EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-10310 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr10:73528110-73531380 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10999992chr1073528898hg19
rs10762477chr1073531069hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr10:73529251-73529262TAAGTAAATAT+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:73528146-73528161TGAACTCCTGACCTC-6.22
SPIBMA0081.2chr10:73529404-73529416AAAGGGGAAGTG+6.07
Number of super-enhancer constituents: 58             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02126chr10:73528123-73528920Aorta
SE_02126chr10:73529220-73534492Aorta
SE_02934chr10:73528117-73528935Bladder
SE_02934chr10:73528955-73533818Bladder
SE_04467chr10:73529333-73535298Brain_Anterior_Caudate
SE_06313chr10:73522866-73528610Brain_Hippocampus_Middle
SE_06313chr10:73529027-73537202Brain_Hippocampus_Middle
SE_09212chr10:73519913-73539677CD14
SE_10507chr10:73526194-73535094CD19_Primary
SE_11555chr10:73525717-73536174CD20
SE_11867chr10:73525696-73533295CD3
SE_13733chr10:73528072-73533652CD34_Primary_RO01536
SE_14459chr10:73526218-73535033CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15435chr10:73527858-73529997CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15435chr10:73530503-73534050CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15862chr10:73528269-73530045CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15862chr10:73530190-73534176CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16389chr10:73528051-73534117CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16982chr10:73528073-73533985CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17364chr10:73520062-73535154CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17829chr10:73522939-73535186CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18298chr10:73519827-73535875CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19115chr10:73520065-73535185CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20080chr10:73525819-73535313CD56
SE_20879chr10:73527995-73534359CD8_Memory_7pool
SE_21529chr10:73528231-73534294CD8_Naive_7pool
SE_21976chr10:73527911-73534794CD8_Naive_8pool
SE_22329chr10:73522842-73535294CD8_primiary
SE_23531chr10:73528126-73534311Colon_Crypt_1
SE_23810chr10:73528169-73528907Colon_Crypt_2
SE_23810chr10:73529148-73530087Colon_Crypt_2
SE_23810chr10:73530106-73531452Colon_Crypt_2
SE_24957chr10:73528132-73529848Colon_Crypt_3
SE_25673chr10:73528060-73534177DND41
