EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-84247 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chrX:12973810-12976570 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chrX:12976252-12976273AAGAGCTTTCACTTTTCTTTC+6.04
RREB1MA0073.1chrX:12974393-12974413CCCCCAACCACTACCCACGT+6.06
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09612chrX:12972105-12976925CD14
SE_10462chrX:12972222-12976871CD19_Primary
SE_11231chrX:12964480-12979243CD20
SE_11864chrX:12967020-12976869CD3
SE_14440chrX:12972408-12976633CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15419chrX:12972058-12976225CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15857chrX:12970491-12974846CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15857chrX:12975338-12976613CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16331chrX:12972355-12976701CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16908chrX:12970426-12975732CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_16908chrX:12975756-12976642CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17382chrX:12964629-12977016CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17855chrX:12964647-12977052CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18339chrX:12964526-12976996CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19260chrX:12964787-12976630CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20114chrX:12964869-12976883CD56
SE_20864chrX:12972546-12976255CD8_Memory_7pool
SE_21563chrX:12973837-12976634CD8_Naive_7pool
SE_21967chrX:12967159-12977050CD8_Naive_8pool
SE_22410chrX:12965021-12976933CD8_primiary
SE_25447chrX:12972538-12976881DND41
SE_27537chrX:12973777-12975378Esophagus
SE_30940chrX:12972019-12976866Fetal_Thymus
SE_32462chrX:12972299-12977020GM12878
SE_38726chrX:12973561-12975965HUVEC
SE_39711chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_39711chrX:12975836-12976618Jurkat
SE_40111chrX:12973747-12976020K562
SE_49904chrX:12973747-12975687RPMI-8402
SE_49904chrX:12975780-12976706RPMI-8402
SE_50189chrX:12973698-12975396Sigmoid_Colon
SE_50189chrX:12975885-12976626Sigmoid_Colon
SE_52563chrX:12973689-12975337Small_Intestine
SE_52563chrX:12975401-12975694Small_Intestine
SE_52563chrX:12976051-12976611Small_Intestine
SE_53489chrX:12972019-12976836Spleen
SE_55209chrX:12973857-12975810Thymus
SE_55209chrX:12975986-12976589Thymus
SE_58417chrX:12964783-13034394Ly1
SE_58905chrX:12964721-13049077Ly3
SE_60593chrX:12964761-12998409DHL6
SE_61870chrX:12964787-12998403Toledo
SE_62231chrX:12964510-13049336Tonsil
SE_66386chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_66386chrX:12975836-12976618Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chrX1297418412974672
chrX1297485412975280
chrX1297615912976277
chrX1297619812976345
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH0XI012945chrX1296392512977022
Enhancer Sequence
TAAGTTTTCC CCCTCAGGGT AGTCTTGTCA GATGAAATAC AGGATGCCCA GTTAAATTGG 60
AATTTCACAG AAATAAAATA ATTTCTATGG TCTCAAATAT TGCATGGGAC ATATTCATAC 120
TAAAAAGCTA TTTGTTATTT ACCTGAAATT CCCATTTAAA TTTGAGGGCG TCTTCCATTT 180
