EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-40889 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:49379320-49384220 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr19:49380807-49380819GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:49381500-49381512GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:49381504-49381516GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:49383147-49383159GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:49383151-49383163GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata1MA0035.3chr19:49382217-49382228TCCTTATCTGT+6.14
IRF1MA0050.2chr19:49379886-49379907AACAGGAAAGTGAAACAGGAG-6.54
PAX5MA0014.3chr19:49379904-49379916GAGCGTGACCGC+6.07
SOX10MA0442.2chr19:49379394-49379405AAAACAAAGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 47             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09874chr19:49375167-49380182CD14
SE_09874chr19:49381515-49382414CD14
SE_10451chr19:49375264-49380143CD19_Primary
SE_11592chr19:49375087-49380263CD20
SE_13446chr19:49375209-49380162CD34_Primary_RO01536
SE_13446chr19:49381030-49382612CD34_Primary_RO01536
SE_14516chr19:49374907-49380097CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16449chr19:49375053-49379829CD4_Naive_Primary_8pool
SE_18005chr19:49375034-49380135CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18664chr19:49375002-49380492CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18664chr19:49380794-49381893CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19244chr19:49375001-49380219CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20386chr19:49375217-49380086CD56
SE_20818chr19:49375164-49380071CD8_Memory_7pool
SE_20818chr19:49380775-49382128CD8_Memory_7pool
SE_22825chr19:49375139-49380025CD8_primiary
SE_26423chr19:49375143-49380219Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27511chr19:49374808-49380043Esophagus
SE_27511chr19:49381617-49382297Esophagus
SE_28037chr19:49375002-49379938Fetal_Intestine
SE_28037chr19:49380947-49382756Fetal_Intestine
SE_29055chr19:49374886-49379972Fetal_Intestine_Large
SE_29055chr19:49380945-49382695Fetal_Intestine_Large
SE_32151chr19:49374786-49380087Gastric
SE_32151chr19:49381077-49382849Gastric
SE_34926chr19:49374664-49380013HeLa
SE_37651chr19:49375001-49380114HSMMtube
SE_38685chr19:49375133-49380223HUVEC
SE_40239chr19:49375236-49379941K562
SE_41238chr19:49375070-49379930Left_Ventricle
SE_41238chr19:49380950-49382315Left_Ventricle
SE_42580chr19:49374908-49380132Lung
SE_42580chr19:49380983-49382317Lung
SE_44996chr19:49375073-49379829NHLF
SE_44996chr19:49380986-49381676NHLF
SE_49212chr19:49381021-49382279Right_Atrium
SE_50975chr19:49375052-49379810Sigmoid_Colon
SE_51362chr19:49374930-49380063Skeletal_Muscle
SE_51362chr19:49381121-49382196Skeletal_Muscle
SE_52923chr19:49375123-49380113Small_Intestine
SE_52923chr19:49381683-49382288Small_Intestine
SE_53855chr19:49374962-49380180Spleen
SE_53855chr19:49380962-49381454Spleen
SE_53855chr19:49381478-49382746Spleen
SE_59232chr19:49361792-49396070Ly3
SE_64565chr19:49375203-49379863NHEK
SE_64565chr19:49381769-49382471NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 9             
