EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS105-03187

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

IMR90

Coordinate

chr1:63877730-63879580

Target genes

Number: 4
Name	Ensembl ID

ALG6	ENSG00000088035
DLEU2L	ENSG00000116652
PGM1	ENSG00000079739
ITGB3BP	ENSG00000142856

TF binding sites/motifs

Number: 7

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

MNX1	MA0707.1	chr1:63878430-63878440	GGTAATTAAA	+	6.02
PHOX2A	MA0713.1	chr1:63878129-63878140	TAATTGAATTA	-	6.14
PHOX2A	MA0713.1	chr1:63878432-63878443	TAATTAAATTA	-	6.62
PROP1	MA0715.1	chr1:63878432-63878443	TAATTAAATTA	+	6.32
PROP1	MA0715.1	chr1:63878432-63878443	TAATTAAATTA	-	6.62
Phox2b	MA0681.1	chr1:63878129-63878140	TAATTGAATTA	-	6.14
Phox2b	MA0681.1	chr1:63878432-63878443	TAATTAAATTA	-	6.62

Enhancer Sequence

AGGCATGTTT AAACACTTTC CTCTCCTTTC TGTTACTGTA CCTTACCTGT GACCTTTAGG 60
GGTTTCATGT AGAAGGTACA AGGAATAGGA ACTTCAGCTA CTTTCCTCCT GTAATCATTC 120
CTTGCCAGTT ATTGCTTGAT TGATTAATTG ATTGGTTGAG ACAGGATCTT GCTGTTGCCC 180
AGGCTGGAGG GCAGTGGCTA TTCGCAGGGG TAATCATGGT GCACTACAGC CTTGAACTCC 240
TGGGCTCAAG TGATTCTCCT GCCTTTGCCT CCCAAGTAGC TGGGACAACA GGGTGTGTGC 300
ACCTTGCTAG TTATTTAATC CATTATATAA CCCCTAGCTC AGGTGGCATT TTTTAGTATG 360
TTCCATCAAT AGGTAATATT CATGCCATCA TCAGATCCAT AATTGAATTA TATGTTTTTG 420
TAATGAAATA GGGTTTGTAA TGAAAGACAG CATGAGAAGT TTCAGCTACA ATTTTAACAG 480
CTGTGTAATT TTTTGGTGTA TATTCTGTTT TTAGTCTTAG GAAATTATTT GTAAAACTAA 540
TAATCATGTT GCTTCAGGAA GATCTCATAA TTTCTTATGA GATATATAAC CTTCATCCAT 600
AGTAATTTTT AATGAGAATC TTTCATTTCA TTTCATTTAA TGCTAGTTTA ATCACTCTTG 660
TTAAACTTTT ATTATGTGAA TAATTTGATC ATTTAGATTT GGTAATTAAA TTAAACCATT 720
TTTCTGAAAC AAAAAGGCCT TTTAATAAAG TTAGACAGAA ACAACATATT TATAGATAAT 780
TTGCTAGCAT TTCTTTTAAA AATAATTTTA AAAGCATATT TTCCTAAGTT TTGAATATAT 840
AAATTTCTAT AGAATATCTT TCAGTAGACT TATAGGAAGA TGGAACCAGC ATTTTGAAAG 900
CGACTAAGAT GGGAGTTTGG TGTTGTGAAG GAACAGAAAT GTGTGACTGT ATGTCAACAG 960
GATGATGGTA GTGATGATCT AAATAATCAC TATTGTTATA ACCACCACTT AGCAGGTGCC 1020
AGACACTTCC ATGTAATTTT ATTTGATCTT TACAGTAGCT TTGTGGTAGC TATTGTCTCC 1080
ACTTTACAGA TTAGAAAACT GAGGTCAAAG ATTCCTATAA CTAGTATGTA GCAGAACTGT 1140
GACTTGAACT TGGAAAATTG TTTTCCTAAC CTCTTCTTTA TATAAACTCT AACACTTACA 1200
TAAAGAAAAG TTTAACTCTC TATGTAAGCT GCCTAATTAT TTGCCTTACC TTCCATTTCA 1260
GAAATGGCAT TTATCATGAT AATTATAAAA ATGAGTATCA GACATGTTTG ATGGTGTTGC 1320
CAGTCTCTTC CATTCACTTC TTGCCTTCAA AATCTGAAAA GCATTTTCTT TGATCCAGCA 1380
GAGGAAAGTG GGATGATATA GTTGTCAGTG ATAGTTACTT TTTTGATGTT AAGTCTGCAC 1440
AGCTGTAAGT CAAGCAGCTG TGTAGAGAAC GGATTTCACC ACCAGGAGAG CTGTAGTTAC 1500
AAACTTAATT TTGAAAGTGA TCCTAGCACA ACTGCTAATG TCTTTAGACT TTGATTTATT 1560
AGCAATTAGC TCTTGTCATT GCTAGTAGCT AGCAGGTTAC TCTGTTACTC TAAGTAAATT 1620
CAGTTGTGTG ATAAAAATGG GTCAAATGTA ATATGTATTC TATAAATTGT AGAAAAAACA 1680
TTTCTTAGAA AAATTTCCAA AGATGAAGGA CTTTAGTATT CAGGGATAGT GCACTGCTCT 1740
TTGAAAACTA TTAAGTATTT GGGAATGTCT GGATTATGGT GGGCCAATGC TTTTGATCAA 1800
CTGCCCTGCA CAAAAATGAA AAATGCTTGA GACAGTGTAT GCGTATATGT 1850