EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS102-02604 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HuCCT1 
Coordinate
chr1:230238490-230243960 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3811489chr1230239259hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:230242907-230242918AGAGATAAGGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:230239421-230239442AAACAGAAAATGAAAGAACCC-6.65
PLAG1MA0163.1chr1:230241093-230241107GGGGCCCACTGGGG+6.86
RREB1MA0073.1chr1:230243379-230243399TGTGTGTGTGTGGTTGGTTG-6.06
RREB1MA0073.1chr1:230239920-230239940GGTTCTGGGGTGGTGGGGGG-6.25
RREB1MA0073.1chr1:230243383-230243403TGTGTGTGGTTGGTTGGTTG-6.86
TFAP2AMA0003.3chr1:230242926-230242937AGCCTCAGGCA+6.32
ZBTB18MA0698.1chr1:230243681-230243694GCACATCTGGATC-6.41
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01245chr1:230239641-230243336Adrenal_Gland
SE_01785chr1:230239049-230240587Aorta
SE_01785chr1:230240637-230243187Aorta
SE_02496chr1:230239508-230241945Astrocytes
SE_25348chr1:230236453-230250730DND41
SE_31112chr1:230238334-230250198Fetal_Thymus
SE_34791chr1:230238329-230243364HeLa
SE_36634chr1:230239950-230242005HMEC
SE_37247chr1:230239177-230242475HSMMtube
SE_39241chr1:230238979-230242188IMR90
SE_39366chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_39366chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_39366chr1:230243332-230245406Jurkat
SE_43672chr1:230238380-230242897MM1S
SE_45047chr1:230239152-230242696NHLF
SE_45719chr1:230236856-230242994Osteoblasts
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SE_49908chr1:230243259-230245387RPMI-8402
SE_50426chr1:230239072-230243127Sigmoid_Colon
SE_51846chr1:230239549-230242044Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_63637chr1:230239456-230242241HSMM
SE_65792chr1:230239400-230241648Pancreatic_islets
SE_65792chr1:230242407-230243231Pancreatic_islets
SE_66256chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_66256chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_66256chr1:230243332-230245406Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1230239370230239686
chr1230240136230242131
chr1230242543230242593
chr1230242784230243065
