Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS108-39090 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | K562 |
Coordinate | chr8:38625700-38628070 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
CTCF | MA0139.1 | chr8:38625983-38626002 | TAGTGCCCTCTGGTGGCTA | - | 8.69 | RARA | MA0729.1 | chr8:38626045-38626063 | AGTGTCAAAAGTTCAATT | + | 6.43 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626697-38626717 | TGGGAGGGTGTGTGTGGTGT | - | 6.01 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627191-38627211 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627408-38627428 | TGGGTGAGGGTGTGTGGTGT | - | 6.12 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627018-38627038 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626631-38626651 | TGGGTGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626822-38626842 | TGGTGGGGGGTGTGTGTGGT | - | 6.3 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626362-38626382 | TGGGGGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.49 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626758-38626778 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38627295-38627315 | GGGTTGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.85 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626943-38626963 | GGTGGGGGGGTGTGGTGTGT | - | 6.86 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626358-38626378 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 | RREB1 | MA0073.1 | chr8:38626880-38626900 | TGGGTGGGGGTGTGTGGTGT | - | 7.51 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 10 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_00183 | chr8:38622119-38630072 | Adipose_Nuclei | SE_25871 | chr8:38622053-38630309 | Duodenum_Smooth_Muscle | SE_27135 | chr8:38624195-38629708 | Esophagus | SE_29948 | chr8:38625586-38629397 | Fetal_Muscle | SE_32046 | chr8:38627018-38629032 | Gastric | SE_42390 | chr8:38625843-38629159 | Lung | SE_46615 | chr8:38625356-38629751 | Osteoblasts | SE_50980 | chr8:38623958-38629300 | Sigmoid_Colon | SE_53926 | chr8:38626751-38628713 | Spleen | SE_54632 | chr8:38613262-38630260 | Stomach_Smooth_Muscle |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr8 | 38626109 | 38626284 | chr8 | 38627218 | 38627790 |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH08I038764 | chr8 | 38622181 | 38629647 |
|
