EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-02264 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:39863140-39865780 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MafbMA0117.2chr1:39863354-39863366AAAGTGCTGACT+6.32
Nr5a2MA0505.1chr1:39864021-39864036GCCGGCCTTGAACTC-6.01
PRDM1MA0508.2chr1:39863451-39863461TCACTTTCAC+6.02
RUNX1MA0002.2chr1:39864323-39864334TTCTGTGGTTT+6.32
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00753chr1:39863212-39865727Adipose_Nuclei
SE_02098chr1:39863552-39864939Aorta
SE_02863chr1:39863503-39865158Astrocytes
SE_26157chr1:39855144-39866292Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30690chr1:39860149-39865801Fetal_Muscle
SE_37092chr1:39855581-39868937HSMMtube
SE_38617chr1:39862318-39865931HUVEC
SE_46332chr1:39860146-39866167Osteoblasts
SE_47389chr1:39856575-39867060Panc1
SE_55086chr1:39859150-39865239Stomach_Smooth_Muscle
SE_55918chr1:39856681-39866226u87
SE_64104chr1:39863212-39866034HSMM
SE_67929chr1:39856681-39866226u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr13986336239865691
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039391chr13985681239867008
Enhancer Sequence
GGAGAATTGC TTGAACCCGG GAGGCAGAGG TTGCAGTGAG CTGAGATCAT GCCATTGCGC 60
TCCAGCCTGG GCAACGAGCG AAACTTCGTT CCAAAAAAAA AAAAAAGTAG CTACTGACCA 120
TCATAGCTCA GCTTAGCCTA CCTTAAACAT ACTCAGACAC TTACATTAGC CTACAGTTAG 180
GCAAAATCAT CTATCAGAAA GCCTATTTTA TAATAAAGTG CTGACTCGCT CATGTAATTT 240
ATTGAATATT GTACTGAAAT AGAGAAACTG AATGATTGGG TACTTGAAGT ATGGTTTCTA 300
CTGAATGCAT ATCACTTTCA CCATCATAAA GTTGAAAAAT CTTCAGTTGA ACCATTGTTA 360
AGTCAGAGAC CATCTATAGT AAGGGAAACA GATACAGAGA ATTACAGTGG TACTGATGTA 420
GTGGTAAATG CAGTAAGAAA GATCTGAGTC TAAATGATCT CTGAAAAAAA CTCTAAATCA 480
GACATTTAAA ATCCTATTTT GCAGATAAGA AAACTTAAGA CTTGAAGAGG TTAAAATAAC 540
TTGTTCGAGC CACATAGCAA GTAAATATTA GAGTTGGGAT TGGGAAGGTC TGTTTGGCAC 600
CAAAGTTTAT GCTACACCAG TGGTTGTCAA CCAAGCATAG CTTTGCAGAG ACTCCCACTC 660
CCCGCCACTC CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT AAACAGTTTC ACTCCCATCA CCCAGGCTAG 720
AGTGCAGTGG CACAATCATG GCTCACTGCA GCCTCGACCT CCCAGTCTCA AGTGATCCTC 780
CTGCCTCAGC CCCACAAGTA GCTGGAATTA CAGGTGCATG CTGCCATTCC TGGCTAATTT 840
TTGTATTTTT TGTAGAGATA GAGTTTCACC ATGTTGCCAA GGCCGGCCTT GAACTCCTGA 900
GCTCAAATGA TCTGCCTACC TCAGCCTCTC AGAGTGCTGG TATTACAGGA ATGAGCCACA 960
GTGCCTGGCC CAGAGACATT TTTTATTGTT ATGACTGGAA AAGCTGCTAC TGGCATCTAG 1020
TAAGTGCTGC GAAACAACCT ACAATACACA GGATGACGGC CCCTTACAAT GAAAGAATTA 1080
TTCAGCTTAC TTCTAGAAAG CTAGGGAATT TGATTTTTGC CATCTTCAGA TCCCATGACA 1140
AGTAAGAGTT AACTGATTAA ATAGTTCCAC TCGCTGGGGG TGCTTCTGTG GTTTTCCTCT 1200
CCTTTTAAGA AAATTAGTTA AGAAATAGTG TTGCTTCCGG GAGTGACTTA CACAGATAGA 1260
GTCAGGATCT TGGGGAACTA ATCTGAGTCA GCGACTGAAG AATTTTCTCT ATGCCTGACC 1320
AGTCCCCACC CCACACTGCC ACAAGGCTCC TGCTGTGGAA ATCAATCAGC TGTGTATCTC 1380
AGGCTGCTTC CTGTAGGGTG TGTTATGGAA TGGCATCAGC CCTTGCACCA GCTGGGAGTA 1440
CTGATCTCAG TGTGATTTTA TCAGACTATG TTTCTTTTGA GCCTTACTGT TTGGAACAAA 1500
GGACCCTCTG TTAAGAATGC AGAGAGCTGG TGTGATTGGA TAGCTAGCAT ATACATACAT 1560
GGTTCCTATG GGAAAAAAAC AGACATAAAT TATGCTATAG CCCTCTAAAA TTTTCATCTC 1620
CAAAATGATT TCCTGACCTT CTGTCTGTAT TCACAGTTCT TTCTGTAAGT GCTTATCCTT 1680
CCCCCAAAGC AATTCGAAGG CCATCTGATC TGATAAATGG TTGTATCCTT CAGAACTAGC 1740
CTATTTCTGT GTCTCCAGTC TTGGATGTAT TTGATCCCCA CTATCTTTCC AGTGTTATTT 1800
CCTATATAGA CCATACACTA CATCCAGTTA CCCCAGACAC TCCTTATACA TTTTAGGTAT 1860
TTGATTTCTG AAGTCATAGC TCAAGTCCAC TTCTTTATAA AGCTTTTTTT TTTTTTTTTT 1920
TTTTGAGATG GATTCTGGCT CTGTCACCCA GGCTGGAGTG CAGTGGTGCG ATCTCGGCTC 1980
ACTGCAATTT CTGACTCCCA GGTTCAAGCG ATTCTCTTGC CTCAGCCTCC CAAGTATCTG 2040
GGATTACAGG CACGCACCAT CTTGCCTGGC TAATTTTTTT GTATTTTTAG TAGAGACAGG 2100
GTTTCGCCAC GTTGGCCAGG CTGGTCTCGA ACTCCTGACC TCAGGTGATC CACCCACCTC 2160
GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTATAGGCGT GAGCCACCAT GCCCGGCCTT ATAAAGGCTT 2220
TTGATCTCCC CAGCTCACTA CTCCTGATCT CTTAATCATT TACAATGTAT AACTCACTTG 2280
GCTTTTATCA CATACCACCT AATTTTGACA TTTTCTGATT ATATCCATTT GTCCTATCCC 2340
CTCAGTTAAT TCACTTTTGT GTCCCTTAAT GTAGTTAGCA TATTGGTATA TACACAGTTG 2400
GAGATGAGAC AATATTTGAC TGACTGGATG AACATTCTTT ATTTCTCATA AGCCATGTGA 2460
GCTCTAGGAT TCAAAATGCT ATCTACTCTG CAAGACTTGA GGTATATATC CTTGTGTGTC 2520
CTGAAGAAAT TCTAATCTTA GCCTGATTTC CTCAGTTCTC CATCTTTCTT CTGGGCTTCC 2580
TTCCTTCTCT GCTAGTTAGT ATATGTTAAG GGAACACAAT CTTTTTTCAG TATAAGAGGG 2640