SE_26143chr10:73524367-73534193Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26620chr10:73524294-73528963Esophagus
SE_26620chr10:73529081-73534644Esophagus
SE_28398chr10:73525468-73531080Fetal_Intestine
SE_29438chr10:73525430-73530510Fetal_Intestine_Large
SE_31197chr10:73528252-73531379Fetal_Thymus
SE_31624chr10:73524419-73528897Gastric
SE_31624chr10:73529147-73534199Gastric
SE_37028chr10:73521981-73535534HSMMtube
SE_40874chr10:73524079-73535781Left_Ventricle
SE_42187chr10:73520149-73536258Lung
SE_44709chr10:73522832-73534109NHDF-Ad
SE_49200chr10:73524322-73528938Right_Atrium
SE_49200chr10:73529144-73534161Right_Atrium
SE_49982chr10:73528141-73529932RPMI-8402
SE_50063chr10:73522901-73536984Sigmoid_Colon
SE_52331chr10:73525159-73531553Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52370chr10:73523085-73535246Small_Intestine
SE_53294chr10:73524204-73537013Spleen
SE_55134chr10:73529228-73530172Thymus
SE_55134chr10:73530787-73531332Thymus
SE_59774chr10:73453131-73536958Ly4
SE_62254chr10:73471895-73536454Tonsil
SE_64128chr10:73524230-73531553HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr107352960073531200
chr107352833973528873
chr107352906473529499
chr107353052273531091
Enhancer Sequence
AGAGACGGGG TTTCACCACG TTGGCCAGGC TGGTCTTGAA CTCCTGACCT CATGTGATCC 60
ACCCGCCTCG TCCTCCCCAA GTGCTGGGAT TACAGGAGTG AGCCACTGTG CCTGGCCGTT 120
TGGTTGGTTT TCTTTAGTGA GCTAGGGTCT TGCTCTTCAC TCAGGCTGGA ATGCAGTGAC 180
AATGAGATCA TAGCCCACTG TAACCTCGAA CTCATGGGCT CAAGTTATCC TCCCACCCCT 240
GCCTCCCAAC TAGGACTACA GACACATGCC ACTATGCCCA GCTAATTTTT AAATTTTTCA 300
TAGTGATGGG GTCTCGTTAT GTTGTCCAGG CTGGTCCCCT GGCTTGAAAC TCCTGGCTTC 360
AAGAGATCCT CCCACCTCAG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCATGA GCCACTGTGC 420
TCGGCCTCAT TCTAAACACT TTTACATAGA TTAGTTTATG TAATCCTTCC ACCCTATGAG 480
GTAGGTACTA GTATCATCTC CATTTTACAG ATGAGAAAAC GGAAGCACAG AGAGATTAGT 540
ATCTTGCCCA CAGCCTCACA ACTAATAAGT GATGGTGTCA GGATCTGAAC CCAGGTAGTC 600
AGCCTCTGGA GGTCTGGTGC CATCTGACTA CTCTCTAGAG AATAGAGGTA GCTGGGGACT 660
GACTGGAGGC CCCACCTCCT TCTTGAAGAC GGACAAATGT CATGACCAAT GAAAGCCCAG 720
CTTGCCTGGC CACGTCTACC ACATAGTTTT ACTTTTGGTT TTACATTAAA TAACATTGAA 780
TCATATATAG AAGAGGTTAT TCCCTTTACA ATTATTTCAG TCCTGATTAC ATCAAAGAGA 840
AAGTCTCAGT TTGATGCTAA TATGTCTCTA AAACATTTGC TAATCTCCTT TTCTTTTTAA 900
ATTTTATTTT ATTTTAATTT TTTGCAAGGG AAAGCAGCAG TTTTCAGACT CCGAGCCTTC 960
CCAGGCTAAA GTTTCCAACT AGAATTCAAT ACCCTTATAT GGTTTTCCTG TTACGTTCTT 1020
TTATGGTTTT GTTCTATTTA TGACAAGTGA TACTGGCTTT CCACTAATGA CAGCGATAAA 1080
AAGTTTCCTT TTAAAGATCT ACATACTCAA ATAAAAGAAT GAGTAGATTT AAAGAAAAAA 1140