Enhancer Sequence | ACACCCCATT CCTTCTGCTG GTCGGGATCC TGCCTCTCAG GGGTGTGTCT TCAAATCCTG 60 TGATTCACAG AGAACTTTCT GTAGCTTCTG AGAAGTTGGG AGTCTCCCTT CTGCAGTCGT 120 TCAGTGCTTG TTCATTTGTA TCTGCTGGTT AAACTGCAGT ATAAACACCC TGCATTGGAT 180 GCAGAGGGGA CTCATTGTGA CTTTTTGTAT TTATAGAAGT ACAAATGTTG AAGAAATTCT 240 CTTCACACAC AAATGTGTTG ATGGACGGTG TGATGGAACG TTCTAGTGCC CTCTGGTGGC 300 TACTGCGGCT TCCGGCTGGT GAAGCTGCAC AGCAGAAGGA ACGGGAGTGT CAAAAGTTCA 360 ATTTTTTCCT CCTCCATCCT TGATAATTGT GTGTCTTGTT TGATCGATTC CATACCCCTG 420 TATGAATGGT CCAGGGGCTG AGCAAGAAGC TGTGTCTTAG GACTGAAGTG CTTGAGGAGT 480 GTGTGTGTGT GTGTGTCAGA CAGAGAGAGA CTTTGAGGGG TATATGTGCA ATGTGTGTGT 540 GTCACCATAT ATATATGTGA AACTGTGTGT GGGAGGTATG TGTGTGACTG TGGGCTTATG 600 TGAGAGTTGG GGGTAGGTGT GGTGTGTGTG GTTATATGTG TACCAGAGAC TCAATGTGTG 660 GGTGGGGGTG TGTGGTGTGT GTGAGACTGT GTATGTAAGA CTGTCGGGGG AGGTGTGTGT 720 GTGACTGTGT GTGGTGTGTG TGACTATGTG TGTGGGGTGT ATATGTGTAC ATGAGACTGT 780 GGGGATGGGA GTGTGTGATA TGTGTGGTGT GTGTGAGACT GCGTGGTGCG TGGATATGAG 840 GCTGTGGGGG TGGAGGTGTA TGGTGTGTGT GTGAGACTGT TGTGGGGAGG TTTGTGTGAC 900 TGTGTGGTGT GTGTGTGTGT GAGAGACTGT ATGGGTGGGG GTGTGTGTGG TATATGTGTG 960 ACTAGGTGTG TGGTGTGTGT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GAGGGTGTGT GTGGTGTGTG 1020 TGATTGTGTG GTGTGTGTAT GTGTATGAGA CTGTGTATGG GTTGGGGGTG TGGTGTGTGT 1080 GACTACATGT GTAGTGTGTA TATGTGTATG TAAGACTGTG TATGGTGGGG GGTGTGTGTG 1140 GTATGTGTGT AACTAGGTGT GTGGTGTATG TGATACTGCA TGGGTGGGGG TGTGTGGTGT 1200 GTGATTATAT GTGTGGTGTG TGTATGTATA TGAGACTGTA TGAGGTGGGG GGGTGTGGTG 1260 TGTATGTGAC TGTGTGTGGT GTGTGTGTGT GAGACTGGGT ATGGGTGAGG GTATGTGGTG 1320 TGTGTGTGTG GTGTGTGTAT GTATATGTGA GACTGTGTAT GGGTTGGGGG TGGGAGTGTG 1380 GTGTGTGTAT GACTGTGTGT GGTGTATGTA TATGTATGTG AGGCTGTATG GGTCAGGAAT 1440 GTGGTGTGTG TGACTACGTG GGGTGTGTGT GTGTGAGAGA GAGACTGGGT ATGGGTGAGG 1500 GTGTGTGGTG TGTGTGATTG TGTGTGTGGT GTGTGTGTGA GACTGGGTAT GGGTGAAGGT 1560 GTGTGGTGTG TGTATGTGTA TGCGAGACTG TGTATGGGTT GGGGGTGTGG TGTGTATATG 1620 ACTGTGTGTG GTGTGTGTAT GTATGTGAGG CTGTATGGGT TAGGGGTGTG GTGTGTGTGA 1680 CTATGTGGTG TGTGTGTGAG ACTGGGTATG GGTGAGGGTG TGTGGTGTGT GTGTGATTGT 1740 GTGGTGTGTG TGACTGTGTG TATGGTGTGT GTGTGTGAGA GAGAGTGGGT ATGGGTGGGG 1800 GTGTATGATG TGGGTGTGAG ACTGCTGGGG GAGGTGCATG TGTGACTGTG CATGCGTGTG 1860 GTGTGTGTGT ATACATGAGA CCCTGTGTGG TGTGGCGTGT GTATGTGAAC ATGCGTGCTC 1920 CCTGCGCTGC CGGCTCTGGC TCTCCCCCAT CCTTCCTCAC AGAGCAGCGC AGGTTTGGCC 1980 ACAGATGTCA GGAGCCCGCG GCTTCCCTGC TGAGCTAAGA GCCCTCTTCA GGCCTTGTGG 2040 TGTCACTATA GCTGACAGTG TCAAGTCTCA CGCCCTTTAC GAAGCAGAGA GGGGTTTTGA 2100 TGCCGCATTG TTTAGCAGTA TGCAGACCTC TCCCTAGGGG CTGTAGATTT CCTGCCTTCT 2160 GAACAATCTC GAGGGGAGCG TGGATTTCCG TCCCGGCGGC ACCCTCGGGT TTTCCCTCCC 2220 CTGCCCCCTC CGCCGCGCTC TCCCCCTTCG CACATTCGGA AACCCTCTTG GGAGCTGAAT 2280 CATGTTCTCG CCTTTTTTGG TCCTAGTTGA GCTCTCTTCC ACTTTCATCA CCAGAGGCTT 2340 GAGATCTGTG AAAGAATCAG TTCCTCGCAG 2370
|