EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-50377 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr20:45961700-45964290 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr20:45963989-45964001AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:45962904-45962916GATTGTTTGTTT+6.92
IRF1MA0050.2chr20:45962873-45962894ATAATGAAAGTGAAAACAGAA-6.77
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr20:45962129-45962144GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
ZfxMA0146.2chr20:45963597-45963611CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 65             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00095chr20:45962072-45963498Adipose_Nuclei
SE_00095chr20:45963657-45965784Adipose_Nuclei
SE_00869chr20:45959540-45962762Adrenal_Gland
SE_00869chr20:45962970-45964304Adrenal_Gland
SE_01611chr20:45960958-45962377Aorta
SE_02247chr20:45961510-45962340Astrocytes
SE_02247chr20:45962448-45966052Astrocytes
SE_03145chr20:45960978-45962195Brain_Angular_Gyrus
SE_03145chr20:45962494-45963334Brain_Angular_Gyrus
SE_03145chr20:45963826-45965882Brain_Angular_Gyrus
SE_03876chr20:45961146-45966084Brain_Anterior_Caudate
SE_04804chr20:45954990-45966079Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05803chr20:45956897-45968313Brain_Hippocampus_Middle
SE_06701chr20:45961330-45966060Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07732chr20:45954917-45966079Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09835chr20:45962350-45963608CD14
SE_11646chr20:45961399-45963728CD20
SE_13328chr20:45959060-45965708CD34_Primary_RO01536
SE_23112chr20:45961836-45962337Colon_Crypt_1
SE_23112chr20:45962445-45963461Colon_Crypt_1
SE_23792chr20:45961951-45962250Colon_Crypt_2
SE_25778chr20:45956523-45966326Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26545chr20:45961657-45965920Esophagus
SE_27632chr20:45959188-45962393Fetal_Intestine
SE_27632chr20:45962412-45966030Fetal_Intestine
SE_28550chr20:45958957-45965993Fetal_Intestine_Large
SE_29696chr20:45962519-45963459Fetal_Muscle
SE_31391chr20:45961791-45964313Gastric
SE_33908chr20:45962560-45963379HCC1954
SE_34754chr20:45961528-45964659HeLa
SE_35374chr20:45961431-45965337HepG2
SE_35897chr20:45961441-45966053HMEC
SE_36972chr20:45959392-45966625HSMMtube
SE_37954chr20:45959303-45966054HUVEC
SE_38929chr20:45963566-45965784IMR90
SE_39842chr20:45958350-45962413K562
SE_39842chr20:45962802-45963379K562
SE_40611chr20:45956497-45962401Left_Ventricle
SE_40611chr20:45962430-45966075Left_Ventricle
SE_42101chr20:45961467-45966004Lung
SE_43380chr20:45958303-45962360MCF-7
SE_44197chr20:45961366-45962406NHDF-Ad
SE_44197chr20:45962443-45965951NHDF-Ad
SE_44778chr20:45962494-45966077NHLF
SE_45711chr20:45961141-45962383Osteoblasts
SE_45711chr20:45962384-45966138Osteoblasts
SE_47133chr20:45943044-45970225Panc1
SE_48090chr20:45957178-45966081Psoas_Muscle
SE_48577chr20:45962680-45963496Right_Atrium
SE_48577chr20:45963530-45965934Right_Atrium
SE_50080chr20:45961578-45962371Sigmoid_Colon
SE_50080chr20:45963687-45965916Sigmoid_Colon
SE_51255chr20:45962511-45963624Skeletal_Muscle
SE_51255chr20:45963630-45966076Skeletal_Muscle
SE_51968chr20:45962455-45965832Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52348chr20:45958334-45965923Small_Intestine
SE_53302chr20:45962290-45965529Spleen
SE_54500chr20:45954940-45966079Stomach_Smooth_Muscle
SE_55653chr20:45958443-45966511u87
SE_58471chr20:45963902-45990518Ly1
SE_62444chr20:45963837-45990735Tonsil
SE_63759chr20:45962431-45965968HSMM
SE_64681chr20:45962409-45963413NHEK
