EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-19016 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr12:58228980-58233210 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:58229323-58229341CTCTCCCTCCTTCATTCC-6.04
LMX1BMA0703.2chr12:58229789-58229800GTTTTAATTAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr12:58229793-58229806TAATTAATTATCC+6.87
Nr2f6MA0677.1chr12:58231699-58231713AGGGTCACAGGTCA+6.28
Nr5a2MA0505.1chr12:58229150-58229165GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RxraMA0512.2chr12:58231699-58231713AGGGTCACAGGTCA+6.12
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01109chr12:58229144-58229841Adrenal_Gland
SE_01109chr12:58229984-58231383Adrenal_Gland
SE_01109chr12:58231492-58233313Adrenal_Gland
SE_01602chr12:58229102-58231368Aorta
SE_01602chr12:58231486-58233306Aorta
SE_03465chr12:58229158-58230032Brain_Angular_Gyrus
SE_03465chr12:58230345-58231287Brain_Angular_Gyrus
SE_03465chr12:58231934-58232672Brain_Angular_Gyrus
SE_04181chr12:58229147-58231440Brain_Anterior_Caudate
SE_04181chr12:58231499-58233391Brain_Anterior_Caudate
SE_05429chr12:58226535-58231419Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05429chr12:58231503-58233453Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06149chr12:58226649-58235406Brain_Hippocampus_Middle
SE_07273chr12:58229141-58231438Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07273chr12:58231509-58232847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_24546chr12:58229193-58229734Colon_Crypt_2
SE_24546chr12:58230426-58231211Colon_Crypt_2
SE_24546chr12:58231891-58232366Colon_Crypt_2
SE_26211chr12:58227895-58233002Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26717chr12:58229150-58233319Esophagus
SE_29576chr12:58229220-58233373Fetal_Muscle
SE_31793chr12:58229158-58231336Gastric
SE_31793chr12:58231409-58232682Gastric
SE_42147chr12:58228910-58233523Lung
SE_46841chr12:58229299-58229762Ovary
SE_48108chr12:58228985-58235118Psoas_Muscle
SE_48620chr12:58229120-58231370Right_Atrium
SE_48620chr12:58231495-58233326Right_Atrium
SE_50105chr12:58229005-58233329Sigmoid_Colon
SE_51099chr12:58226619-58231341Skeletal_Muscle
SE_51099chr12:58231506-58248418Skeletal_Muscle
SE_52596chr12:58229095-58231434Small_Intestine
SE_52596chr12:58231483-58233314Small_Intestine
SE_53450chr12:58229072-58233294Spleen
SE_65570chr12:58228919-58231366Pancreatic_islets
SE_65570chr12:58231529-58232251Pancreatic_islets
SE_68875chr12:58229101-58231488H9
SE_68875chr12:58231513-58232431H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr125823148758233162
