Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS105-20370 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | IMR90 |
Coordinate | chr12:109880080-109881180 |
Target genes | |
SNPs | Number: 2 | ID | Chromosome | Position | Genome Version |
|
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
EBF1 | MA0154.3 | chr12:109880623-109880637 | GTTCCCTGGGGAAT | - | 6.89 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 2 | Chromosome | Start | End |
chr12 | 109880267 | 109880317 | chr12 | 109880514 | 109880595 |
|
Enhancer Sequence | AGGCGATGTG TGTCCTCAGT CTCAAACAGG ATTCCCTCAT CGAGTCTAAG AGCAGGGTCC 60 CCTTTCTCCA TAAAGGGCGC ACTATTTAAA TGCAGGGGTG CAGCTGGGCA GCTGGGGCTC 120 TCAACTGTGA TGCTTTGGGT ATTAACTAAG ATGATGGGGA ACAAATGATG ATTAGATAAT 180 GGCTGCTGTT CTCATGACAC CTCCGTCACC CTAGAAACTG TCTTGGTTTG CTTTCCTACA 240 AAATTGAATG AAGTGTAGCC ATGAACTTAA TCACGAAACA CCCCCTTATT GGTGAGAGGC 300 AGTGTGGCAT AGTGCCTGGG CACTGACACT TGCTTTGAAC GTAGCAGCCG TGAGATCCTG 360 GGCAGGTCAC TTAAGCTCTT GGTGCCTCTG ATCTTCTGTG AATGAGGATG ATGGGTTTAC 420 TGAGAGGATG AATGAGTCGG TGGGCGAGAG GTGCTCAGGC TGCTGCCTGG CACGCAGCAG 480 CAGGTGAAGC CCTGGTGATC GTGTGTGCCA GTGTCTGCTC TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 540 TTTGTTCCCT GGGGAATAGA AGCCACTGTG ACTGGATTGG ATTACACTGT GGCTGTGAGA 600 GTTTTCATCT CTGACCATCA GAGCAGACCT GCAAGGCAGG CAGCCATAGC CTTGACTTCC 660 TCAGAGGGCA ACGCAGGTAG GCAGAGCTAG GGATCCAAAT CCCCATCATG CAGAGAGCCA 720 GGAAAAAAAA AAAAATATAT ATATATATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTATATATGT 780 GTACGTATGT GTGTATATAT GTGTACGTAT GTGTGTATAT ATGTGTACGT ATATGTGTGT 840 ATATGTGTAC GTATATATGT GTGTATATGT GTACGTATGT GTGTGTATAT GTGTACGTAT 900 GTGTGTATAT GTGTACGTAT ATGTGTGTAT ATGTGTACGT ATATGTGTGT GTATATGTGT 960 ACGTATATGT GTGTGTATAT GTGTACGTAT ATGTGTGTGT ATATGTGTAC GTATATATGT 1020 GTGTATATAT GTGTACGTAT ATATGTGTGT ATGTATGTGT ACGTATATAT GTGTGTATAT 1080 ACACACACAC ACACACACAC 1100
|