EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-28993 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr15:93351280-93354420 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr15:93352488-93352507CAGCCGCCAGGGGGCAGCC+6.31
HNF1AMA0046.2chr15:93352268-93352283AATTAATAATTAAAT+6.58
Klf12MA0742.1chr15:93353942-93353957GCGGAGGGCGTGGTC-6.05
PHOX2AMA0713.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr15:93352274-93352285TAATTAAATTA-6.62
YY1MA0095.2chr15:93352620-93352632CAAGATGGCGGC+7.22
Number of super-enhancer constituents: 90             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93350382-93355263Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93351321-93354597Astrocytes
SE_03406chr15:93350992-93351943Brain_Angular_Gyrus
SE_03406chr15:93352538-93354537Brain_Angular_Gyrus
SE_04213chr15:93350937-93355562Brain_Anterior_Caudate
SE_05294chr15:93350768-93355754Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06531chr15:93350669-93355592Brain_Hippocampus_Middle
SE_06939chr15:93350714-93355992Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08169chr15:93350930-93352317Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08169chr15:93352502-93355632Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08934chr15:93352512-93354443Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09652chr15:93349955-93354866CD14
SE_10533chr15:93351009-93354773CD19_Primary
SE_11607chr15:93350814-93355778CD20
SE_12070chr15:93350988-93355082CD3
SE_13564chr15:93350781-93355924CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93350583-93355909CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15588chr15:93350907-93354429CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16031chr15:93351298-93355362CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16747chr15:93351476-93354037CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17069chr15:93350870-93355124CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17547chr15:93350914-93358846CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18103chr15:93350647-93355857CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18547chr15:93350654-93355466CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93350633-93355417CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93350970-93354657CD56
SE_20859chr15:93350648-93355761CD8_Memory_7pool
SE_21781chr15:93351598-93354459CD8_Naive_7pool
SE_22279chr15:93351135-93354892CD8_Naive_8pool
SE_22966chr15:93351217-93355222CD8_primiary
SE_23716chr15:93351127-93354525Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93351235-93353574Colon_Crypt_2
SE_24264chr15:93353788-93354144Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93350804-93355497Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93350743-93354513Esophagus
SE_27996chr15:93350943-93355551Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93350776-93355741Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93351018-93355815Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93350936-93355586Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93351112-93354423Gastric