TTATTGGCTA AATCTGGCCA CCCTCCCTCA GGGTGTGACG GCAGGAAGCG GGAGAGAACA 240
CAGATGTCCC CTGTTATCTC CCTGGGCCCT GCGTGGCCCT CTCAGGGAAC CACAAGCCAG 300
GGCCAAGCCC ATCCAATCCT CCTGCACCAG GAGCAGCAGA AGCCATGCCG CTAATGGCAG 360
TCACCTCGGT GGAAGTAGAG CGGGCCTGTG GCGGCGTGAG GCTTTTCTGC TCTGCTTCTG 420
TGGAAGTGAT TATCCAATAA CTAGTAGGAA TCGGGCAGTT GGCAGACGCC TCCCATGCTA 480
TAAAGCCACA CAAGGCAGGC AAGTGTGGGC ACAGATGAGA GGCTGAGAGC GGAGGTAGGA 540
TGTCACCCCT GCCCTCGCCA GCCTCATCTG TTTTCCCAGG CGTCCCCCAA CCACTACCCA 600
CGTGGATTCT CCCTCGAAGA GCCCCCTTTC AGGGCCCCAT TGGCACTTCA CTCTTGAGGG 660
AGGCCTAGGA GAAGCTAGTG GAAAGTTACT TCCACATAAA CGGTCAGACA GACGGATGAT 720
GAAACCACAG GAAACCACAG CTCCTCCCCT GCCGGGGCAC CAGGCCAGAA GCCGACCTGC 780
TAGGCTTGGG GACCCCTTCT GGTCTTGCTA GGGGCTCAGA GACCCTGGGG AAGTCCCTTA 840
CTGTGTGTCT CATGTCTTCA CTTATGGATG GGATGCCAGC TGCCCTCTCA TGCCCTCACA 900
GGGCTGTTGG GAGGCAAGGG TGAGCTAGCA GATGCAAAAT AATGGCAAAA TTAAGAAACC 960
AAGTACCTGT ACAAATGTAC ACCTTTATAG TGGTTCAATT TGGCCACACG TGCTTCTACT 1020
TAGAGAAACA CCATACATGA ATATTCAGGC ACATATACAT ATCACTATAT GATCCTACGA 1080
GCAACTTCCC TACCTCACTG AAAATATGAT TCACTTCACC AAAATGTAAT GCTATGGTCA 1140
CATTCTACAA GGAAAACATC CAAAGCACAG CCACTGTAAG TGAGGATAGT TCTCAACTGG 1200
GCCTATGGTG GGCTGGCTGA CTACACTTGC AGTCTAGAAC GGGGCCTACT GCAGACTGGT 1260
CTGCAGTTAG TTTGATCTAG GGTTATGACA GCAGTTGACT TGAAAATAAC TTTCCTCCTG 1320
CCCCTTTAAG AACACGGGTT CCTTCCCTTG CAGATAAGCA GGAAGTCCCC CTCCCTCTGT 1380
CTTGGTGCTT GGTGGTGTGT TTCACTTCCT TTCAAAGGTG TTTTCTTACT AAAGAAACCC 1440
TAAGCCCAGG GTCACATTCT GTTTCTTTCA CAGGCATACT CAACTGCGTG TTGTTGATTC 1500
TGTGACAAGT TTCTTGAGCA AGAAAATACA CAGAAAAAAT GTTAAATGTA TAAAATATGA 1560
AAGTAAAACA TCAATAATGT TTTAAATATT TAAAATATAA AAGTAATGCA TGCTTCTGGT 1620
AAAAATGTAA ATGGTAGAGG TTTCTCTATT TCCTTTCCCC AGAGGTAAGC TCTTAAAATT 1680
CCCTTCCGGA AATGGTCTCT CTACACCTCA CTTTTTTATT GCACAGAAGG GATCAGACAC 1740
TATTTATGAG GCTCTTTATT TTCCACTTAA GAGTATTCTG GCTGGGCGCG GTGGCTCACA 1800
CCTGTAATCC TAGCACTTTG GGAGGCCGAG GTGGGTGGAT CACGAAGTCA GGAGTTGGAG 1860
ACCAGCCTGG CCAACATGGT GAAACCCCAT TTCTACTAAA AATACAAAAA GTAGCTGGTG 1920
TGGTGGTGGG TGCCTCTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATTGTTTGAA 1980
CCCAGGAGGC AGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGCGCCAC TGCACTCCAG CCTGGGTGAC 2040
AGAGCGAGAC TCTGTCTCGG GGGAAAAAAA AAAAGAGTAT TCTTTGGACA TCCTTCCACA 2100
GCATATCATG AATAAATCTG CCTCAATCTT TTTTTAACAG CTGCATAGTT TTCCATTGTT 2160
TGGGTACTCT ATCATGTATT TAATTAATCT CCCAATTAAT ATACACTTAG GTTGATTGTA 2220
GCTTTTACTC TTATCTACAA TGCTATGGGG GAAAGATCTA GATGTTTGTG CATGTGTATG 2280
TATATGTATA TGTAAGTGTG TTAGTATGGC TATAGAATGA GAGTCCTGTC ACTGGACTTA 2340
AACTGGAAAT GCTGGGTTCA ACTGGAAATG CTGTTTTAAT TGTGACAGCC ACCGGTGCCT 2400
CTGAAAAGTC CCTACGAATT GACCCTTCCA ACAACAGCAT ATAAGAGCTT TCACTTTTCT 2460
TTCCCTGCAT TCTGGCCAAC TGGAGCCACT ACTCAACCTT TTCATTTTTG TCAGTCTGAA 2520
ATGAGCAGAG AGGTCCTCAT TGTTTGATTT GCATTTGAAA GCCTACCATA CACGGGCATC 2580
TTCTCATGTT GTTCTTAGCT CAGTGAGGAG GGCCTTAGAG ACCAGACTTT GGAACCAGAT 2640
AGAGCTGGAT ACCGTCCCAG CTCAGCCACT TGCCAACTGT GATCTCTGGA GCCTCGGTTT 2700
ATCCATCTGT AAAATGAGCA TCCTTAGACT AAATTCATGG GATTTACTGA GAAGGTGCAA 2760