EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-43478 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr2:54797960-54801050 
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs67079536chr254798844hg19
rs10181201chr254799174hg19
rs10205410chr254799599hg19
Number of super-enhancer constituents: 70             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54798017-54798845Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54799001-54799364Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54799791-54802361Adrenal_Gland
SE_02562chr2:54796678-54802057Astrocytes
SE_04102chr2:54799690-54802108Brain_Anterior_Caudate
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_12885chr2:54798660-54800004CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54800577-54801934CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54797492-54801918CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54798186-54800123CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54797995-54802474Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54798082-54798503Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54798527-54798876Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54799057-54799437Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54799575-54801320Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54797970-54802593Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54797982-54798877Esophagus
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54797867-54801835Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54796712-54798915Gastric
SE_31545chr2:54798932-54799520Gastric
SE_31545chr2:54799542-54802418Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54795734-54802579HUVEC
SE_39396chr2:54795484-54802646Jurkat
SE_40773chr2:54796706-54802488Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_43945chr2:54794597-54799592MM1S
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54799847-54801132Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_55277chr2:54796750-54798969Thymus
SE_55277chr2:54799068-54799409Thymus
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_56813chr2:54798007-54799425VACO_400
SE_56813chr2:54799680-54801306VACO_400
SE_57612chr2:54799687-54800303VACO_503
SE_57612chr2:54800456-54800805VACO_503
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54795484-54802646Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr25479924154799892
chr25480004554800558
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
TTTAAAGTTT ACCGTGTCTT TGAAAGTCTA GTCTGTTGAA CTCTTAAATC CCAGTGAGTT 60
CCTATAGATT GCTAGCTTGA GTGTATAGTA TTTGAGATGT GAATAAAGTC TAGTGCAAAG 120
TGTGTTTCTT GTGCTTGAAA ATGGTGCCCT GATTTCTGTT GAGGGAGACG TTTATTCCTA 180
TAAAGGTTTA AACGACTTGC TGTACAATTC AGTCTTGCAA TGACAGAGAG ATTACACACT 240
ATCTGCAAAC AACTGCCAAG CAGATGAAAT CCTGGCTGTG GGAAGTCTGC GGTGAAGAGT 300
GGTGGGGGTG GTCAGGAGAG CAGTGGAAGG GAAGTGGCTC AGAACATTGT AGTGGTGGTT 360
TGGCGTGCCT GTCAAGGGCT GTGGGACGTT TTCTCTCTCA TTTCAGAAAC AAGGGTGGTG 420
GGAAACACAT GGGCCGTGGA TTTGCATAAA CCAACAGTCA AATCCTAGCT CTACCAGTGA 480