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230101chr1230237569230243904
Enhancer Sequence
CTGTTTTTTC ATAGCCATTG ATGGAAACAG ATTCTGTGGG GTAAATAACA GAGTCTTGGG 60
TGGTGGAAAG GTTGAAGATG TCCAGTAGTT GTGGCAGGGC AAGGATGGAG GACTTTTTCT 120
TTGCAGGGGC AGTGGAGAGG CGGGGCCATG GGTGAAGACT GGAGAATACT CAGAAGGTAG 180
CATGGACGAG AGTGTTGTTT GATGACTCTG CATGTGACCA GTAGTGACAT TTTACTCACT 240
GAGGCTCATA TTGAGGTTAA GCCCGAGGTC CATTGGCCTT GCTGAGATCG TGTTTAGAAC 300
ACAGCACTGT GCAGTAAGAG ACTCCTATAA CTCTATCAAA TTTGCATTTG GAGGAATTGT 360
AAAGAGCCTC TGTTACCTCC TAGGTGAGGC AGTCCAGGAA AACAGTTGCT AGAAGGAGCT 420
ATCTGCAGAA ATAGACAGTT GTGGTCCTTT CATGTTTTAA TAATTGTTCC CTGGATTTCA 480
AGGAGTCAGT CCAAAATCCC CGTAATAGAT TTTAGTAACG TTCATGGAAT CTCAGTTTGC 540
ACATCATGAG ACCTTTAGTG TGGTGTTTAC TGTCTTCACC TTAATATACT TTGTATCCAT 600
GAGCAACCTT GCTACAGTCA TGCAAAGATG ATTATTTTTT ATTCAGCAAT AATTAGCCAC 660
AGTGTTGAGC ACCCAGATGC CTTCCTGCAG CAGCCCCCCT TTTCTCCCCA GCCAACATCT 720
GCAACTGTGA ACAGATTTCC ATCTTCAGCC TTGGTGGTTG GAAAGAAATG TAAGTCACCT 780
TTTTTTCTGG TTGGTTCTGG GGCAGATGCC ACCAGGCTGC AGAGGCAGTC TGTGTCTGTG 840
GGGCTCACCA GGGCATGAGT TCTGCTCCCA GGAAAGAGAT TCTTGCAGGA TTTTGTCTGT 900
GGTTCTAAGG AGACAAGTAG GTGGCACACA AAAACAGAAA ATGAAAGAAC CCATCCCTCC 960
AAAACCACAC ACACAAAGCC AAAAGGAAAA AAAAAAAGCA CATAATTATC ATGTAGGCAC 1020
TGTTGCAGCT AACCCTGATT TTGGCCTCAA TTCTGAAACA AGTTAGCTGG TTTAGACAAA 1080
CCCCTTATTA GGTAATGGAT TGTTATTCAT TCCTCCCCTT CTCCTAGTCA TTTACTCCGT 1140
GAGAGCTGCT CCTACCTGAC CTTCCACTGA TTTTGGTAGC AGCATCTCCC AGAGCGACTG 1200
TTTCCTTCTT CAGCAGTGTT CCTTACTCAG GGTGTAAGAT CTTAACCCCA CAGAGCCCCG 1260
TATCAGGTTT AATTAACTAA TTGATTCAGC TTGTGCTTAC TGAGTGCGAG GCAGTCATGT 1320
GCTTCTGTTT GGTAAATGGC TTCATTTTCC CTCTAACTCC TGAGCGTCCT GAAGCTTCTC 1380
TTATGGTTCT CTCCAAAGGA GTCAGCAGGC TGGCTCTGCA AGGGTCAGTA GGTTCTGGGG 1440
TGGTGGGGGG CCGAGGGAGG CAGGGAGGTT GGCTCTGTCT TTATTTGGCA TAGAGCTCCC 1500
CGAACAGGGT CTCTCCTCCT TTCTCCAAAG GTTAATGGAA CCACTATCTT AAAAAGCTGA 1560
AATCTTATCT TCTGGGGTAT TTGGGTAGAG AAGGCTAGGG AATCCCTTTT CCATGGTGGT 1620
GCAGTAGGTT CTCAGAACCA GCTGGTGGGC CTCAAAGAGA GGCGGCTGTA TTTTAGCCTG 1680
ATAATCTTGA TTCCTGGTTT CCTGGCTCTG TAGCATCAGA AATGGGAAGC TTTAAAAGCC 1740
GTGCCTTGTT GGATGCACCG AGTCATAAAA TAAATGTGAT GTGCTGGGTG GGGGAAATGC 1800
