EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-68739 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr6:36562260-36564530 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:36562902-36562912TTTAATTAGA-6.02
KLF4MA0039.3chr6:36562858-36562869ACAGGGTGTGG-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr6:36563157-36563170TTTAAGTGGTATT-6.22
YY1MA0095.2chr6:36562357-36562369GCCGCCATTTTG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12413chr6:36561017-36564952CD3
SE_13167chr6:36561024-36564533CD34_Primary_RO01480
SE_13808chr6:36560786-36565124CD34_Primary_RO01536
SE_14688chr6:36560596-36570930CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15650chr6:36560840-36565377CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16118chr6:36560812-36564800CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16533chr6:36560971-36565058CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17127chr6:36560914-36565619CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_18203chr6:36559482-36573210CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_20668chr6:36559682-36565514CD56
SE_21055chr6:36560789-36565633CD8_Memory_7pool
SE_21664chr6:36560818-36565288CD8_Naive_7pool
SE_22219chr6:36560942-36565633CD8_Naive_8pool
SE_22781chr6:36559647-36571432CD8_primiary
SE_26390chr6:36560821-36565262Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28352chr6:36560727-36566242Fetal_Intestine
SE_29430chr6:36560615-36564663Fetal_Intestine_Large
SE_30463chr6:36560728-36564587Fetal_Muscle
SE_35625chr6:36560873-36564780HepG2
SE_52665chr6:36560866-36564188Small_Intestine
SE_63018chr6:36559298-36569712Tonsil
SE_65091chr6:36560995-36566284NHEK
Enhancer Sequence
AAGAGACCAG CGAAAGAGGG AATGAGGTGG AAATGGAATT TAACAGTACC AAGGAGCCAG 60
GCCCAATGGC GGCGCCAGAT TGAGACAAAG AGGCGCCGCC GCCATTTTGT GACGTTCAGC 120
ACGGGGCGGT GGCGGGGGCT CCCGGCCCAT CGGAGGGTTT CCTAGTCTTG GAGTGGAAGT 180
CTTTATATTC CTCATTGGGG CATGAGCCAG GATGGGGGTT ACCTGGGAGT TGGGAACCAC 240
AAAGGGGAGC CGATAGCCGA GTTGTATTCC AGGTCACGGC CTTTTTATTT TTATGGCGCC 300
TTTTTTTTTT TTGGCCCCTC ATTTAATTGG GAAGCTTCTC AGAATGTTTT TGTAAAGTCA 360
CTAACCAAGA CCGGACCTTT CAGTTCATAT TAAATGGCCC CCGTAGTCAC CTTACTTTCA 420
TGTAGTTTCA GATTTTGCAG CCTGAATCTA ATCACCTTTT TCTAAGACCG AAAGATCTTC 480
CTTGAACTTA AGATTCGTTC TTTCATCGCT TCCCATTAAA ATGGAGGCTT AAGACAGGTG 540
CCAGCAGTGT TTTTAAAAAT TTTCACCAGT GGTTTGGTCT TAGAACTTAC TCCTGGGCAC 600
AGGGTGTGGT CACGGCAAAT AGGATGTGTC TGGACTGGAT ATTTTAATTA GACAAGCCCA 660
GAGTAAGAAG AACGTGGTGT TTATGGAAAG CACTTCAGCT GAATTATTGA GTAGATGGTT 720
TTTATGTAAT TGAAACTGGT CTACAAGTTT ATCAGATTCA TCGTCGAAGT GACTCAGTAA 780
TAAAGCTTTA TCAAATACAA GTCCGCCAAG GAAGAACAAA AAAATAAGTC CCCAAAGTGC 840
AGTAAATTTT TTAGTAGCAA ATATCTCTTT GTAATTTTTT ATTAAAGTGA AATTATCTTT 900
AAGTGGTATT TAGTATATTC AGTGTTGTGT AATCATCACT TACACGTAGT TCCAAAACAT 960
TTCCGTCACC TCCCCCCGCA GGAGACTACT ACCCATTGAG CACTTACTCC CAGATTCCCT 1020
GTCCCCCTTC CTCTAGTCCC TAGCAACCAC TAATCTTCCT GTCTCTCTGA ACTTAGCTAT 1080
TTTAGATATT TAGTATTTAT GGAATCGTGT ACTTTTATGT CTGGCTTCTT TAACTTAGCG 1140
TAATGTTTTC AAGATTTTCC AACGTTGGAG GATTTGTCAG TACATCATTC TGAATAATAC 1200
TCATTTTATG TCTATACCAC ATTTTGCTTA TCCGTTTCTG TTGATGGACA TTTGGGTTAA 1260
CATCTTTGGG CTACTGTGAA TAAGTGCTAC TATGAGTTTA CATTTTTTAA AAAACTGTAA 1320
AGTTGGTCTC GTTGCTTGAT AAATTTTTAC CGCGTAAGAC TCTGGTCTAT CTAATGACAT 1380
TTGATACTAG CCTTGTTCCT ATAGTTCCAA ATGACCAAAA TAGGCATTTA TTTATTTATT 1440
TATTTGTGGT TTTTTTTTGG CGATGGAATC TCGCTCTGTC GCCGAGGCTG GAGTGCAGTG 1500
GCGCGATCTC GGCTCACTGC CACCTCCGCC TCGCGGGTTC AAGCGATTGT TCTGCCTCAG 1560
CCTCCCGAGT AGCTGGGACT ACAGGTGTGC GCCACCATGC CCGGCTAATT TTTGTATTTT 1620
TAGTTGTGAC GGGGTTTCAC CATATTGGCC AGGCTGGGTC GAACTCCTGA CCTCGTGATT 1680
CGCCCGCCTC GGCTTCCCAA AAGTTCTGGG ATTGCAGGTG TGAGCCGCCG CGCCCGGTCC 1740
ATGGGCATTT TTTTAAAAGT GAAAATCGTT GGCCTTATTT TTATTAAAGC TGGTAAGTTT 1800
TGGCTTATGT AGGTACTTTG AATCGCTTGC CTGGTAGTAT AACCTTAAGG ACTAGCTTTC 1860
TTCATCATTG TTTTATTTAG TTTTGAGTCC CCAACAGAAT TCTCTTCTGT TTTTCTAGAA 1920
ATGCTTTATT TTGGGGATTA AATGAAATAA CAGGTTAAGT CTCTTAACTC ACGGCCCAGA 1980
TGGTGGTAAA TGCTCCTCCA GTTGTTCTCA ACGTTCCAAG GAAGCTGTTT TTTTCTTCAC 2040
TAATTGCTGG CTTCCTGAGG GTTAGGAGTA AAGATAATGG GGCGGGGTGG CGGGGGGGGG 2100
GAAATGGGTG CTTAGCAGTA ACATTTCTTG TTTGGTTTCT AGCATTTTTG TAATTTTTTT 2160
TTCTTTACGT GCTACCTTAA ACTCTCTTGT CCTCTCTAAT GGAGTTCTTT CTAAGGATCT 2220
GTGGTTTTAA CTGTAGATGT TTAGATGAAT GAATATTTTT GGTATTTTTC 2270