EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-60096 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr4:38675140-38677940 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs552599526chr438677013hg19
rs68191221chr438677062hg19
rs34089598chr438677227hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr4:38675424-38675435ACAGGGTGTGG-6.14
Nr5a2MA0505.1chr4:38675258-38675273GATGGCCTTGAACTT-7.55
Stat6MA0520.1chr4:38675963-38675978GTTTCTCTGGAAAGG-6.34
ZNF263MA0528.1chr4:38676435-38676456TCTCCACCTTCCTCCTCCCTC-6.97
ZNF263MA0528.1chr4:38676432-38676453CTCTCTCCACCTTCCTCCTCC-7.87
Number of super-enhancer constituents: 40             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00335chr4:38663539-38678192Adipose_Nuclei
SE_04596chr4:38671524-38677971Brain_Anterior_Caudate
SE_05689chr4:38670043-38677962Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07401chr4:38665540-38678122Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08638chr4:38670091-38678081Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_12423chr4:38671540-38675431CD3
SE_13081chr4:38675669-38676894CD34_Primary_RO01480
SE_13626chr4:38671439-38677238CD34_Primary_RO01536
SE_14340chr4:38675591-38677021CD34_Primary_RO01549
SE_14634chr4:38665539-38677376CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17489chr4:38659574-38677981CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18991chr4:38665635-38678125CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20502chr4:38671532-38677609CD56
SE_21014chr4:38665609-38677219CD8_Memory_7pool
SE_22143chr4:38671856-38675608CD8_Naive_8pool
SE_22845chr4:38662943-38677487CD8_primiary
SE_23162chr4:38671574-38676902Colon_Crypt_1
SE_23162chr4:38677173-38677563Colon_Crypt_1
SE_23890chr4:38673705-38675623Colon_Crypt_2
SE_23890chr4:38675649-38676758Colon_Crypt_2
SE_24758chr4:38671558-38677338Colon_Crypt_3
SE_24758chr4:38677421-38677824Colon_Crypt_3
SE_25872chr4:38665634-38678083Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26762chr4:38671535-38677734Esophagus
SE_27686chr4:38662858-38677914Fetal_Intestine
SE_28628chr4:38665609-38678154Fetal_Intestine_Large
SE_29808chr4:38671469-38677893Fetal_Muscle
SE_31613chr4:38671547-38676965Gastric
SE_36665chr4:38673088-38677170HMEC
SE_37466chr4:38672662-38681491HSMMtube
SE_40278chr4:38672274-38676989K562
SE_41226chr4:38671603-38677067Left_Ventricle
SE_49111chr4:38671659-38676879Right_Atrium
SE_50241chr4:38671433-38677050Sigmoid_Colon
SE_52450chr4:38671441-38677154Small_Intestine
SE_53561chr4:38671414-38677060Spleen
SE_54879chr4:38665563-38677855Stomach_Smooth_Muscle
SE_57521chr4:38676141-38676685VACO_503
SE_62955chr4:38655747-38677540Tonsil
SE_64563chr4:38671455-38677954NHEK
Enhancer Sequence
CCCTTAAAAC TAAAACACAA AATTGTCAGA GAGCATAAAC AAGTGTGTAA CCCTAGTAGG 60
GAAAATGATT CGAGTTTGCT GCAGTTTCTC TAAGAAGGGT GTGGAATGCC ACTAGCCAGA 120
TGGCCTTGAA CTTAGAGGGT AGCATAGGTG TGGGTGTCCC CGCCCCCAGC CCTGCTTTGC 180
TAGGCCTCAG TTTGGAAACT TGTCAGGCTT CTGCTTGGTT GTTACCTTTG CACCTGTCCT 240
