EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-49627 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr20:30285690-30288900 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr20:30287836-30287857ACTCAGTTTCATTTTCTGTAC+6.55
Number of super-enhancer constituents: 72             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30285914-30290417Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30286536-30289005Aorta
SE_02627chr20:30286460-30288538Astrocytes
SE_03109chr20:30286419-30287781Bladder
SE_03156chr20:30286548-30288932Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30286146-30289176Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30285752-30290530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30285526-30290713Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30286157-30289233Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30285525-30290582Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30286618-30287903Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30286373-30288569CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30285971-30289231CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30286164-30289073CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30286373-30288645CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30286524-30287948CD56
SE_20764chr20:30286371-30287968CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30286355-30289018CD8_primiary
SE_23622chr20:30286599-30287706Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30285768-30289021DND41
SE_25933chr20:30285935-30289194Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30285884-30288535Esophagus
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30286335-30288967Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30286060-30288986Gastric
SE_33407chr20:30286348-30287887H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30285817-30288911HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30285416-30289224HUVEC
SE_39144chr20:30286359-30288952IMR90
SE_39853chr20:30286529-30288860K562
SE_40644chr20:30285851-30288970Left_Ventricle
SE_41648chr20:30286800-30287453LNCaP
SE_42121chr20:30285414-30289018Lung
SE_43515chr20:30284537-30290340MM1S
SE_44365chr20:30285831-30288996NHDF-Ad
SE_44995chr20:30285926-30288667NHLF
SE_45708chr20:30285814-30288971Osteoblasts
SE_47264chr20:30285629-30288991Panc1
SE_47861chr20:30286630-30287685Pancreas
SE_48182chr20:30285753-30288791Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30286555-30288558Right_Atrium
SE_49684chr20:30286541-30287553Right_Ventricle
SE_49886chr20:30286550-30288884RPMI-8402
SE_50155chr20:30285869-30288969Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30285595-30290402Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30286350-30288800Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30285428-30288947Small_Intestine
SE_53471chr20:30285965-30288824Spleen
SE_55108chr20:30285903-30286551Thymus
SE_55108chr20:30286561-30288235Thymus
SE_55770chr20:30285683-30288979u87
SE_56767chr20:30285910-30286508VACO_400
SE_56767chr20:30286579-30288939VACO_400
SE_57375chr20:30285911-30286270VACO_503
SE_57375chr20:30286582-30288547VACO_503
SE_57919chr20:30286762-30287447VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30286344-30288924HSMM
SE_64478chr20:30286331-30288179NHEK
SE_65412chr20:30285884-30289501Pancreatic_islets
SE_66898chr20:30286348-30287887H2171
SE_67146chr20:30284537-30290340MM1S
SE_67821chr20:30285683-30288979u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203028658330287977
chr203028617630286226
chr203028869330288840
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
TGCTGTTTTT TTTTTTTTGA GACGGAGTCT CGCTTTGTTG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG 60
