EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS108-29744 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
K562 
Coordinate
chr3:196345960-196349270 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6583331chr3196347253hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:196347929-196347941AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:196348257-196348269AAACAAACAAAC-6.32
MEF2BMA0660.1chr3:196347622-196347634GCTATAAATAGT+6.18
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09200chr3:196343621-196354385CD14
SE_13431chr3:196345771-196346649CD34_Primary_RO01536
SE_13431chr3:196346669-196347970CD34_Primary_RO01536
SE_14158chr3:196346670-196347889CD34_Primary_RO01549
SE_31236chr3:196345776-196346556Fetal_Thymus
SE_31236chr3:196346736-196347723Fetal_Thymus
SE_43316chr3:196345762-196346485Lung
SE_43316chr3:196346778-196347566Lung
SE_43316chr3:196348091-196348786Lung
SE_49884chr3:196345583-196346569RPMI-8402
SE_49884chr3:196346798-196348056RPMI-8402
SE_53988chr3:196345718-196346589Spleen
SE_53988chr3:196346732-196347711Spleen
SE_61138chr3:196331094-196372504HBL1
SE_62069chr3:196330325-196371278Toledo
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr3196347011196347384
chr3196346201196346378
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I196619chr3196345873196349070
Enhancer Sequence
GTTTGTCTTA TCCCTCTGTT GATTGCGTCC TTTAATGCAC ATAAACTTCT TTAAGCCTGT 60
GAAATTTGGG GTTGCAACTC TTCCTCCCAT CTGTGGCCCA TGGCTGCAGG CTGAGGACCT 120
TAACCTCTCT GTCCTAAATG AGTGGTATGC CTGCCCTCCT ATCTCTTTGA TGATACATAT 180
TTCAGAATAG AACTCTAAGT TCTTATTGCT GGAATCAACT TTGGAATTCT TGTCCAACCT 240
CATTTTACTC ATGGACAAAC AAGGCCCTTT GTGAGCAACA GAGCTGGATC TAAAGTGTGA 300
GCTTCTCTCT CCTTCCGGCG CTCTCTGCAC TGCGATGCAA CTCGACAAGT CAGCTGGTCT 360
TTGTAATGAA CTCCTCAGGA AACACAAGCA ATTACAGGAA AAGACAACCA GGCTATTAAG 420
AGGGAATTTT ATTCTATTGA AACTCTGTTA TGGGGAAACG TGTGTGTTTG TTATAGGTAA 480
TCTATTTACA TTTTCAAAAA CCTTTTTTTT TTTGGTAATT ATTTTATTTT ATTTTATTTT 540
TTTATTGATC ATTCTTGGGT GTTTCTCGCA GAGGGGGATT TGGCAGGGTC ATAGGACAAT 600
AGTGGAGGGA AGGTCAGCAA ATAAACAAGT GAACAAAGGT CTCTGGTTTT CCTAGGCAGA 660
GGACCCTGGG GCCTTCCGCA GTGTTTGTGT CCCTGGGTAC TTGAGATTAG GGAGTGGTGA 720
TGACTCTTAA CGAGCATGCT GCCTTCAAGC ATCTGTTTAA CAAAGCACAT CTTGCACCGC 780
CCTTAATCCA TTTAACCCTG AGTGGACACA GCACATGTTT CAGAGAGCAC AGGGTTGGGG 840
GTAAGGTCAC CGATCAACAG GATCCCAAGG CAGAAGAATT TTTCTTGGTA CAGAACAAAA 900
TGAAAAGTCT TTCAAAAACC TTTTTACTTT CTAAAAGCAA CTACACATAT TCTAGGACTG 960
CAAGTGCTGT TTTCTGGTAA ACGGGGAGTT GCTTAGAAAC CAGGAATGAG GGATGGAGAC 1020
CAACGGTCTT CTGTGGATGA AGTATAAACA GTAACTCTTC TAAGGAATCA GTACTAACCT 1080
TGGGAAGAAG ATGAGCATGA TTTTTCTCTG TACAACCTCT ACCCCTCTTC TGATGAAAGC 1140
