EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS108-20359 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
K562 
Coordinate
chr19:39177680-39180360 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr19:39180298-39180313AGTTAATTTTTAATT-6.49
NFE2L1MA0089.2chr19:39179695-39179710ATATGACTCAGCAAT+7.68
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39177830-39177845TGAACTCCTGACCTC-6.22
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT+6.02
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39172709-39178176Adrenal_Gland
SE_05805chr19:39172836-39178090Brain_Hippocampus_Middle
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39179003-39180338CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39172843-39178692CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14624chr19:39179374-39180514CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39173158-39178239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25779chr19:39179417-39180269Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39172863-39178234Esophagus
SE_26525chr19:39179021-39179809Esophagus
SE_26525chr19:39179873-39180389Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_31384chr19:39172828-39178145Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39172846-39178074HUVEC
SE_40018chr19:39179218-39180516K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_40594chr19:39179201-39180442Left_Ventricle
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_42097chr19:39179722-39180563Lung
SE_44161chr19:39177919-39179043NHDF-Ad
SE_44161chr19:39179045-39180304NHDF-Ad
SE_44797chr19:39179102-39179721NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39172970-39178180Right_Atrium
SE_50056chr19:39172842-39178237Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39179021-39180428Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39179204-39179729Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51705chr19:39179740-39180298Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39179735-39180329Spleen
SE_56725chr19:39177711-39178272VACO_400
SE_56725chr19:39178407-39179038VACO_400
SE_56725chr19:39179083-39180391VACO_400
SE_58038chr19:39179862-39180220VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39179071-39179729HSMM
SE_63494chr19:39179752-39180316HSMM
SE_64225chr19:39179057-39180305NHEK
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193917865339178869
chr193917903439179144
chr193917945139180013
chr193917950339179787
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
GCAGCCTCCG CCTCCTGGGC TCAAGCGATT CTCTTGCCTC AGCCTCCTGA GTATCTGGGA 60
TTACAGGCGT GTGCCACCAC GTCTGGCTAA TTTTTCTGTA TTATTAGTAG AGACGGCTGG 120
TCTCTACTAA TAGTTCAAGA CGGCTGGTCT TGAACTCCTG ACCTCAAATG ATCCACCTGC 180
CTCAGCCCCC CCAAAGTGCT GGGATTACAG GCGTGAGCCC CTGCACCCAG CCCCTCTGGT 240
TCTACTGAGA CCTCAGATCT TTCATTTATG GAACAAGGGG GTTGGATTAG ATTGTTCGCT 300
