EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-49114 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr20:5588230-5591480 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs238295chr205588449hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr20:5588801-5588812TAAGTAAATAT+6.14
MyogMA0500.1chr20:5588898-5588909AACAGCTGCAG+6.02
Tcf12MA0521.1chr20:5588898-5588909AACAGCTGCAG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_12448chr20:5589278-5591664CD3
SE_14728chr20:5588235-5592746CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16110chr20:5589481-5592495CD4_Naive_Primary_7pool
SE_20472chr20:5588717-5591712CD56
SE_21008chr20:5588470-5592753CD8_Memory_7pool
SE_21769chr20:5589164-5592655CD8_Naive_7pool
SE_32619chr20:5582044-5591676GM12878
SE_43784chr20:5588088-5592303MM1S
SE_60658chr20:5567220-5592360DHL6
SE_62967chr20:5566832-5592755Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr2055898805590681
chr2055889485589498
Enhancer Sequence
AAAAAGAAAA AAAAAAGGCT TCCCTTCATC AAAATAATTT CTAAAATAAA TAATTTCTTA 60
TTCTACTTTC TGCATCTAAG AGTAAACATG GCGGCCAGGT GTGGTGGCTC ACGCCTATAA 120
TCCGAGCACT TTGGGAGGCA TGAGAATCAC TTGAACCCAG AAGGTGGAGG TTGCAGTGAG 180
CTGAGATTGT GCCACCACAC TCCTGCCTGT GTGACAGAAT GAGACTCTGT CTCAAATAAA 240
AAAAAAAAAA AAAAGCCTGA CATTTAAATT ACTGAATTAA TTTTAAGAGA GCAAATACTC 300
TATCACCCAT CAAAAGAGCT GAATGACCAC TTCAGTCTTA ACCTTAACCA AATAAGGTGC 360
CCTTTCATTT GGTGTTTACT GCTGCGGTTC TCAACTAAAG ACAACCTCAT ATACATGATT 420
AAATAGTTTG TATTTTGCTA TTTGTTGACT AACTTTAAAT AACTATTTTA ATCAACTTAA 480
GGGAAATCAG ATATTATTCC TATGTACTAA AATCAACAGC TAGTACAAAA TTATCTCTAG 540
ATTTCTACTG CATGAAAGCA AATGGAAAAC TTAAGTAAAT ATAATAAAAG GGAAATGAAC 600
TGATTATAGA AATTGAGTCT TTTATTCTCA AAGATGTTTG GAAGAGTGAC TACAGTAACT 660
TAGCGGTAAA CAGCTGCAGT AAATGTACTA TACAAAGCTA TATACACAAG CACAAAAACA 720
CCTCCCAGAA AACCTCTCCA AAAGTCAACA AAGCATCATC TTCCACTTGA TTTACCAAAG 780
TCAAGCAATC TGGTTTGATT TCCACCCTGA GCGCCCCCCT CCCCAAATTT GATACCATAC 840
CAAATAAAAG CCTCAGGAGC TGTTCCAAAT GCAATTCACT TGATTATGGA CAGAGGCCAA 900
AAGTCTGGTG CAGTGTTGTA GTATACAATT TTGGCATCCA GTTACCACCA AAACAGCAGT 960
GACCAAGTAA AAAAATGACT GTGTTGTGAA ACAAAAAATG TATGCACCCA CCCATACACC 1020
TTCTTCTAAA CAAGGAAGAA AAAAAAAAAT CACAACTTGG AAAGGGAAGG TCAGTTCTGG 1080
ATATACATAA AAACAAGAGT AAGATGAAAA ATGTTAGTCA TTGTATGCAC ATGAGCTGAC 1140
CAGATAATTT AACCAACTCG CCTATTACCT CACATACAGA CTACACTTCC TGAAACAGGC 1200
