EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-05119 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:156475640-156476540 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SCRT1MA0743.1chr1:156476393-156476408ATAAACCTGTTGCTT-6.03
SCRT2MA0744.1chr1:156476395-156476408AAACCTGTTGCTT-6.03
Number of super-enhancer constituents: 68             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156465189-156476309Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156465123-156476044Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156468387-156476109Aorta
SE_02565chr1:156469795-156476049Astrocytes
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156475698-156475875Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156472220-156476240CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156469839-156476292CD3
SE_13036chr1:156472174-156476102CD34_Primary_RO01480
SE_13485chr1:156465196-156476191CD34_Primary_RO01536
SE_14170chr1:156468402-156476146CD34_Primary_RO01549
SE_15064chr1:156468335-156476467CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156473658-156476030CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156473094-156476615CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156472808-156476020CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156466294-156476695CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156466624-156476417CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156467906-156476154CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156466814-156476634CD56
SE_21124chr1:156468394-156476159CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156468468-156476440CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156468381-156476957CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_24009chr1:156475595-156476090Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156469338-156475883Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156465342-156477016Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156465154-156476164Esophagus
SE_28187chr1:156468391-156476221Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156468218-156476064Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156468651-156480271Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156465385-156476063Gastric
SE_32703chr1:156473398-156476452GM12878
SE_34669chr1:156467034-156476478HeLa
SE_37054chr1:156464710-156476367HSMMtube
SE_38176chr1:156467537-156476177HUVEC
SE_39310chr1:156470701-156476098IMR90
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156475614-156476015LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156468511-156476032NHLF
SE_45962chr1:156465453-156476220Osteoblasts
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156467911-156476055Right_Atrium
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156470739-156476071Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156469779-156476230Small_Intestine
SE_53429chr1:156465373-156476196Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156469792-156476120Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63769chr1:156469818-156476118HSMM
SE_65297chr1:156472329-156476016Pancreatic_islets
SE_66788chr1:156475588-156476144Jurkat
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Enhancer Sequence
AGATTGTGCC ACTGCACCCC AGCCTGGGCG ACAGGGCGAG ACTCCATCTC AAAAACAAGA 60
AAAAGGAAAT GCAGGGTAGA CGTTTAGAAG GACTTCCCAG AGTAGGAGAG TATATTTGCT 120
CATGGGAGAG AAACCCAGGA GCAGGAGGAG CAGAACCACT GTGAAAGTGG AGGCTTGGCA 180
TTTAAGACTC GCCCAGTCAT AATTTCAGCC TTTCCCTTAT CCCTGCCCCG CATGTGCATA 240
AGCACAAGGA CTTCGTTCAC TTCTGTGTTG CCAGCACCTA GAACGCAGCA TGTAGTAGGG 300
ACTCAATTTA AGTCCAGTCC TTCCTCCTTA CCTGATGGGG TATTGGTTCC GGGACATCTC 360
CCATAGGAAA ATCTGCTGAA TCTGTGAGAT AGTGTAACAT TTGCATGTGA CCTATGCGCC 420
ACCTCCGATA CACTTTAAAT CATCTCTAGA TAACTTATAG TATCTAATAC AATGTAAATG 480
CTATGAAAAT AGTTGTTATA CCATATTGCT TAAGGAACAA TGACAAGAAA AAAGGTCTGT 540
TCAGATGCAA TTTTTTTTCT GAATATTGAC CATCCAAGGT TGGTTGAATC CACGGATGCA 600
CAGTATTTGT AGAATGAATG AACTGATCCA TTGAGTCCAA TGCAAAGCCA CCTCCTTTAG 660
GAGGCTTTCC CTGATTGCTC CACCCAGCAT GCATAGCACA AACACGCTCA GCTAAAGACA 720
ATTGAACTGT CTTTTGAACG CTCACAGCAA ATAATAAACC TGTTGCTTCC TTCCATGCAT 780
TAGAGACCAT GAGAGCAGTT GTTAAGAGCA CAGAACTAGG AATAATATAA ACTTGGGTTC 840
CAATTCCATT AATACTGTTT ACTAGTTGAG TGACCTTAGA CAAGTCTCTT CATCTTAGTT 900