TATTGACATG CAAAATCAAT TGCTTCACTT GGTCTTTCCG AAGTACAGGG TGTGGGCAGA 300
ATCTTATCTG AAGCCATGTC CTGTTTGGAC AAGTTGGACT TGCCTTGGCA ACTCTCCATA 360
GGGTGGAGCA GATGGGTGGA GGCAGGAAAG TAAAATTGGG TGGCTTGTTA GCAGAGAGAG 420
GAGAGAGGGT GGGTTGTTTG CTCACTGGAT CATTATATTT CATCTGAAAT GAAATAATTA 480
ACTTCTTTCC CATTTATAAT ACACATTAAT GCAAAATAAC TAATTCATGA GGGGCGAAGA 540
TTTAGAAACA CCCCATGGAA TTTTTCTCCT TTTCAAACCA GTCATAGAAG AGTAGGACAG 600
GTGAAAATCA CAGAGTGGCA TGAAAATTTC CAAGAATGTC TAGGTAGGAA ATTCCAGGTA 660
GGTGCCAGTG CTTAGCTTTG TTTCAGGGAG CCTCCAGCTT AAAAATGCCT GCTGACATCT 720
GTTGCCTGTC CCCTGTATTT CTGGCTAGGG CAACTGTCCT TAAATAATAC TTGAGCCATT 780
GGGGGATTTT GAAGAATTTG GGTAAAGAAA CGAAGAGAGA AAAGTTTCTC TGGAAAGGAA 840
GTTTAGCTAC AGGGATGTTG CTTGCCTGCC CAGTTTTCCT AGCCAAGAAT TACACACACA 900
CATGCACACA CCGCCTTTTT TTTTTTTCTT TTTTTGCCTT AAGTTCCTTT GGGGAGTAAG 960
GGTAGGGGAA GATAACATGT TTTCTCTTTG AAAAATCCAA AAACTTAGAA GAGTTGAAAG 1020
GGAGGCTTAG CGATGGTGTG TTAGTGTATT GCTCCGTATG CCTAGCCGAG GTCAGCTGGG 1080
AGACGGAAGT TTGCTTGGAG GAAGGCAGGT GATTTGGAGC CTCGGGGTCA GTCCTGGGTT 1140
GGGGAAGATA ATGCAGGCAC CCTTTGAGGA TCTGTGGGAA GAAATGAGGG CATGGAGAAA 1200
GGAAGAAATA GGGAGATGAG AAGGGAGAAC GTCAGAGGCA GGTCTTGCTC TAACCCCAAG 1260
AAACAGGAAA CTGCTCCTGA TACGTACACA TTCTCTCTCC ACCTTCCTCC TCCCTCAGGA 1320
AGGGGCAGGC AGTTGTCTGT AAGGTCGTTT CTGTAATAAA TCATGCTCTA GCCTCCAGGC 1380
AAGCTGCTTT CAGAGGAGGT TTAGTAACCC CCTAACCTCG TCTTCCATGA AGGACTGTGT 1440
GTGTGTTTCT AAGCCCTGCA GCTCACCTGC AGCCCCGCTC CCCACTCCAT AAAGCCATTG 1500
TGCATAGGTC TCAGACACCA CTGGATAGGG CTCCAAAGCA GGACTGCATT ACTTCTGAAA 1560
CTTCATGTCA ATGATTCACC AACCCTTTTA ATCTATAATC ACGCAGTCTT GCATTTTGAC 1620
AGAAATTTGA CCCTTATTTT AACATCTGAA AAGTCAGAAG TGCAGGTGGA AAGAGCATGA 1680
AGGGAAATCT GTTTCTCCTT TTTGAGGACC ATTCATTTTT ATTGGCCTTT CTCTGCAAAA 1740
TAACACAGCT GGGGAAGATG GCATTTGCTC CAGTTATGGA AAATTATTTT GGCGGTGGTG 1800
ATGTTCCTGT ATATTTTTGC TTTTAAGCAC CTCAATAACT TAGAATTTTT CATAAAAACA 1860
ATTTTGCCCT TCCCCCCCCT TTTGGATGCA GTTTTGTTAT CCTGGTATTG CTTAGTTTAG 1920
CATTAGAATG TATTTCTAAG ACTAGCTAAT GTATTTCTAA AGCTAGCTAA GCTAGTTAAA 1980
TATAATGAAG ATGTAAATGT GTTTATGATT GGAAAATAGT CGTCAGAAAA AAATAGAACC 2040
ACATTTAGAG CCTCCTCTTC TCTGTGATAC CCACATAAAA TGATTAATAG AATTCCTGAG 2100
CCTGGTTAAA ACCCACTAGG TTTAAAGACC CCGAGGTTGG CCAACTGGAT TGATTTACTG 2160
CCGGTGTCCT GGTCTCTAAT GCCTGTTTTA GTGCGCCACC TACTGGTTCT GCTTCAGATT 2220
GCCGTCAGTA CTGTATGATA GATTTTCTAA GCATTTGTGG TTTACTTAGC ATTCTTTCAG 2280
AATGGTAATA ACCCCAGTGC ACTGAGCCGC CCATGGGTAC CAAAGACTGC CAAGTTTAGG 2340
GACCCTAATT CTTCCAGGGC TTAAGTTACT TCTCAGTTAT GTGGAAGGCA CTTTGAAGAC 2400
TGTACAGTCA CTCTTTTATG ATTGTAGATC AGAACCTGTA AACAAATTAG TACCAATGAC 2460
AAAAGTGGTC CCTGTAGTCA GAGATATGGG TGCAAAGTAT AGAAATTTTT TGCAAATACA 2520
TAAACAGAAG CCTCATTTCT GTTCATGTGT TTGATTCTGT TTCTAAATTT AGTTCCTTCC 2580
TAGCTTGGCT TCCCTATCTT GTCTTTGTTA AAAGTTTTGA TTATGGAAAT AATAAACTTG 2640
GCCGGGTGTA GTGGCTTACA CCTGTAATCC CAGCACTTTG GGAGGCTGAG GCAGGCAGAT 2700
CACTTGAGGT CAGGAGTTCG AGACCAGCCT AGCCAACATG GTGAAACCCC GTCTCTACTA 2760
AAAGTATAAA ACTAAGCCAG GAGTGGTGGT GCATGCCTGT 2800