EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-34003 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr17:38688620-38691250 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr17:38689734-38689753GAATGCCCCCTTGTGGACA-6.02
TP63MA0525.2chr17:38689480-38689498AACGAGTCATGACATGTG+6.28
Number of super-enhancer constituents: 47             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00517chr17:38687646-38700726Adipose_Nuclei
SE_02998chr17:38689847-38690495Bladder
SE_10389chr17:38686949-38691067CD19_Primary
SE_10931chr17:38686345-38694174CD20
SE_12200chr17:38689830-38690812CD3
SE_14639chr17:38689341-38691421CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15803chr17:38689447-38690749CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16947chr17:38689891-38690629CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17295chr17:38688932-38691243CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17919chr17:38688443-38691452CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18283chr17:38689065-38691171CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19186chr17:38689248-38690668CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20639chr17:38687018-38689016CD56
SE_20639chr17:38689146-38690978CD56
SE_20960chr17:38689485-38690986CD8_Memory_7pool
SE_21909chr17:38689363-38691144CD8_Naive_8pool
SE_22423chr17:38689616-38690839CD8_primiary
SE_25403chr17:38686357-38691359DND41
SE_25943chr17:38688142-38691233Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26577chr17:38688508-38691869Esophagus
SE_29882chr17:38688433-38689731Fetal_Muscle
SE_31181chr17:38687654-38691249Fetal_Thymus
SE_32359chr17:38689005-38689400Gastric
SE_32359chr17:38690803-38691287Gastric
SE_33816chr17:38686113-38690425HCC1954
SE_34508chr17:38690543-38691347HCT-116
SE_34641chr17:38687957-38690807HeLa
SE_35821chr17:38688262-38690519HMEC
SE_38887chr17:38688569-38691238IMR90
SE_41480chr17:38688372-38690845Left_Ventricle
SE_42403chr17:38688893-38700340Lung
SE_44181chr17:38688515-38691364NHDF-Ad
SE_45551chr17:38687599-38700884Osteoblasts
SE_48754chr17:38688510-38691220Right_Atrium
SE_50356chr17:38688525-38691255Sigmoid_Colon
SE_51567chr17:38688442-38691305Skeletal_Muscle
SE_52624chr17:38688523-38691262Small_Intestine
SE_53520chr17:38688782-38700318Spleen
SE_55173chr17:38689428-38690644Thymus
SE_56221chr17:38688346-38691236u87
SE_56976chr17:38688654-38690177VACO_400
SE_58835chr17:38672665-38782311Ly3
SE_61067chr17:38687460-38781557HBL1
SE_61495chr17:38672564-38757231Toledo
SE_62232chr17:38671160-38782171Tonsil
SE_64249chr17:38688245-38690499NHEK
SE_67770chr17:38688346-38691236u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr173869060038691156
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH17I040528chr173868498238700734
Enhancer Sequence
CTGTGGCCTT GGAAACTCAA AAGCCAAGAA TTATTGAGCT TATTGTGTTT GTTGCATTTA 60
AGCTTCTCTT CTGTTCCTTT GTGGTGTCAG AGGCTGAGTT TATTTTGAAC ATGAACAGAG 120
