EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-65873 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr5:139054820-139059230 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3822742chr5139059017hg19
TF binding sites/motifs
Number: 34             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PLAG1MA0163.1chr5:139058399-139058413CCCCCTTGAGCCTC-6.35
RARA(var.2)MA0730.1chr5:139057466-139057483TGACTTCTAATTGACCT-6.09
ZNF263MA0528.1chr5:139056449-139056470TCCCCTTTTCTCTGATCCTCC-6.01
ZNF263MA0528.1chr5:139056078-139056099CTCCTCCCCATCTCCTCCTCA-6.04
ZNF263MA0528.1chr5:139055970-139055991CCTCCTCCCCAGGCCTCCTCC-6.06
ZNF263MA0528.1chr5:139056025-139056046CCCACCTCCTCCCCAGCCTCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr5:139055783-139055804GCCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.24
ZNF263MA0528.1chr5:139055895-139055916GCCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.24
ZNF263MA0528.1chr5:139055819-139055840ACCCTCCTCCCCACCTCCTCC-6.25
ZNF263MA0528.1chr5:139056005-139056026ATCTCCTCTCCAGCCTCCTCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr5:139055736-139055757CCTCCTCCCAAGTCCTCCTCC-6.3
ZNF263MA0528.1chr5:139055748-139055769TCCTCCTCCCCTGTCTTCTCC-6.53
ZNF263MA0528.1chr5:139055772-139055793CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139055884-139055905CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139056052-139056073CCTCCCCCCAAGCCCTCCTCC-6.56
ZNF263MA0528.1chr5:139055808-139055829TCCTTCTTGCCACCCTCCTCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr5:139055844-139055865TCCTTCTTGCCACCCTCCTCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr5:139055923-139055944TTCTCCCCACCCTCCTCCCCA-6.75
ZNF263MA0528.1chr5:139055945-139055966CCCTCCTCCCCAGACTCCTCC-6.78
ZNF263MA0528.1chr5:139056137-139056158CCCTCCTCCCCAGACTCCTCC-6.78
ZNF263MA0528.1chr5:139055957-139055978GACTCCTCCCCACCCTCCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr5:139055933-139055954CCTCCTCCCCAGCCCTCCTCC-6.93
ZNF263MA0528.1chr5:139055715-139055736TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCA-6
ZNF263MA0528.1chr5:139056031-139056052TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCA-6
ZNF263MA0528.1chr5:139056064-139056085CCCTCCTCCCCAGGCTCCTCC-7.08
ZNF263MA0528.1chr5:139055859-139055880TCCTCCCCACCCTCCTCCCCA-7.23
ZNF263MA0528.1chr5:139055960-139055981TCCTCCCCACCCTCCTCCCCA-7.23
ZNF263MA0528.1chr5:139057518-139057539GGAGGAGGGAGGGGGTGAGCA+7.24
ZNF263MA0528.1chr5:139056028-139056049ACCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-7.2
ZNF263MA0528.1chr5:139055871-139055892TCCTCCCCAGCCTCCTCCCCC-7
ZNF263MA0528.1chr5:139055868-139055889CCCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-8.38
ZNF263MA0528.1chr5:139055712-139055733TCCTCCTCCCCAGCCTCCTCC-8.5
ZNF263MA0528.1chr5:139055920-139055941TCCTTCTCCCCACCCTCCTCC-8.81