CACAATCTCA GCTCACTGCA ATCTCCACCT CCCGGGCTCA AGCAGTTTTC CTGCCTCAGC 120
CTCCTGAGTA ACTGGGATGA TAGGCACACG CCATCATGCC TGGCTAATTT TTGTATTTTT 180
AGTAGAGATG GGGTTTCACC ATGTTGGCCA GGCTAGTCTT AAACTTCTGA CCTCAAGTGA 240
TCTGCCTGCC TCGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATGACAGGC GTGAACCATC GTGCCCAGCC 300
TGGTGATCCT TTAAAAATGT ATGTCGGACT GTCATTTCTT GGTTCAAAAC CCTCCAATGA 360
CTCTTTTTTC TGAGACAGGA TTTTGCTCTG TCGCCCAGGT TGGAGTTCTG TGAGATGTGT 420
TCATAGCTCA CTGCAGCCAT GAACTCCCAG GCTCAAGTGA TCCTCCCACC TTAGCCTCCT 480
GAGTAGCCAA GATTATTGGC ATGTGCCACC ATGCCTGACA AATTTTTTGT AGAGATGGAG 540
GTCTCACTGT ACTGCTCAGG CTGATGTTGA ATTCCTGGGC TCAAGTGATC CTCCCACCTC 600
AGACTCCCAA AGTTTTGGGA TTACAGGCAT GAGCTACTGG ACCCAGTCGA TTTTCCTTCT 660
TTTTTTTTTT GGAGACGGTC TCGCTTTGTC ACCTAGGCTG GGGTATAGTG GTGTGAACAT 720
GGCTCACTGC AACCTTGACC TCCTGGACTC AAGTGTTTCT CCCATCTCAG CCTCCCGAGT 780
AGCTGGGAAT ACAGGTGCGA AACACCACAC CCGGCTAATT TTTGTATTTT TTTGTAGAGA 840
CAGAGTTTCG CCATGTTGCC CAGGCTGGTC TCAAACTCCT AAGCTCAAGC AATCTGCCTG 900
CCTCAGCCTC CTAAAGTGCT CAGATTACAG GCATGAGCCA CCACACCTGC CCTTTTTTGC 960
TTTTCAATTA GTGAGTCAAG GGGAGATCTC CAATATATCT CCAATAGTGT GGTGGCTGGT 1020
CTGCTCTGAA ATGTAAGCAG TTTTTTTTTG TCCCCTTGAC CAGACTCTAA AAGTCTTAAG 1080
GTCAAAAAGT CCACAAATAA CGTTTTGTTT ACCCATCCTA CAGTGCTAGG CCTAAGCCTC 1140
GGACTTAGGC AAAGGAGATC AGAAGGGTCA TATGGCTAAA TGTAGGTGGA CAAGAGGGAG 1200
TCGGGGAGGG CCTTCCTGTG AATCCTCCTG CCTCTCAAGG ACGCTCTGTT CCCTTAGCTT 1260
GAGAAGCCTT GAGGAAAGCT TTTTCCATGA ACAAGCTTTT AAAAACCTTT TAGCTCTTTA 1320
AAAGCAGCAA GTACCATTCC AGTCATGACC CTGCAGACAG GTGGAACACC CATACTCCAG 1380
CCTCATTCTG AAGAGACTTG CAGAGCAGGA AGGAAGGGGT AATGACTTTC AGTTCCAGTA 1440
ATGTATCTAG AAGCAGCAGC TGATTCAGCT AGATGATGTC ACCTTCCCAA ACCTCCTGAC 1500
CAGCAGCTGA GATGGTAAAA GCAGGAAACA GGGGATACTC AGCTGGCTAA GTCCGAACAT 1560
GCCTCTGGCA AAGGCCTACA GTAACCCCAG GCTCTGGAGG CATCCTCCTG AAGATGAGGA 1620
GAAAGAGTCC TCTCAGCTGG GAGTACAGTA GGTGTCCTTC AAGACCCTCA AACCAAGATG 1680
CTTCTCCAAC TCTCCTTTTG CTAAGCAGCT TTCTGCATAT CCTGAACCAA CAATCCTTCA 1740
TTTATTCCAA GAGTGGAGCA GGGGAAAGAA GCCTGGCTTT AGAGCCAGCC CAATCTAGGT 1800
CCAAATCCAG GATTCACCAC GTAAAGCTGC AGGACCCTGG CATGCAACTT CACTTATCCA 1860
AACCTTAGTT TCTTTACTGG AAAAGAAAGT AGGGCTAATG GACCATTTAG CACACAGTCT 1920
AGGTGAGGGA ATTAAATGAG AAAATGCATG TAGAGTACCT GACATGGGCT AGGTGCTCAA 1980
TAAATGGTAG TCAACCATTA TCCCATTGGA TCTCTGCAGA GGAGATTTGA AAGATCACCT 2040
CCATCTATAA CACAAAAGGA AACAAAGGTA CCAACTAGAC CCAACAGTGT CAAAGCTGAG 2100
TAACTGAGTT GGCCCATGCA TATAGTTGCT TCCTAGATAT TCCATTACTC AGTTTCATTT 2160
TCTGTACAGC ATTTAACCCA ATCCCTGAAA TAATCTTGTT TGTTTCTCGG GCTAGCTGTC 2220
TCTCCCATTA AAGTAAGAGT TCTACAAGAG CAATGTCCTT GACCTTATCT TGTTTATCTT 2280
AGCATCTTCA GCATGTAGCA CAGGGCCTGG CACATAGTTG GTGCTCAATA AACATTTGCC 2340
GAATCGCCAA ATGAATAGCA CCTGGGATGG CCAAAAGCTA AACTGACAAT GGCCCCACAC 2400
TTAACTCCTC CCCTCACTAT TAGTTGAAGG CTCTGGCTCC CATTTCAGAA GCTGCCATTG 2460
CCACCTGGGA ATCAGCAGCC CAACCAGTGG CCAGCATGGG CATTAGTCCC TGGGCACGAC 2520
CTATCTATTG GGATACCAGG GCTGCCAAGG AGGGCCTTGG AATCCTCCCC CTGGCACTTG 2580
AAGATCCTAC AAACCTGGTT CTAGCTGACC TTTTTGGCTT TATTACCTAA TGAAAGAGAC 2640
CCCTCCACAT ATGCCTAAAA TTTGACTGCC ACTGCCCACG GGTCTCTTCT TGAGAGTTGG 2700
TCTCAGCCTG CAAATCTTAA CCCACATTGA CTCTCCTACT GGGAGCTACA GCCCCTCTTT 2760
TCTCCGCTTT GTGGTAAGGC TCGGTGTAAA CCTCACCTCT TCTGTGAAGT CCTTCCCTCA 2820
TTTGGCATTT AGCATTTATT GTTGGCTTTT ACAAGATCTC CTTTCATGTA TATTATGTCT 2880
TTTCTCTCTA ATTCAACTGG AAGTATCTTG AGAGCAGAAC TGGGTTTCCA ATGGCAATAT 2940
CTCAATTAAT AAACCTTCTA CAGAAAAGAC TCCTTGAAAC AAAGTTAGCT AGGTCCAGAG 3000
AGGACTGGAG AGGGGTCTAG GCTCCTCCCT GCTGGACCAG CCCCTTTGGC AAAAAGAGGA 3060
GATCGTGTTG CCTCAATCCA GGAGCCCAGC TGATGAGGCA GGAAGGGAGC CAGCAAATCC 3120
TAGACTATTA GGTGCAGTCT GGGACAATCC CAAGGTCATC TATGTAATTA GATTTTTTTT 3180
TTTTGGAGAC GGAGTCTTGC TCTGTCGCCA 3210