EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-40106 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:39180450-39185020 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs34105297chr1939184669hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184056-39184074GGAAGGCAGGAAGAAAAG+6.98
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184712-39184730ACATCCTTCCTTCCTCCC-7.11
Foxd3MA0041.1chr19:39182542-39182554AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39182546-39182558AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39184184-39184196GAATGTTTGTTT+7.22
IRF9MA0653.1chr19:39182019-39182034AACAAAAGTGAAACT+6.15
NFYBMA0502.1chr19:39180631-39180646CACCTGACCAATCAG+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39181299-39181314TGAACTCCTGACCTC-6.22
RUNX1MA0002.2chr19:39184668-39184679CTCTGTGGTTT+6.14
YY1MA0095.2chr19:39181221-39181233GCTGCCATCTTG-6.32
Number of super-enhancer constituents: 68             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39182076-39185083Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39180666-39181982Aorta
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_02408chr19:39181342-39185560Astrocytes
SE_02946chr19:39182825-39183824Bladder
SE_03166chr19:39182673-39184911Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39182386-39185093Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39182350-39185068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39182428-39185106Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39182077-39185225Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_13194chr19:39183611-39184401CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39182874-39185111CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39183423-39184854CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39182491-39185050CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_20865chr19:39183372-39185109CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39182731-39184965Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39183074-39184903Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39182754-39183899Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39183955-39185064Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39181947-39185064Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39182626-39185071Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34681chr19:39184216-39184943HeLa
SE_35430chr19:39183365-39184979HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_38896chr19:39182466-39184917IMR90
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39181143-39185634NHDF-Ad
SE_44797chr19:39181919-39184905NHLF
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_46686chr19:39182759-39183893Ovary
SE_46686chr19:39184055-39184894Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39182677-39185005Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39181288-39181899Right_Atrium
SE_48555chr19:39182415-39185026Right_Atrium
SE_49449chr19:39182454-39184953Right_Ventricle
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39182066-39185548Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39180720-39181485VACO_400
