EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-40105 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:39172920-39177570 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs973009chr1939174332hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr19:39176207-39176218CTAATCCTCTC-6.02
Foxd3MA0041.1chr19:39175584-39175596GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39175588-39175600GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39175592-39175604GTTTGTTTGTTT+6.32
RREB1MA0073.1chr19:39177414-39177434TGGTTTGGGTTGGTTGGTTG-6.4
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA-6.43
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA+7.04
STAT1MA0137.3chr19:39175026-39175037TTTCCTAGAAA-6.14
Number of super-enhancer constituents: 79             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39172709-39178176Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39172839-39177657Aorta
SE_02408chr19:39172990-39177649Astrocytes
SE_02946chr19:39173560-39175782Bladder
SE_02946chr19:39175844-39176424Bladder
SE_02946chr19:39176426-39177590Bladder
SE_03166chr19:39174301-39175014Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39175825-39177560Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39172941-39177792Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39173279-39175506Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39175517-39177731Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39172836-39178090Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39173207-39177647Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39173597-39177838Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13194chr19:39173530-39174621CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39171584-39177811CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39172843-39178692CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39173158-39178239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39169957-39177919CD8_primiary
SE_23062chr19:39172808-39177650Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39172948-39175688Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39175772-39177606Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39172745-39175747Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39175790-39177583Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39172863-39178234Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39173105-39177586Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39172828-39178145Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35430chr19:39173018-39177757HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39172846-39178074HUVEC
SE_38896chr19:39172978-39177574IMR90
SE_40018chr19:39173109-39177708K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39173026-39175372LNCaP
SE_41601chr19:39175790-39177612LNCaP
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_44161chr19:39172957-39177683NHDF-Ad
SE_44797chr19:39173417-39177160NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_46686chr19:39173697-39175316Ovary
SE_46686chr19:39175843-39176491Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39172966-39175743Pancreas
SE_47461chr19:39175774-39177484Pancreas
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39172970-39178180Right_Atrium
SE_49449chr19:39173064-39175397Right_Ventricle
