EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-05117 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:156456200-156460300 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 78             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156456600156457200
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
GCTTTTTAAA TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC AATCTAGACT GTTAAATGCA 60
GGAACTGCTG AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC CTCTCTCCCC TTTACTATCT 120
CCCTCTCACC ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA GATGTAACCT CTGTCAGCTG 180
ATGACCAATA CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC CTCTCTTTGT TCTCATGACC 240
CTCAGAAAAG TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA CAATTGTGAA TAACTATGAT 300
TCTGTGCTTC TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA AAGTTTCATG AGGGCAGGAA 360
TCACATCTGT CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG GGAGCTGAGA AAATGTCTGT 420
TGAAAAGAAG AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT 480
AACCTCCAAC AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT CTATCCTCTA TGGAGCTAGA 540
ACCCTTGCTC TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA CCTACCCTCC AACCACCCCT 600
GGTATCCCAG TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT GGTGCAGAGG GTGAGACTCT 660
AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA GAGGATGGGG TTGCTTAGGC 720
AACTGTCGCC TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC ACCGCCCCCC CCACCCCCGC 780
CTCATGCTGG GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT GAGAAGGCAG GGAAGCAACA 840
GAGATTCACT GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT TAAAAAGACT AGGCCCCATC 900
TATCCCCACT CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA TAATTCCATG CTTCCCAGGC 960
CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG CCAGAGGAGG AGATGCCCCT 1020
GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT CTACAAAGCA GATGCAGTCT 1080
ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC 1140
TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA 1200
GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA GGCCTATCCT AGCTAAACTT 1260
CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG 1320
CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA 1380
GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT 1440
AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA 1500
CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG 1560
GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG 1620
GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG 1680
GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT 1740
GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT 1800
GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT 1860
CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA 1920
TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA 1980
ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG 2040
GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA 2100
AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT 2160
GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA 2220
CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC 2280
TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC 2340
TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC 2400
TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT 2460
CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT 2520
GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC 2580
AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC 2640
AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG AGCAGTGGGC CTCAACCTGC 2700
TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC CCTTCATCTC TTCCTCCCAG 2760
GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG GAGACAGCTG 2820
TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG GGCATGAAAT AAGCAGCAGG 2880
CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC CCACAGTCAG GCAGCCTCAA 2940
GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC AGACACAGAA GAGGGTGGCA 3000
GAGGGGGGAC AGACACACAG ACACAGGAAA GATGACAGAG AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA 3060
GAAGGCATTA TGGGGCAGAG GCAGAGACAG ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG 3120
CAGGAGACCA CAGAGACAAA GATTCAGAGA GAAGCAGGTA GAGAACAAGA GACAGGTTCA 3180
ACAACGGCTT CCAGGACTGA CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG GAATAACTCA ACAGGACACC 3240
ATCCCTGCCC TCTGAGAACT TGCAGTGCAG CCAAGAGACA GACAAGGGAG GGGCAGGTCC 3300
CACCCAGGGC AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC TGGACCCAGA 3360
CACAGCCCCA GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG 3420
AGGACCGAGG ACCAAGGACG ACAGCTGCCC AGCTGAATCC CCAGGCCCTG CCTTATTACC 3480
CAGTCTACCC TCAGGTTCAC AACCTTCCTA GTCATTCTCT CTTCCAACTT CAGCCCTGGG 3540
ACCTCCTCCC TAGTACAGAG ACACAGGCTA AGGAGCTCTG GGAGACAGGG CAGGAAGGTG 3600
AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA CACCCAGGCA AGATGGTCCA GGATCATTCT GTGGTTCACA 3660
CAGTGAGCTC TTCCTTCACA AAAGAAGTGG GGGGCATTAC CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA 3720
GGCAGGAGCC TCACATTGTC CCTCTCCCCA TCCCACACAC AGCCCAATTC TCACAACCCC 3780
TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT 3840
GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC CACAGCAGCC TCTTTTCTTC 3900
ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG GTCTGATCTC AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC AACCCTTCAA 3960
AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA CTACCCAAAT CCCTGGTTCC CACCGTCTTT CCCTCCCTCG 4020
GGGACTCCCC TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC AGGGGCTATT TTTAGCCTGG 4080
GCACTGAGCT AATTTTAACT 4100