EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-55529 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr3:50273890-50277400 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs62260798chr350274278hg19
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:50275472-50275483GGGCGGGAAGG+6.62
ELK1MA0028.2chr3:50275631-50275641CACTTCCGGT-6.02
ELK4MA0076.2chr3:50275630-50275641GCACTTCCGGT+6.02
ERGMA0474.2chr3:50275631-50275641CACTTCCGGT-6.02
ETS1MA0098.3chr3:50275631-50275641CACTTCCGGT-6.02
FEVMA0156.2chr3:50275631-50275641CACTTCCGGT-6.02
FLI1MA0475.2chr3:50275631-50275641CACTTCCGGT-6.02
FOXP1MA0481.2chr3:50276699-50276711ATGTAAACAGAG+6.32
FOXP2MA0593.1chr3:50276699-50276710ATGTAAACAGA+6.02
Hnf4aMA0114.3chr3:50273937-50273953CAAGGACTTTGACCTC-6.4
ZNF263MA0528.1chr3:50274336-50274357CCACCCACTCCCTCCTTCTCC-6.15
ZNF263MA0528.1chr3:50274844-50274865AGAGGAGTGGGGGGAAGTGGA+6.21
ZNF263MA0528.1chr3:50274339-50274360CCCACTCCCTCCTTCTCCTTC-6.73
ZNF263MA0528.1chr3:50274333-50274354CCCCCACCCACTCCCTCCTTC-7.07
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00328chr3:50272275-50294504Adipose_Nuclei
SE_00924chr3:50273461-50278126Adrenal_Gland
SE_01672chr3:50273581-50277451Aorta
SE_02846chr3:50273457-50276188Astrocytes
SE_03020chr3:50273565-50276821Bladder
SE_03205chr3:50273746-50276414Brain_Angular_Gyrus
SE_03917chr3:50273547-50281586Brain_Anterior_Caudate
SE_04864chr3:50273515-50278097Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05809chr3:50271925-50313735Brain_Hippocampus_Middle
SE_06748chr3:50273436-50277740Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07819chr3:50273449-50289446Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08798chr3:50274242-50275288Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08798chr3:50275715-50276190Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09475chr3:50273514-50296642CD14
SE_13800chr3:50273539-50278274CD34_Primary_RO01536
SE_17710chr3:50272093-50288404CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18113chr3:50272067-50287604CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18975chr3:50273503-50289925CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19368chr3:50273524-50278182CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22929chr3:50273764-50281576CD8_primiary
SE_23202chr3:50273573-50276314Colon_Crypt_1
SE_23879chr3:50273600-50274322Colon_Crypt_2
SE_23879chr3:50274326-50276225Colon_Crypt_2
SE_24968chr3:50273385-50274871Colon_Crypt_3
SE_24968chr3:50275240-50276066Colon_Crypt_3
SE_26040chr3:50273448-50277871Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26665chr3:50271938-50278049Esophagus