CTCAGCCCTC ACTTCATGTT AGACTCACTA GGTGGACTTT GTCAAATGTC ATTGCCCAGG 360
GCCCACCTTG AGGGAATCTG TCTCATTTTG CCTGTGGTGA AATTCAGGTA TTTTTAAAAA 420
GCTCCCAGGT CCCATACATC TATTGTCAAT TGATTTTCAA CAAGGGTGCA GGACCATTCA 480
ATGGGGGAAA GAATAGTGTT TTCAACAAAT AGTGCAGGAA CAACTATTAA TAGATACCCA 540
TCTGCAAAGA ATGAAGTTGA ACCTTTACCT CACACCATAT ACAAAAATTA ACTCCAAACG 600
GATCAGATAC CTAAATGTAA GAGCTAAAAC TGTAAAACTC TTAGAAGAAA ACACAAGTGT 660
AAATCTCATG ACCTTGGGTT AGGCAATGGT TATTAGATAT GACAGCAGAA ACACAACCGA 720
AGAAAAATAG ATAAATCAGA CTGTTTCAAA ACTGGAAACT TTTTGCTTCA AAGGACACTA 780
TTAAAGTAAA AGGACAACCC GCAGAATATT TACAAATTGT ATATCTGATA AGGGTCTACT 840
GTCCAAAATG TATAAAGGAC TCTTAAATTC AACAGTAAAA AGACACACCA GTTAAAAATG 900
GGCAAAGGAT TCAAATAGAC ACTTCTCCAA AGAAGATCTA CAAATGGTCA ATAAGCACAT 960
GAAAAGGTGT TCGATGTCAT TACTAATTAG GGCAAATCAA AACCATAACC ACTACAAATG 1020
GTCAATAAGC ACATGAAAAG GTGTTCAATG TCATTACTAA TTAGGGCAAA TCAAAACCAT 1080
AACGTGGTTG GGCCTGGTGG CTCATGTCCA TAATTCCAAC ATTTTTGGAG GTAGAAGTGG 1140
GAGGATGGCT TGGGGCCACG AATTGGAGAC CAGCCTGGGC ATCATAGTGA GACCCTGCCT 1200
CTACAGAGAA TTAAAATAAA AAATTAGGCC GGGTATGGTG GCTCATGCCT GTAATCCTAG 1260
CACTTTGGGA GGCCGAGGCG AGTGGATCAC CTGAGGTCAG GAGTTTGAGA CCAGCCTGGC 1320
AAACATGGTG AATGAAACCT TGTCTCTACC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA ACCCACAAAA 1380
ATTAGCTGGA CATGGTGGTG GGCGCCTGTT GTCCCAGCTA GTGGGGAGGC TGAGGTGGGA 1440
GAATCGCTTG AACCTGGGTG GGAGAGGTTG CATTGAGCCG AGATCACGCC ATTGCACTCC 1500
AGCCTGGGCA ACAGGGTGAG ACCCTGTCTC TAAATAATAA TAAAAATGAG AAATTGGCCA 1560
GGTGTAGTAG CATATTCCTG GGAGGCTGAG GTGGGCAGAT TGCTTGAGCC CAGGAGTTCA 1620
AGGCTGCAGT GAGCTATGAT GACACCACTG TACTCCAGCC TGGGCAACAG AGTAAGACCC 1680
CAACCCTAAA ACAAAAAAAA ACAGAAAACC ACAATGAGAT ACCACTGCAC ACCCACCATG 1740
ATGGCTATAA TCAGAAAGTC AGATAATAAG TATTGACTAG GATGGGAGAA ATCAGAACCC 1800
TCACATTGCT GGTCAAAGTG TAATGTGGTG CAGCTTCTTG GGAAAACAGT CTGGCAGTTC 1860
CTCAAAATTT AAACATGTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGG GGTTTCACCA TGTCACCCAG 1920
GCTGGTCTTG TCTCAGCCTC CCAAAGTGTT GGAATTACAG GCATGAGCCA CCACGCCCAG 1980
CCAAGTTCCT CAAATTTTTA AATATAAGAG GTATCATATG ACTCAGCAAT TTTACTCCTA 2040
GGTATATGCC CAAGGCAGTT GAAAACATGT CCACATAAAA CTTGTACATG AATATTCACG 2100
GTGGTGCTAA TATCCAAAAG ATAGAAGCAA CACAAATAAT GCCCATCAGC CAATGAATTG 2160
ATAAATAAAA TGTGGTATAT CCATACAATG GAATGTTATT CAGACAGGAA CGAAGTACTG 2220
GTACATGCTA CAACATGGCT GAACCTTGAA AACATGCTAA GGAGAAGCCA AACTCAAAGA 2280
TCATATACCA TATGGTTCCA CTTATATGAA ATGCCCAGAA TAGGTAAATT GCAAGAGACG 2340
AAAGAAAGGT AGGTTAGTGG TTGCCAGGGG CTGGGGGCTG GGTAGGAGGG AAGTGGGGTT 2400
GGAGAGTAAC TGTACCAGTT TTGCGGTGGT AGACATGTTC CTTGTATTTT TGGTTTTTTG 2460
TTTTGTTTTG TTGTTTTGAG ATAAGGTCTC ACTGTCGCCC AGGCTAGAGT GCAGTGGCGC 2520
TGTCATAGCT CACTGTAGCC TCGAATTCCC AGGCTTAAGT GTTCCTCCCA CCTCAGCCTT 2580
CTGAGTAGCT GGGACTACAG GCAAGAGTCA CCATACCCAG TTAATTTTTA ATTTTTTTTT 2640
TCTTTTTCTT TGAGATGGAG TCTCGCTCTG TTGCCCAGGC 2680