TTTTGCTTTT TGGTTTTTGA AAACGTAACA TCTATTCTGT ACTTTTTGAA GAGAAACACT 1260
AAATGGCATT CTCATCTGAG ATTCTGGGTA GTATTTAAAT AACCCTTTTT AAAAGACTCA 1320
AGCAATCAGC AAAATACAAC ATGGTAATTA ATCCACATTT TAAAAAATTT CAGAGTTCAC 1380
ACTACCTGCC AAAATAAATT TTACTCTATT CTTTTCCTCA AATAAACTTT CCCGACACGT 1440
GACACTACTG ATTTACCAGG CTGGGAAACC AAAGGGATAT GAAGTAAACC AAGGTAAAGG 1500
GACATTCACT TTAGAGCTAA ATTGAAGTCA GATATTTTTA GCTAAAGTGT TTTTTTGGCT 1560
ACAAGGAACA TGTCAGTCTT CCTTCGAATT TTTTCAAGGA AAAAAGCTGT TTCCAATTCT 1620
TCTTGCCCTT TCCCAGGCCT TGGCAGCTTT GATCCTCCTA ACTAGCTAAA TAAAGTAATA 1680
TATAAAATGC CTAACTTTCC CTGAGTTAAT TTTTGCTCAT CTTGGTGAAG GATCATTACG 1740
ACCCTTGCTA CATTTCTGAC AAGTTGTGAC TGTCATTCTG ATTCCCATAT ACTTGAAGCC 1800
AATATCTTAA TCAAATATGT TAAGACGTTA ATGGATCTTT ATTTAAAAAG TGTTTCTGGA 1860
ATAAGTTTCT TTACGCCAAG TTAATTCCTT GATCAACTTT CTAAACAATG CAGTAACATT 1920
TTCCCAAATG TTTTCCATTC ATTTTACCGT GATATTATTC TCTTGTGTAT GTTTCATACC 1980
TTTTTTCCTG TTTTAACTCA TACGTAAAGA TTCGATTCAT CAACGTACTT TATGTACGTA 2040
TCAAATTTTA CTCACTTTGC TACGATGAGT TTTCTTTTGT GGTCATTATT TCTCAAGAGT 2100
CCAGCTTTCC CACGTCGTTA TTTTGCAGAT TTAAATTTTG TCTAGAATAC TGGTTTTCTC 2160
TAGCTCTTGG TTCTTCCTAG TTCTTAAATC AGGAATGGAT TGCACCATGT GCAGTTTTGC 2220
TTGTTTGCTT GGTGTTATTT GTATCCACGA CATTAGGAAT TTTGAAAAAA AAAAAAAAAG 2280
ACTGATACCT TGTATTTATT TCTTAGTTAA GTCACAGCTC GTCAGCAACG TAGCAAGGGG 2340
AAGCATGACG GGGTAGAGTA GTGGGTGAGA ACTGTGCAGA AATGGGAGGA GGCGACAGAA 2400
GAGTATGAAG AAAAAACATC GGGTCCAAAC ATCCTGCTCA GTTCCATCAG TTCCTCTATG 2460
CAGGTCTACA TCAGACTAAC AGCTGCCTTA AGGTGGAAGA ATCCTCTACA ATTCATGCCC 2520
GATTTCTTTT CCAGCCAGCC AGTGGAGTCT GGGGAGAGGG CTGATGAGGA CACCTAAGTG 2580
ATTGAGGCTC TCTCTCCTAC CTCAGCAAGG CAGTCTGAAG AGCTTTGGGA AAAGTAGAGC 2640
TTTGGAGAGA AGGGGCAGCA GACCTAAAAA ATTGTATCGA GGGCACTCAT GACTATTCCT 2700
GGAACCTTTT CCTAGGAAAG GCACTTTAGT TTCTTGGAAT AACTGAATTA TACAAGCATG 2760
CCCTAGACTA CGTGTCCGGG CAATTTCAGA AAATAAGCAG TTGTCAAAAC ACGGTGAGTA 2820
ACTTAGGGAC AGAGAGCGGC GGTGAGCCGG GGGCCGCTGT GGGGCAGGGG ATGTCCCCAG 2880
AGGACCTCAT CTGCATTTTT GGTGTCTTTG TTCCCCGACT CAGTACTCTG CATATTTGCG 2940
GTAGTCCTAT GCTCCACGCA CCCTGCTACT CCTCAAATGC TCCACGTATT TTTTAGAAGG 3000
GAACTAAGCC CCAGGCAGCC CAGCAGAAGC GCGGCAGTGA ACAATAAAAG TCGAAGAGTG 3060
CGTCCCAGCC ACCGATTTAG CGCAGCGAAC GCCCGGCCGC CGTTCCCCTG CGGGCAGTGG 3120
CCGGCCCGGC CCGGCCCGAG GACCCCGCCC GCGCCTCGGC CCCGACGCCC CAGGCCCGCC 3180
GCGTCCCGGG CCGCCCTGAC AGCTCAGCCC GCCACGTGAG TGGCCGCCCG GCCCCCGCAC 3240
CCGGCTCGCT 3250