EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-05210 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:159015280-159016350 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:159015588-159015609TGATTCTTTCTCTTTCATTTA+6.29
Lhx3MA0135.1chr1:159015665-159015678AAATAATTAATTT-6.78
MEF2CMA0497.1chr1:159015424-159015439TTCTATTTTTATCAT-6.64
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09429chr1:159012068-159015541CD14
SE_11012chr1:158996533-159048941CD20
SE_18632chr1:159010634-159026142CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19676chr1:159013673-159015423CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I159042chr1159012069159015541
Enhancer Sequence
TCCCCTCACT ACAATGTAAT GACAAGGATT AACACAACCT TGAAAGCACC TCACCAATCC 60
CCTACTACAT ACAATGCTTT AATTTAACCA AATCAGTCAT TTATTTATCA AGTGTGTATT 120
TTGAGGTCCT ATCCAAAATT AAAATTCTAT TTTTATCATC TCTATTCCAT AGCAGGTATA 180
ATTAGATATC TTTTTAATTT TATTTTCCTT TTGGCTTACC TTTTTGTTTT TCCCTCAATA 240
CACCACGAAA ATAATACTTT AAGGTAGAAC AAGGTGGGAA AAAACAGAGC CAACCATAAC 300
ACTATCACTG ATTCTTTCTC TTTCATTTAT TATAACTCAA ATAATACCAT CTTTAAAAAT 360
TTAGGAAAAG AAGGTACATA AGCAAAAATA ATTAATTTTT AACTATCAGA AATCTTTATC 420
TAATGCCACA TTTCAGTACA TGGTCTTTCT GACTTTACAC CTTTCATTAT GTATATACAA 480
AGAGTCTTAT TATATTCTCT CAGAGTAAAT CACATTACGC ATATTTTTCT ATAACTCATG 540
CTTTTTATTA ATATATCTTG AACTGCCATT CAACCATACA ATATAGATTT AAATTACTTT 600
ATTGTACCAG AAAAATTGCA TGGTTATTCC ATACATTATA AAATGATCCT ACGTTATTTG 660
GCTTATGTTG TTTCTAGTAT TCTGTGAATT TACAATGAAC ATAGTAAGAA CAAATGTCTC 720
TCAGATCTTC TTTCATTACC CTCAGAGTAG CTTTATAATT ATTTCCTTAG GTCCTGTGCA 780
CCTTGTGTCA GGGTACTAAT GTCATGGCTA TTGTAAGGTG ATTTGATACT GATTAACTTC 840
ATTGGGAACG GGTTTCCTAA TGTTATGGAA AATTGGCCAC ATTGATGAGT TTTGTGTGTG 900
ATATGCGTTA TTCCTGGTTT TGATTTGAAA ACCAGAAGGA TAACATTTTT ATATTTGATA 960
TCTTCTACCA TGTCTCCCTT TAAATAAACA ACATACAATG ATTTGAGATA TGAACAGGAA 1020
TAATTGCTAT TTTTTCCTGA ATAACAATTC CACCAGTATT ATTATTACCA 1070