SE_65346chr20:45962013-45963122Pancreatic_islets
SE_67460chr20:45958443-45966511u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr204596202445962108
chr204596232945963495
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I047313chr204594242945970421
Enhancer Sequence
GCAGCATTAT TCAGTCATAA AAGGAAATGA ACTACAGACC CTCCTCAACT CACGATGGAG 60
TTACAGATGA TAAACCCATA AAATGTAAGT ACCAGAAGTC AAAAATGAGG TCACACACAG 120
TGGCTCATGC CTGTAATCCC AACACTTCAG GAGACTAAGG CCAGAGGATC ACTTGAGCCC 180
AAGAGTTCCA GACCAGCCTA GGCAACACAG TGAGACCCCT GGGTCTACAA AACATATATA 240
TATGAGAGAG AGAGAGATAA AAAAACACAA ATGCATTTAA GCCAGACATA GTGGTACACT 300
CCTGTAGTCC CAGCTACACC AGAGGATCCC TTGAGGACAC CATTGCACTC CAGCCTGGGC 360
AACATCGTGA GACCCCATCA GAAAGTAAGG CAGGCAGCAC TTTGAGAGAC TGAGGGAGGC 420
AGATCACTTG AGGTCAGGAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA CAGGTGAAAC CCCGTCTCTA 480
CTAAAAATAC ATGGCAGGGC ACAGTGGCTC TCATCTGTAA TCCCAACACT TTGGGAGGCC 540
GAGGCAGGTG GATCACATCA AGAGATTGAG ACCATCCTGG CCAACATGGT GAAACCTCGT 600
CTCTACTAAA CATACAAAAA TTAGCTGGGC GTGGTGGCAC ATGCCTGTAG TCCCAGCTCC 660
TCGGGAGACT AAGGCAGGAG AATCGCTTGA ACCTGGGAGG CAAAGGTTGC AGTGACACGA 720
GATAGTGCCA CTGCACTCTA GCCTGGTGAC AGAGCGAGAC TCCGTCTCAA AAAAAAAAAA 780
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA CATTAGCTGG GCGTGATGGT GCTCACCTCT AGTCCCAGCT 840
ACTCAGGAGG CTGAGGCAGG AGAATCGCTT GAACCAGGAA GCAGAGGGGT GCAGTGAGCT 900
GAGATAGTGC CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAAAGTGA GACTCCATCT CAAAAAAAAA 960
AGAAAAAAAA GGAAATTAAG AAAGGGAAGG AGGGAGGAAT GAATAAATGA ATAAATAAAT 1020
AAATAAGCAT CGAATATACA TAACCTAGGG AACATCATAG CTTAGCCTAG CCTACCTTAA 1080
ATGTGCTCAG AACACTTAGA GTTAGGCAAA ATCATCTAAT GCGAAGCCTA TTGTATAATA 1140
GTGTTGACTC TCTCATGTAA TTTATGGAAT ACCATAATGA AAGTGAAAAC AGAATGGTCG 1200
TATAGATTGT TTGTTTACCC TCGTGATCAT GTGGCTGACT GGGAGGTGCC TGGCACCCCA 1260
AGAGAGTCTC ATACTGATGC TAGCCAGAGA AAAGATCAAA AATCCAAAAT GCCAAGTACT 1320
GTTTGTACTG AACTGTCACT TCCGCACCAC TATAAGTCAG GAACTGTCTG TACTGATGAT 1380
CTATGCTACA AGAATGTGGA TGAGCCTTGA AAACATTATT CTAAGTGAAC GAACTCAGAC 1440
CAAAAGGTCA CATACTGTAT GATTCCATTT ATATGAAATG TCTAGCATAA GCAAATCCAC 1500
AGGCACAGAA AGTAGACTGG TACTTGCCAG GCACAGGGGT AACGGGGGAA TGGGAAGTGA 1560
CTGCTAATGA GTATGAAGTT TCTTATTGGG GGTGATGAAA ATCTACAACT GATTGTGCTG 1620
TTGGCTGCAC AACTCTGTGA AAAAAAAAAA TATATATATA TATATATATA TTTTAGGCAG 1680
TCTTGCTCTG TCACCCGGGC TGGAGTACAG TGGCACGATC TTGGCTCACT GCAACCTCCA 1740
CGTCCCACGT TCAAGCAATT CTCCCGCCTC AGCCTGCTGA GTAGCTGGGA TTACAGGCAC 1800
ACGCCACCAC ACTCAGCTAA TTTTTTGTAT TTTTAGTGGA GACAGGGTTT CACCATGTTG 1860
GCCAGGCTGG TCGGAACTCC TGACCTCAGG TGATCCACCC GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC 1920
TGGGATTACA GGCGTCAGCC ACCACACCCG GTCTCCGTGA AAATATATTA AAAACCATCA 1980
AACTATTCAC TTTAAATGGA GAACTGGGCC CAGGAGTGGT GGCTCACACC AGCAATCCCA 2040
GCACTTTGGG AGGCCAAGAC AGGAGGATCG CTTGAGCCCA GGAGTTCAAG ACCAGCCTGG 2100
GCAACATAGT GAAACCTCAT CTCTACAAAA AAATATAAAC ATTAGCCAGG GGTGGTAGTG 2160
CACACCTGTA GTCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGCAGTGGGA GGACTGCTTG AGCCAGGAAA 2220
TCAAAGCTGC AGTGAGCCGA GATCGTCCCA CTGCACTCCA GCTTGGGCGA CAGAGAGAGA 2280
CCCTGTCTCA AACAAACAAA CAAAAAAAAA GGAGAATTGT ATGGTATGTG AATTATATGT 2340
CAATAAAGGT ATTTTTTTTT TAAGTCTATA AAGCGCTGGA TCTCTAGGTT CCCAGGAAAG 2400
CCCAGGATAG GTGAGGGGAG TCACAGGAAG TTGAAGGGGG CTTATTATCA TTCCACTCAC 2460
CCTCACCCCC CCACAGCCAT GACACCTGGT CTTTCCAAAC TGATCACCTC AAGTCATCGG 2520
TAAAGGATCC ACTATCAATA GAGAACAATG AAGGAATGAC GACTTTAATA AGGCAATAAA 2580
AAGTACCCAG 2590