EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-84251 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chrX:12995350-12998400 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SOX10MA0442.2chrX:12997038-12997049TTCTTTGTTTT-6.62
STAT3MA0144.2chrX:12997063-12997074CTTCCCAGAAG-6.14
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09612chrX:12988035-12998325CD14
SE_10462chrX:12995551-12998359CD19_Primary
SE_11231chrX:12985204-12999646CD20
SE_11864chrX:12995533-12998487CD3
SE_14440chrX:12987980-12998536CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15419chrX:12987940-12997781CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15857chrX:12988349-12997348CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15857chrX:12997372-12997927CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16331chrX:12987867-12998136CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16908chrX:12995252-12998345CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17382chrX:12984499-13005297CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17855chrX:12984353-12998827CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18339chrX:12984154-13005741CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19260chrX:12995298-12998554CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20114chrX:12995089-12998747CD56
SE_20864chrX:12990985-12998172CD8_Memory_7pool
SE_21563chrX:12990973-12997433CD8_Naive_7pool
SE_21967chrX:12987852-12998699CD8_Naive_8pool
SE_22410chrX:12995414-13001518CD8_primiary
SE_25447chrX:12988084-12998545DND41
SE_27537chrX:12996238-12997678Esophagus
SE_28103chrX:12991738-12997624Fetal_Intestine
SE_29081chrX:12991902-12997700Fetal_Intestine_Large
SE_30940chrX:12988069-12998536Fetal_Thymus
SE_31989chrX:12994880-12995690Gastric
SE_31989chrX:12996217-12997528Gastric
SE_32462chrX:12991010-12998477GM12878
SE_38726chrX:12990952-12998013HUVEC
SE_39711chrX:12995781-12997391Jurkat
SE_49904chrX:12995382-12998399RPMI-8402
SE_50189chrX:12994779-12995791Sigmoid_Colon
SE_50189chrX:12995911-12998891Sigmoid_Colon
SE_52563chrX:12995157-12995670Small_Intestine
SE_52563chrX:12995899-12997679Small_Intestine
SE_52563chrX:12997715-12998566Small_Intestine
SE_53489chrX:12988185-12995758Spleen
SE_53489chrX:12995868-12998587Spleen
SE_55209chrX:12995331-12995711Thymus
SE_55209chrX:12996307-12997625Thymus
SE_55209chrX:12997718-12998461Thymus
SE_58417chrX:12964783-13034394Ly1
SE_58905chrX:12964721-13049077Ly3
SE_60593chrX:12964761-12998409DHL6
SE_61870chrX:12964787-12998403Toledo
SE_62231chrX:12964510-13049336Tonsil
SE_66386chrX:12995781-12997391Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chrX1299680012998351
chrX1299698612997135
Enhancer Sequence
GTGTGTCTGT TTGGTTTCTG GAAGGATCGC GGATGAAACC TTTGCAAAGA GGCCTACCTC 60
TTGGTCCATT GGGGAGGGAC AAGCATCTGG TGACTGGATA AATTCCCTTA TGGCATAGAA 120
ATGGGTTTCA CCCAGGTATG CAAAATACCT TGTCTATACT AGGAGATCAT TTTCTCAGGC 180
TGATTGAATT CCTAGTATGA ATTGTGTGAG AGCTTTAATA AAAATATCTT TGCAGTTCTT 240
ACGGGTTTTG ATAAGCTGAC ATTGCACGTG CTCAAGAAAA TGAAGGTGAT AATTTACAGC 300
ACAGTATCTT ATTTCAGGGT ATCAAATTGA ACTTGGTTAT TTAACCAAGT GCTAGCATTA 360
