EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-39341 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr19:16425720-16428810 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs410867chr1916427111hg19
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr19:16428265-16428278TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:16428269-16428282TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:16428262-16428275AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:16428266-16428279AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:16428270-16428283AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:16428261-16428274AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr19:16428273-16428286TAATTAATTAAAT+6
POU6F1MA0628.1chr19:16428263-16428273ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:16428267-16428277ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:16428271-16428281ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:16428263-16428273ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:16428267-16428277ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:16428271-16428281ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr19:16428704-16428715TGCTTTGTTTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02121chr19:16426207-16428157Aorta
SE_14486chr19:16426942-16427904CD4_Memory_Primary_7pool
SE_30197chr19:16425439-16428327Fetal_Muscle
SE_31861chr19:16426443-16427896Gastric
SE_37239chr19:16425803-16428299HSMMtube
SE_38557chr19:16425794-16428412HUVEC
SE_41301chr19:16426162-16428123Left_Ventricle
SE_42601chr19:16426138-16428104Lung
SE_45405chr19:16426148-16428002NHLF
SE_49016chr19:16426131-16428080Right_Atrium
SE_53383chr19:16426178-16428098Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr191642652316427721
chr191642838816428438
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I016314chr191642565016428905
Enhancer Sequence
CCGCCTCCAG GGTTCAAGCG ATTCTCCTGT CTGCTACCTT CATAAACACA TGATGGGCAG 60
GCATTCTCAT GCCCCTTTGA CGAATGAGGG ACTGAAGTTC AAAAAGAAAA CATCAGGCCA 120
GCGCAGTGGC CCACGCCTGT GATCCCAACA CTTTGGGAGG CTGAGGCAGG CGGATCATCA 180
CTGGGATCAG GAGTTTGAGA CCAGCCTACC CAATATGGTG AAACCCCGTC TCTATTGAAA 240
ATATAAAAAT TAGCTGGGCG TGGTGGCACA TGTCTGTAAT CCCAGCTATT CAGGAGACTG 300
AGGCGGGAAA ATTGCTTGAA CCTGGGAGGC AGAGGGTTGC AGTGAGCTGA GATTGCGCCA 360
CTGCACTCCA GCCTGGGCAA CAGGGCGAGA CTCCATCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAGAAT 420
ATCATTCACT CAAGGTCAAC AAGTACAAGT GCCAGAATCT AAACTCAGGG CTCCAGCTGT 480
CCATCGCTTA CCTCACTGAA CAGACCAACT GGGAGGATTA AATGAGAAAA TACATCCAGA 540
CAAGCCTGGC CAACATGGTG AGACTCCCGT CTCTACTTAA AATACAAAAA TTAGCCAGGT 600
GTAGTGGCGT GTGCCTGTAA TCCCAGCTAC TTGGGAGGCT GAGGCAGGAG AATCACTTGA 660
ACCTGGGTGG TGGAGGTTGC AGTGAGCCGA GATCGTGCCA CTTCACTCCA GCCTGGGTGA 720
CAGAGTGAGA CCTGGTCTCA AAAAAAAAAA AAAAGAAAAT ACATCCAGAT CCTCAGCATA 780