SE_49449chr19:39175778-39177507Right_Ventricle
SE_50056chr19:39172842-39178237Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39172773-39177883Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39173163-39177229Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39172716-39177734Spleen
SE_54534chr19:39172958-39177716Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39173251-39174352Thymus
SE_55638chr19:39174378-39175365Thymus
SE_55638chr19:39175739-39176457Thymus
SE_56725chr19:39172594-39175708VACO_400
SE_56725chr19:39175804-39177608VACO_400
SE_57359chr19:39173016-39175736VACO_503
SE_57359chr19:39175799-39177608VACO_503
SE_58038chr19:39172904-39175754VACO_9m
SE_58038chr19:39175814-39177664VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39172985-39177528HSMM
SE_64225chr19:39172977-39177763NHEK
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39172837-39175413H9
SE_68725chr19:39175534-39177843H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr193917308739175609
chr193917500039175365
chr193917734039177518
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CTGCCTGCCT CAGCCTCCCG AAGTGCTGGG ATTACGGGTG TGAGCTACCA TGCCCTGTCT 60
CTTTTTTTGT TTGTTTTTTT TCCAAATTGA AACAGGGTCT CACTATGTTG CCCAGGCTGG 120
ATTGAACTCC TGGCCTCAAG CAGTCCTCTC GCCTTGGCCT CCCAAAGTGT TGAGATTAGA 180
GGTGTGAGCC ACCATACCTG GCCCTGTAGA GGGGAGGCAT TGATGAAGGT CAAGAAGTCC 240
TGTTAGCTCT GCCTTCAGAA TCTACCCCAG GTCCTTTTAG TTCTCTCCAG CCTCACTGCT 300
GGAACCCTCA CCCAAGCCAC CACCTTGCAG TCCACACACG GCCACTGGGA TTGGGGCGGC 360
GTTCTCCGCG CGAAATCTGG CTGTGCTCCT CCCCCATGAG GCCCTCCAAA GGCTTCCTCT 420
TCTTAGGATG AAACCCACAC TGCCAGCCGA AGCTCCTCAG GCTCCCACCC TCTACAAGCT 480
CCTTCTGCTC CAGCCACACT CACCAGGCCC GAGTTCCCAC CTAGCACCTT CCCTGGGAAT 540
GATCTCCCCC TGGTTGGCTC TTTCTACTTA TTCAGCCTCA AATGTCATCT CCACTGAGAG 600
GCCTTTCCTG ACCTGCTGAG CTTGATTCCC TCCCCTCCCC AGTCACATTA CTCCGTGTTA 660
TGGTACCCAT CCCTGTCTCC TTAGCTTGTT TTTGTCTGTA TTGGCTCTTC CACTAGACTG 720
TAAGTTGCAT GAGGGCAGGG ATGTCTGTTT AATCCCAGTG CTCAGGATAG TGTATGGCTC 780
GTGATAGATG CCTAGTACAT TTTAAAATGA GAACGAATGA AGTTTGGGAG AGGCTCAGAG 840
CAGTGAGTCT CCCCCTTGTT GGGGGACTGG GGAGTGCCTG GGAGGGGCTA TCTGGTGCCA 900
GCGGTTTGGA GTGGCTGGGA TGACTCTGGA ATCCTGTGAG GCCCAGTCAG TTTCTTTGGT 960
TCTCATGCAG TGCAGTGCCC TCAGACCTAA CCATTTTGTT CCGTGCTGGC TTGAAAGGGT 1020
CTGCCTCCCT CCCAGTGCAG CCCCTGCCTC TCCTCTTTCT CGCCCCCCGC CCTCCTCCAG 1080
AGAAAGCAGG TGGTGAGGGC TCTCTAACCC AGACAGGACT TGCTGTTCAG CCCCAGCTTG 1140
AAATTGATTT CCTCCAGCCC TCCTTGAGCC AGGCCCCGTG AACAGAGGAG GGGTCTGAGC 1200
CAGGCCTCCT AGGCCATTGG TGGGAGGGAG AATGAGACAG CCATTTGGCC CACAGGCCAC 1260
CAACTTTTCC CCCCCTTCTC TAAAAGACAC ACAATGGCAG TTGGGCTGCA CCTTTGTGAG 1320
TCACCGGTGA TAGCCCATCA TAAATTGTTA TTTCCTATAT TTCCAGAGCA GCTTTATCGG 1380
GCGTTGCCTG TGCAGTCCGG GAACCGATTT GGTATGGGGT CAGTTAACAT GCTGTCTTGT 1440
TGAAATCTGT CATCATGCCC ATATAAGGCA AACTCCTTGG ATTACTTTTT ACCTTGGCAG 1500
AATCACAGGA ATGTCAAGGT AACCAGGCCA CCTCAGCATA GCTCTGATTC TCACCCGGTC 1560
ACCTGACTTG CCCGCCCTCC CCCATGACTC ACCCAGTGGC TCAGCATGGG GCCTGCTGCA 1620
CTGTGGCTGC TGGAATCTGC CAAGGACCTC CTGGGACTGC CCTTGGTTTT GTGTCTTCCT 1680
TAGAGTAGAT CAAATGAGAG GAACCATGTG AAGTAGCTCA CACAGGGCCT AACAGAGCAA 1740
ACACAAGACG TGGAAAGCAG ACTTGGTGAG GCTTGAGTTT AGTTTGGGGG TTGCGGGGGT 1800
CCCAGCTCTG CTGCTTAACA GCCCTGTGGC CATGGGTATA TCCCCCAGCA TTCAGAGCCT 1860
TATCTGTAAA ATTAGAGCAC GCAGAACAAA CCCTGGTACA CACTAAGTGC TCAATAAATG 1920
