EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS105-01646 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
IMR90 
Coordinate
chr1:27848890-27850260 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs74606343chr127850075hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:27849870-27849881TTTTATGGCTC-6.14
Number of super-enhancer constituents: 40             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01588chr1:27847229-27850959Aorta
SE_02913chr1:27849064-27850177Bladder
SE_03261chr1:27848220-27851115Brain_Angular_Gyrus
SE_03939chr1:27845236-27851100Brain_Anterior_Caudate
SE_05196chr1:27845131-27856743Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05814chr1:27844227-27851238Brain_Hippocampus_Middle
SE_06945chr1:27845183-27851030Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07770chr1:27844238-27856992Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08936chr1:27849828-27850095Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_14757chr1:27847180-27856512CD4_Memory_Primary_7pool
SE_23188chr1:27847642-27849034Colon_Crypt_1
SE_25901chr1:27849050-27850678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26518chr1:27843507-27857767Esophagus
SE_27625chr1:27843691-27857024Fetal_Intestine
SE_28547chr1:27843416-27856986Fetal_Intestine_Large
SE_29557chr1:27845136-27850991Fetal_Muscle
SE_31031chr1:27846218-27856799Fetal_Thymus
SE_31394chr1:27847672-27850831Gastric
SE_33477chr1:27843634-27857256H2171
SE_35950chr1:27847434-27851336HMEC
SE_36974chr1:27845141-27851091HSMMtube
SE_39896chr1:27849246-27851350K562
SE_40593chr1:27844098-27856916Left_Ventricle
SE_42106chr1:27844182-27851151Lung
SE_48058chr1:27847224-27850904Psoas_Muscle
SE_48567chr1:27844222-27851412Right_Atrium
SE_49444chr1:27848868-27849874Right_Ventricle
SE_50130chr1:27844122-27851113Sigmoid_Colon
SE_51091chr1:27848905-27857215Skeletal_Muscle
SE_51984chr1:27847470-27849848Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52467chr1:27848710-27850530Small_Intestine
SE_54527chr1:27845490-27857100Stomach_Smooth_Muscle
SE_55184chr1:27847634-27851100Thymus
SE_62007chr1:27846487-27856737Toledo
SE_62718chr1:27801410-27856116Tonsil
SE_63223chr1:27848362-27856425GLC16
SE_63746chr1:27846637-27850471HSMM
SE_65253chr1:27843908-27851025Pancreatic_islets
SE_66890chr1:27843634-27857256H2171
SE_68682chr1:27848751-27850192H9
Enhancer Sequence
TTTGTCTGTG TGGTTGTTGA GAGTGACTCA GGGGAACACT GTGTGACTGT ATATGCTTGG 60
CTGTGTGTAC AGGGAACAGG CAGCACAGGC ATTGTGTTTC TGTGGTTGCA TTTACACAGG 120
GCGGTGGCGG CGGCGGTGGT GGTGATGGTG ACGGTGCTGT GCTACAGGTT TGCACTTGTT 180
TCTCTATGTG GCAAGGCCCT GCGTGTGACT GCGTTTGTGC GTGTCTGTGA GCACGGTGCG 240
CTGGAAACTG CGTGCTTGGG TCTGTGGCAG GCTGAATGGA GGAGGGCGGA GGGAGTCCAT 300
GGCTATGTTT GTACTTGTCT GTGAGCCCGG GGTCAGATGC GCTCCATGTG CTACCTCCTG 360
TGTGCACAGG TGGCCGCTGT GTCCAACCGT GTCTTTGTGT GTTTCGGGTT GCCTGAATGT 420
GCACAGGCGG AGGACATGGA GGGGGGGATT TGAGTGCGTG CCTGTGCAGG CCCCTTTAAC 480
GTGGCAAGTC TAAGAAATGT CGGCCTTCTT GGCAGCGAAT CTGGGCTTGG TTCCACTGGG 540
GGCGTCTGCA GAGAGGGGCT CTTAGAAGGG ACGTGCTTGA GCGAGAGAGA CAGGAAGGGA 600
AGGGGGGGCC AGCCCCAGCT CGGGGTTTCC AGGAGGGAAA GCCAGACATT GGAACTTGTC 660
AACGCTACCT CCTTCCCTGC CCCCACCTTC CACTGCTGCC TCCCCTCCTG GCGCCTGAAG 720
GCTGCTGGCA GACGGACAGA CAGACAGACA GTGCACACAT AGACTGGCTC ATAGGCACAG 780
AGCCCAAACC TGAGCCCCTA AATGCACAAG CCTGGACACT GAGGTCCAGA GAGGGCAAAG 840
GAAGTAGCTG AGTCTCGGAG GAGCACATGT GTTTATGCAT GTTGGGGGCA GGGGGTGCTG 900
TTGGCCTCTG GTGCTTCAAC CCAGACTGGA GCCCAGGCCT AGGGCGGGGA AGAGGCTGTG 960
GAGAGCCTCT GGGGAGGGGC TTTTATGGCT CTAACCAGGC CCTCAAGGCC CCCAGCTCCT 1020
CTCCCTGTTT ATACAACTGC TGCAGTGTCT TTGAGAGTCC TGTTGCCTCA AAAAAACACC 1080
TACCGCAACT CCCTGTTTGT ACAGAGGCAG AAAAGACCCA GAGAGGAGCA GCAGCTGATC 1140
CAGGGTCACA CAGCAGAACC AGGACTGGAA TCCAGGGCTC CTTCTCCTAG CTGTGCATGT 1200
TGGCCCATGG GCCACTTAGT CTTATCTTTC CCTTGGTCCA TTTATCTTTT CTTCCTCCCA 1260
GGTCTTCGGG ATATGACAAC GACCTCTTTT TTGTGTTGCT TTTGTTGCCC AAGTGATATG 1320
TCTGTCTGCC TGTTAGTCCA TCTGTTTGTC ACAGGGCTTC AATACCCTCT 1370