ATAAGTAAAT ATTATGAAAG GCAGACACTG CAGAGATCAC AAAGGTGATA AGCAAATGAC 1200
TGAAGCTAGG GAAACACCAT CATGGAATTA ACCTTCAGAG GAGGGTGGTC AGCCTCACTG 1260
AGACCACGTC ACCCAACCTG TCCATTGCAC AGACAAAGGG GAAGTGTGTG TTTGTGTTCC 1320
CATGATGAGT GAACAGCAGA GGCAGGGTTT GACCCCAGGT CCCCATGGGA AATAAGATCC 1380
TACGCAGAAA GGCTAAAGGA ATGGGCTTGC TTGGCTTGGT AAGTAGCAGA GCAACCTCAT 1440
TATTGGATTA CTGATGAGAA AGATGGTGGC CACTGTCTTT GTCTTTGGTG ATGGCCAGCC 1500
AAAGTGAATG GACCGAATGT AAAAAGATCA GATGTAAGAA AGATCCACCA AGATAAGCAA 1560
ACCCAGGGCC AGGCTTGCCT TCAAGTTGCA ATGTCCCCAT CTCCTGACAA CTTTAAGAAG 1620
AGAACCTGTA GGCACCTCCA TGGGCATTTC AGACTGTGAG GGCCTACAGG GGCTCACAGG 1680
TAGCTGGACG CAGCCCATGC ACCCTTCATA CTCCAGGCTT TGGAGAATCT AGTCCCAGTG 1740
AAGCTCACCA ATGCCTTCCC AGGCCCTGGG CACTCCATTA GGCCCTGTAG AGAGCAAGCA 1800
GCTTAGATAG AAAGCCAATG GCATGTGGCC TGCAGAAGCC AAGAAATACC ATAATATTAC 1860
ACAGTATTCA CGAGGAGCCG GGTGCTGTGT TAAGTGTTCG TTCATTGGCT CTTCACAGTT 1920
GCCCTCCAAG GGAGGTGGTA TCATCTTCCC ACTTTAGAGG GAGGGGAACT TGCTCAGGGA 1980
GACTGAATAA CTTGTCCAAT ATCACAGAGC AGTAAATGGC CATCTTGGGA TTTAAGCCTA 2040
GGTCTGAGTG ACTCACAAAG CCCAAGAGTT AAGCAAGGGG CTGTACGGAA GCCCTGGCAT 2100
GCATGTCCCT GGCTTTGCCA TATACAGGCA TGCTGGGACT GCAGCTAAGG GCATCTGTGG 2160
GGCCACTGGA AGCCACAGTG CTGATCCCTG GCCCACCCTC CCCTGGGAGA CCAGACTGAC 2220
CCTGGGTCAT TGGTTGGCTA AAGCCTGGGG CCTCAAGTTT GGTATGTGGG GCTCGCTCAC 2280
TGCCAACGGG TTCTCCTTGA GGATCCCTTT CTTCCTTTCA TCTGCTCAGG CCTAACACCC 2340
CATACACTGT GTGCGGATAG GGAGGTGACC CCTTTAGCGT CTCAGCAGCA CACTCCTGCC 2400
TGGACCACCC TCTCCCAGGA AGGTCAGACC CCAGCGGAAC CTTTGCCCTG CTTGGGTGGA 2460
AGCATGAACA ACTAGTACAG CTCAGCAAGG GACTCCCAGT ATTGCTGGCC CTTGGGTGTC 2520
CCTGGCATTG GGTAGATGAC CCCTCATGCC AGGGACTGGC CTCAAGGCTG TTCCTCTCTA 2580
CTCCAGAGCC TCTGGGCAGT GGGTTGTGGA TTTCCTAAGA GCTGACCATT GCTGCGTCAG 2640
AGGCTTGCAG CACTGGGTTA CTCAACAAGG CCCTGCAGCC TGGTTTGCTA TGAAGGAGAA 2700
GATGGGGTCT CTCGTCCCTA GCCCCAGTGC ACTTAAATGT GCTAGTCCCA GAGGTTGGGA 2760
GTCCTGAGTC AGCCTGTGAG GACAGGGCAA GGACAGTAAC TGCCTCGGGT CCTGGGAATG 2820
TCTGTGGGGA AGAAGAGGCT CTGCTACCCT TGAGATCTGC TGGGTCCTGG TCCCTAAGTG 2880
TACCTCTCCA CCCATCTCAC CCTGAGTCAG GCCCAGGAAA GGGGTATCTT TGGTGTTTCC 2940
TGGGCTTCTG AACACCACAT TCATCACTAC CATTCTCCTC AGTGCTGGCC CAACCCCAAG 3000
AGCTGGAGAA CAGGCTGGCC CCGGCCACTC TATCTCACTT TCCCTGGCAT AAAGGCTTTG 3060
ACCTTGGGCA ACATACCCAG GGCAACCCAG CACCTCGGCA GGCTGGTGAT CAATCTTCTC 3120
AACTTACAGA TCCTGCTGAC CATGCCTGCA ACCAGGCCTC CCATCTGCTA TCTCCCTCAG 3180
TGCACACTGT CCTAGGGAGT TGGGTGAATA TCTATTATAG TGTGTCCATG TCACAGTTCA 3240
GAATCCTGAG GTCCCAGAGC AATTCAAATG 3270