EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-17478 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr12:6943210-6945020 
Target genes
Number: 55             
NameEnsembl ID
CD9ENSG00000010278
TNFRSF1AENSG00000067182
LTBRENSG00000111321
RP1ENSG00000213942
CD27ENSG00000139193
LOC678655ENSG00000215039
TAPBPLENSG00000139192
VAMP1ENSG00000139190
NCAPD2ENSG00000010292
MRPL51ENSG00000111639
RP5ENSG00000255966
GAPDHENSG00000111640
IFFO1ENSG00000010295
NOP2ENSG00000111641
SCARNA11ENSG00000247853
CHD4ENSG00000111642
LPAR5ENSG00000184574
ACRBPENSG00000111644
ING4ENSG00000111653
ZNF384ENSG00000126746
C12orf53ENSG00000139200
COPS7AENSG00000111652
PTMSENSG00000159335
MLF2ENSG00000089693
LAG3ENSG00000089692
CD4ENSG00000010610
GPR162ENSG00000250510
U47924.11ENSG00000256010
LEPREL2ENSG00000110811
GNB3ENSG00000111664
U47924.25ENSG00000237240
CDCA3ENSG00000111665
USP5ENSG00000111667
TPI1ENSG00000111669
RPL13P5ENSG00000240370
LRRC23ENSG00000010626
DSTNP2ENSG00000248593
SPSB2ENSG00000111671
ENO2ENSG00000111674
ATN1ENSG00000111676
C12orf57ENSG00000111678
PTPN6ENSG00000111679
SCARNA12ENSG00000238795
EMG1ENSG00000126749
PHB2ENSG00000215021
U47924.19ENSG00000255896
C1SENSG00000182326
LPCAT3ENSG00000111684
C1RENSG00000159403
ABC12ENSG00000205885
C1RLENSG00000139178
RBP5ENSG00000139194
CLSTN3ENSG00000139182
RP11ENSG00000256967
PEX5ENSG00000139197
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:6944765-6944778AAATAATTAATTA-6.71
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Lhx3MA0135.1chr12:6944769-6944782AATTAATTAATTA-6.78
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Lhx3MA0135.1chr12:6944781-6944794AATTAATTAATTA-6.78
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:6944530-6944545GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
POU4F2MA0683.1chr12:6944763-6944779TTAAATAATTAATTAA+6.25
POU6F1MA0628.1chr12:6944770-6944780ATTAATTAAT+6.02
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POU6F1MA0628.1chr12:6944782-6944792ATTAATTAAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr12:6944247-6944263TGGTGCATTCTGGGAA-6.81
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1269435886943681
chr1269441726944325
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH12I006833chr1269430456944328
GH12I006835chr1269449416945110
Enhancer Sequence
AAGGTAGGAA GACCTGCAAG CTCATCAGCT CGTTCAAGAC TCTTGGATAC AATCACCTGT 60
TCCCTTGCTC TTGGCCTGCC CCCTTCATTC TGCCTGTCCT GATTATCCAA CCGGGACTGT 120
GCTTACCACT GCCTCTCAGC TGTGGATAAG TTCCGTCTCG TCTTAATTTA GCTGACATAG 180
GTGGATGTTC TTTACAAATG AATTTTGCTA GAAATTGATA GGAAGAACAA AACAAAAAAC 240
ATGAAGGCAT AAAAATGGAT GAGTGTGCAG GTAAGGATTG CTTGGTTAGC CAAGAGTTTA 300
GTTACTGGCT TGGCTGATGG CTCAGCAGAC ACGCAGGCCT TTCTTTCCCT CCTAGTTTAG 360
GTTGAATGAC TCATACTCAC CAGGTTGAGG CTACCATTTT ATGAAGCTTC AACCCTTATC 420
TTAGGTTAGT GCTCATTCAG TAATATACTC ACTGAGTAGC TGCTATACAC TAGAAACTGC 480
TAGGTTCTAG GGAGAGGAAG ATGATTATAG ACTCTGCCCT TTGGGAGCTC AAGTGTAGAG 540
GTGGAAACAG ACAAGGAAAT ACATAATATA AGCAGGTGGT AAGTTTGGTA AAAGAAGTAT 600
GTTTTTGGGC TGGGTATGGT GGCTCATGCC TGTAATCCCA GCAATTTGGG AGGCCGAGGT 660
GGGTGGATCA CCTGAGGCTG GGAGTTCGAG ACCAGCCTGA CCAACATGGA GAAACCCTGT 720
CTCTAATAAA AATACAAAAA AGTTAGCCAG GCGTGGTGGC ACATGCCTGT AATCCCAGGT 780
ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG AGAAGCGCCT GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GTGGTGAGCT 840
GATCTCGTGC CATTGCACTC CAGCGTGGGC AACAAGAGCG AAACTCCATC TCAAAAAAAA 900
AAAAAAAAAG TATGTCAAAT AGAAGCACTG AAATGCAGTT ATAGAAGGCT TGCTGGAGAG 960
GTGGTATTTG AGCTCAGTCT TAAGGATGAG TTAGTCAGGC GATTGGGGGT GGAATCAGTC 1020
TAAGAGGGAG AAGAGCATGG TGCATTCTGG GAACTGCAGT CAAGCACAGG GGTGAGAGCA 1080
GGGCCAGCTC CATAGTCATT ACCTGTGTGA TCTTGGGCAA TTTATTTTAA CATCTCTGAG 1140
CCTAATTTGC TCATCTATAA AATGAGGATA ATAATAGTGT TTTTGTCATA GTGTCGTTGT 1200
GAGGATTAAA TGAGTTAGCA CATGATAAAG CTCTTAGAAC ACAGAATCAT CACTGGCTGG 1260
GTGTGGTGGC TCATGCCTGT AATCCCAGCA CTTTAGGAGG TCAAGGCAGG TGGATCACTT 1320
GAGGTCAGGA GTTCAAGACC AGCCTGGCCA ACATGGTGAA ACCCGGTCTT TACTAAAAAT 1380
ACAAAAAAAT TAGTGGGCAT TGTGGCAGGT GCCAGTAATC CCAACTACTG GGGAGGCTGA 1440
GGCAGGAGAA TCGCTTGGAC CCAGGAGGCG GAGGTCGCAG TGAGCCGAGA TCGCACCATT 1500
GCAGTCCAGC CTGGGCAACA AGATCAAAAC TCCGCCTCGA AAAATAAATT TTTTTAAATA 1560
ATTAATTAAT TAATTAATTA ATTAAAAAAG AACATAGAAT CATCAGGGTG TATGTTACCA 1620
AGAGACAGTA TAGGGAAAGA GGGAGAGAGC CCACACATGA AGGCCGAGGG ACAGTGAGTG 1680
TCTTCTGTGG CCTCCCAAGG AGTTTGGGCT TTATCTGTGT ATGGTAGACA GCTGTTGCAG 1740
GATTTTAGGA CGGTTGACTT TTGCATTCCT GTAGTACCTG GAATCAGGTG CAGGGTCTGG 1800
AGTCACCTGT 1810