EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-40103 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:39164710-39168360 
Number of super-enhancer constituents: 71             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39165147-39167595Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39164613-39166814Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39166901-39167874Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39164445-39171596Aorta
SE_02946chr19:39166206-39167906Bladder
SE_03166chr19:39164661-39165957Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39166126-39167588Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39164983-39168193Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39164489-39168342Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39164448-39170203Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39164765-39168166Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39164796-39167643Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39164569-39168138CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39164572-39168378CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39164617-39170179CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39165018-39168386CD8_primiary
SE_23062chr19:39165306-39165967Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166087-39166803Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166892-39167972Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39166141-39166668Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39166954-39167795Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39166028-39167370Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39164610-39168530Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39164574-39167863Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39164629-39166814Gastric
SE_31384chr19:39166841-39168068Gastric
SE_35812chr19:39164437-39168549HMEC
SE_36926chr19:39164423-39168326HSMMtube
SE_38012chr19:39166134-39168129HUVEC
SE_38896chr19:39166079-39167996IMR90
SE_40018chr19:39164614-39168462K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39166914-39167674LNCaP
SE_42097chr19:39164441-39171613Lung
SE_44161chr19:39164690-39165914NHDF-Ad
SE_44161chr19:39165948-39168436NHDF-Ad
SE_44797chr19:39165055-39165813NHLF
SE_44797chr19:39165893-39167853NHLF
SE_45660chr19:39164558-39165979Osteoblasts
SE_45660chr19:39166130-39167979Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39166251-39166741Pancreas
SE_48075chr19:39164445-39168285Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39164445-39168503Right_Atrium
SE_49449chr19:39164658-39165488Right_Ventricle
SE_49449chr19:39165542-39166833Right_Ventricle
SE_49449chr19:39166954-39168021Right_Ventricle