ChromosomeStartEnd
chr194938106949381668
chr194937956549380240
chr194938035149380412
chr194938325749383714
chr194938073549380878
chr194938234349382814
chr194938176849382311
chr194938290949383192
chr194938140049382400
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I048880chr194938385849385706
Enhancer Sequence
CAGCGTCTGT ATGTGTCAGA AACTGACAGC ATTCTACTTA CAGGTCCCTG AGGGAGCTGG 60
GAAGAGAATA GCATAAAACA AAGCACTTCA ATGGCGGATA AACCGCTTTT CCTCAAATTT 120
GCTACCACTC ATCCTGAGGC TTCTTTTGAA CCTAACAGTG CAGGGACCAG CCCCACAGGG 180
TCGGTGGGCT TCTCCCTGTG TGCGGCGACG AGAGAGTGTA GAAATAAAGA TACAAGACAA 240
AGAGATAAAA GAAAAGACAG CTGGGCCCGG GGGATTACTA CCACCAATGC GCGGAGACCA 300
GTAGTGGCCC CGAATGTCTG GCTGCGCTGA TATTTACTGG ATACAAAGCA AAAGGGGCAG 360
GGTAAGGAGT GTGAGTCATC TCCAATGATT GATAAGGTCA CACGAGTCAC GTTTCCACCG 420
GACAGGGGGC CCCTCCCTGT TTGGCAGCCC AGGTGGAGAG AGAGAGGAGA CAGCTTATGC 480
CATTATTTCT GCATTTCAGA GACTTTTAGT ACTTTTACTG ATTTTGCTAC TGCTATCTAG 540
AGGGCAGAGC CAGGTGCACA GAGTGGAACA GGAAAGTGAA ACAGGAGCGT GACCGCTGAA 600
GCACAGCATC ACAGGGAGCC GGTTAGGCCT CCGGATAACT GTGGGCCAGC TTGACTAATG 660
TCAGGCCCTC CACAAGAGGT AGAGGAGCAG AGTCTTCTCT AAACTCCCGC AGGGAAAGGG 720
AGACTCCCTT TCCTGGTCCG CTAAGTAGCG GGTGTTTTTC CTTGACACTG AGGCTACCGC 780
TAGACCATGG TCCACTTGGC AACGGGCGTC TTCCCAGATG CTGGCGTTAC CGCTAGACCA 840
AGGAGCCCTT CTGCTGGCCC TGTCCGGGCA TAACAGAAGC CTCGCACTCT TGTCTTGTGG 900
TCACTTCTCA CTATGTCTCC TCAGCTCCTA TCTCTGTATG GCCTGGTTTT TCCTAGGTTA 960
TGATTATAGA GCGAGGATTA TTATAATATT GGGATAAAGA GTAATTGCTA CAAACTAATG 1020
ATTAATGATA TTCATATATA ATCATATCTA AGATCTATAT CTGGTATAAT TATTCTTGTT 1080
TTATATTTTA TTATACTGGA ACAGCTCATG TCCTCGGTCT CTTGCCTCGG CACCTGGGTG 1140
TCTTGCCGCC CACATAACAG CTGGTGGGTT TTATAGTTTT TTTTGTTGCT TTTTTTGAGA 1200
CTGAGTCTCG CTCTGTTGCC CAGGCTGAAG TGCAGTGGTG CAATCTCAGC TCACCACAAC 1260
CTCTGCCTCC CAGGTTCAAG TGATTCTCCT GCTTCAGCCT CCCGAGTAGC TGGGACTAGA 1320
GGTGTGCGCC ACCACGCCTG GCTAATTTTT GTATTTTTAG TAGAGACAGG GTTTCACTAT 1380
GTTGGCCAGG CTGGTCTCAA ACTCCTGACC TTGTGATCCA CCTGCCTTGG CCTCCCAAAA 1440
TGCTGAGATA ACAGGCGTGA GCCAATGCAC CCGGCCTATG TATTTTTGTT TGTTTGTTTG 1500
AGATGGAGTC TCGCTGTGTC ACCCAGGCTG GAATGCGGTG GCACGATCTC TGCTTACTGC 1560
AACCTCCGCC TCCTGGGTTC AAGCGATTCT CCTGTCTTAG TCTCCTGAGT AGCTGGGATT 1620
ACAGGCACAC TCCACCATGC CTGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC GGGGTTTCAC 1680
TACGTTGATC AGGCTGGTCT CGAACTCCTG ACCTCATGAT CCACCCGCCT TGGCCTCCCA 1740
AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACCG CACCCAGACC CGGCCTGTAG TTTTTCTTTG 1800
ACATCTGCCT AAATTGTATT AAACTTGGGA CAATTATCAC CACCCCCCCA AGGGAGCTGG 1860
AGAATTGAGT CACGGATCCC TAAAAGGAGG CAGAATTGTC TGTGCCTTGC TGGACCATTA 1920
AGGCTCAATC TCTACAGGCC TTTACATTCT CCTCCGTTGC TTTGATACCA GTGGGTATCG 1980
AGGTCCCCAA GCCCGGGTGG GACCTCCCCC TCAGCCAGTG TTCAGGCTCT TGACACAGTC 2040
ATGAAAATGA ATTCAAGGAC GAGTTGGAAA AGAGTGAAAA TACAGGATTT ATTGCAAAGG 2100
GGAAAGTCCA CACTCATGAA AGGGGACTCG AGAGAATCAC GTGCAAGGGG GGTTGAGGCT 2160
GCTACCGTTA TGGGTTTTTT GTTTGTTTGT TTGTTTTTTA AAGATGGAGT CTTGTTCTGT 2220
CCAGCCCAGG CTGGAGTGTA GTGACACGAT CTCAGCTCAC TGCAACCTCC ACCTCCTGGG 2280
TTCAAACAAT TCTCCTACCT TAGCTTCCCA AGCAGCTGGG ACTGCAGGCG CCACCACACC 2340
TGGCTAATTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC AGGGTTTCTC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT 2400
CAAAGTCCTG ACCTCAAGTG ATCCACCTGC CTCAGCCTCT CAAAGTGCTG GGATTACAGA 2460
CGTGAGCCAC CACGCTGGCC CTTTTTGGAT TTTTTTAACC AAGGGGTAAA ATACTCATGA 2520
GCATTCCTGG AAAAAGATGG AGATTTCTCA GAACTGTGGT GCCACCCATC TTTACACCAA 2580
ATATGGGTGT TCCTGGGACC GTCATGATGC TGGTGGGTGT GTGACTGTGT TGATGAACAT 2640
ATAATGAGGT CCTACGTGAA ACCGAGGTCA GACCCAGTGC CATATTGGGT CTAGTCGGAC 2700
TTAGCCTACT TGGCCCACGC CCTGGTTTTT CAGGATCTTA TCAGCCCATA GCTTCTGTAG 2760
CTATTTCAAG TTTCCTGTTG CTGGTCTGGT CTTGTGAAAC TGCTGCCTGG AATTTTCTAA 2820
TCTCCTGCAA CCACCCTGTA TGATTGCTGT TGCAGCCTGA TTTTACATTT ATAAGCCCTG 2880
TGTCCATAGG CCTAGTTTCC TTATCTGTAA GCTGACTAAC AATTGTACAT ATCTTATGGG 2940
ATTGTAAGGC CCCAAAGGAG TTAAAACAAT GCTCATGAAA TAAATGCTAT AATACGGTAA 3000
TTATTCTATA TACCGTTATT CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTCCTGATA CGGAGTCTCA 3060
CTCTGCTGCC CAGGCTGGGG TGCAGTGGTG GGCTCTCGGC TCACTGCAAC CTCCACTTCC 3120
CAGGTTAAAA CAATTCTCCT GGATCAGCCT CCCAAGAAGC TGGGACTACA GGTGTGCGCC 3180
ACCACTTCCA GCTAATTTTT TTTTTTTTTA TGGAGTTTCA CTCTTGTTAC ACAGGCTGGA 3240
GTGCAATGGC ACGATCTCAG CACACCAGCA ACCTCCGCCT CCTGGGTTCA AGCGATTCTC 3300
CTGCCTCAGC CTCCTGAGCA GTTGGGATTA CAGGCGTGAG CCATCACGCC CAGCTAAGTT 3360
TTGTATTTTT AGTAGAGAAG GAGTTTCACC ATGTTGGTGG TCAGGAGTTT GAGACTCCTG 3420
ACCTCATGAT CCGCCCACCT CAGTCTCCCA AAATGCTGGG ATTATGGGCA TGAGCCACTA 3480
TGCCCACCTC TACCTCTAAT TTTTAATTTT TTTTTTTTTT TTTGAGACCG AGTCTCTCTG 3540
TGTCACCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCGTGA TCTCGGCTCA CTACAACCCC CTGGGTTCAA 3600
GCAATTCTCC TGCCTCGGCC TCCCTAGTAC CTGGGATTAT ATGCGTGCGC TACCACGCAG 3660
GGCTAATTTT TGTATTAATC TACCTCTAGA CCTTCACAGA ATGCAGGCTC CTCTCATCCT 3720
CCTAACCTAA TGGCCTTTCA TTAGCTTTAC AAAAGCAGCT TAGTTAAACT AGAAATCCTA 3780
GCACTTTGGG TGGCCGAGGT AGATGGATCA CTTGAGGTCA GGTTTTTGTT TGTTTGTTTG 3840
TTTTGTTTGT TTATTTTGAG GCAGAGTCTT GCTCTGTCGC CCAGGCTGGA GTGCAATGGC 3900
AGGATCTTGG CTCCCTGCAA CCTCCGCCTC CCGAGTTCAA GTGATTCTCC TGCCTCAGTC 3960
TCCTGAATAG TTGGGATTAT AGGGGCCCGC CACCACACAG GGCTAATTTT TGTATTTTTA 4020
GTAGAGACGG GGTTTCACCT TGTTGGTCAG GCTGATCTCT AACTCGAGGT CAGGAGTTTG 4080
AGACCCCCAC TCCTGCCATA TAATCCTTTC ATTTCCCCAA GGCAACCAAG CCTAATTCCA 4140
CCTAATTAAA AACCTTTGTA TGAGTGCTAC CTGCTGCCTG AGGATCCCAA CCCTGAGGCC 4200
TCTTGCTCAG CTAGTTGCTC CTGATTCTTC AGATGTAGTG TGAAAATTCC TTTTTTTGGT 4260
GGGGGGATAG AGTCGCATTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCACGA TCGGGTCACT 4320
GCAACCTCCG CTTCCCAGAT TCAAGCAATT CTCGTGCCTC GGCCACCGGA GTAGCTGGGA 4380
TTACAGGCAT GCGCCACCAT GCCCAGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACGGGGTTTG 4440
CCATATCGGC GAGGCTGGTC TCGAACTCCT GACCTCAAGT GATCCTTCCG CCTCGACCTC 4500
CTAAAGTGTT GGGATTCCAG GTGTGAGCCA CCGCGCCCGG CATTTTTTTT TTTTTTTTTT 4560
TTTTGAGACA GAGTCTAGCT GGAGTGAAGT GGAGCTATCT CAGCTCACTG CAGCCTCCGC 4620
CTCCCAGATT CAAGTGTTTC TTCTGCCTCA GTCTCCTGAA TAGCTGGGAT TACAGGTGCC 4680
TGCCACCACG CCCAGCTAAT TTTTGTACTT TTAGTAGAGA CGGGGTTTCA CATGTTGGCC 4740
AGGCTGGTCT CGATCTCCTG ACTTCAGGTG ATGCACCAGC TTCAGCCTGC CAAAGTGTTG 4800
GGATTACAGG CGTGAGCCAC CTTGCCCGGT CAGTGTTGGT TATTAAGGTG GTGCAAAAGA 4860
AGGCATGTCG GGGCCCTTCC TCCAAATGAG GAGGCACAGA 4900