CTTCACTGAG CCTCATTTTC TTCAGGGGGA AAGAATAAAT AGCCCTTGGG GTGATTGTAA 540
AGCCTAATTA GGTATGTTAT AATTGTATTA AGAGGATGAC GAGTTCACCG TTTGCCAGGG 600
AGTTTTCCGG TTTTAGTGCC AAACATTCCA CATCCGGGGA ATCTTCCTCA GTCCCAGGCA 660
CACTGGGTGG TGAGTCCCCC AGTTATATAT GAAGATACCT ATTACTGTTC CCTAATTGTA 720
TGTACACACA CACACACACA CACACACACA CATACACACA CACACACACA CACACACATA 780
TCTATAAATA AAGGGCTTCT GGAAGCTGGC TGCCTATTAC TGTGTACCTG ATACTCAGTG 840
GGTATTTGTG AACTCCCAGG AGGATAGTGT GTTAGTGTGT TTGCGTGTAT CTCTGTATTC 900
CTTCTTAGGG ATGGCATACA AATAAATGTT TCATGAATAA AGGGATGAAT GAGTAGGTAA 960
AGTAATATAA GCAGTAATGC ATATGTTTTA AAGTGATTTA GCTGGTTTTC CTTCCAGGGG 1020
CCTCTTCCCT GAGAAAAGAG CCACTTAATA AATGATGTCT TGAATGAAAG AATACATCAT 1080
GAAAATAATT TTGTCCATGA TGTGGCTAAA CTAAAACTCC AGGAAGGGCT TAGGCTGGGC 1140
CTATCTACTT TTTTTGATAA AATGAAGTTT AATATGACCC TAGTGACAAC CTCCCCTCAT 1200
CCCCTTAAAG CTCAAATTTA GGGAACTCTT GTGGTTGGAC TCTCACATAC TCCCTAGGAC 1260
TCTGCTGGGT GCTGGGGAAT TTACTAAACT TTGGTGAGGA GAAGAGGAGA GGAGAGGGAA 1320
GCCACGGTAC TAAGGTACTT AGGGAGACAG AAACAGTTCC CCTAGAAATT AGACATCACA 1380
TTGTCTTTTT CCCCCCTTTC TTTTGAATGA GATGGGGCAA GAATATTTGG ACCAGGATAA 1440
AGTTTTAAGA TGCATTTACA CTAATGTAAT CAGGTTACAT AGCAAAAAAA TGTTAAAAAT 1500
GTACCCTGGG AAATTGAAAT CTATCCATTC TTCTAGGTGT GGCAGCTTAT TCAGATTTTT 1560
ATGTTGTGTG ACCATAAAAC GAACACAGCT TTTCTAACCG CGAGTGTCTT TGTTTACAGA 1620
GATAACAGTG TGAGTAATGC TTTGCTAGAA GCCAGGCAGT TAAATCACAC TCTGAGCAAA 1680
TAGAGGCTGG GCTTCAGAAA CTTAGATAGC ACACGAATGT GCAAACTTGG TCTTTTAAAC 1740
TGAAGACATA TCTGAAAGAA AACTGCTTTT GGCCCATGAA CTACTTTCCC AGCCCTTTGT 1800
GCCTCCCAAT CTCTGCCCCC CTTTACAAAA AATCTTTGTT TTTCCTCTAC AAATATACAT 1860
ATATGATTTC AATTTGGAGG TGGGATGTTA TTTTTTTCAC TTGAAACACA AGGAAGCAAT 1920
TTTTAAAAGT CATACTCGTT CAGCAGTGGG CTTGACTGTA GCCAGTTTGA CTAGGAGTTC 1980
TTGGCTACAG AACCATACAC TTGCAGTCTT TATCAGGGTA GTAAATTCAG ATGGGTTTTT 2040
GGAAAGGGAG AGGGCTGGAG TTGAGGGAAG GGCACTAGAG CAGTGTGACC CACGGCCCAG 2100
GAGCAGTGTG AGTGGGAAGG GGCTCTAGAA GCTGACTGCC TTTGTGTTTG CCACAGCGTG 2160
CTGGGAATCA GATGAGAAGG CGGGCCCAGA CCCCACCAGA TACTCATCTC AGCCATTGTT 2220
GTCATTAAAT GACTCTGAAA TGACCTTTCT TACCTCAGTT TCCTGTGAGC TCATAGTTGT 2280
CTGCAGATGT GAATTATGTC ATTGATCTTT GCTCCCTCTT TGCTTATAAG GAGTAGCTGT 2340
TCTGCTCCAT GTTTCTGGAA GAGGAAAGTG ATGCACAGGT CACTTAGTAA AGCGGTCCCC 2400
AGCCTTTTTG GCACCAGGGA CTGGTTTTGT AGAAGACAAT TTTTCCACAG ATAGGGTGGA 2460
GGAAATGGGG AGTTGGTTTC GTGATGAAAC TCTTCCACCT CAGATCATCA GGCATTAGAT 2520
TCTTATTAAG GAGTGGTAAC CTAGATCCTT TGCATGCACA GTTCATGATA GGGTTTGGCT 2580
CCTGTGAGAA TGCTGCTGCT GATCTGACAG GAGGCAGAGC TCAGGCAGTA ATGCTTCCCA 2640
TCCACCACTC ACCTCCTGCT GTGTGGCCGG TTCCTAATAG GTCACGGGCC AGGACCAATA 2700
CCGGTCTGTG ACCTGGGGGT TGGGGACCCC TGACTCGGTG ATTCAGCAGT TGATTTGGGA 2760
TCCTCTGTCT TTGTTCCTCC TCCCTCAGCG GGAATTCACA GTGTAACTCA TTTGCTAAGG 2820
TTTTCTGCGT TAGAAACAGA ACTCCTTTTG GACTACTAGG AGACATGGTC ATTAGAATAA 2880
TTATGATTCT TAGTATGACT CAACCCCTTT TTAATATTCA GCCTTATGGA GGGCCTCTGC 2940
CTGCGGCTCT TTGCTCAGGC ACTAGGGCCA CAGGGGTGTA ATTTCTATCT CTGCCCTCAG 3000
GAAGCTCACA AACAAGTCAA GAGACAGGAA AACGGATCCT GTTTTTCTAA TGGGATTTGA 3060
ATGGATGTAT TTATGGGAGG GGGGTGCTTT 3090