EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-05062 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:155936680-155938940 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:155937983-155938004CTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.41
Myod1MA0499.1chr1:155937739-155937752TGCAGCTGCCCCC+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155938583-155938603CCCCCACCCCACCCCCTCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr1:155938584-155938604CCCCACCCCACCCCCTCCAC+7.01
ZNF263MA0528.1chr1:155937603-155937624CTCTCCAGCTTCCCCTCCCCC-6.35
ZNF263MA0528.1chr1:155936834-155936855CTCCCACCTCCCTCTTCCTTC-6.41
ZNF263MA0528.1chr1:155936827-155936848CCCTCTCCTCCCACCTCCCTC-6.44
Number of super-enhancer constituents: 49             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155935629-155941788Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155934724-155941198Aorta
SE_03231chr1:155935411-155941178Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155936927-155937325Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155937326-155938520Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155938679-155939364Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155936457-155939358CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155937235-155938653CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155936695-155940384CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155935980-155938209CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19282chr1:155938352-155941313CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26270chr1:155936615-155938673Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155935912-155941094Esophagus
SE_29653chr1:155935863-155942574Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155936039-155937982Gastric
SE_32195chr1:155937995-155941084Gastric
SE_37367chr1:155935140-155941528HSMMtube
SE_39002chr1:155938017-155941141IMR90
SE_40938chr1:155934691-155941319Left_Ventricle
SE_42293chr1:155934607-155941204Lung
SE_45406chr1:155937214-155937779NHLF
SE_45406chr1:155938586-155939581NHLF
SE_47089chr1:155937159-155937866Ovary
SE_47089chr1:155938546-155939070Ovary
SE_48803chr1:155935124-155941166Right_Atrium
SE_50236chr1:155936031-155941345Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155935853-155941418Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155936908-155938578Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155938679-155941227Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155936636-155941195Small_Intestine
SE_53512chr1:155935694-155941433Spleen
SE_55468chr1:155937112-155937974Thymus
SE_56150chr1:155938459-155941237u87
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155936894-155941241HSMM
