EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-28992 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr15:93344420-93348440 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr15:93347181-93347192AATGAGTCACA-6.62
JUNMA0488.1chr15:93347658-93347671AACATGATGTCAT+6.07
KLF4MA0039.3chr15:93345056-93345067CCACACCCTGC+6.62
Klf1MA0493.1chr15:93345054-93345065GGCCACACCCT+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr15:93345581-93345596TGAACTCTTGAGCTC-6.19
Number of super-enhancer constituents: 94             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93344490-93346258Adipose_Nuclei
SE_00699chr15:93346313-93349694Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93344356-93346022Astrocytes
SE_02552chr15:93346515-93348585Astrocytes
SE_03406chr15:93347275-93347952Brain_Angular_Gyrus
SE_04213chr15:93344683-93345364Brain_Anterior_Caudate
SE_04213chr15:93347004-93348272Brain_Anterior_Caudate
SE_06939chr15:93346372-93348290Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_09652chr15:93344405-93349641CD14
SE_13564chr15:93344856-93345607CD34_Primary_RO01536
SE_13564chr15:93346405-93349099CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93344287-93346258CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14477chr15:93346295-93349611CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18547chr15:93346435-93348385CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93346527-93348035CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93347111-93348231CD56
SE_20859chr15:93344392-93345551CD8_Memory_7pool
SE_20859chr15:93346358-93349017CD8_Memory_7pool
SE_23716chr15:93344676-93345274Colon_Crypt_1
SE_23716chr15:93346629-93347958Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93344677-93345190Colon_Crypt_2
SE_24264chr15:93347078-93347935Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93344365-93346231Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26010chr15:93346287-93348981Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93344537-93345993Esophagus
SE_26840chr15:93346453-93349029Esophagus
SE_27996chr15:93346609-93348262Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93346580-93348392Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93347101-93348008Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93346524-93347997Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93344607-93345323Gastric
SE_31921chr15:93345424-93345935Gastric
SE_31921chr15:93346702-93348063Gastric
SE_33848chr15:93344601-93346032HCC1954
SE_33848chr15:93346499-93348990HCC1954
SE_34564chr15:93343115-93346256HCT-116
SE_34564chr15:93346403-93349127HCT-116
SE_34679chr15:93343662-93356193HeLa
SE_36003chr15:93344258-93346223HMEC
SE_36003chr15:93346288-93348853HMEC
SE_37354chr15:93343418-93348955HSMMtube
SE_39112chr15:93344631-93346007IMR90
SE_39112chr15:93346453-93349151IMR90
SE_39970chr15:93344334-93346003K562
SE_39970chr15:93346445-93349356K562
SE_41310chr15:93344648-93345967Left_Ventricle
SE_41310chr15:93346604-93348678Left_Ventricle
SE_42600chr15:93344591-93346094Lung
SE_42600chr15:93346482-93349148Lung
SE_43471chr15:93346491-93347125MCF-7
SE_43471chr15:93347221-93347981MCF-7
SE_43659chr15:93346441-93348220MM1S
SE_44673chr15:93344367-93346219NHDF-Ad
SE_44673chr15:93346443-93349092NHDF-Ad
SE_45291chr15:93344417-93346229NHLF
SE_45291chr15:93346458-93348738NHLF