GGGCCTGGTA TACATTAGGT GCTCAGTAAG TATTGCTCTC TCCCCCTCTT CTGTCCTGTG 840
TGTCAATAAG AGCGAGGCAG TAATGGCCTG GCTGGCAAGA AGATGATGAG AGGTTCTGAT 900
GGGAACCCAT CAGTCATCAG CCCAGTGCAA TCCCGCATCT TCCCCAAGCA CTCGCGACCT 960
ATTTATGTAG TAGTAAGAAA ACTCCAGAGG CAGGGCCAGG CGTGGCGGCT CAGGTCTGTA 1020
ATCCCAGTGC TTTGATAGGC AAGGGCAGAA GGATCGCTTG AGCCCAGGGG TTTGAGGCTG 1080
CAGTGACCTA TGATCACACC ACTATACTCC AGCCTGGGAG ACAGAGCGAG ACCCTGTCAA 1140
AACACACACA CACACACACA CACACACACA CAAACTCCAG AGACAACCAG GCAAATCACA 1200
AAGTGACCTT TCCTATCAGA CCTCAGCTCC AAGCATTGCA GCGACAAGGT GGTGACCCGA 1260
GATAAGAAGC GCACTTGCAG AGGGTGCCTC TGCCCGTATC TCTCCGCATC CTCAAGAAAC 1320
ACAGAACTAT CAAACATTTT TGCAACATGA GGAGCCAAGT TTTGCAACAT ACTGAAAAAG 1380
GGTTGTGCAA ACTTCAGCAG AAACACCCCA ATTGCCCCAG CTGGGAGTCA TCATCCAGTT 1440
GCTGCTGTAA TGTGATTGTA ATTCCTCCAG TGTTCATAAT TTGTCTTGGA AGCTCAGCTG 1500
TATTTTACAT GACGTGTTTT CTGTAGAATT CCTGAGTACT TGCTCTTGGG ATCTGAGCCA 1560
AGTGCACACA ATAGCTATTT GGGGCAAAAC AGCTGGTAAA GAGAAAGGCA GCTTAGACCC 1620
TGAAGAAAAG TGGAAAGAAT TCAAGGTTAC TAGAAATGTC CAGGGCCCAG TAAAAGAAGA 1680
TTGTAATCTC TCTATGTGCA GAAACAGGCC ATATACTTCA TCAGTTTCCT CTCCATGCTC 1740
AGCTCAGCAT GGAGCGGAAG CTCAGTATTT ATTTGTGGCT CAGACGAAAA ACTTCTTGTT 1800
TGCAAGTTTC CTGAGCCCTT GAAGACAGCC TGGCAGGAGA CAACAAATGC AAAGCTGCAC 1860
ACGTACCACT TATCCAATCC CCTGTTAGTG ACAGACATCA CCAGTCAATC AGTCAATCAC 1920
AGACATGACC AATCCATCAC AGCACTGGGC CTGGCTACAA CCTCAGAATC TGCACCAGCA 1980
CAGTGCTAAA AGCAACTATT ATCAACAGAT TTGAGGAAAA TATTCTGCCT CCTTGGTCTA 2040
CATTTATAAT GTTGAGTTGT TAGGAGAAGA TAAGGGGCAG CAAGAAAGAG ATGACAATAA 2100
GATAATCACC ATCGAGGCTG GGCACTGTGG CTCATGCCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG 2160
GCTTAGGCAG GAAGATCACT TGAGCCCAGG GGTTCGAGAC CAGCCTGGGC AACAAAGTGA 2220
GACCCTGTCT CTACAAAGAT TAAAAATTAG CCAGCCAGGC CAGGCACGGT GGCTCACGCC 2280
TGTAATCCCA GCACTTTGGG AGGCCAAGGC GGGCAGATCA CCTGAGGTTG GGGGCTCAAG 2340
ACCAGCCTGA CCAACATGGA GAAACCCAGT CTGTACTAAA AATACAAAAT TAGCCGGGCA 2400
TAGTGGCGCA TGCCTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ACTGCTTGAA 2460
CCCAGGAGGC AGAGGTTGTG GTGAGCAGAG GTCGCACCAT TGCACTCCAG CCTGGGCAAC 2520
AAGAGCAAAA CTCCATCTCA AAAATTAATT AATTAATTAA TTAAATAAAA ATTAGCCAGT 2580
CGAGGTAGTG CACACCTGTA ATCCCAGCTA CTCAGGAGGC TGAGGCGGGA GTATTGCTTG 2640
AGCCTGGAAG TTGAAGGCTG CAGTGAACTA TGATCGCATC TCTGCATTCC AGCCTGGGTG 2700
ACCCTGTCTC CAAAAAACAA ATCATCATCA GGAAACATAA AGTTCCCAAC AGTGGCCAGG 2760
TGTGGTGGCT CACGCCTGTA ATCCCAACAC TTTGGGAGGC CTAGGTGAGT GGATCACCTG 2820
AGGTCAGGAG TTTTAGACCG AGTCTCCCTC TGTCACCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCATGA 2880
TCTTGGCTCC CTGCAACCCT GCCTCCCAGA TTCAAGTGAT TCTCCTGCCT CAGCCTCCCA 2940
AGTAGCTGGG ACTACAGATG TGTGCCACCA TGCCTGGCTA ATTTTGCTTT GTTTTTGAGA 3000
TGAAGTCTCG CTCTGCTGCC CAGGACGGAG TACAATCAGC TCACTGCAAC CTCCACCTTC 3060
CAGGTTCAAG GGATTCTCCT GCCTCAGCCT 3090