chr125822917658229606
Enhancer Sequence
CATGCCTATA ATCCCTGCTA CTTGGGAAGC TGAGGCAGGA GAATTGCTTG AACCCAGAAG 60
GCGGAGGCTG CGGTGAGCCA AGATCACACC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAAGAGCGA 120
AAATCCGTCT CAAAAAAAAA AAAGGGATGA GGTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTGGCCTTG 180
AACTCCTGGG CTCAAGCAAT CCTCCTGCCT CATCCTCTCA AAGTGCTAGG ATTACAGGCA 240
TGAGCCACCA TGCCTGGCCC CCGTAGGAAA TTCATTGCAC ATGGTTTCCC CAACCAGGGA 300
GGGCAGGACT CCAGCGGATG CCATGTAGCC CAACTACGAG CTGCTCTCCC TCCTTCATTC 360
CCTGCTACCC TCTGCGGACA CCCAGCCCTC CTCTTCTGCC CAGATGCAGA TGTGCTTCTG 420
CTTTCTCTGC CCCAAACATT TGGTTTGGGG CTAGATGTCT GAGAGGACTA GCACAGACCC 480
AATGAGGGAA GCAGCTCTGG CTTAAGAAGA AAGTGAGCTG GTGGCTGAAG ACAGGGAAAC 540
CAGGCCAGCC ATCCAGCTCA CTGCTGCGAG TCTTCCTACT GAGGCGGGGT GTGAGGAGAA 600
GAGGGGATGT GAGGAGTATG CCCCCACTGA GGATCATCAG GGCTGGGGTC CAGGCTCTGC 660
CAGTTACTGA CTCAGCCACA CAGCCTTTTG GAGCCTTAGT TTCCTCATCC ATAAACTGGG 720
ATAACAGCAA GCCCTCACTC AGGACTGAAA GGATAAACGA AGTTAGAGAG TAAGGCACTG 780
TGCTAACTCT AAAGCTAAAT GCTGCGCTTG TTTTAATTAA TTATCCAAGG GGAGATGACC 840
ACTAAATGGC AACATCATGG GCCTCATTCC AGGAGGCCAG CAACAGACCA GGAGCCCTCC 900
CACCATCATC ACGTGGATGA AGCCCAAGAA GATGAGGGAA AGGTGCCTGA GAGCTCTGAT 960
CATGAGCAGG TTTCAGAAAG TCAAAATAGC CCCTATACCT TCTCCCAAGT CCACAACAAA 1020
ATTTGTTTTC CAGCTCACAA ACTCCCTGAC TGGGTATTCT GTGAAAAACA AAAGCAAGTA 1080
AGACTGTTTC ACTTGAGACA AAAATCGCTG TCTCCCCTGG TATTCATCCC CACTACTCTC 1140
AAGAAGTACC AGGTAAGGAC ACTATTTGCC CCTATGCATG GGCCGGGGTA GGTGGCTCAA 1200
GCCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAAGCTGG GCCGGTTGGA TCACTGCAGC TCAGGAGTTC 1260
AAGACCAGCC TGAGCAACAT GGCAAAATCC TGTTCTACCA AAAAAAAATT AGCCAGGTGC 1320
ACCTGCAGTC CCAGCTTGGC AGGCTGAAGT GGGAGAATCA CCGGAGCCCA GGAGTTTGAG 1380
GCTGCGGTAA GCCGTGATTG CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGTGACAGAG TGAGATTTTG 1440
TCTTTAAAAA AAAAAAGTGT ACATGTACAA ACACGTGAAC ACGTGCACAC ATACACACAA 1500
ACGAAGACCA GAGTGACCAG GGCAACACTG TTTTTAATCT TCTCCTGAAA GTCAGGTCCA 1560
GATACCACTT TTGTCAACAA CACAGCTTTG TGTCCCAGCA AAGGAACTCC TCACACATCT 1620
GCCTGCGATT CAGCAGAAGG TAACCTCTGA GACAATCAGA TTTTAACAAG CCCATTCAGG 1680
TAGAAAGTTG CTTTCTTTTT TGGTTCATCC CCAGAAGTAC TTCCTTCCCC ACCACCTCCC 1740
ATCCCCCACA GCAAAGGACT TAGCCTTAGC CTGGCTATCA CTATAAAATG GCCCCTCTGA 1800
GGGGCCTCCT TCCTCTCAGC TATTGGAGGA AGGAGAGTAT TTGGAGCATT TCCGGCCCTT 1860
CTTGGACGGC TGCCTGAACC CTGCAGCCAA GACACATTTG ACTGGGACTC CCCCATGGAG 1920
AGAAGTCCTC CCAGGTCCTC TGCAAGGGGC ATCTGTTCCT TGGCTATGGA CATGCCCTAA 1980
AGTGCCAGGT GGACGGAAGA GCTCCTGGGA CCAGCAGGTG AGTCGGCAGG GAACAAAAGA 2040