SE_32877chr15:93352538-93354900H1
SE_33509chr15:93350953-93356085H2171
SE_33848chr15:93350818-93352457HCC1954
SE_33848chr15:93352527-93355881HCC1954
SE_34564chr15:93350755-93353970HCT-116
SE_34679chr15:93343662-93356193HeLa
SE_35377chr15:93350917-93355359HepG2
SE_36003chr15:93351053-93356046HMEC
SE_37354chr15:93351059-93355124HSMMtube
SE_39112chr15:93351110-93355282IMR90
SE_39970chr15:93350921-93354700K562
SE_41310chr15:93350936-93354495Left_Ventricle
SE_42600chr15:93350773-93354539Lung
SE_43471chr15:93350846-93352419MCF-7
SE_43471chr15:93352547-93355811MCF-7
SE_43659chr15:93351234-93355573MM1S
SE_44673chr15:93350972-93354914NHDF-Ad
SE_45291chr15:93351064-93353833NHLF
SE_47211chr15:93346289-93355941Panc1
SE_47960chr15:93351302-93353578Pancreas
SE_47960chr15:93353817-93354264Pancreas
SE_48549chr15:93350767-93354450Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93351031-93354449Right_Atrium
SE_50492chr15:93350994-93354648Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93350138-93355727Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93351272-93351908Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52184chr15:93352090-93353925Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93351139-93354533Small_Intestine
SE_53626chr15:93350055-93354623Spleen
SE_55179chr15:93351149-93354451Thymus
SE_56153chr15:93350977-93355800u87
SE_57089chr15:93351141-93352494VACO_400
SE_57089chr15:93352542-93354015VACO_400
SE_57089chr15:93354024-93354395VACO_400
SE_58215chr15:93351274-93352463VACO_9m
SE_58215chr15:93352576-93353598VACO_9m
SE_58215chr15:93353610-93354109VACO_9m
SE_58414chr15:93350819-93397613Ly1
SE_59292chr15:93350909-93397284Ly3
SE_59816chr15:93351073-93397403Ly4
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93351225-93353925HSMM
SE_64371chr15:93350953-93355902NHEK
SE_65898chr15:93350806-93353833Pancreatic_islets
SE_65898chr15:93353894-93356264Pancreatic_islets
SE_67338chr15:93351234-93355573MM1S
SE_68639chr15:93350938-93376211TC71
Enhancer Sequence
CATCACAGAA TTATGCAAAA TGCCATGGAA TCAGCACTCA ATAAAGACAA GTCTCCCTTT 60
CCTTACCCTG AGAAGGGCTG TGAGGGAAAG GGGTCTTCAG TGTGCCTCGG AATCACCTTG 120
CTGCCTAGTA ATCACAGCTT CTCGGGCCCC ACCCGCCACC GTCCTCAGAA TTTCCCATTT 180
AGAAGGTCCG GGATAGACTC CTAACACTGG CATTTCCAAC GAGCTCCCCG ACATTGGAGA 240
TGCTGCCTGG CTGGAGGACT ATCTGAGAAC CTCAATGTCT AGTGGAAACT TACGTGCCCT 300
CGATTCCAAC CAGGCTCTAC CCCATGAACA AATTACTCTT GCTGAGCGCC AGTGTGAGTA 360
GAAAGAGCTT CCATATCAAA GGCTGCTAGG AGGATTACCT AAGATAACGC AGGCCTTGCT 420
CAAGACAAAC GTTCAGGAAA TCAAAATCGG TTTGGAGATG AAATGGGAAA GACAAGAGCA 480
GCTCCAAGGA GAGAAGAACG TCCAGAAAAC CAAGAAATAG GACTGGTAAA GGGTGCTGAC 540
CAGGTCCCTG GAGCTGCACC CCGCCCCGTG CGCCTCCCCA GCCCCCCGGC CGCACCGTGC 600
CCACCCCGCG CTCGTCGTCC CCCTCGCCCC CAGCGCCACC CTGCACTGCG GACCCGGGAC 660