ZNF263MA0528.1chr5:139055856-139055877CCCTCCTCCCCACCCTCCTCC-9.74
Number of super-enhancer constituents: 55             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00187chr5:139052580-139059377Adipose_Nuclei
SE_03140chr5:139054437-139055772Brain_Angular_Gyrus
SE_03140chr5:139056046-139056660Brain_Angular_Gyrus
SE_03140chr5:139056739-139059366Brain_Angular_Gyrus
SE_03865chr5:139028287-139055846Brain_Anterior_Caudate
SE_03865chr5:139055996-139061963Brain_Anterior_Caudate
SE_04768chr5:139026027-139072090Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05771chr5:139026065-139074431Brain_Hippocampus_Middle
SE_06683chr5:139027027-139071104Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07722chr5:139028082-139075240Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08785chr5:139056815-139058122Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_11063chr5:139026860-139059578CD20
SE_13414chr5:139053784-139055505CD34_Primary_RO01536
SE_13414chr5:139056780-139058400CD34_Primary_RO01536
SE_13414chr5:139058435-139059304CD34_Primary_RO01536
SE_15340chr5:139054793-139055739CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20188chr5:139054283-139055773CD56
SE_20188chr5:139056880-139059135CD56
SE_25255chr5:139058189-139058964Colon_Crypt_3
SE_26221chr5:139056720-139057563Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26778chr5:139056356-139058039Esophagus
SE_27739chr5:139056202-139058212Fetal_Intestine
SE_28684chr5:139056665-139058254Fetal_Intestine_Large
SE_29581chr5:139056057-139058505Fetal_Muscle
SE_30930chr5:139053361-139055811Fetal_Thymus
SE_30930chr5:139056057-139058331Fetal_Thymus
SE_31417chr5:139056046-139059186Gastric
SE_33677chr5:139055902-139059162H2171
SE_34346chr5:139057922-139059244HCT-116
SE_36941chr5:139027373-139059446HSMMtube
SE_40649chr5:139053309-139055789Left_Ventricle
SE_40649chr5:139056032-139059400Left_Ventricle
SE_41599chr5:139057494-139058017LNCaP
SE_42197chr5:139056073-139059249Lung
SE_45813chr5:139052444-139055736Osteoblasts
SE_45813chr5:139056829-139059282Osteoblasts
SE_47229chr5:139028435-139055812Panc1
SE_47229chr5:139058326-139059295Panc1
SE_47460chr5:139056780-139058230Pancreas
SE_47460chr5:139058237-139058680Pancreas
SE_48055chr5:139051864-139055859Psoas_Muscle
SE_48055chr5:139055919-139062629Psoas_Muscle
SE_48579chr5:139055935-139059336Right_Atrium
SE_49460chr5:139056809-139057877Right_Ventricle
SE_51090chr5:139054441-139055802Skeletal_Muscle
SE_51090chr5:139055934-139059157Skeletal_Muscle
SE_53351chr5:139057715-139058567Spleen
SE_54845chr5:139055998-139057753Stomach_Smooth_Muscle
SE_55117chr5:139056107-139056654Thymus
SE_55730chr5:139057497-139059261u87
SE_58504chr5:139012442-139092243Ly1
SE_63555chr5:139056584-139057808HSMM
SE_65250chr5:139036623-139059169Pancreatic_islets