SE_47211chr15:93343882-93346232Panc1
SE_47211chr15:93346289-93355941Panc1
SE_48549chr15:93344612-93345404Psoas_Muscle
SE_48549chr15:93346443-93349091Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93344682-93345409Right_Atrium
SE_49286chr15:93345529-93345957Right_Atrium
SE_49286chr15:93346537-93348190Right_Atrium
SE_50492chr15:93344610-93346025Sigmoid_Colon
SE_50492chr15:93346504-93348621Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93344312-93346130Skeletal_Muscle
SE_51268chr15:93346353-93349466Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93344640-93346256Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52184chr15:93346456-93348299Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93344621-93345349Small_Intestine
SE_52822chr15:93345427-93346060Small_Intestine
SE_52822chr15:93346497-93348061Small_Intestine
SE_53626chr15:93344673-93345362Spleen
SE_53626chr15:93345397-93345907Spleen
SE_53626chr15:93346470-93348701Spleen
SE_55179chr15:93346705-93347124Thymus
SE_55179chr15:93347228-93348035Thymus
SE_56153chr15:93344552-93346055u87
SE_56153chr15:93346333-93348696u87
SE_57089chr15:93344656-93345260VACO_400
SE_57089chr15:93345539-93345975VACO_400
SE_57089chr15:93347273-93347954VACO_400
SE_58215chr15:93344670-93345184VACO_9m
SE_58215chr15:93347082-93347928VACO_9m
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93344626-93346244HSMM
SE_63974chr15:93346442-93348299HSMM
SE_64371chr15:93344611-93345614NHEK
SE_64371chr15:93346470-93348707NHEK
SE_65898chr15:93344422-93345397Pancreatic_islets
SE_67338chr15:93346441-93348220MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr159334499393345488
chr159334705693347810
Enhancer Sequence
ACAAATCCTT GGAATTTTTT TTTTTTTTTT TTTGAGATGG AGTCTTGCTT TGTCGCCCAG 60
GCTGGAGTGC ACTGGCACGA TCTTGGCTCA CTGCAGCCTC TGCCTCTTGG ATTCAAGCAA 120
TTCTCCTGCT TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG GACTACAGGC ATGCGCCGCC ACGCCCAGCT 180
AATTGTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TCACCATGTT GGCCAGAATG GTCTTGATCT 240
CCTGACCTCA TGATCCACTC ACCTCAGCCT CCCAAAATGC TGTGATTACA GGCGCGAACC 300
ACCACGCCCA GCCAATTCCT TGGATTTAAG AGCCGACAGC TGCGAGAACT TCCCTTCTGG 360
CAGGCAAACC AACTCCAAGG CATGAAAGCC ACAGGAATGC TGGGGAGATA AATGCAGGAA 420
GACACAGGTC CTACTCAATG GCACCATCAC CCTGCACTGC TGTGGCCAGG CCTCCAAGGT 480
TCCCTGGCTC CTTCTTCCAG GCTGCTGAAG GGGACCCTGG AGCACCTTGG TTGAGAGGAG 540
TCCCTGCCCC AGCTTTCGGG GCACAGGCCC CTACTGTCCT TTTCTGCCTT GTCTCTGGCC 600
CTTCTCCCCT ATCTTCCAGC CACACCAAAC AACAGGCCAC ACCCTGCTGC ACTCAGCTTT 660
CTCCCACAGA CGTGTTTTTG CCGTTTCTCA TGCAGTAGCT CACTGCCTGG AATGGGCTTC 720
CCAGCATTTC CCCTAGAAAT TCCATTTGCT CTTCTGAATG CCTTATAAGG ATCTCTTCTC 780
CAGAAAATGT CCTTACTAAT CCTATCAGTT GGGGTTACCT AGTCATCTCT CTACTTAGTG 840
ATCAGTGTTC AAATCCTGCT TCTCTATACC AGCTCTGTGA GGTTGAATGA GCTATTCCAT 900
CTTTTCTGTC TAGGTTTTCT CATTTCCTTT TTTGTTCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTGA 960
GACAGGGTCT GGCTTTGTCA CCCAGGCTAG AGTGCAGTTG CGCAATCTCG GCTCACTGGA 1020
ACCTCCTCCT CCCAGGCTCA AGCAATTCTC CCACCTCAGC CTCCAGAATA GCTGGGACCA 1080
CAGGCATGTG CCACCAAGCC CAACTAATCT TTTTGTATTT TTAGTAGAGA TGTAGTTTTG 1140
CTATGTTGCC CATGCTGATC TTGAACTCTT GAGCTCAAAA TTATCCACCC ACCTTGGCCT 1200
CCCAGAGTGC TGGGATTACA GGCATGTGCC AACATGCCCG GCTGGGGCCA TGCTCTTTCT 1260
GAAGCCTCCA GAGGAGACCC TCTGTTCCAT GGCTTTTTCT TCTGGTGTTG GTGGCAGTCC 1320
TTGGAGTTCC TTGCTTCATG GATGATACTT CACTCCAGTC TCTGTGGCAG AAATTCTCTG 1380