AGACTTCTCT CTCCTTGACA AGCGTGATTT GTTGAATTAG CTAGTTAGGT GGGAGTGTAG 180
TGGTGATACA CTGTGTAGTA GAAGCATTCT CCATGTTTCC ATTCCCCATC ACAGTCACAC 240
AGCTGTGGAT TTCCAGGCCT GATTGTCCAT TGTGTTGATG TCCCAGTTTA TTAAACCACT 300
TCCTTATTGT GGTTCCCAGT TTTTGACCTT TAAAGAAAGA CTTCAATGCA CACATGTATG 360
CAGATAACAC TTGGCTTCGT TTGGATAATT TCCTTGGAAT AATTTCCCAG GGAAAGAGAT 420
TACTGGGTCA AAGGGGGAGG AAGAGCTTCA TGCCTTTTGC TGGTAATTGC TTTACTGCTT 480
TCCAAAGGCA CTATACCAAC CCAGCATCGA CAGTTTATAG TGGATGAGGG GTCAGCTTCA 540
GGGCACCAAG TTATTCACTC TTAGGAAATC AGCTTCCAGG TCCTTCATCA ACCACCCAAA 600
AGGGCCTGTA GATGTGAGAA GTGGAGTCCA GCACAGAGAA TCCCGGGCTG AGAAGTAGGA 660
TGTCTGAAAG TCCAGCCTCG AGGCAGCAGA GTGAGCAGTT AACAGTATGA CCTATGGACA 720
ACAGATCCTG AGTTCGAATT CTGCCTTCAC CACTAAGTGA CCCTGGGCAA GTTACTTAAT 780
TTTTCTAAGT CATTAGTTTT TTCATCTATA AAGCAGGAAT TATAGCAACA CTAAGCCTTG 840
AGGAGGTGAG AGGAAGATTA AACGAGTCAT GACATGTGAA GTGCTTAGAC CAGGGACTAG 900
CACTTGGTAA ATATGTAGAG TGAGTGGTAT TACCATTTCT ATTATTCAGA CGGAGACTCC 960
ATCTCCATCA GCCCTGCTTC TGTAGTGGCT GACCACCTCC TCTTCTGGGT TTCCACGTGA 1020
GACCCCACCC TGGTTCTTCA GTTTTTCCTG GGATCTCGTC TCTCTGAGAC CAAGAAGCAG 1080
TCTTAGCTTT GAGATATTGA GTTGGATGGT CCTTGAATGC CCCCTTGTGG ACAGCTGGCT 1140
TTCTTTCACT CTTTCAGCTG AAGAGGAAAA CTGGCTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTCTCGGGGT GGGGAAGAAG GTGGGGGAGG CCTCCATGTT 1260
TGCAGACAAA ACAGGAAATA GCACGTCATG GCATCTTTCT TGCCGGCTAG GAAGGCATGG 1320
GTGTATGGGT CTCTGTACAC TTACATAAAC ATGGAGGGGA GCTGCATGTG CTGGTGTGCA 1380
GGTGTGTATG TGGGCATACA CTTGATACCA CTCTCCTTGT TACTGGGGTC TCTCACTGGG 1440
TTCTACTGAG ACGATGTGAT TAATGTGATT TGAAAAATGA AAGCCCTGTG CACACACGAG 1500
GACATTGTTA TGTAGAATAG CTTGTATAAC CATTCGGTTG ATCCTTTCAC TGATTTGGAC 1560
ATTCAGTCCC ACAGTTGTTT ATTGAGTACT TACTATGTAC CGGGTCTCCT GAGGTCTGGG 1620
GAGGCTACAG TGACCAAGAC AGAATCTGTT TCCATCCTCT CACAATCCAG TGGGTGAGAC 1680
AGACAGGTGA GTAAACCTGT GGCGTGCTAG TCCAGCACTT GGTAAATATT CAGTAAATAT 1740
GAAGAGTGAG TGTTTTTACC ATATTCCCAG AGGAGGGGCA GAGCGGCTGT GGAGGGGGAA 1800
GGAAGGCTGC CTGGAGGAGG TGACATCTGA GCTGAGCTAT GAACTGTGAG TGATCTATCC 1860
TCTCCCTGGC TTTGGGGCAG AGGGCTTGGT ACAAAAAGCA TTAGTGGGGT TTTGGAAGTG 1920
CAGGCTGTAA CCCCAACTCC CTGAGCAAGT CCTTTTTTTT GGGCCGGAGT TTCCTCCTGG 1980
ACTAAGTCAG GGGATTTGGC CATGAAAGCC ACAGTTTCCA TCAACTTTGA TGTTTTCTGA 2040
CCTTTTATTC CCTCAGCCTG AGGAATTCCC ATTTCTTCCA CTGGTCTTTC ATGCCCCATC 2100
CTCTTCCCTA AAGAAATGAA AACCAGACTG AGTGATAAAA AGCAGTGAGA CATTGGTATA 2160
CACATGTAGG ACACACACAC ACACTCTCAC ACACACACAC TTTCTCACAC TCTCTCTCAC 2220
ACACACACAC ACACTCACAC ACACACACAC ACAGACACAC ACACTCCTCT ATTCCCGCCC 2280
TACCCCTGCT CTGCTGGAAA CCTCGAGCTG CCTCCCAGGT CAGAGTGGTC TGACAAGGGA 2340
GGGGTGGAGT GCAGAGGCAG AGTGGAGGTG AGAGCTCAGC AGACCCAGTT TCTTTTATGC 2400
TTGGCCACTC AGGCAGGTCA CCTTGGGGAG GTTACTGAGC TTCCCAGAGC CTGCTTCCAG 2460
CTCAGCAAAG TACATACCCA CCTGGCAGGG CTTCCGTGAT GATTAGAGCT GCTATATGCG 2520
AAATGCGCCC CCCGGACTCT GTGTAGGACC TAGCAGGCTC TCGGAAAATG GGAGCTGAAA 2580
AGTAATGATA TTACAAAATA TCTAGTGTGG TGGCTCACAC CTGTAATGCC 2630