SE_69165chr1:155935996-155938187H9
Enhancer Sequence
GGGAGGGTGG GGTAGAGAGG GTGAAGGGAG GGCCGGGTGG TACAGGAGGG GACACACCCA 60
CATGCAGACA CCCATCTCCT CCTGGCCACA CAGTCCTCGG GGACTCTCCC CCCTTCCCCG 120
ACTTCTGGGC CATTACCACA CCCCAGTCCC TCTCCTCCCA CCTCCCTCTT CCTTCAAGCA 180
GGAAATGAAG TGAGGGGGGT ATAGGTGCTG AATGAAATTA AACAATCAAG TGGGATGGGC 240
AATCCTGACC CCAAGGTGGC CTGAAGGGCG GACCAGAGGG GAGCAGGGGT CACTGGCTGC 300
CAGAGATGAG CTCAAGAAGC ACGAAGGTGG TTGCGAATGG CAGATGGAAG AGAGGACTCC 360
CACAGAACAG AAGATGGCAC AGAGGCAGCC AGAATGGGGG CTAGGGGCAG AGGGGAAATT 420
TACATTCCCT GAGCTTTTAT AATAGTAAAT GTTCCACATT TACTTAATCC TAACCACCCG 480
TAGAGGGAGG TTCAGTTATC CTCATTTCAT GTATGAGGAA CCTGTCCTGG AGTGGCTAAA 540
TCGTCCATCA GAGGTCACAC GGCTAGTGGG AGAGGTGGTG TTTACACTCC GGTGGGCCTG 600
AATCCAAAGG CCGTGCTCCT TCCCTCGCAC CACATGCCCT GGACTCTGGC TGGGCCTCAG 660
CAGCTCCAAG GCTGATTGAT GGCTCCAGTG GTAAAGAAGG GACAGGCAAC TCCCCACCAA 720
GCCTGGCCTT CTCCCTTCCA GGCCCAGGGA GTCCTGTTCC CCCAACTCAG GCAAATCCAC 780
AGCTCCCACA CTCCATCTGC TTCTCCGCCA TCCTCCACCC CACCTTGCCA TGGGGTAGGA 840
GAGAAGAAGA AAGGAGGATT CGCTGAGCCT AGGCACTGGG ACCCTGGCCG TGCCCTTCCC 900
AGACATGCCC TCAGCTCCCG GCCCTCTCCA GCTTCCCCTC CCCCATCCAA CAACACCGGA 960
AACTCTGCTA ACTCTTTCAG ACAATACCCA GCACCACGCT CACTTCCACA AATACAAGGC 1020
AAACAGGGTG GAGCAGAGGG GGCAGACAGA AGTGGGGGTT GCAGCTGCCC CCACCCCCCT 1080
GGAGCTCCCT TCTCCTACCC CCAACACTCA GTGTCTCTGG ATTGAACCTC CGCTTTCCAC 1140
CTGCTCTCAA AATAGTGCTG CCCGCCTCCC CTGTTCCCCT GGCAACAAGC TTCCGGATTG 1200
GGAATTTTGT CAGGTCTCTA TAGGGATCTA GATTGGGGTT CCCTCCTCAT CCTCACAACT 1260
CTAAATTGAA CAGTGAGGAA AGTAGGGAGG CTTCACTGGT TTTCTTTTCT TTCTTTTTTT 1320
TTTTTTTTTT GAGCGGTAGC AAGCTTTATT GTGAAGAGCA AAATGACAAA GCTCCCACAG 1380
CGTAGAAGGG GACCCGAGCG GGTTGCCCAT CACTGGTCCT TTCTGGGGGT TCCTTCCCCA 1440
AGTTTCATAG GGATTTACAG GCTAGAGCTT TTGTCCGCTA TTCAGTAGCA GGTCACAATA 1500
CCTTCAATCC TGCTCTAATC AGAGGCATCT CTGCCATAAC TTCAGGAGGA ATTGAGGGAG 1560
AGGGGGCAGC AGGAGCCCTC TGTGTACTGG GGAAGGAAAG AATTCCTGGC TTATACTCCC 1620
TAAAGACAGG ACTACACTCA GATGTGGATG AAGGGCAGGA ATTCTAACCC CTGCCCCTCA 1680
ACACACACAT CCCTGCTACA TTCCCTCTTT CTCACTAGAA ATTTGAGATG AAGGGTCCTA 1740
ATCACATCTT CTGCTTGAAA CAGCAGAGAT TTCAGGCTCC ACCCATAGTC AATAGAAAGA 1800
AAGGGGCAAG GGGACTGTGA AGTCCTGAAT GCCCAGCTCT GCGCAGGAAG ACAGGCAGAG 1860
CCAGCTGCAA GGCTGGCAGC TTTCCACCCA GTTCCTCTGT CACCCCCCAC CCCACCCCCT 1920
CCACACATAC AACATTCCTG CTCCTTCTCC AATCAGTTCC CCTAACCCTT AGCAGCTGTT 1980
CGGGGAGCAA GGGGGGTGCC TGGTGGATGA CAGCTGCAAG AGGAGCCAGC ACAGCCTCCC 2040
CTCCCCCACA TTCCCAGATA GTCCGGCTTA TGCCATATTC CAACAGCCAC CACCCCTCAG 2100
AGTGAGGACA GGGAGCAAGG GATCAAGCAA CTGGCCCTGG CATTTGGGCC CAGCTGGGGA 2160
TCAGAGAGAA GAGTGACCCT CATGGATCCA GGCAGAAAAA ACAGATGAAA AGATCAGGGT 2220
CAGTGGGCAC CGAGTCTGGG TGACTCTCAG GGTCCAAACA 2260