SE_67548chr5:139057497-139059261u87
SE_68692chr5:139057230-139059117H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr5139058350139058600
chr5139056887139057262
chr5139057354139058068
chr5139055823139056431
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH05I139674chr5139054284139055802
GH05I139676chr5139056126139059178
Enhancer Sequence
GCCACCTGTG TACATGTCTG TGTGCAGATG GCACTATGTC ATCCCAGGAT GTCCCCTCCT 60
TCCCAGTGCT TTCTGGCCCG AGAGTTCAAG ATTGAACCCT GCGGGGGGTG AAGTGAGGCT 120
CTTCTAGGGC TGAGGGTTGA ATAAGGGCAC TGCCACCACC TCCAGTGACC TCACTGCCAG 180
CTGGCATTAT GATGTCACTG GCTTAGCATT CCAGGCCCTG GGCATCTCCA AGTGCCCCAG 240
GTGGGGGCAC TCTCCTGGGG TCTGTGACAG CTTGCCCCCA ACCACGGAGA GGTGACAGGC 300
ACGGTAACAA TCCTGGGGAG TGAGAGCAGC CTTAGGGGTA CCTAGGTCAC CTGCCTTGGG 360
CCACTCTGTC AATTGCAAAA GTGGCCACAG AACAGGGTGA CTAACACTTG GGCTCTGGGT 420
TCAAGCTCTA CCCCTGCTAG GCACCAGCTG TTTGACCTGA GGCTGACAGC TTGAACCTCT 480
CTGAGCCTAA ATTTCCTCAT GTCTGAAATT GGCAAATAGT TTCTGTCTCC CGGGGTTCTG 540
GGGAGGCATT CAGAAGCTAA GACATGTAAA GCATAAAAGC ACAGGGCCTG GGACACAGTA 600
GATACTCAGT AAATGCTGGT TGATAGGATC CGTTGGTTAA GGAAACCAGA GTGGCAACAC 660
AGGTGGTGGG GGCTGGCTAG AAGGGGGCAG GCTCCGTGCC TTCTGGGGCT GGCCAGAGCC 720
TTAGGGTAGA GGCACGGGGT GGCCTCCACT GCCAGGAAGG TGGCCCCAGG TATGAGTCTC 780
CCTCCTTCCA GCTCAGCCAG TTAGCTGGAG CCTACAGGAG GCATTGGGCC CTGCAGCCAT 840
GCTCTGGGGC CAAGAACCCA TTACCCCCCA CCTCCTCCTC GGTACTCCCC AGTCCTCCTC 900
CCCAGCCTCC TCCCCACCTC CTCCCAAGTC CTCCTCCCCT GTCTTCTCCC CACCTCCCCC 960
CAAGCCCTCC TCCCCACCTC CTCCACAGTC CTTCTTGCCA CCCTCCTCCC CACCTCCTCC 1020
ACAGTCCTTC TTGCCACCCT CCTCCCCACC CTCCTCCCCA GCCTCCTCCC CCCAAGCCCT 1080
CCTCCCCACC TCCTCCCCAG TCCTTCTCCC CACCCTCCTC CCCAGCCCTC CTCCCCAGAC 1140
TCCTCCCCAC CCTCCTCCCC AGGCCTCCTC CGCAGATTCC TCCCCATCTC CTCTCCAGCC 1200
TCCTCCCCAC CTCCTCCCCA GCCTCCTCCC CACCTCCCCC CAAGCCCTCC TCCCCAGGCT 1260
CCTCCCCATC TCCTCCTCAG TCCTTCTCCC CAGTGTCCTC CCCACCCTCG TCCCCAGCCC 1320
TCCTCCCCAG ACTCCTCCCC ATCTCCTCCC CACCTCCTCT TCTCAGGCCT TGGGCTACAC 1380
AGTGGGTCTG ATCTGGTCTC CTCGCCACTT CTCCTCTACC CTTCCCTCTG CCTCCCTCTC 1440
CTGTGGGCAT GCCCAGCTGC CTTCTGGGAT TCCCTCCTTA GGGCTGTTTC CTTGTCTTTT 1500
AGACCCTCAA GTCCCTGAGC CTGGACAAGG TGTCCTGGGT CCCTGGGTCT CTGAACCCTG 1560
TTACCCCAGA CACTGCTTCC CATGACACTG TCTCCACTAA CCTTGACCCT CTGCCCCTTC 1620
CTCTCCAGCT CCCCTTTTCT CTGATCCTCC CCTCTAGTTC TCTGTCTCAT GATTCTGTCC 1680
CCACCACCTG TCTCTATTCT GCCCCCGCAT GCCCCTCTGC CCCCCAGCTT TCCATGACTC 1740
GTCCCCCCTC AGCCCCCCGT GCTCTGTCCC CGCCCGTCAG CCCCTGGTCC CAGCTCCCGG 1800
CTGGCCGGCT CCTGCATGGA CAAAGGGGTC CTTTGTGGGC TGACCGCGGC TGGCGGGGCG 1860
GCGGGGCGCT GGCTCCGCAT TGCTGATGAA ACGGAGCCCT TTGTTGTCCC TCCTCAGGCG 1920
CAGTATTTCT TTTTGGGGGC TGGATGTGTT CCTGGCAGGG CCGATGATGG ATGCGCCCGC 1980
CGCCGCCCGC CTGCCCGCCA GCTTTCCCTC CCGCTCATTC CCGCTCCGCT TCAACGCAGC 2040
