EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS102-02435 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HuCCT1 
Coordinate
chr1:218670630-218673960 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs72738842chr1218672807hg19
rs11118112chr1218673257hg19
rs12046780chr1218673593hg19
rs12039922chr1218673815hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXH1MA0479.1chr1:218673425-218673436TGTGGATTGGA-6.62
Foxd3MA0041.1chr1:218670944-218670956AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:218670948-218670960AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:218672251-218672272AAGTGCTTTCTCTTTCTTTCT+6.35
NFAT5MA0606.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:218672400-218672410AATGGAAAAT-6.02
NFICMA0161.2chr1:218670753-218670764TGTGCCAAGTA-6.32
STAT1MA0137.3chr1:218671728-218671739TTTCCTAGAAA-6.14
TCF7L2MA0523.1chr1:218672834-218672848TTCCTTTGAAGTTG-6.16
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218668940-218673595Astrocytes
SE_34115chr1:218670708-218673590HCC1954
SE_36549chr1:218669094-218673670HMEC
SE_37059chr1:218667317-218675140HSMMtube
SE_38564chr1:218669211-218673648HUVEC
SE_45788chr1:218669012-218673879Osteoblasts
SE_51738chr1:218669025-218673706Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218667886-218673684u87
SE_63527chr1:218668917-218674335HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218671355218673056
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218493chr1218667158218673741
Enhancer Sequence
CAAAATGATT CCTCACAAGA TTATAAATGA ATGAACTAAT AAACTTCCAC ATGTCTCTTA 60
AAATAGGATT TGCTATATTA GTATTTATTA TAATAATAAT AAAATTAACA TTTTTAAACC 120
TTTTGTGCCA AGTACTGAGC TGAGGGCTTT ATGTGAACTA CCTCATTTCT GTCTCCCAGT 180
CACGCTAGGA TGTAAGGTAA CATCATTATC CTCTGCATTT GAAAACTTGA GGTTTACACC 240
TGTTCCCAAA AATCTATTGA AATAAAATAA AAATTAAAAA AATTTTAAAA AGATATTCAG 300
CCTAGTTGAA AAGCAAACAA ACAAACAAAC CCTTGAGGTT TAGAAAATTT CATAACTCTC 360
CCAGAGTCAC ACCTTAATAA GAGATGTAGC TGGGATTCTG ACCCCATAGC CTGTACCTCC 420
CTCTTCTCAA CAGTATTTCT ATATTTTGGG ATACCATGAC TCTTATGCAA AGCAACTCAT 480
CTGTACAAAT AGCTTGGGCC AAAGCAATCA ATCATGTAAC AAAGGTGTAA ATAGAAATAA 540
AAATATTAAC CCTTGGCTTG GATCCAAATG TCATTCATTT TAGCCAATGT TTTCCTTTCC 600
ATCATTAAGA ATTCTGCTTT TTTTTTTTTT AAGTTTGGGA AAATCTGATA TCAAATAAAT 660
TCATTGCATT CTTTCTGCAT AACCATGTGG TAAATGCTAG TCCCGGGCAT GGAAAGACAG 720
GCACAGTAAG CAAAGACAGA ATGAGGAAAA ACTGTGAATC TAGATTTTTT CCTCTGTGTA 780
AGAAAGTATA GTTCCCTTGG TAGAGAATGC AGAGACTAAA GCCTTTGACT ATTGGACAAG 840
AAACTGTTGA CATTGCTGTA GTGAATCATC CGTCATACAC AGCTCTTAAT GGGGATGGGA 900
CAAATTACAG CATTTCATGA TGCTGCCCAA AGATAATTCA GTCTAGCACC TGGATTGTTT 960
GGAAATCCAC TGGATCCCTC CTTGACTCTC ACATGCTCAT CCTGCATATA CACTCCTTGT 1020