SE_29626chr3:50273536-50282572Fetal_Muscle
SE_31450chr3:50271960-50278114Gastric
SE_33322chr3:50274708-50275988H1
SE_34350chr3:50271901-50276757HCT-116
SE_34830chr3:50273462-50277325HeLa
SE_36596chr3:50273453-50276986HMEC
SE_38192chr3:50273512-50288122HUVEC
SE_40718chr3:50273505-50281595Left_Ventricle
SE_42127chr3:50271906-50288361Lung
SE_45312chr3:50273580-50276938NHLF
SE_47551chr3:50273572-50276896Pancreas
SE_48477chr3:50272015-50277902Psoas_Muscle
SE_48622chr3:50271985-50278174Right_Atrium
SE_49541chr3:50273530-50276721Right_Ventricle
SE_50198chr3:50271944-50278187Sigmoid_Colon
SE_52519chr3:50271978-50278182Small_Intestine
SE_53321chr3:50271955-50288381Spleen
SE_54862chr3:50272032-50277531Stomach_Smooth_Muscle
SE_55612chr3:50273613-50276278Thymus
SE_55612chr3:50276728-50277093Thymus
SE_62832chr3:50263305-50298785Tonsil
SE_65919chr3:50272062-50281928Pancreatic_islets
SE_68717chr3:50273554-50281602H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr35027540050275885
chr35027452550274666
Enhancer Sequence
GCCGCGTCCC GCACTGGGAT CCTTGATTCC CAGCTCGAAT CCCCAGACAA GGACTTTGAC 60
CTCCCAGACT AGGGCTTCAA ACTCCCAGAC CCGGGCTGTC TGGGACCCCA CACCTGGGCC 120
AGGACCAGGG TTGAAAACTC TAGATTGGAC TAGACCTTTG ATCCTGCCCA GACTCTAGAC 180
CAGACCCCTG TCTCATCCCA GACCCCAGAC CTCCAAATCC AGTCAACAGT GCCCCAACAC 240
CCGCGGTCCA GTGCCCTGCT TGGCCATCCC CCCTTGCTAA CTAGCTTCAC AGAACTTCAG 300
AGCCCCGCCA TCCTTCCCTA CACTTTGCCC AAACCCCCAG GATGCCCGCC ACTTGTTCCC 360
CAACCCTCAG GCTCCGCTTG TTTTCCTCAC CTGCGCCTTT TATTCCTATT GGGCATGAGC 420
ATCCCGCGGG GCCCCTGCCA GGCCCCCCAC CCACTCCCTC CTTCTCCTTC TGTGCCCCAT 480
CCCTAGTCTG GAATCTGTAT CCTCCACCTG TGCACTCTGA CCCAAGGAAC CTCTCGAGTG 540
GGAAACTGCT CTTGAGCCCC ATCTCCAGCT GGAACCCCTT CAGCGAGCCC TGCTCCCTGC 600
TTCCTGCCCT CCAGATCCTT CTCTGCAGGC ATCACTCCCG AAACCCTCTG CTGATCCTCC 660
CCTAAGTCCT CTTACACTCT GGCCTTCCCC AGATCCCTCC ACCCTTCCTG CACCAAGTGG 720
GCTGGGCTAG GAGGCGGGAG CCCTGGGTTG GAGAGGGCCT AGGCTGCCTT ATGCAGAACC 780
CCCACGGGGC TGGATTGAGG CTCCACTGGT CACGCTGGGG GAGGGGGCCA GGCCTCAGGC 840
TTCCCAAGGA GGCTCTATGT TTTCCAGTTT CGAAGGCCAG TCTGGGAAGT AGGAGAGAGA 900
GTGGAGGAGT TAGGGTTGTG GCCGCCTCCA AGGCCAGAAA AGATGGTGGC TGCTAGAGGA 960
GTGGGGGGAA GTGGAAGTGG TGAGACAGCC GACATATTGC TGCCCCTGCG GGTGAGCCCA 1020
GGAGATCTGC TAGTAGGTGC TGGGCTGCCC ACACCCCTTC TGGGCTGCAA GGCCTGGGAT 1080
GTAGCCTCTG AGAGTTGGGG GGCTTGTTGG ATCTTGGGAC CCTGTGAAGG GGGATGGTGG 1140
ACTAGCTGAA TGAGGAGTTG AGGGGCCAGC TGGGGGTGGG CCAGGGTGCC TCTGAGCATC 1200
CCAGCTGGCC TTTTGCAAAG ACGGTGGGCC TACTGGCTGT CCCCATCCAG CTTCCCACTG 1260
GAAGTAGGTG TGGTGCCCAG TGGCAGTCTA ATTTTGATTT GGGGGTTTTA GAGTTGGGGG 1320
