EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-54141 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr3:5237190-5240340 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:5239052-5239064AAACAAACAAAC-6.32
RUNX1MA0002.2chr3:5239284-5239295CTCTGTGGTTT+6.14
SPICMA0687.1chr3:5238268-5238282TACGTCCTCATTTT-6.2
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09304chr3:5235565-5242737CD14
SE_10631chr3:5235585-5242557CD19_Primary
SE_11212chr3:5216690-5245652CD20
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SE_14879chr3:5237921-5242988CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15662chr3:5236805-5237986CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15662chr3:5238061-5241621CD4_Memory_Primary_8pool
SE_18430chr3:5227416-5242870CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19446chr3:5228420-5242420CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21306chr3:5238163-5241438CD8_Memory_7pool
SE_25431chr3:5218099-5242490DND41
SE_30950chr3:5235453-5242806Fetal_Thymus
SE_39625chr3:5235544-5241792Jurkat
SE_43559chr3:5225887-5242268MM1S
SE_55302chr3:5237140-5240363Thymus
SE_58753chr3:5201330-5241760Ly1
SE_59028chr3:5227479-5248256Ly3
SE_60533chr3:5218103-5241954DHL6
SE_61182chr3:5228044-5247995HBL1
SE_61620chr3:5210188-5247435Toledo
SE_62538chr3:5221687-5247709Tonsil
SE_64520chr3:5235416-5240198NHEK
SE_66449chr3:5235544-5241792Jurkat
SE_67279chr3:5225887-5242268MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr352380075239713
chr352374035237551
Enhancer Sequence
ACGATTGATT TTAGGGAACC TATTTTTTTT TAACCAGTTT CTATCTTATT CCCTAAAAGA 60
ACCCATAATG AAGCTCATTA ATATTGATAA TTATAGTCGT TGCTATTCCA GGAGTAAAAG 120
AGAGAAGATC TAAGGGTTGG CAGGTACCCT GAAATGTCAT CTAGCCACTG GCTCCCCCAG 180
GAGCAAGTTG GAGCCCTAGC GCCCATCCTT ATGTGGGGCT CCCTAGAAAC CCTTCTCTTT 240
TATTTGCCAC TTCCTGTTTT GTGGACACTC CATGCCTGAG CTGCCAACGT GGGTGCTGGC 300
ATTACTGCCT CATCCTGTGG TTTTGCTCAT TGACTCTGGA GAACTAGAGG CCTTTGAGCA 360
GATATGCAGA AGCACCTTGA AGGCAGTGTG GCACTCAGTA CATGGTGCCA TGTCTGTGTG 420
CTTCATCTGC TTCACCTTTT GCCATTAAAG CAGTTTCCAG GGGACTGTAT TCCAGCATAG 480
TGTTGTTTTA AAATCTTCTT AGTTAAGGTG ATTTTTACAA CCTCTTTGCT TTCCTTCATT 540
GTCCAGCAAG TCTTTACCAT GAGAAATATC TTATTGCAGT CTAGCCCAAA TGTTGTACTT 600
TTATTTATTC TTGTTTCTTT TAACATGCCA TAGAAGAGTT TAAAGCTGTC TGTTAGGAGA 660
TAGAATTGGG GCCGGGCGCA GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTTAG GGCGGTTGAG 720
GTGGGAGGAT CAGCTGAGGT CAGGAGTTTG AGACCAGCCT GACCAACATG GTGAAACCCC 780
TTCTCTACTA AAAGTACAAA AATTAGCTGG GCATGGTGGC GGGCGCCTGT GGTCCCAGCT 840
CTTCAAGAGG CTGAGGCAGG AGAAATGCTT GAACCCAGGA GTCAGAGGTT GCAGTCAGCT 900
GAGATTGCGC CACTGCACTG TAGCCTGGGC AACAGAGTGA GACTCCATCT CTGGAGACAC 960