ACATAGATGA GTAAAAATTA CATTTTTAGC AGCTGCGTTA AGAAGGAATT TAGGACTTGA 420
GCTTACTCAT TTTCTAATGG CCGGTTTCTA ATCAGAGTTC AATATTTACA ATTGCTTTAA 480
TGAATACAGT TAAGATTAGT GAACATGATT TTAAATTTAT TGGGTCCTCT TCATTTGAAT 540
AATCTTTGGA TTTAAAAGAT ACTTATTCGA TCTTTTGGGT TTAAAGGACA CTAGCAGGAC 600
ACAGGTGAGA TTTGTACTAA GTTTAAATCC AGCGGGAATT AATTGACTCA CATTTAGGTC 660
TTTGAGTCCT TGATAACTTC TCAATCATCG GAAGTAGTTA TTTTCACTGA TGGGTAAAAG 720
CAAAGTCCTT GGTGCGGGAA GACGGAAACA ACGTCAATTT TTTAAGAGTT AAAAAAAGAT 780
TTGCCATTCT ATAAGGTCCT TAATGGATTC CTCGGTTCTG TAGGGAAGGG TGGAGACTTT 840
TTTTTTTAAA TAAGCACCAG TTTTATTAAG CCGAAACAAC AGCATTTAAG AAGGCTCTTA 900
GTTCACTGAA TGTTCTGCAA AGCTAAATTT TACAACGCAA ATGTCCAAGA AGTTAAACAT 960
TTTTCTCTCA AAACCGATTT ATGAAAATAC CCTTTTTGAA GCGGAGGGGT AGGGAAAATT 1020
GTTGATCACT ATTAAATTGG TTGCTTTCAT TTCCTTTGCT CAACGCTTAT TTTGAGAAAT 1080
GCACAGGAAA CCATTTACCT GTGGTTTAGA CAATCAAGTA GACCATCAGG CTAGAAGCCT 1140
TGCTCTGCGT TGCAAGGGAA GGGGTGTGTA CAGGCTGCTG CAGAGGCTGC TACAAAACCT 1200
GAAGCGCCAC AGCCCGCTTA GCTCCGTGAA GAGAGGAGTA AGCACAAAGG TTCTGGAGCC 1260
ATCTCAAGAT GGAGACGGGC CTGGAGCCCT GTAGTTTTCT TGCCTATAGG GAAGGGTGTG 1320
GGCACAGTGC AAATGCCCAA GGCACAAAGA GAAACCATTC CCACGTGGGC TTTTGCTGTG 1380
TGCCTTTTTC AAACAATGCA AAGACGAAAG AAGATTTTAA GAAATTAACA CAGCTCCAGT 1440
GTTCCTCAGT TGAAGAAGGA ACATTTAGGA AAAGGGATAA TTCATGGACT AAAAGACCTT 1500
TCTCCCCTAG AGGGACGAAG CTAAAACATA GCACAAAAAA AAAAAAGTAA AATGGTAATG 1560
ATTGAATTCA GGCTGCTTGA CGTGTGGAAT GGGGAAATTC AGAAGCTTCT GCCCATATCA 1620
CACTCTGTAC ACTTAACTGC TGCACACGGG GATGGGAGAG AATTTATTTT TTTAATTTTG 1680
ATGGGGGATT CTTTGTTTTT CCCAAGAGAG ATTCTTCCCA GAAGGGCTGG GGGTATTTAT 1740
GAGTCAGTGT GGGGATATAT GTTCCTGCTA TGTAGGACTT GGGAGTCGAC AGTATTTTTC 1800
ACAGATACAA AGAGGACATT AGGTTTACCC TTAGAATGAG AGAACGTTGG GATTGAAGGA 1860
GACCCTATGA CTGTTTCTCT TCCCCCCAGG ACAAAACAGG CCAAGGTAGC TTAAGTAAGC 1920
CCCGAAGGTC ACACAGTTTA GTCTGGGATT TCTGCAAATT TTGAATTGAC CAAGACAAAT 1980
AAAGCAAAAA TAAAGGAAAT AAAAAGAGAC TCACTAAAGG ACCTTTGAGA TTGAGCTGGC 2040
TTCATTTTGA AATCTCGCAA ATTTGTCAAC CATCACAGCC ACATTTGCAG CCTTCCAGTG 2100
GTTGGAATTT TAAAGCTATT TTATTCTTTC AGGAGAACAA CACAGCTTTT GGGCTGTGTA 2160
TGCAAAGATT GAGTGTGTAT GGGGGGGAGG TGGGGTTCAA AATCTTCACA AACTTTGAGT 2220
CTCTCGGCTG TGTAAGAGAC CCATTATAGT CAGAATCAGG TATTGTCTCC TTTAAATGCA 2280
CAAGGAAGGT CTGTTTATTT TCCCCCAAAG AAGCATCTAA TTCCTCAAGA GACAAAAAGA 2340
AAATATTTTT GCATTTTTTT TTTCTAAACA TATGGGGTCA ATTTTGTGCT AACGAGAAAG 2400
AACAGAGCGT TTTGGAGACA ATATTACAGA CAAAGAGTAA AAATAAAAAA TCTTGAGTCT 2460
TTCTTTGTTC AAGAATGGAA ACTTCAAACG TTGTTTAAAA ACGTTGAAAG CACTCAATGC 2520
TTCATTTACC CTAGTAGCCT TCACTAGCCT AGCAAGAAAA TAAGAAAAAA CCACCCTCCG 2580
CACTCCACAC TCCCCAAATC CTTTCTTTTC GATTACACTT TCAAGAGTGG CTTACACTGC 2640
AATCTAAGAG AATCAAACAC ACCAATTTGG GACTCAACTA GGTTTTCTCT GCATGTAATG 2700
AGAAGGGGTG AAATTACAAA TGTAAGGCAG AGATATACAA CAAAGCAAGC TAGGAAGAAA 2760
ATATGTTTCT AAGACCTGTA TTTACCTAGT TTATATTTTC CTTGGACACT TGCATAGCAT 2820
TTTATTTCTG TAATCACATT GTCGTGCTAA TACCATCTTT GCCCCTGGCT TCTGAGACTT 2880
TTGTAGGCAG GGCTGGTGCA TGCCACATTC ACTGTGTGCA TACACCACGC ACTCTTCCTT 2940
CTGTGCCTCA AAGCACACTT CTCCCCTTAC TTGATGGAGA CTTCATTTTT TTTTATTTTT 3000
ATTTTTTTTG AGATGGGGTC TCTCTCTGTC ACAGGCAGGA GGGCAGTGGC 3050