ATAGCAACAA GCATGAGATT GAGCGATAGA GTTGGACAAA TGACCAATAT TTATTCAGTT 1080
AATAAAATAC AGAGTTGTTT TCCTAGAAAC ACCAGCAAGG CAAAGGGAAA CAGAGAGAGG 1140
AATCCTGCTC CTACCAGAGA GATGAATGGG TGTGAGAAAA TGTGAGGGAG ACTCATTGCA 1200
TAAACATAAC TGAGGCTAAA GATCGCTGCA GCCCCAGCCA GGCTAAAACA TGGAGAAGAT 1260
GACCATGCGA GGCTGGGCAA GTGGGGTGCT ATCTACCGAG GAGTGGGTAG GACAAGGGGT 1320
CCAGGCCCCA TGCTTATCTA TTAGGTGAAG TTTTGATCTC AAGGCTGGGA AAGACATGGC 1380
CAGAAATAAA TGTTTAGGAC ATAACATTCT TTCCATGTTA GGACACCACA TTCTTGCTAT 1440
TTGGTGACAA ATGACTGAAC CGGGAGCTTG GTCCCATTTA TGATCTAATT CTATAAAAAT 1500
GAAATCCCGG GCATCTGGTT CAGAGCATTC CAGGAAAGAG TTAAAGCCCA ATATTGCTGC 1560
CTCACTCTGT TCTTCCTTTT TGGTGAATGA TAGGCTAGGA CGTGAACTTG CTGCCTTCTG 1620
GAAGTGCTTT CTCTTTCTTT CTGTGGATTT TATTTTCTGC CTTCTATGGG AGAGAACAGC 1680
TCTCTTGCCT TTCCACTTCC CCTGGGCTTG AAAACACTCA TAGTAGAACA TATACCTTCT 1740
ATCTGAAGAC AACATATAGA AGGTAAAAGA AATGGAAAAT CATCTGCATA AAGAAGAAAA 1800
ACAGAGAGTG AGTGAGCATA TGGGCGTGTC TGAGTGTGCG TGTTCAGTGT AGGAAGTGTC 1860
TGAAGAGAAG TCCAGCTACA AGAACTTGCT GCAATAATTC TCTAACAGCA TGAACAAAGA 1920
CTCCAATAAT AAATGGTGAC ATTTACACAA ATATTTGTGG TTGTGCTTTC CATTTCTTCT 1980
TATAGGAAAC AAGTAAGATT TTTAAATGCT TTAGTGATGT GATCAGTAGA CAGTAGTGGG 2040
AAAGAATTTC CCTGAAACCT GACTTGCAAT CAAAATAAGG AAGGAAGATC TGAGAGAATT 2100
GAGAATATTT CAGCTAATCA GGATATGGCA CTTTCCGGCA TCTGGGTGTC CAAACAAGTG 2160
TTTTGAATTC AATACTGTTA ACATGTGTCA CTTTAATGAA TATTTTCCTT TGAAGTTGAT 2220
TGGATGGTTA CATTTTTGGC AATAATCTTG TGGTCTGTTG CTTACATTAC CTGACCCACA 2280
GTCCATTTTC CTTGTGTTGG CTGTGGGAAA GAAAAAGAGT GAAAAATATC TCAGAACCTG 2340
GGAAACAGCA CTGAGAATGC GACTCATCTT TTAGTTAAAC CACTTCAGAT AGAAGCTCTC 2400
TAAGGATTGC CTCCTCACTG TCTGTGATAT GTGTAACCAA AAAAAAGAAA TAAGTTCCCC 2460
CGGTGTCAAA AAGATAAGGG GAAAAATCCA CAAAATGAGA TGAGGCTATT TTTCTTTTTT 2520
AAGCCTGAAA TAGGAGGTCA GTCCTTTGCA CTCTTCCTTT TGACTTCTAA CAAAACCAAT 2580
CACAGTCAAG CTATTCTCTT GAGTTAAAAA GTGTTTTCAG GAAGTCCATA ACATGTTCTA 2640
ATTGATTATT TAAAAATCCC CACACAGGAA CATCCCCTCA TGGTCTGAAT GTCTTTTTAG 2700
CCCTCTGCTA TTTGCAGAAC CTTAAACAAA TTGTAAGAGA GAGTCCTTGG CTAACTCCAA 2760
GGACCTTTAT GAGGAGTGGG AGAGAAAGGG GAGGATGTGG ATTGGATGCA GCAAAGTGCT 2820
CTCTCAAATC AGCATGAGGC CGGGCATGGT GGCTCACGCC TGTAATTCCA GCACTTTGGG 2880
AGGCCGAGGG GGGCGGATCA CCTGAGGTAA GGAGTTCCAG ACCTGCCTGG TCAACGTGGT 2940
GAAACCCCGT CTCTACTAAA AAAACAAAAA TTAGCTAGGA GTGGTGGTGG GCGCCTGTAA 3000
TCCCAGCTAC TCAGAAGGCT GAGGCCGGAG AATCCCTTGA ACCAGGGAAG TGGAAGTTAC 3060
AGTGAGCTGA GATCACGCCA TTGCACTCCA GCCTGGGCAA CAGAGCGAGA CTCTGTCTCA 3120
AAAAATAAAT AAAATAAAAT AAAATAAAAT AAAAAATTAG CATGCATTGG GAGAGTTTCT 3180
ATGGGTGGGC AGCCCTAGTG ATGTGTGTGT ATATGTGTAT GTGTTTGTGT GTGTGTGAAT 3240
ATGTTATGCA TGTGGGTATA TGTGTGAATA TGCGTATGTG AGTATATACA TATATGCATA 3300
TATACGTGAA TGTGTGTGTG TTTATGTGTA 3330