SE_56725chr19:39181511-39182336VACO_400
SE_56725chr19:39182441-39185071VACO_400
SE_57359chr19:39183289-39184322VACO_503
SE_57359chr19:39184333-39185048VACO_503
SE_58038chr19:39182547-39184962VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39182024-39185548HSMM
SE_64225chr19:39181233-39181937NHEK
SE_64225chr19:39182411-39185099NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39182386-39185068H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chr193918122239181305
chr193918259439182977
chr193918203739182274
chr193918414839184440
chr193918132139181446
chr193918154339181788
chr193918249139184907
chr193918194839182010
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CTACAGGCGT GCGCCACCAT GCCCGGCTAC TTTTTGTATT ATTAGTTAGA GACGAGGTTT 60
CACCATGTTG GCCATGAGAG ACAGGACTAG CTGGATTTCC TAGGCCGACT AAGAATTGCT 120
AAGCCTAGCT GGGGAAGGTG ATCGCACCCA CCTTTAAACA CCGGGCTTGT AACTCAGCTC 180
ACACCTGACC AATCAGGCAG TAAAGAGGGC TCATTAAAAT ACCAATTAGG TTAAAAGCAG 240
GAGGTAAAGA AATAGTCAAA TCATCTATCA TCTGAGAGCA CAGGAGGAGG GACAATGATT 300
GGGATATAAA CCCCAGGCAT TTGAGGCGGG AGTGGGCCAC CCCCTTTGGT TCCCCTCCCA 360
CTGTATGGAA GCTCTGTTTT CACTCTATTA AATCTTGCAA CTGCACACTC TTCTGGTCCA 420
CGTTTGTTTT GGCTTGAGCT GAGCTTTCGC TCACCATCCT TCACTGCTGT TCACCGCCAT 480
CACAGACCCA CTGTTGACTT CCACCCCTCC GGATCCAGCA GGGTGTCTGC TGCATTTCTG 540
ATCCAGCGAG GCGCCCATTG CTGCTCATTC GGGCTAGAGG CTCGCCATTG TTCCTGTGCG 600
GCTCAGTGCT CGAGTTTGTC CTAATCGAGC TAAACACTAG TCGCTGGGTT CCATGGTTCT 660
CTTCCATGAC CCACGGCTTC TAATAGAGCT ATAACACTCA CTGCATGGCC CAAGGTTCAA 720
TTCCTTGGAA TCCGTGAGGC CAAGAATGTT AGGTCAGAGA ACAAAAGGCT TGCTGCCATC 780
TTGGGAGCAG CCACTACCAA CTTGGGAGCT CTAAGAACAA AGACCCACCG GTAACAGCCA 840
GGCTGGTCTT GAACTCCTGA CCTCGTGATC TGCCCGCCTT GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA 900
TTACAGGCGT GAGCCACCTT GCCTAGCCTT GTTCTGGAAT TAGTGGTGAT TGTTGCACGA 960
TCTTGTGAAT ATACTAAAAC TCCCTGAATT TTATGTAAAA GGGTGAATTT TTTGGTATGT 1020
TATGTGAATT ACATTTCAAT TTTTAAAAAT TGATTCTCCA AATTATGTAC ATATTTAAAG 1080
AGTACATGAA AGAGAGGGAG AGAAAGAAAA GCTGGATGCG AGATGCCGCA ACCTGATTCC 1140
ACTCACTCCT AGATTTGTTG AGTACCTGCT ATGTGAAAGG TACCAGTCCA GGCAGTGGGT 1200
TCCCACAGCA AACAGAACCC TCCTCTGGGG AGCTTATGCT GCACTTGGGA GGGAGACTGG 1260
TTATGAACAA AGAACATAGT TTTTGATGAT GAAAAGTGCA GTGAGTAAAA CAATGCAGTG 1320
TGAGGCCGGG TGTGTTGGCT CACGCCTGTA ATTCCAGCAC TTTGGGAGGC CGAGGTGGGC 1380
GGATCACCTG AGGTTGGGAG TTCGAGACTA GCCTGACCAA CATGGAGAAA CTCCGTCTCT 1440
ACTAAAAATA AAAAATTAGC CAGGCCTGTA ATCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGCCAGA 1500
GAATAGCTTG AACTCAGGAG GCAGAAGTTG CGTTGAGCTG AGATCATGCC ATTGCACTCC 1560
AGCCTGGGCA ACAAAAGTGA AACTCCGTCT CAAAAAAAAA AAAACAAAAA AAACAAAAAA 1620
AAAAACCCAA CAACGCAGAG TGGAGTGATA GCCTAGGGGA GATGACAGAG TCCAGGAAGG 1680
CCTCCTGGGT TGCTGACATT TGAGGCAAGT CCTGAGTGAT GAGACAAAAC CAGCTCTATA 1740
AAGAGCTAGA CGAAAGTCTT AGACCAGTAT TTCTCATGAG GAGGAGACAG CACTCCAAAA 1800
TCCATCCTTT GGCCTGGCGC GGTGGCTCAC GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCTGA 1860
GGCGGGTGGA TTACCTGAGA TCAGGAGTTC GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGCAGAAACC 1920
CGTCTCTACT GAAAATATAA AAATTAGCCG GGTGTGATGG TGGGTGCCTG TAATGCCAGC 1980
TACTCGGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCACT TGAACCCGGG AGGTGGAGGC TGCAGTGAGC 2040
CGAGATCATG CCACCGCACT CCAACCTGGC GACACAGCGA GACTCTGTCT CAAAACAAAC 2100
AAACAAACAA AATCCGTCCT TTGCAGCAGC AACACGCACG CTTTCTGGCA CCTCAAAGGG 2160
GATTGTCCAA GACTGGAACA CTGGCTGCAG GGAGGGGGCC GGGTGCAAAG AGCTGGTTTC 2220
TGGGTGGACA CGCAGGACCT TTGGAATGCT CGCTACCCCA CTCAGCAGTA TTTATACCTC 2280
TTCTCCAACT GCGAAGTCAG AGCTTTTTCA TGCAGGCTGA GAAAACTCCG AATAAGGCAA 2340
CTTCAGGCCA GGACATAAGA CGCATTCCAT ATTTCACTGT AATTGCTTTC AAATTAGGTT 2400
ATGTCGTCAT GTAACAGGCA CACACAGTGC ACTTGCTTTG CCCCTGGCTG GGGTTGGGTC 2460
CTGGACAGGC TGCCCCGTGT GTCGCTGAAC TGCCGCAGTG CTAGCCCTGA TTGCCTGGGC 2520
AGTAGGGCTG TCTGCGTCCC ACGTTGCTGC ACCCATCTAA TTTGTGGCTG TGTTATTGTG 2580
ACCTGCTCGT TTTCTGTTCT TTCAACCTGC TTCCTGGCTT TTATCTCCTT CAGAATCTGG 2640
TGGCAGTGGA TCTTCAAAAA GTGCTCAGGT GTGCAGTCTC ACAGGCCAGA GGCTCCACGG 2700
GCCCCCTTGC CAGGGCGAGC ATCTCTGCCT GTGCCGCTGG TAACCCAGAT TCCAGAAGGC 2760
TTAGCCGTCT GGCCCTGAAA GCGCCTTTAT AGTTGGTGAT GAAGCCCATG GGCTGGGGAG 2820
CCGTTTCTGC TTTCAGGAAC TGAAAAGATG CCCCAGTGGG GCTAGGCCTT GCCTGAGGTC 2880
TGGCAATAGC CTGCCAGATG GGTGATAAGA AGGCCTACCC AGGTGATAAG CCTACCCAGG 2940
AATAAATAGC TGTACCTCCC CTGTGTCCAA GCCCTGGACA CCCTTCCCTA GGACCCATGG 3000
AAGCAGGAAC CATGGGCAGC GTCAGAGGCC ACAGCAGGCA AGGTGGAAGT TCAGGAGGTG 3060
GGACGGCGCC CTCCCCCTCA AAGCAACTGA TGCCCCAGCG GAGCGACAAA CCCTACACGG 3120
TATTTCAGAG CCAAGGTTTG AAAACTCCCA GGGTGCTAGG GAGCTCCGTC TGGCCTCCGG 3180
GTACCTGGGG TTGGGGCTGG CTGTGGCCAG TTGCAGTCAA CCCTGAGCCT GGGCAAAATG 3240
CATGCAGGCT GGTCCTCCTG GGTGATATCC TGCTAGGCGG GTGGGCAGTG TACACGGCAG 3300
AAGAGGGTTG CGGCATGAGG CAGCAAACGT TTTTTTCTAA AATCTTGTCA AGCGTGGGGT 3360
CCGTGGAATC CACATGTGAG CATCAGCCTG GTGGGTGGGG AGAGTGAAGC CTGCGATCCA 3420
GTCTGGATCA TGTGCTACAC AGTGCAGAGC CGGCATGCTC ACCCCTCCTG AGGGATCGCT 3480
CGAGCCTATT TCTAGGCCCA AAGCGACTTT GCAAGAGACT CCCTTTATTC TGGGCTTAGT 3540
GGAATTCCAG CTTCCAACAG CCATTTCCCT CCACCCCCTT CAGTTCTGAG AACATGTTTT 3600
GTAACAGGAA GGCAGGAAGA AAAGAGAAGG CGAGTTTGTT CAGCTGGGTC AGCCGCATCC 3660
CACCAAGGCC CTTTCTTCCC TCCAGCTCAC CATCGCTCTG CCCACTGGAA CCACTCGGTT 3720
GCCCTGTGTC TGCCGAATGT TTGTTTCTTA ATCAGCGCCC CAGAGTAGAG AGGGCTTTGC 3780
CTCTTCGGGT TGAGGGAGGG AATCATTGAT GAATGGCTCA TTAAAGCCCA CTGCTGCCAC 3840
ATTCCTGGGT GCTTAGGTCA CCTCCTGAAC AATATCCATC ATTCATTCAC CTACCGCCCC 3900
ACATCCTGGC GGCTGGGAGG GGTCCCTGTG ACGCAGGAAG GACTTTATGA CCAGAGATGC 3960
TAGGTCTCCG TCTCCCTCCT GCAGCCCACA GTGACAAAGC AGAAACTGCT CTTGGGGCCC 4020
CCTGAAGCCC GCCTTAGCTG GGTCACCATG GGCCTTGGCA CACGGAGGGG TGACAGTGGA 4080
TCCCAACTCA ACTGACAAGC TTGCCTTTCT CTGTTCTTCC ACCCCCCTTC CCCGCACTCA 4140
CACCCTGTGC TATTTTAGCA ACCAGAGAAG CCTCTTTAAT AGGCTGCCCG TGTGCAGGGG 4200
CAAGCTCTGA AGCCTCCTCT CTGTGGTTTG GTTCACATGT GTTCTCAAAG ACAGATGAGT 4260
CCACATCCTT CCTTCCTCCC TAGATAGGTC AAGGGCTGGG TGCAGGCTGC CTTCACAGGA 4320
GGGCCAGGGA CAGGCTGGGA GGAGCGGGGC CACCTTTTGC GAAGCGGGTG ATCTGCTGGG 4380
GCGTTGCTCT GCCTGCCTGC CTTGTTCTCT GAGTTTACCT CTAGCTTGGG GACCAAGGGT 4440
GGGCTGGGGC CTTCTTTTTT TTTTTTTGAA ACCGAGTCTT ACTCTGTCTC CCAGGCTGGA 4500
GTGCAGTGGC GCGATCTTGG CTCACTGCAA CCTCTACCTC CCAGGTTCAA GCGATTCTCC 4560
TGTCTCAGCT 4570