCACCT CAGCCTCTCG 4380
AGTAGCTGGG ACTACAGGCG CTCAGTACCA CGCCTGGCTA ATTTTTGTAG TTTTTGTAGA 4440
GATGGGGTTT TGCCATGTTG CCTAGGCTGA TCTCAAACTC CTGTGCTAAA GCAATCCTCC 4500
CGCCTCGGCC TCCTAAAGTG CTGGGATTAC ATGGTGTGTG CCACCATGCC TGGCTGGCCA 4560
GAATGTAAAT GATAACTGTT TTGCTTCCTC CTGTGTCCAG TACATAATAG GGCTCCAAGT 4620
CAGTATTTGT GAGGCAGGTG CATGCCTCTT AGTTGCGGTC CTGAGGGCAT GGCCACTGCC 4680
ACGTTCTGGA CAGTCAGAGT CGCTGCTGCC CCTGGAAGAT GACCGCGATC ATGAAGCCCA 4740
GGAGAGCTCG ATGCTTTTTG CCTTTCCCTC CTCCCACAGA GGGCTGGCAG CTCTGGTTCC 4800
TCCCAAATGA AATAGAAACC TTGAGTTTGC ATTTCTTCTT TGGCGTGCCG GCAGGGCACC 4860
TCTGCCTTCC TCTTCCTGCC AGGGGGAGGA AGTTTCTCTC AGGGGCTCTT CACCCTGCTT 4920
TATTCCTGGC CATCACACAT TGACCCTTGT CCCCTTCGGC TCTTTCCCTG CATGGCAGGG 4980
ACAGCATGAC CGTTTAATGG CTTTGTGAGG CCAGCATGCC AGCCTCACTT CTTTACTCCC 5040
TTCCTTCTCG GAGTGGGCTC TGTCCCTTCT GCAGGAGGGC TTTGGCACAT GCTCTTCCCA 5100
GTATCTGGAA GGTCTCCCTC ATTTTTATCT TATTAACTCC TCATCCTTCA GCTCAGAGTT 5160
TGAGAATGAC TTCTTCAAGG ACACCTTTCT GTGTCTGCCT CACCAGTCGC TTGGTGCCCC 5220
CCCACCCCGC CACCATGCTG ACCGCACTCT TCAGCTCCCA TCCCAGGGGA GGTGACACAA 5280
ACTCGGCCCC 5290