ACACACACAC ACACACACAA GAATTGGGTA ATGTGCTAGC CAAGTTTGCA TTATGATTGT 1020
CTAGTATCTT GCTAGTAGTA GAATTACCAG AACTTGGAAA GAGCTTGAGA GATCATTCTA 1080
CGTCCTCATT TTATAAATAA GTAGTAGAAA TAGGACTAGG CCCTTGGTCT AATAGGAAAT 1140
CTGGGGTACT GATTTAGTAT AATTTAAATT ACAAAGCAAC TTAGTTTCCC AATATCTCCT 1200
TCTGAAGTTA TTGCTGCTCT GTTTCAGTCA TTTACCATCA CTGATCAAAA TGTGCCCAGA 1260
CAAGTATGTT CGACCTTAGA GCTAATTTGT TGATGATACC AGAGGCTGAC TCAGCCTACA 1320
AGTGTTGCTT AAAGGAAACG TCCTAAGACT CAATGTATAG CTCATGAAAG CCTACTCCTT 1380
GTCCCTGAGA GCTTTGTCAT CGTCGTCGTC TTTTCTTTTC TTTTCTTTTC TTTTTTTTTT 1440
TTTTGAGAGA GTCTCGCTCT GCCGCCAGGC TGGAGTGCTG TGGCGTGATC TTGGCTCACT 1500
TCAACCTTCA GCTCCTGGGT TCGAGTGATT CGCCTGCCTC AGCCTCCCGA GTAGCTGGCT 1560
TTTTTTTTTT TTTTTTTCCC CATTTTGTTT TTTTATCCCT CCATCTTGCC TGCTATTCTG 1620
TTGTTCACCA TACTCTCCCC CACACTTAAT GGTGTCTGGT GCACAGTAGC AGTGCAAATG 1680
TTTGTTCAAA AAATGAATTC TGACTAATGA AGCATTTCCC AACACAGATT CCAAAGATAC 1740
TTACTCCCTG AAAGAAGAGT TCTGTTTCTA AATGAACTTG AGAAATTCCG TATGTCTGGT 1800
CCCACTATTA GAGAGCCACA GTGCCCATCA GCATTTTAAA GACTCTGAGA AGTCCTACAG 1860
TCAAACAAAC AAACCCATTT AGCTCCTCTG TCCCATTCAG CCATTTTCAA ACATTAGTGT 1920
GATTTCAGAA CATAGTCACT CAGGATTCTA TAGCTATCTG ACCATAATGA TAAACTACAA 1980
TAAGTAAGAG CTGTTGACTT CCTTCACCTT CCTCACTTGA TTTGAGCTCC TGTCAGCACC 2040
TGCAGCTTCA CCAGATATTG TTGCTGGTAA ACATCTGTAA GGAAACAGAC TCATCTCTGT 2100
GGTTTTCATT GTAGAATATC CGGCCTTTAG TGCTTCAGGC TTATTTTTCA GGTGTTACTT 2160
CTGTTGAAGT TTTCCTTTTC TTTTGCTAAC ATTTAAACAG GCTTTAACAG ATGTGCTAGG 2220
GAAACACTGT GAAGATAGCA GTCCCCTGAC CATTGGATGC AACTTGCAGC ATTATTGCAT 2280
CATCTTCTAA AAAGAAAGAA CTGAAAGCTA GAAATGTCTG TACTTACTCT GTAGGTTACA 2340
GCAAAATAAC GATGAGGTGG AAAAAATGTA GTTAGGCACA GCTTGGTTTT ATACATTGTA 2400
GGGAGACATG AGACATCAAT CAGTATGTGT AAGATGTACA TTGGTTCAGT CCAGAAAAGT 2460
GAGACAACTT GAAGTGCTGG GGGTGGGGTG AGGGGGCACT TCCAAGTCAC AGGCAGATAA 2520
AAGACAAATG GTTACATTTT TTTTGTCTTT TTTTTTTGAG ACAGAGTCTT GCTGTGTTGC 2580
CCAGGCTGGA GTGCAGTGGT GAGATCTCGG CTCACTGCAC CCTCCACCTT CCCAGGGGTT 2640
CAAGCAGTTC TTGTGCCTCA GCCTCCCGAG TAGCTGGGAT TACAGGCATG CGCCACCACG 2700
CCTGGCTAAT TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACAAGGTTTT GCCATGTTGG CCAGGCTGGT 2760
TTTGAACTCT TGGCCTGAAG TGATCCGCTC GCTTTGGCCT CCCTAAGTAT GGGCTTACAG 2820
ACCTGAGCCA CCGTGTCCAG CCGGTTGACT CTCTGATTAG CCTTTCACGG AATATACAGT 2880
TTACCTGTGA CAAAGGTAGA GGAATAGTCA CTTATGCCTT TGTCTGGCTT AGTGAATCTG 2940
CAGTTTTACA TAAACAGTAG GGCAGAGGAA GCAATCAGAT ATGCATTTTT CTTAGGTGAG 3000
CAGAGGGATG ACTGAGTTCT GTCCTTTGTT TGTACCTGTG AAGATAAACT GTCAATTTAC 3060
ATTGCCTGGG TGAAATTCAG CAGAATTGTT TTGAGGGGAA GATCTTGAGG CCCACAAGGA 3120
ATTTCCTTGT AGGTAAATTG TAAGGGACGT 3150