GGGAGGAGGG AAACAGGTGG TTGGAGCTGC TTCGTGATGG CCGCCCACCC TGGCTCTCCT 1860
TTCTTAATAG GCTTCAGAAA TCCTGGAATG CGTAATTCAC CAGCTCACAG AGTTCCACCC 1920
ATGTCCCCAG TGGCTTCAAA ATGTAAATGA CATTTGCAGT GCTGGGAGGT AGGAGGGCGA 1980
TCCCGTTCCT TCCCTGGATC TCAGTCGCAG AGGTGCTGGC TCATGTGCCT GAGTGCAGCG 2040
GCTGGCCCGT CATTACTGGT CTTTGCAGGA AGCCACTCTG AAGGCACCTG GGCCCTTGCC 2100
AGGCTGAGTC ACAGCTGACT TAGGGAAATG CCACACAGGA CGCTTGCAGT CCCCCCGTTC 2160
TAAGCGTAGG TTTTGCAACT GCATACTCGG AAAATGAATC AGAGTGGGGG AAAGTGTCAG 2220
AGAAACAGCA GAAATGGAAT GTAGGCAGGA GGGCCACAGT GGCGCTGTGG ATTCAGACCA 2280
CACCTTCGGC TCTGTTTGGG GCCCTTCCTG TAAGGAGCGT ACTGATGCCA GAGGCTGGGG 2340
GTGTGGAAGG GAAGCTGCTG TGCTGTTAGA TCCATTCTGC TATTTAGCCA GCCTTCCTTT 2400
TCCCAGCTGG CACAGACAGG ATGTGTTAGA GAGGTGCTCA GACCTCCTTT CAGAGCAACT 2460
GAATCATTCT CCAGGAGGGA CAGGGAGTCT GAAATGCAAA CAGGTTCCCA GGGTTATTGA 2520
AGAGCAGCCA AACTGAACAC CCACTGCTCT GTGGACTCAA GCTGGTTTTA GACATTGTTT 2580
GGTCAGGACC AGAGCCGAGC TCTGGGGCCC ACTGGGGGCT CTTGTCGCAC CATATCATTG 2640
ATTCTACAAT GCACATTTCC CCCGCCTCTC ATGTTTTAAC ATGTCTGAAA TCAGGATGCA 2700
TCTTCCATGG ATGGTGTTTC AGGGTTTCAT TGATCGTGTT TTTCTTCCTG AGTGGCACAC 2760
AAAATTAATG GTGCTCCCTA GAGTTGATGG TCCCTGCGGT TCAGTGAACC GTGTTGCTCT 2820
TGTGTAAGCT CCTGTGGGAA CATAGAGTCT CTGTGTCCCA CCTTCTTCCT CGCAGTGGTC 2880
AGCACGGATG AGGTGGGAGT TGCATAAATG TCAGCATTCG AAAGTGAGGG CGTCTGTCGG 2940
TGCTGTCTCA CTGTGGGGCT TCAGAGAACG TGAGCACCTG TGTTTGCATT CTCCATCAAG 3000
GTTCATGTCC TGTTGGCTCA TAAGCATGAT TATATCCATT ATACAAACTG GGGCACAGGC 3060
ACCCAGAGAG AAGTCAAAAG ACTTGTTCAA GATGGACAAC TAGGAAGTGG TGGGGACAGA 3120
CCAGTCCTGT CTGATGCCAG ATCCAGCGCT GTATCTGCCA GTCAGCATGC ACACTTTCAT 3180
CTCTCCAGCC TCTTCCCACT CACCTTTACT CAACATTTCT GGGCCTCCAT AGTGATTGTA 3240
GTAATTCGGT AAAGATGATT CATTTCTTTA GTCCGGTCTT CGGACTTGAC TTCTTAGAAG 3300
CAGGTCTTGT GCAATAGTTG CATATTAACC ACTTGGTGAC ACAGTGCATG AGGGTATGCC 3360
AACTCTTTTT GCTCATGGCC GTGCAGTGCA GAATTTCCAG GCATTGTCCG CTCTGTTTCC 3420
TGGACTTCGG AGTGATAGCA AAGTTTTGTA TTCCCTGATC AGCTGTGTAT CTCTGAGCAG 3480
CAAGTTGATC TCTCTGTATA AGGGTGACTG TGCCCATGGA GGATGGCATG CAATTGCCTA 3540
AAGATTTCAG TCTGAGAATC TGAGAAACGA TACTGAATGG AGATGACAGG CTTAGTGCCT 3600
GCTTCCAGGA GCCATGCCTC CTCCTGGCCT GGAATGAATA CCTAAACACC TGAGGCTCTG 3660