SE_50056chr19:39164598-39172640Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39164476-39168293Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39164591-39167784Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39164439-39168563Small_Intestine
SE_53291chr19:39164439-39168017Spleen
SE_54534chr19:39164447-39168169Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39164641-39165676Thymus
SE_55638chr19:39165817-39166888Thymus
SE_55638chr19:39167040-39167924Thymus
SE_56725chr19:39164643-39166779VACO_400
SE_56725chr19:39166876-39167993VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39164405-39167784HSMM
SE_64225chr19:39164570-39167858NHEK
SE_65266chr19:39164394-39165412Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39165862-39166710Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39166857-39167918Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39165582-39166750H9
SE_68725chr19:39166945-39167695H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193916472439166067
chr193916609339167732
chr193916800239168130
chr193916630239166492
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CGCCCGGTGT GATTATTTTT ATGAAGGAAA AGACCAGAGT CCTTTAAGAG GGGACAGTGG 60
GGGACTTGCA ATAGATTGTG TGGGAGCTGT CAGGGGAGAC TTTCCAAGAT GATGACAGTG 120
AAGTGAGGCC TGGAGGGAGA GTTAGAGCCA ACCTCAGAGA AGGGAACACT GTTCTAGGCA 180
GGAGGACCCA GGGTTGTGGG AAGAGAGAAA TAAAATGAGA CCAAGACAGT GGGGAGAGCA 240
GTGTGAGTTG AAGTCAGAGG GGTGACAGCA GCCAGAATGT GCCGGTAGCG AGGATCTTGG 300
ATTTTATTCT AGCTGCAATG AGAGCTTTGA TTCTACAAAT ATTTATTGCG TGCTAGTCAC 360
TGTTTTAGGT ACTGGGTGTA CAACAGTGAA AAAAGAACTT CCCAGCCGAG TGGAATGCCG 420
TGGAGCATAT CTGTTTCGAT GCTGGGACAG ATCCCTAACA CAGCTCATTA AAGCAGATAG 480
CACCATTCCG TCTCTTTCTT CAGCTTCACT TTACGTCAGT CCCAGCATTT TTATCCCTAC 540
CCTTACAGAT GAGAGAACTA AAGTTCAGAG AGGTGACGTG ACTTGCCCCA GGCCCCTCAG 600
TCAGTAAAAG ACAGAACTGA GAATCCAACC AGACTCTTCC CTTTTTAGGT TATTTCTCTA 660
ACATTAGGGC CGAGTATCGA TTCTCTTTAC CTCTGACTTC GTGTCCCTGG TATTAAGACT 720
CAGGGCCCAC AGTGCCTCTT GGAATTCAGG CATATGGTGA CATCAGTGTG CCTACCATTC 780
AGGTCTTGGA GAATAGGGTA TGGCGAAAGG AGAGAACTCG TGATATCGCT GATTCAGTAG 840
CCCAGAGTTG TACGAGTCCT TGGGTGTTTC ACCTTCATCC AGGCATCTGA GATTGGAGAC 900
AAGCATGTGG CTGAATGACG TATCTGGGGG AAGCTGTCTA AACAGCCGTG TGGAGTTGGA 960
GAGTTGAATT AGCTCTGTGG CCAAACCTCT GGGCTCAGTC TGCCTATATA TGGCTTGATC 1020
TCAAAGAACA GGTGATAGCA GTAGGAGTTG TTTTCTGTGT TGCTGGTGGG AGATGCCCAG 1080
GCACATTCCT TTGTAGACAA GCACAAACTA GATATTTTTG AAATCGGAGG TCTGAAACCA 1140
GCCGAAGAAT TAATCCTGGC CTGGAAAGCA TATGGGAGAG TACAGCCAAC CTGGCTTGGG 1200
TGTTGCTTTC TTGGTTTTGT TGCATTTTTG AGGCAGGGTC TTGCTCTGTC ACCCAAGTGG 1260
GATCACAGTG GTACAATCAT GGCTCATTGC AGCCTTAACC TCCTGGGCTC AAGTGATTCT 1320