GGGTGAGATG CCTAGACAGC CCCCACACAC AAAAGACTGC AAACAATGGG GAGGGTGTAC 2100
TGCTTTCATG CCTGGCCACT GACACTGTTC TCTACAGCTA ACAAGCAAGG CAGGGCCGGA 2160
CCCAGCTTAG CACCGGCTCC CGAAGTTCCA AAAAGTAGCT GTGTATCTAA CTGCATGGGC 2220
ATTTTTTGAA AAAAGCAGTT TTAACACTTT GGGGGGCAAA GGCAGTGGGG ATCACTTAAG 2280
GTCAGAAGTT CGAGACCAGC ATGACCAATA TGGTGAAACC CCATCTTTAC TAAAAATGCA 2340
AAAATTAGCA GGGTATGGTA GTGAGCTCCT GTAATCCCAG CTACTCCGGA GGCTGAGGCA 2400
CGAGAATCAC TTGAATCCAA GAGGTGGAGG TTGCAGTGAG CCGAGATCAC ACCATTGCAC 2460
TCCAGCCTGG GGGACAGAGC AAAACTCTGT CTCAAAATAA ATAAATAAAT AAATAAAATT 2520
TAAAAAATTA AAAAGCAGTT TTAGCCATGC TGTTTGGCCC ATACCAGCAT GTTGTATGCT 2580
GGTGCCCTCT CTGCACCAGC AACTGGGGCA GCTCTACCTA AGCCAGTGTC TCCATTAGTT 2640
CCCTTTCCCT GGGCAGGAGA GCTCCCTATA TGGCTGTCTC TTCTTTCAGA CCTGAGTCCT 2700
TAATGCCACC TGTGGGGCGA GGGTCACAGG TCACACACTT TCTTGTCTCT GCCCCTTCAG 2760
CAATCTGTTC TCTGACCTCA GCTAGAGAGG TAAGAGGACT CAGTTTTGGG AGCAGGGGAT 2820
TTCTGGCAGT TCTAAAGCAC GCTGATTTCA GAATCAGCCT CTAAAGGAGG TATTGCCAAA 2880
ACACCCTCCT GGGCAGCTCC AACGTACTTT AAAAACGTGC TGGGTTGGGG TGGGCCTCCA 2940
TAAGTAGCAG ATCCTGGACC AGAGACAGAG GAGGCGTTTC CTCATAGACA AGTCAGCTGC 3000
AGGCTCAGCC CTGCAAGCCC CACTCCAGAG GACTCTTGAG GGATGTCAGG AAGTGATCTA 3060
ATAGCCCACA GGGCAGCAGG GACAAGCCTG AGATGCCATC CAAGAAAACT CAAAGGACTG 3120
GATCCTGCCC CTGCCTCAGC AGGAGACCCT GCCCTATGTA GCACCAGCCA GAGCAAAGGT 3180
ATCATTGTGA GGGATTGGAA ACCACACTTG CCTACCTGGA GTTACCCCTC CTTCCCCCTA 3240
AGGAGGTGTA TAACAAGCCC CTGTGGGAGG GGCTACACAC AGACAACCTC TCAGTGAGTG 3300
TTTCAAGTTC CTGCCTTAGT GCTGTGCCCT TGACTCCTGG AATGCTTAGA TATAGTTGAA 3360
GCCTAGGAAG AATCCACTGC TTCTTTCCCT TCCAGGTATG TAGGCCTGCT TTAGGTTGAT 3420
ACAAACGTGA GCTGGAGAAA GCAGTGAGGA CACAGGACAA AGCAAGGGTA TCTGTTCTGA 3480
CCAGGGAAAA ATACAGTGGT GACACAAGGC ACCCAGACTT GAGTTCGAAT CTAGGCTCTG 3540
CCATGTGTAA GGTATGCAGC CATGGGCCTC AGTTTCTTCA TCTGCAAAAT GGGAAGACTA 3600
CCTATTTCTC AGTGTCAGAA TTGCAGGGAG CTCAGGGAGT GTCCTGGTCC TAACAAAAGC 3660
TTTGTAAGTG TCAACTGCTA CTCATTAAGT GCAAAGTACT TTCATACTCT TACCTCAGTC 3720
TCCATCTCAA AATGTTCACA TTAAAGGGAC CATAGAGATT TCTTCTAACT CATTTCAGAG 3780
GTAGTAACAG GGCCAAACCG GAAATGATGT TTTCCGGGAC TCCACAAAAA CGAATCAGTC 3840
GCACACACAC ATACACACTC ATTGAGGCTG GCCAACCAGT TCCTCCTTCA TATGGCTGGC 3900
CTCTGCAGAA GGAATGGAAG GAGTCTGCCA GGGAGGCACC CATCTCCAGG GACATTCTGC 3960
TGCTCCCCCC ACACCCCTCA GCTTCACCTA TGACCAGCCA AGCCGTATAG GTGAGTCCAC 4020
TTGAGAAAGT ACTGATCTAG AAGTCAGGAA ACCCAGCTCT TGCTCCAGTT CAGCTTTTCA 4080
ACAGTTCCGT GGCCTTGCTA GGGCACAATT CTCTGGGGTT CAGTTTCCTC ATAAGCCAAT 4140
CTGGAAAGGT TTCCCCTGCA TGGTCCCTTA AAAGGTGGCT TCACCTGAAG CATGCACCTG 4200
AATCATGAAC TCAAAAGCAC TCTAAAAGGT 4230