GAGGGAGGCC CTTGCAACAG CGCAGCACCG TTGTAGGCTG AGAAGTGCAT GGGGGGGTGT 1380
GGCCCCTCGA CTTCAGAACT GTCATAGGGC TCCCAGGCTG TGAAAAGCAG GGCTTTTCGT 1440
GCTGGACCTG TGGCCGAGGA ACAGCATGTA TGTCCATTAT GGGCCATCTG TTGACTGTCC 1500
CTGCGGACCC GGCCTCCGGG GCACAGCCTT GGAGGTTTCA AAATGGCATC CGCTTCGCTG 1560
CTGCCTCAGG GAGGAAGAGA AGGGGCGGGA AGGGGCGGCG GCCCAGCCTC CTGGGCTGCT 1620
TTGCGTTGGG CGCTTGCCTC TTCCTGTCTC TGCTGTGAGT GCGGCAGCGG CAGTGAGTGG 1680
GTGTCGACGC GGCGGAATGC CCGTCGCTGC TGCTGCTGCT GCCCGACGGG CCTGGGGAGG 1740
GCACTTCCGG TACCGCTGCC TCCCAGTGCC CAGCCAGGAG TCTCTAGACA GCCTCTCCCC 1800
AGGCGATTGC AGTTACTGTG GTGGCCGAGG AAATGCAAGA CTGGACCATA GAGCTGGGGG 1860
AACGCAGGGC TTCTGGCTAG TTTTGTGTCC CGACACCAGA AGGGTCCCCC ATCCCACCAG 1920
GCCTGCTCCT TGGAGCCCAG CTCACCTTTT GGGCTAAGGC AAGTGAGACC TGGTAACTCC 1980
TCCCACACTG GGCTGGCAGC AGCCAGGGGT GCAGGGTCTG GCTTAGCACT TTCTAGCCTG 2040
GGAAGTTCAC CCTGGGGTCC TGGCCTTCTG GCCTTTGCTT ACTCTGTGAA ATGGGCTTCC 2100
TGGGTTTTGG CCAAAGGAGT GCCCCAGGTC AGGATGGGGA GGGAGAACAA GAGCCTCCTG 2160
GTGGTTCTTG TTGGGGATGT AGGTTGGGAG TAAAGACCCT GCAGTGTGCT GCAAAGGGCT 2220
CTGACCAAGC TCTGCTTGAT ATTGATGACC CAGTCTGCCA TGGCTGCCTG GGGAGGGATC 2280
CTGGCTTGAG CCATGCCTTT CCCATCCAGG TGCAAGGTGG TGATGGGAGC CCAGCTGTGG 2340
TAAGTTCAGA GTTCTGGGCG CCTGTCCCAT GTAGCGGGAG ACTTTGTCCA GGCAACGGGA 2400
CTCAGGTTGG GCAACTGCCA GCCTTCCCTC CCAGCCAGAA CCACGCCTGC TGCCCCGCCC 2460
GCACACCGCC TCCCTCCCAT CTTGGGTAGC CCTGCCAGCA GGCAGGCACA GTCCTTGTCA 2520
CCAGGGCAGA GGCTGATGTG GTACACACAG GCAAGAGAGT ATTTCCTGGC AACTTTGTAG 2580
GGGGAGCAGA TACCAGTCCT ATTCTAGGGA TGCTCCCCAC TCCTACCCAG CTCAACGTGA 2640
CTGATCAGCT AGGCCCAGGT GGAATCTGGG ACCCTGGTCT GGGCTCTTAA GGGAAAGGAA 2700
GCCAGAGTGT ATGTGAGGGG GGAGAGTCTC TGATTTGGGA TGGGCCTGTG TGGACAGCTT 2760
CACAAAAAAA GGAGACAGTG TCCACCATTG GCTCCATAAA GGCTTCAGAA TGTAAACAGA 2820
GCAGTTCTCT CTTGCCCCTG GAACTTTGTG TGTGTTGTTC CCTACTTGAT TGTTCTTTAA 2880
AACTTTACTC TGGGATCACC TCCCAGGATC CTTCCTGGAC ATCCTCCCTC GACCAAGGCT 2940
GGTGAAACAT CTGGCTCCCA GCGCTGTTGC TTCCCCCCTC AGATGCCTGG AGACTGCAGG 3000
GCAGGGCTAA GTCCTCTTCA TTTCTGTGCC CAGCATGGAG CCTGGCATCT ACTGGGTGCT 3060
TCTCATCTGT TTGTTGAATG AAGGAAGTAT CCTCTGAACC TGATTTTGGG TAGATGGTGG 3120
AGTAAACTGA GCGGCAGTTT GCATACTGTG GGCAGGTGGC AAGGGCCCAC AGGCCCACCA 3180
CAGGATTGGT GACCAGCATT GAGGGGACAC TGAGAAAAGT TCTTCAGGCT GTTTCTTCCC 3240
AGCCCCGCCA CAGGCTATGC TGGCACCTGA GAGAGTTCTT ATCCCACCCT GTGCGGAACT 3300
CCTGCTGAGC AGAGTGGCTT TGTATTCTTC CTTCCAACTC AGGCTGTTGG TGCACTGCTA 3360
GAGGGCTGCT GTCTCTGACA CTGCAGTAGC CACAGTCGAG CTTGAGCTGG CTGGTCCAGC 3420
AGGGGCTGCT CCGCAGCCCT GGGGCTCAGA CCAGAGCAAT GCTGTGAGAG TCCTGGTACT 3480
GGCCAGTGCA GAGACTGCAC ATAGCAAGGG 3510