EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-40153 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:39532140-39533230 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:39532432-39532448TTTTATTTACATAAGT-6.23
LMX1BMA0703.2chr19:39532537-39532548ATTTTAATTAA+6.62
Lhx3MA0135.1chr19:39532541-39532554TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532545-39532558TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532549-39532562TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532542-39532555AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532546-39532559AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532550-39532563AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr19:39532543-39532553ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532547-39532557ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532551-39532561ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532543-39532553ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532547-39532557ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532551-39532561ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GGCCAACATG GTGAAACCCT GTCCCTATTA AAAATACAAA AATGAGCCAG GCATGGTGGG 60
ACACACCTGT AATCCCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCCAGGA 120
GACAGAGGTT GCAGTGAGCC AAGACTTTGC CATTGCACTA CAGCCTGGGT AACAGGTGAT 180
AGAGCCAGAC TCCTCCAAAA ACAACAGCAA CAACAACAAA AGGTGAAAGC ATTTGCTTTT 240
TCTCCTCACT TGATTCCTCC AAAATCTGGA AACTCTTCGT GAGTATTCTT ATTTTTATTT 300
ACATAAGTTC AGAAAAAGTC TGCCCTTTCT TTATAAGCAA GATATAATAG AAAACACTGG 360
CTATATCACC AAGGCTTTGA CTGAAGTGTC ATATTTTATT TTAATTAATT AATTAATTAA 420
TTTATTTATT GAGACCAAGT TTCACTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCACGATCT 480
CAGCTCACTG CAACCTCTGC CTCCCAGGTT CAAGTGATTG TCCTGCCTTA GCCTCCCGAG 540
TGCTGGGATC ACTGGTGTGC ACCACCATGC CCAGCTAATT TTTTTTTTTT TTTGTATTTT 600
TAGTAGAGAC AGGGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAGCTCCTG ACCTCAGATG 660
ATCCACTCAC CTTGGCCTCC CAGAGTGCTG TGGTTACAGG TGTGAGCCAC CATGCCTGGC 720
CTGAAGTATT ATATTTTAAA ATATACATAA ATGCCTGGCT TCAAGAGTTC CCAGTCTTAC 780
AATGAATGAG TAAAAATGGC CCCTTTCTGG CAGGCCCAAG AACCTTAAGA ACCTGTTGGT 840
AAAATCTAAA GTCTGCCTTG GTTTGGCTTC TGAGCCTCAA GAGGTTTCTA AATCTGAGAT 900
TCCTATATGA TAAATGTGGA GAGAAAAAGT TACATTTCTA AAGAAAAACT ATAATATACC 960
TATTAATAGA TTGCAGCCCT GTGCACTGTT TTTAAGTTCT TGTTATCTAC CTATAGACTG 1020
GACGAGTTCC TGAATTCTCC TGACTTCCTC CAATATATTG CTACAACTCT CTGACTAAAA 1080
GCAACGGCTG 1090