Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS108-26203 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | K562 |
Coordinate | chr21:45394210-45395890 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
Foxd3 | MA0041.1 | chr21:45395612-45395624 | GTTTGTTTGTTT | + | 6.32 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394468-45394488 | GGGTGGTGTGTGTGTGGTGT | - | 6.11 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394472-45394492 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45395031-45395051 | GGTGTGCTGGTGTGTGGTGG | - | 6.39 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45394363-45394383 | TGGGTGGGTTTGGTGTGTGG | - | 6.82 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 4 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_03672 | chr21:45394858-45395433 | Brain_Angular_Gyrus | SE_05128 | chr21:45394247-45395919 | Brain_Cingulate_Gyrus | SE_06203 | chr21:45394331-45396046 | Brain_Hippocampus_Middle | SE_08184 | chr21:45394249-45395943 | Brain_Inferior_Temporal_Lobe |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
|
| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH21I043975 | chr21 | 45394155 | 45394780 | GH21I043974 | chr21 | 45394869 | 45395850 |
|
Enhancer Sequence | TAGTGTGGCG TGTGTATAAA TTACATATGT GTATGGTGTG TGTGATGTGT GTGTGGTGTG 60 TGAGGTATGG TGTGTGTAAA TTATATTTGT GGTGTGTGTT GAACTGTGTG TGGTATGTGT 120 GTATAAATTA TAAATGTGCA TGTGTGTGCA AAATGGGTGG GTTTGGTGTG TGGGGTATGT 180 GTGGTATAGT GTGTCATGTG GTGTGTGTGT AAATTATATG TGTGTGGTGT GTGTGTAGTG 240 TGTGTATATA AATCGTGAGG GTGGTGTGTG TGTGGTGTGT GTGTATAAAT TATGTGTTTG 300 ATATGTGTGG TGTGGTGTGT ATAAATTATA AATGTGTGTG TGGTGTGTGT ATATGAATCA 360 GGGTTGGTGT GTGTGGTGTG TATAAATTGT ATGTGTTTGA TGTGTGTGGT GTGTACGACA 420 TGGGGCTGTG TGTGTCAGGG ACCACAGCCA GCCAGTGTGG GCCTCTGGGC AGGCCCCTCC 480 CCTCACTGTA GACAAAGAAG CCTCTGCGCC TCGGTTGTTC CTCACATGGC GTCTGTGGCA 540 AATCCTCCCC ATGCCAGTTG AACCTGGGGC CAATGTGAAG CTGCTTTTAT TTACTGGGAC 600 GTGATGTTGT CTTCATAGCC ATCTGCTCAC CAGCATGCGG CAGAGGCTTG TGAACACTGC 660 ATGTGTGCTG GTGTGTGCTG TGTGCTGTTG TGTACTGGCG TTTGCTGATG TGTGTGTTGT 720 GCACTCGCAT GTGATGTGTA TGTGCTGGCA TGTTGCATGT GCTGGCATGT GCCAGTGTGT 780 GCACTGGTGT GTAGTGTGTG CTGGCATGTG GTATGTGTCG AGGTGTGCTG GTGTGTGGTG 840 GGTGCTGGTG TATGGCATGT GCTAACGTGT GGTGTGTTCT GGTGTGTGCT GGTGTGTGGT 900 AATGTTTTGG TGTGTGCTGG TGTGTGGTGT GTTCTGGTGT GTGCTGGCGT GTGGTATGTT 960 TTGGTGTGTG CTGGCATGTA GTGTGCTGGC GTGTGCTGGC GTGTGGTATG TTCTGGTGTG 1020 TGCTGGCATG TGTGTGGCAT GTGCTGGCAT GTGTCGGTGT GTGCACTGGT GTGTGGTGGG 1080 TGCTGGTGTA TGACGCATGC TGGCGTGTGC TTGTGTTGCA ACGAGACTCA GCTTTCACTT 1140 CTGATGGGGT GAGGATCCAT AGGTGGAATC CTCATACACC AAAGCTTTGG GTTCCTCAGT 1200 TCCTAGACAG AAGTGTGAGG CGCGTGACCC TAGAGCGTGG AGACCTGCCT GGCTGTGGAA 1260 ACCTCACCCA TGGGCCCCGC AGCTCAAGCC TGGTCTTTCC TGCTCTGAGG TGCGTCGTCG 1320 CCCCCTCCTG GGCGCTGGGA GCACTGCGGT TGCCCGTGGA CAGCAGGTTC CTACCTGTGT 1380 ATCTTAATTT TGGGTTTTTT TTGTTTGTTT GTTTTCGTTT TTGTTTTTGG CTTACAACGC 1440 AGCGATTTGC TTCTCCCTCA TAAAGGTCCA CGATGAGCCC AGACAGTGCT CGGGGCAGCC 1500 CAGCTGTCCC CACCTGGTGG CACGGGGCCG CCCTTCCTTA GCAAAGTGAT TCTCTGACGG 1560 CCGTCGCAGG GAAGAGGCAG CATTGAGCAC CCGCTGTTAA GATGCTCCCT TACGGAAGCG 1620 ACTTGTGGGA GGCAGGGATG TGTGTTTTTC TTTTCCTTTT TTTTTTTTTT AAGAGAAAAC 1680
|