CGCCTGGGAA ACGCCCTGGT CTGACATGGC TTGGGGCTCT GGGCAGAAGC CAGGTCTGAA 720
AACCAAGGTT GGGGCCTCAT GTGTTAGTCT GGAAGCACCA AGCACCGCAT ACCAAAATAC 780
CTCGAGGCAA CCGTATGGCT TTTTTTTTTT TAATTAAGTT GTTCCCGGGC GGTGGCTCAC 840
GCCCGTAATC CCAGCATGTT GGGAGGCTGA GGCGGGCGCG TCCCTTGAGC ACGGAAGCTG 900
AGGCTGCAGA AGGCTGTGGT CGCGCCACTG CACTCCGGCC TGGGGGACAG AGTGAGCCCC 960
TGTCTCAAAA ATATAAAACA AAATAAAAAA TTAATAATTA AATTAAATGT GTGTAAACAT 1020
GTAGGTGACC TTCTAGCCCT CGGTGAACCA GACTAAAAAA CGCTCCCGCA CTAGGCGTGG 1080
TGCCCGGAGC GGCCCCGCCC TCGGAGCACG CTTGTGCGCC AAGGCTGGTG GCGGAACGCG 1140
GACGTGCTGC AGGCAGGGAA TGAAATGGCG GAGGAAGGCG GGGCAGGGCG CGGCCGGAGC 1200
TCCGCGGCCA GCCGCCAGGG GGCAGCCGCG CGTCTGCGTC CCGCGGGCGG CTAGAACCAG 1260
TCCTGCCGGA AGTTGGGGCG GTGCCTTCGC TTCCGCGGAG CCGTGCCACG TGGCCGGCCC 1320
GGAGGGACAG GGGAAAACAA CAAGATGGCG GCAGCCGGGG GCGGGGTCAG CCCGGCGTCC 1380
CTGAGGCTGC GAGCCCCTTA AAGGGCCGCG TTCGAGGAGC CGGGCGAGAT GAACTGAGTG 1440
GTTTTACCCA GCCGTGGGGG CTGTTCGACT GAACATGGGC CTGGGCGGGG ACAACCGCGC 1500
CAAGCGGACG CGCCCTCCGC CTGGTCGGAG TTCATCGACC CAGGCCCTGC GGGGAATCCC 1560
GCGGCGCAGT TCCGCAAAGC TGCCAGCGTG CTTACCAGTC GGGGCCCGTT TCTTTTGTCT 1620
CTGCGTTTGC TGCTCCGTGC AAACAAGGAG GACAGAAAAC TCTTTATCGT GGCGTTTTCT 1680
TCCTGAGCGA GAGATTAGGT TGCTGCAAAT CCAACGAGGC GAGTCCTCTT GGATCGAATT 1740
AATGCATTGG CTCTTCCCTT CGCAACAGCT TTGATGACCG TTTCCCGCCT TTGTGCAAAG 1800
CGTTAGAACA AACCCTACCT TCCTCCAAAC GAAGGAGAAA AATCTCAATG ATCTGGGTTT 1860
TAAAGTACCT TCCCCGCCCT GTCCAAATGC TGGAATTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGACGG 1920
TAGATGGGAG CTGCCCTAGG ACCTTGAATG TGTGCTAAAA TCTGAAATTC TGTTAATTTA 1980
TATCAGCCAC CTTGGACACC TTTTCAGGAA ATAAACATTT AGACATCGGT CGCTGTGTAT 2040
TACAAAATGC AAGAAATAAA GCACAATCGT CAAGTGCTGA AGGCCCACAG CTTCCCCTTC 2100
GTGTCCACGG ATCTAGTGCT GAAAGACAAA CCCTTTGACT CCGCCGGGGC AGTTGGTCCA 2160
GGGTCCATTT TCATTTCTCA CCGTTTTTGT TTTACATGAG TTTGAGATGC AAAAGAGCCG 2220
GTGTGGGTAA AAATAGTTAA CCCCAGCTAC TCAGAGTGTG ATGGTATATT TAGAATAAAG 2280
GAGACATTTG TCCTTGGTTT TATTTATAAA TGTGTCATCT TACATTTGGG ATTCGGATTC 2340
TCTCATGCTT GCTAAGAAAT TTGTGAGGCC ACTGGCATGT TTCTGAAATG TGACCTTTTT 2400
CTTGCTTATT TAAAACAAAA TAGTAATACT TGCCTCCCAA AGGTTTGGGA GGTTAATGTA 2460
ATCAAAAAAA AAAAAAAAAG CCTGAATGTA ATAAGGCTTC CAATGGAGGG CACACGACAG 2520
TGACAGCTGG GGAAAAGACA TTATTTTCTT CATGAAGAGA TCCCTTATGG TTTCTTCGGG 2580
CTGGTAGGGA TTTTTAACAC CTGTGCTGTG ATCAAAATTG TATTACTATT AATGGTATAA 2640
TGGTGTAATG TGAAGGGGGG CGGCGGAGGG CGTGGTCAAG CCTTCTATTA TAAGGCTTAA 2700
GGGTGGATTT TTGACCCAAT CAGAGGTTTA AGAGAATTTT CCTTTAGCCA CTCCTTTGTG 2760
TATCCATGCC CTCTGAGGCT TCACTTCAGA CTCGTCCATC GTTTGGCAAA GAAGCGGTGG 2820
AAAGAGTTTC TAAAGAATCC TTTAATCTAG AAAGGTCAGG AACCCTCCCT CCCCTCAGTC 2880
TGAGAAAAGA ATGCAACTTT CCTTCATAGC ATTTCCTCCA AAGGACCCTG CCCCATTTGT 2940
GTCCTTATAG TTTGCAGTGA CTACCTCCTT TTTTGTCTCA TTTTGTATAT ATGGTTCAGA 3000
TAAAATATCG GACAACTTTT TCTGCAAATG CCATTGGCAT ACCGGAGCAC AAGCTTCAGA 3060
GTACAGCCTC AGGTCTTAAG TTGTCTCCAG ACTTTCATTA ACATAGGCTT CCTGTTACAA 3120
AAGAGAAAAT GTATTTTAAA 3140