TGAGTCATTT GTGTAATTAT AGTAGGGTAG GCCTTATGCC CCACCCAGTC ATAAAAATGC 1980
CTCTTGCTGT TGTTGGTTCA GGCTCAGCCC CTTAGTGGCT TTCATGGGGC AGGTTGACAT 2040
GGTACCCAGA GTCCTCCTCG GTCCTCTTCC CATGGTGTAG TGAGAGCACT CAGGACCACC 2100
TAGGCCTTTC CTAGAAAACT GAACCCACAC CTTCCCAGTG CTGCCCCACC CTGGTCCCCC 2160
ACCCCCTGCA GGACAAACCA CTCCTCCCTT GTTTTGGGGC CAGGAGTCAG ATCTGCCCCT 2220
GAGAGCAGCA GGGGCCCCTT TGTCCTTTGA CGTCATACCC ACACCGCTCC TGGAGACAGC 2280
CACCCCTTCA TGCCAGCCCC AGGAAGGCTT GTAGGTGGGG CGAGCCAGGG TGAGAGTGTA 2340
GCCCTGTTCC TCGGCCAGGG CAGATGTTTC ACCATTTTTA ATGGAGCAAT TATGAGTCAG 2400
AGGTTTCAGT CTCTACTGGT TCCTCCCGAT CCTATAATTA CTCTTTGGCT ATAGAATCCT 2460
ATTTTGATCT CTTCTTTTCT TTTCTCTTCT TTCTCTCTCT GTGGTCATGG TCAGGTTTTT 2520
CTTTTTTTAA ATCCTCCCAA GACACTGCTA ATGTTGTCTG TCTCATGCAT CCAAGGAATC 2580
TGAGATGGAC TGAATATTGT CAAGGGAAAA AAAAAGAGAC CCCCAAATCC AGAGTGATTT 2640
CTTAACCCAC CCAAATGGCT TTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGAGACG GAATCTCGCT 2700
CTTTAGCCAG GGTGGAAGGC AGTGGCGTGA TCTCAGCTCA CTGCAACCTC TGCCTCCTGG 2760
GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGACTCCC AAGTAGCTGT GATTACAGGC ACATGCCACC 2820
AAGCCCAGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGATAGGGTT TCACCATGTT GACCGGGATG 2880
GTCTCGAACT CCTGACCTCG TGATCCACCC ACCTTGGCCT CCCAAAGTGC TAGGATTACA 2940
GGTGTGAGCC ACCGTGCTTG GCCAACCCAC CCAAATTGTG TACCCTACAC CATCCTAGTG 3000
CTTGGGAGCC AACACCCACT CACAGGAGGC TAAGGGCAAG TTTAGGTAAC TCTTAACACC 3060
ACGAATTAGT TGCCTGCTGG CAAACTTCAA ACTCCAAGCC TGAAATTTCT GGTTGGAGTC 3120
ACCTCCCAGA TGGACTCAGG GATTCATTCA CCCCCTCATC CAGTGCTCAC GGAGCCTCTG 3180
TGAGGTGCAG GCCTGGAGAG GAGCCCTGTG GCCTCAGCAA AGGGCAGGCA GGCTGGTGAG 3240
CACCCAACCT CTGGATCGAG GGGACTCAAT TATGCGGATA AAGGCCCCTA ATCCTCTCAG 3300
TGCTCCAAAC TCACTCTGCT TCTGAAAGGG ATCTTCGTAC CCTGGGTTCA GAGAGTAGGA 3360
AGCCCGCAGG GACCGAGTAT GCATGAAACA AGCCCAAGTC TGTGGGGGCT GTACATGGTC 3420
AAGATCACAG ATTTCCAGAC CAAGCCAGCT CCACCCTAGC TGGGATGCCC ACCCTGAGAC 3480
ACCCCTCTCT GCTTTCACTG GAATAGGATG GCCCTGACTT GGCCGGGTGG ACTGTTGAAT 3540
CAGAGCCTCT CAAAACAGGA AAAAGGAAAA GGATCACCAA GCAGGAGTTT CAGTTGTCAA 3600
AGACAAAACC CTTACCACGA TTAAAGATTA CTCCAGGGCC TCGCATATTC ACCCTTCCAC 3660
CAGCAGGGCC CAGTTTACGG ATCATTTGAA TACTAGCAAA AAAACAAGCC ATCTGCTGGA 3720
GAGATTGAAC AGAGGGAGAA ACAGGAGTGT TTGCCCTGCT TCCAGACACC CCTTTCCTGT 3780
GGCAGTTCCT GCACCTGGCA AGATCTACTG GGGAATTCCC GGGGTCCCAC TAGCTCAGGA 3840
CGGGTGTGTA GCACTTGCCT AAATAACAAT CCCATCAGTG CCCTGTCTGA CCTTTTCTCC 3900
CCAAATGCCA AAGGCCTCTT GTCTGGATGA ACAAATCCCT GGGCGGATTT GTCCAGACTA 3960
AAACGTTAAT TCTAAAGACT GGGCCCCTTA GGCACTCGCT AAGATTCCAG GCCACACTGT 4020
CTCAAGGCCA GAATTGGCTT ACTTGGCTAT CTTTTTGAAA GATCAAAGTT TAAACCAGAT 4080
GATCTGTAGT CCCCCACCCC CACCCTGAAA CCTGAGCTTA GCTGTAAGCA TTGAAAGTAA 4140
ATGGGGTGTT TGTAGCTCAC CCTCCCTGTT CTCCAGGTGA AGGGCCCCGT GTGCCTGATC 4200
ATTTCATAGC AAAATGCTAG ATGGGGCCAG AGGAGGCCCC AGCCTCTGCT GCTGCCCTAA 4260
TTTTAAAACT GCCTTTTGGG AGTGTAAGTT TCCTCTGTTA AAGGTAGTTA TTTCAAGGTA 4320
GGCCTCACCA TCTCCTCCTC CTGGTGAGAA GCTCTGCCTG GAGGGCTGAG CACTGCCTCC 4380
CGCTCTGTGG GCCCCACCTG CCTTGGGTTG AGACCTATCT CTTCCTGGAC TCTGTGTGGG 4440
GAGTGCAGGC TCTTCCCCTT GGGGAGAACC CAGTTCTTTG ACGTATAATC TGAGTGGTTT 4500
GGGTTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTT CCCATGTGTG GGATGGCTCC GGAAGTCTGT 4560
TTGAGAACAG AGGCAGGCTC AGATGGGAGC AGCTCCTACC CCGGGCCGCC TATCCCCCTT 4620
TACCCTGGGG TTTCTTTTAG CTCCAAGCAT 4650