CCTGCCTTAT TTTTTGATTT TTTTTGTAGA GGTGAGGTCT CACCATGTTG CCCAGGCTGG 1380
TCTTGAGCTC CTGGGCTCAA GTGATCCTCC ACCTTGGTCT CCCAAAGTGT TAGGATTACA 1440
GGCGTGAGCC GCTGCCCCTG GTGACTTTGT TGCTTTTTAA TAAGCCCAGA AATTTCTTTC 1500
AAGAGGGAGG ATCTTTGTGA ACATCTTGAG CCGCGTTCTT GATCGCTGGC TGTGGAAGCC 1560
TCCACCTATC AGGCTCAAGT CCATGTTGCT ATCATGTGCA CTTTGGCTGG TGAGGTGCTG 1620
AGCAGAGGTT TCAGCCTCTA CCACAAGGTT TCCTGATGAA AGGTCAGCTG GGTGGGCCCA 1680
GCTTCTCCTT ACCCAACTGA GAGGCCTCAT AGAGCACAAG GCCTGGGTAC GGAGGTTCCT 1740
GGGGCTCCTG CCATACCCAG CCAGGCCAAG CAGAGGGCCC CAGTGTGTTG TTGGGTGCTG 1800
AGAGGCTGCC CGCAGCTCTC GCCTGTGTTG GAAGGCTGTA GACTTGGCTT CTCCCAAACG 1860
TAAGCTGTGA AGCCATGGAC TCAGATTCTC AGCCTGGCCC TGCTACTTAC TGTGGGACCT 1920
TGGGCAAGGA AGTCTCCATT TTCTCTTTTA CAAAATGGGG CCAATAATCT GACTACCACA 1980
GGGCTGTCAG GATGCAGCGG GATGGAGCCT TTATAGGGTC TTGTTCTGTG GGATCTGGAG 2040
TCCCATATGG GAGTTATTAG TTGAGGGACG AGGCATCTGG GAATCTTTAT TCAACTAGGA 2100
AACTTCAGCC AAAGAACTAA TGCCATAGAG ATGTCTTATG GTGTCTGCAT TTGAAGCCAG 2160
CGGTTCTTTG AAAATTTATC CTGAGTTCCA GAAAGCCAAC TGCTAGATAA GTAAGCATTG 2220
AGCATTTAAG GGGTCCTGGA AGTAAGATTC CTGGAAAGAA GCAGCAATCT CTTACTCATC 2280
CCCGATTATC TCAGACACAG AGTGGTGGAT GGAACCTTTG TGGTTTAGGG GCTGACTCTT 2340
GGTATTGCTG GATAAGGAAT ATGAGCCAGT AGAGACGAGT GTGTTGTATA GCAGTGTCCT 2400
GCGACTGGGC TGGAGACGTG GCTGAGGGAG GCCAGGGGGC CTCAGAGTGC ACGGGAGGAG 2460
GCTTACAGAG GTCTTTTGCA TCCTGCAGAA CACCACATGT GTCCTTCCCT CTGGGAAACC 2520
TCCCACCCGG GCAGGGCCTC TGGGGCCGGA TGTGGAAGGT AAACAGGCTG CCTTTCTGCT 2580
CTCTACCACA GACAGGCCCG GAAAGGCCTG AGTAGGAGCT TTTCATCTCA GGAAGCCCTG 2640
AGGTCCCACA GCTTCTCCTG AAGCAGCCTC ATTGTCCCTT TGTAAGAGCA TGACCAGGTG 2700
CTCTAGCTCC TGGAGCACCA GTGGAGAACT AGAGTGGCCC AGGTGCTGAT GCCAAGTTCG 2760
AGCAACAGCT CCTGGCGGGT TTCCCTGCAT CCCCCCACTC ACTCCCATCT ATTCTTCACA 2820
TAGGGGCCAA AGAACATCCT GCTTGACATC TTGATCAGTG TCCCTTGCCC TCAGGATCAA 2880
ACCTGCAAGT CCCCAAGGCC CTGCAGGATC TGTTTTCTCC TCTCTGTGCT CCGGGCGCAT 2940
GCCAGCTGCC TCTCTGCTCC ATGCTCATTC CTGCCTCCTG AGGGACTTCA CACGGGGCCC 3000
TTGCCTCTGC CCCTTTCGCC TCAGCTCGCC ACCTACCTCC TCCTCATTCT TCAGATGGCA 3060
GTTTATGCTT CACTATTTGT AGGGCCGTCG CACCTGACAC CTCCAGCCTA GGTTAGGAGC 3120
ATGTCCATCA CCTCTACTTC TCCTTTTAAC TCCAACCATC CTTGGCTCTC CCTCTCGAGG 3180
GTCACGAGAG CAGAGAGAGA ATCTATTTTG TTCACCACTG TGTCCCTACC ATGTGGGACA 3240
TTGTCAAGGC AAATGTAAGT GTGCACTAAA TAAATATGTA TTGAATGAAT AGATAGCCAA 3300
ACAGACAGAA TGGATCTGCC ACAACACAAA CAGGATGCTT TTCAAGTGGG CAGAAGATGG 3360
AGACATCACT TGTCGAGACA CTCAAACAAG TGGCTGGATG GATGAGTGGC AGATCCATTC 3420
TGTCTTTCTG CTTGGCTTTA GGAGTAGAGG GATCACCCAT GGTCCATCCT CTGAGGACAA 3480
GGGTATCATG ACCGCCCAGG CCCCACTCAC CCCTGCCAGG CTCATTGCAT CCCATCTAAA 3540
AGTGTGCTCT GGAAGGTCAT AAGAAGTCCT CACCTGGGAC ACTTCTAGGC CCAGTGTTCA 3600
GCCAGCTGTC CTGAGTTCTG CATCAGTCCC TGCTAGATAT GAAACACAAA 3650