CCTGACTCCT CCCCTGCTGC CTGGGCACTG CCAGGCCCTT CCTGGCCTGG AAGGGGATGG 2100
CTGTGTGCCC TAGAGTAGAA GACTGGGACC TGGGAGAACG TCCCCTCTAT GTCCTCCTCT 2160
TCCATGAGTA GGGCAAATGG GGCTTTTGGT CAGGGGTCCA CTGGGACCAG GACATCAGTT 2220
TTTCCTAAGG TCTGAAGGAG AAGATGAGCC AGGTATCAGG GCCGATTTGG AACAAGCTTG 2280
AGGACCAGAT GTTCATGTCT GTCTACTCTG GATTTGAAAA CAGAGTTGTC CCTGTGAGCC 2340
AGTCCCTCCG TGTACCCACC TCCCTTCAAC TTCTGTGGCT GAAAAACCAT AGTGTTCTGC 2400
CTGCAGCACC TGTTTGGTGA CATATCACAT CCTCTGGTCC CAAGCTCAGT ATGTCCCAGG 2460
ACCTCAGAGG CTGGGGGTGG GTGGGCCCTG AAGAAGGATA GAATAGTGGA AGATCAGAGA 2520
AATTCCAAGA GAGGAACAGA ACATGAGGTT TGGTCCCCAC CAGGAGAGAC TCAGGACGGA 2580
GACAAAAGCC GAGACACTCA GCCAGAGCGC CAGCCCTGAG CGCAGGCCGG CTGTGTTGGA 2640
AGGAGCTGAC TTCTAATTGA CCTGCCCGCC CCGCACGCAG AGCCAGATCC TGGAGCTGGG 2700
AGGAGGGAGG GGGTGAGCAG AGCAGGAACA GCGTTAATGC AGCTATCGAT TTCTGCCACC 2760
AGCCAGCAGG CCGCAGAGGC GGGGGACGCA CACAGGGGCT GGGGCGCAGC CTGCTCCCCT 2820
CCCCATCTCT GCAGCCCACA AGACACCTGC CTTCTGCCTT CTCCCCTCAC CCAGTATCTG 2880
GGCTGCCGGG GTTGTCGTCC AGGGCAGGGC AGATGAGCTT AGTTGGGCAG GAGCTGGATG 2940
AGCTGACTTG ACGGTTTTTG TCCCTGATCT CACTGACCCT GGTCCCCAAC AACTAGCCAG 3000
GGTCACTGAT TCCTGAAAGG GTCACCAGTC TCTGAGGAGA GGGGCTGAAA AGACCATCCT 3060
GGTCTTGGCC GTTATGAGGT GGGAGGGAAC ACAGCTATCC TTGGACACAC ATGGTCTTCT 3120
TGCTTCAGCT CTGACCTCTG ATGCCCCCCA ACCCAGCCTG GATTCCCTGC CAGGGCCCCC 3180
CGGCTCTGTC CTGGTGGAAT CTGCCATCTT GCCCAGCTCT TCCTCCTCAC CCATTTCCCT 3240
CTGCTAGGAA GGAGCCCTAG GTGGTCTGGT GCCCACTGGG GAGGGACAGG GAGTATCTGA 3300
CTGTTGATGG CGGCTACTCG CCTCACCCTA GAGACAGAGC TTTTCCTTTC CCCACACCCG 3360
GTCCTCTTTG GCCACTCCTT AGTCCTGGGG AAGCCCCCCC TCCCCCCCGC TTGGGGCCTC 3420
AGTTTCCCCC TCTGTAAATG CAGAGGGTTG GACTAGATGC TCTCTTGGGA CAGGCTTGAG 3480
TCCTGTGACT AGGGGGGTTT TGGGGTTGCC TGGGGACAAA GATCCAGTGT GTGCTGCCCT 3540
CAAGCCCAGG GCGTGATGGG GCCCGCCAGA TGTGCGCCTC CCCCTTGAGC CTCCAGCTGC 3600
TCTGGGGCTG GGCCCTGTCC TCCCACCCCT CTCTTGGGGC ATGCTAGGCC ACAGCAGGCA 3660
GACAGGGAAG CAAGGCTGGA GAGCCGGGAC TGATGAGGAA ACCGCCGCCT TGCTCCATCT 3720
GGCCCAGTCC CTTCAGCTGA GGAGGCAGCT CAGACGCCTT AGCCTTGAAA CCTGAGTAGA 3780
GCAGGCCCTG CCCCGGGATG GGCTGCCTTG GAAATATGGA GGTGGCCAGA GGACAGGCTC 3840
CTGCTGGGCT CCATTCCCTT GAGGGTCACG CCTACTCCTC AGTGCCAGCC TGCCCCAGCC 3900
AGAGGTCCCT CCTGGCAACA GCCCACCCCG GCTCTCTGGG TTCTCACTGA GACCTCCACC 3960
CAGGCCCTAC TCTGCAGGCC TTGTGAGGCC TCTGCCCACC ACCGCCCCCA ATCTGGGAGC 4020
CAGGCCAGAG CACCACAGTG AGGCCTGAGT AGAGACAAGA ATGAGGTCTG AGACGATAAT 4080
GATTGTGGTT CGGGGGTTGA GAAGGAAGCG TGTGCCAGGG TGTGCACAAG CATGTCCTCT 4140
CACTGTGGCA GGGGACGGCT GGTCCTCTGG CCCTGTGCTG CTCGCCCTGT AGCAGGCGGG 4200
GAGAAGATCC CTGAAATAAG GGTTCTGCAC TCATTGGCAA ACTGGGTTAC ACAAAGGCAA 4260
CCAGGTTCCT TTGCCTGCAG GACATGTCAG AGCCTTGAAA TAACTGATGT GTATTAGTAA 4320
TCCCCAGATG AGGATCCAGG GGCAGCCTTC CAGACTTAAT GATCTGTACC ATCAAGCACT 4380
CTTCTCCTCA GATGGAGAAG GAAGATTAGG 4410