GTGTGTGTAG ACAAGCCTTC CTCTGCCTCC CTCTTAGGAA GATACATGTG ATAACACTTA 1440
AGGCCCACCC TGATCATCCA AAATCATCTC CCCATCTCAA GATATTTTTT TTTTTTTGAG 1500
ATGGAGTCTC GCTCTGTTTC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC GCAGTCTTGG CTCACTGCAT 1560
CCTCCGCCTC CCGGGCTCAA GTGATTCTCC TGCCTCAGCC TCCTAAGTAG CTGGGACCAC 1620
AGGCATGTGC CACCATGCCC GGCTAATTTT TGAATTTTTA GTAGAGGTGG GGTTTCACCA 1680
TGTTGGCCAG GCTGGTCTTG AACTCCTGAC TTCAAGTGAT CCACCTGCCT CGGCCTCCCA 1740
AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCATCG TGCCCGGCAT CAAGATCCTT AAATTAAGCT 1800
GGGCGTAGTG AGCCGAGATC ATGTCACTGC ACTTCAGCCT GGGCTACAAA GCAAGACTCC 1860
ATCTCAAAAT AAAATAAAAT AAAATAATTT TTTTTTTTTT GAGACGGAGT TTCGCTCTTG 1920
CTGCCCAGGC TGGAGTGCTA TGGCACGATC CTGGCTCACC ACAACCTCCG CCTCCTGGGT 1980
TCTAGTGATT CTCCTGCCTC AGCCTTCCAA GTAGCTGGGA TTACAGGCAT GAGCCACCAC 2040
ACCCGGCTAA CTTTGTTGTA TTTTTAGTAG AGACAAGGTT TCTCCATGCT GGTCAGGCTG 2100
GTCTCGAACT CCCAGCCTCA GGTGATCTGC CCACCTCGGC CTCTCAAAGT GCTGGGATTA 2160
CAGGTGTGAG CCACCACACC CTAAAATAAA ATTGTTTTAA AAGTAAGATC TTTAACTTAC 2220
ACACCTGCAC ATTTGCAAAG CCCTAGTTGT TGGGGTTTTG TTTTTTTGTT TTTTTTTTTC 2280
TTTGAGACAG AGTCTCACTG GGATTGCAGG TGTGAGCCAC CTTGCCCTGC CTGTGTTTTG 2340
GTTTTTGTTG TTTTTGCCAG ATAAAGTAAC ATTCAGTTTC CACATATTGG GATATCACTG 2400
GGAGACCATT ATTCAGCCCA CCACACACAT CCCCAAATCT ACCAGGTTAA ATGGAGGTAG 2460
ATTTTTAAGC TTCCCAAGTA GCTGGGACTA CAGGCATGCA CCACTATGTC TGGCTAATTA 2520
TTTTTATTTT TTATACAGTT GGGGTCTTGC TACATTGCCC AGGCTGGTCT TGAACTTCTA 2580
GGCTCAAGCA AACCTCCTGC CTCTGCCTTC CAAAGTGCTG GGATTACCGG TATGAGTCAC 2640
CACACTGAGC AAGGGAGAAG AATTTTAAGA GTCCCTATAA TAACTCCACA CCTCTCTAAA 2700
AACCGCACTG CTCGCCCCTC CCCACTCCCA CAGGTTTTGG AGTTTCTGAC TCCTGAAAGA 2760
GAATGAGTCA CAGACAGTTC CCGTCAGAAA AGACTATGTC CCTCCCACCT CTCATTTAGT 2820
TCCCGTTTGT TTAGGATTCA AGTGTCTTGG GCAGTTAGAT AGCTCCCCAG CCTACCCAGT 2880
TTCCCTCTTG CCTCCCCTCT ACTACCCCCA GAAATGCTTG TGCAATATTG GACTGACTCA 2940
CCCAGAAATA ACTCATGACT CTCCTTTGTT TACAGTTTAA GAGACTAGGG TGTTGAAATA 3000
TCTCAGCAAA GGCCACTGAG GGACTCTTCA GTCCAGGGAC AATGAAACAC TGGACAACCT 3060
GGGAGGAGTT AGGTACATTC TCTGGCCTTC TCTCAGAGGG GCTTTTGCTG TGTTGTAACA 3120
GGCAGTGGAG TGTTGGTAAA TATTTAACAA GGCATCTCCA AGGGGAAAAG CCTTAATATG 3180
TAGTGTTTAC CTATTCCTGT GGTGTAAATA CCCCTGCTAT GGCCAGTTTC AAGCTACCAA 3240
CATGATGTCA TTGAAACCAA AGTTGGAAAG AAAAGTGCAT CATCATTCTG AGCAGCTGAC 3300
TCCAACACGC CACTGTAGCT CCACTGACCT AAGGGAAAAC TGTCAGTCTT CACTCCATAA 3360
GGATGTACAG GCCCAGGGGC TGGACAATGT AGCTCTTGGA AGATCACAAT AGAGTCAGTT 3420
TCCTAATTTC AGGGACCAAC TGTTACTGCT AAGAATAAAT GGGAGGCCAG GTGCAGTGGC 3480
TCACACCTGT AATCCAAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG TAGATCACCT GAGGTCAGAG 3540
TTCGAGACCA GCCTGACCAA CAGAGTGAAA CCTCGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAATTAG 3600
CCAGGCTTGG TGGCGTGCAC CTGTAATCCC AGCTACTCAG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC 3660
ACTTGAACCC AGGAGGCAGA GGTTGCAGTG AGCCGAAATC ACACCACTGC ACTCCAGCAT 3720
GGGCAACAGA CCAAGACTCT GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AGAACAAATG TGTAAAATAG 3780
TCACAGATCT TTACAATCCC ATCCAGCGAT GAGGTTCTAG GTACAAAACA AACATTAACA 3840
TCTTTCTCCT CTGGAATCGC TTGAACCAAG GAGACAGAGG TTGCAGTGAG CCAAGATCGT 3900
GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GAATCAGAGT AAGACTCCGC CTCAGGAAAA AAAGAAAAAG 3960
AAATCTTTTT CCTCTGAACT CTCATCAAAC TTCTATTTCT ACATCTCTTT TGATTTTTTT 4020