ACCTGCTTTT CTTTAGGGCC TACTCCATCA ACAGGAGCCC ATGTCGTTTG GGTGGAGCTT 1200
CAGGAATCGG CATATGAGTC AGTCCAGAAA AATAGGCACA TCCCACCCGC CAACCACAGT 1260
GACTGATTGC GGAAGAGGCA CTTGACCCCA GGTCACACAA GGGGGTTCCG TCCTGGGACT 1320
TTTGCTGCAC TGTTTTGAAA GAGGCCTCTT TCCCCCTGGT ATTGCTAGAC TAGCAGGCCA 1380
TGGGCCCGAA ACTGCCAGAA CGCACCCTTG ATGCCACCCG GGTAGAGTCA GGGGAGAGCA 1440
GGGCTGAGAG TTGGAGACAC AGATTCCTGA AAGCATTGTT TGAGCGCGTG GATCCAGTCT 1500
TGCTTTAAAT CAGACTTTTT AGTAACATGA ACCGATCAAT TCCTCTGCTA CACCAGTTTG 1560
AGTTGGGTTT CTATCACTAG TGATTAAAAG AGTCCTCATT AGTCCAGATT GTACTTTAAG 1620
TTGCTTGTAT ACATTATCTG GAGGAGAGTA TAAAAATAAT AGGCTATAAA TAGTGAGACT 1680
AATATTAAGT TATTTTAGGT AATAAAAAGT CAAACTGATG GGAATAGTTC TGTGGGGAAA 1740
TTGTGTGAAG CTATGTTAAC AGTAAGAAAA GTGACTAGGT TTTGGTGTAA GTAAATGCCT 1800
GGTCACACAT TCGGGAAATA ATAATTTAAG TTCTATTTCT AGTATGACAC ATTGCAAGGC 1860
AAAGAATAAG TCATTAAGGG CTCTTTAAGA ACATTCAGTG CAAAGATGCT ACTGCACATA 1920
ACATATTAGA AAAGTATAAT AGAAGTAAAA CAGGTGACAA CGTTTAAAAA AACAAACAAA 1980
CAAAAAAAAA CAGGTGGCCA GATGCAGTGG CTCACGCCTG TAATCCCAGC ACTTTAGGAG 2040
GTCGAGGTGG GCAGATCACT CGAGGTCAGG AGATCAAGAC CAGCCTGAGC CAACATGGTG 2100
AAACCCCATC TCTACTTAAA AAATAGAAAA AAAAAAATTA GCGGGGGGTG GTGGTGCACG 2160
CCTGTAATCC CAGCTACTCG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT CACTTGAATC CGGGAGGCGG 2220
AGGTTGCAGT GAGCCAAGAT CACACCACTG AACTCCAGCC TGGGCGACAC AGCAAGGATC 2280
TGTCTCAACA CAAAACAAAA CAAACAAACA AAACCAACAG GTAACATTCA TCCCACTGTT 2340
GCATAGAATC ACAACGGGCC GGATGTATTC CGTCTGAGCT TCCAGATCCA CTGTCTACCC 2400
TCTCCCACCC TGCTCTCTGC TCAGCAGACC TGTGTCCTTT GTCCTCTAGC TGGGGTCCCT 2460
AAACAGGGAT CCCCGTCAGG GAGGGGAGAG TGGTCGCGTG TTTGCTCCCC TGGTTTCCTC 2520
CTGCAGGGCT TCCTCGGGGA GCTGCTTCCC TAGATCAGGG GTCACAGGGC TTCTCCAGTA 2580
GCCTCTCCAG GCGCCTGTGG ACTCTCACCT TTTGGGCTCT GATCATTGTT GCCTCCCCCA 2640
GACCTAGGGA AGTAACAGCC CTTTGGGGCA AGTCCTGGGC TCCCGCTTTG CCGTGACCAC 2700
ACTGGGTACT AGTCCCTTTA TTAAACTCTC CTCAAATTGC CTAACTTGCA GATGGCAACT 2760
GTTTCCTATG ATATGACATA ATATATCATA ACGCACGTTC TTTTTTTTTT TTGAGACAGA 2820
GTTTTGCTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGCTCAAT CTCAGCCGCT CACTGCAACC 2880
TCCGCCTCCC GGGTTCAAGC GATTCTCCTG CCTCAGCCTC CCTAGTAGCT GGGATTACAG 2940
GCACTCGCCA CCATGCCAGG CTAATTTTTG TGTTTTTAGT AGAGATGGGG TTTTGCCATA 3000
TTGGCCAGGT TGGTCTCAAA CTCTTGACCT CAGGTGATTT ACCCGCCTTG GCCTCCCAAA 3060
GTGCTGGGAT TACAGGCGTG AGCCACCGTG CCTGGCCACG CAACGCACAT TCTATGTCCA 3120
CATTTGGAAA ATTACCTTTG ATTGTGAGTG TTCAGCCTCA AGAAAACAGC AAGGCAGGCA 3180
AAGTCTAAAG GAGGGGAAGT GAAGAGATCA AGAGCTGGGA GTGTGAGCTA GAACAGTCAT 3240
ATCGGGACCG ATTAAATGTG ATGCCTGAAC TTATAATCTT CATATGAATA ACTGATCGGT 3300
TTGATTATAG 3310