AGTTCCGGCA GTGTGCTGAA ACTGCTGTTG GTCTGGCCCA CTGACCCGGA AACCCAGCCA 3720
CCTGAGGTTG TGACTTTAGG GCTTCTAGTT TTGTATTTAG CTTTAATTCC ATCTGTGAGG 3780
CAGTGGAGAC TGTTCATTTT ATTTTACATC AAAGGCTTTT GGAGGTTGAG ATGGGAACAG 3840
GATGATAGAA CAGTAATGCA TAATTATGGA GCATTTGCTG TATGGCAGGC ATTCGTAAGA 3900
GTGCATTTGT TGATATTATT GTTTGGCCTC TCCTGTCATT AGCCCTAAGC AGCTACACTT 3960
GCTAAGCTCT GTGCTAAGGC TGCAGTAAGC AGGCAGGCAG TGCGTGCTGG TGAGCTTGGG 4020
CAGTGCTGGA GTGTGTCTTG CCCAGTGTGG GGATGAACAT ACACCCTTTC ATGCTCACAG 4080
GTGCCTTAGC CTGGATGATA ATGTTTAAGT TCATTCTGTT TATATGCACC GTGTCATTAA 4140
ACAATGCTGT GAAAAGGGCA CTATTATTTC CCCCATATTT TCAGTGATAA GGCAGAGGCC 4200
CATGGGCTCC TTGTAGCAAT GGAGGCATTC CTTGAGGATC CAGGCAATCT GACTCCCGAG 4260
TCCCGGGGCT GGACAGAAGG AAGCTGGCTC CGAGAGCTAG ACTGCAGTGC AGAGGAATTC 4320
CACGCTCCGC AGGTGCTGTC TTCAGAAGTT GCATCTCGTC AGCAGGATGA GTGCTTTTGG 4380
AATAGACAAT CTTAAATGTC ATAGTGAGGT GACTTGCAGA GATAAGGAAG GACGCCAGCC 4440
TCAGGCACTG ACTGATGAAT CCAGATGGTG ACTTCCTCCT TGCAGGAGAA TCAGCCACTT 4500
ACACAGACTG GGAGGGATTC TACTGAGGGA AAAAATGAAT TCGCAGCCAG GGACAGTGGC 4560
TCATGCCTGT AATTCCAGCA CTTTAGGAGG CTGAGGAGGC AGGAGGATCA CTTGAGCCCA 4620
GGAGTTCGAG ACCAGCCTGG GCAACAGAGC AAGATCCTGT CTCTACAAAA ACAGAACAAA 4680
CCAACAATTA GCCAAGTGTG GTGGCACACA CCTGTAGTCC CACCTACTCG GGAGGCTGAG 4740
ACGGGAGCAT TGCTTAAGCC TAGGAGTTTG AGGCTGCAGT GAGCTATGAT TGTGCCACTG 4800
TACTCCAACC TGGGTGACAG AGCAAGAATG TTAAAAAAAA AAAATTCTCA TTTCTTCTCA 4860
TGGACTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GGTTGGTTGG TTGGTTTAAG 4920
CCATGGATTA AAGAAAGGAG AACTATTTCC TGTGACTAAA AGTGGTTTAC ATATTGGTGC 4980
TTTAGCAGGA ATTTTGGAGG GTGGCTTAAG TGAATAATTA AAACAGAAAT CTTCCTAGAC 5040
GATGTTTATC ACACTCAAGA CATTAAAAAT TAGAGTCAAG GGACTGCTAA GACTTGGGGT 5100
GCTGGTGGGT GAGGCTGCCT TTCAGGGAGG CCATGCTGTG AGTTGAGAAT CCTAGGCCAC 5160
CTTGCCTGCA CTGCCAGCTT TGCAGCTGTG GGCACATCTG GATCCCCATT TCTGTGCGGG 5220
TGCAGACAGG TGAATGTTAC CTGCGTGCAT CATAAAATGC TGTGAAAGGG GTCACAGGTA 5280
TTGCCCAGGC TTGGGCAGAC TCATTCATAG GGCTCACTGG CTTGCATGAG AAGGGATGCT 5340
GGGCACGGTA AACACAGAAG GAGAAGGCAG GCTCTGCTGC CAGGAGCTTG CACCCTGAGC 5400
CACGTGGAAC TGGTTTGCCT GTGAAGCAAT AGGCACAGTC CTGAAAGAGC ACAGTCCTGA 5460
AAGAGCACTT 5470