EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS101-45681 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
HT29 
Coordinate
chr9:95958070-95961830 
Target genes
Number: 11             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr9:95961662-95961681TTCCTCCACCTGCTGGCGG-6.11
HNF4GMA0484.1chr9:95958618-95958633TGACCTTTGATCCTA-6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr9:95960023-95960038TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6MA0677.1chr9:95958618-95958632TGACCTTTGATCCT-6.49
RxraMA0512.2chr9:95958618-95958632TGACCTTTGATCCT-6.25
SCRT1MA0743.1chr9:95960664-95960679ACCCACCTGTTGCCC-6.79
TFAP2AMA0003.3chr9:95960515-95960526TGCCTGAGGCA-6.02
ZIC3MA0697.1chr9:95959553-95959568CACCCCCTGCCGTGC+6.17
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23115chr9:95958087-95958925Colon_Crypt_1
SE_23115chr9:95958961-95959866Colon_Crypt_1
SE_23115chr9:95959983-95961852Colon_Crypt_1
SE_23780chr9:95958418-95958917Colon_Crypt_2
SE_23780chr9:95958968-95959378Colon_Crypt_2
SE_23780chr9:95960053-95960646Colon_Crypt_2
SE_23780chr9:95960702-95961824Colon_Crypt_2
SE_24791chr9:95958486-95959689Colon_Crypt_3
SE_24791chr9:95960019-95961917Colon_Crypt_3
SE_35698chr9:95957881-95959271HepG2
SE_40853chr9:95958008-95962046Left_Ventricle
SE_41692chr9:95960928-95961957LNCaP
SE_47502chr9:95960087-95960979Pancreas
SE_47502chr9:95961005-95961765Pancreas
SE_48701chr9:95958168-95959937Right_Atrium
SE_48701chr9:95960105-95961934Right_Atrium
SE_49661chr9:95960986-95961867Right_Ventricle
SE_50355chr9:95958133-95959786Sigmoid_Colon
SE_50355chr9:95959980-95961886Sigmoid_Colon
SE_65547chr9:95958982-95959724Pancreatic_islets
SE_65547chr9:95959991-95962753Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr99595821895958862
chr99596039095960541
chr99595976395959856
chr99596038595960909
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH09I093195chr99595814295959179
GH09I093198chr99595940295959752
GH09I093197chr99595998195961957
Enhancer Sequence
AATAGGACCT TCTAGGTCTT GTTTGCACAT GTATAGCATT TAAAAATACA GCTGCAGTTC 60
AGGGTGTCAC GACTTCTAGA ATCTGTCTCT GGAGTGTCTT TAAAGCTATT GTTTTGCAAG 120
AGGCCATGGT TCTGAGGTTT GTTCCTGGTC TTGGTGCTAT TTTGAACCCT TTGCTGAGGG 180
TGGCTGCAGA AGAGGTGCTA TCATTAGATG TGTTTGGGGA GTGGTGGGTC AGACAGGCAT 240
TGCTGTTGAG GAACTTCTCA GAGCCTTTAC GATGCCCACT GTGTTGTGAA GCTCTTGAAG 300
GGTGCGAGGG GGAAGGTGTT GGGCCACCTC CTTTTTTTCT TTCATTTTAC AGTTATCTTA 360
TAAGCCAGGA CTGGCTCTGG GGAGGGGCGT TAACAGGCTG ACTGTTAGTG GAGGGTCACG 420
GGCTCCCTCT GGTATTCACT CTCCCCAATC CGCCCCTCAC CCCTGCTTTC TGGGCACTGT 480
GCGTGCTTGC TCTCCGGTGG GGGAGATGGG ACAATTCTCA GCTGTGAGCC GACTGTGGGA 540
AGCAATGCTG ACCTTTGATC CTACTCAGAA TCTGGAATCT GGAGATGGCC ATGTGACAGC 600
CCTGGAGGTG GCTCAGCAAC ATCAGCTGGG ACATGGGGTT TTCTCTCTGT TTCTTCTGTC 660
CTCATCCATG TTGGCATTTT GTCCCTAGTC TTGCTTGGCC TCATGGCTAC AGTAGGGCTG 720
CCACAGCTCC AGGCATCACA ACCACATTTG ATGGTGGGAA ACAAATGGGT GGTTAGGTGG 780
GGGCCAAGCA GCCAGAAGGT CCATTTTTCA AGTGGCTTTG TTCATATTTT AATCCATAAA 840
GAGAAATATT TACCAGGGAT TCTCTGGTCT CCTTGGTTAG CATGTGTTTG TGTGGCCAAC 900
TGTAACTGTG CTTGTATCTG GGAAAAGCTT GATTGGTGTA GCAGGTTATG ATCTGTTCTC 960
TGGGGCTGGG CATAGTGAGT TTCTGGGTTT CTGTTGGTCA GGAGGGGTGG CGGGCTGTGG 1020
GTGGAGCGTG CCTGCTGTGT CTGTCTTGGT TACCTTGTCC CTCCAAGACT GTCAGTGTCT 1080
GTGTGTGCTA GAGCCCTCCT CTGCCTGGGC CTGCAGAGAA CAGCACAGCA CACATGCCCG 1140
CTGCATCTGC AGGCTCCTCC CTGTCCACAG CTCCCACACC CAGGCATCTG TGGGCCCTGA 1200
TGATTTTCCT TCCCTCCTGT GTGGCCACCC CAGCTCCCTA CCCTCTGTGC CAACCCTGGC 1260
AAAGCTTTTT CCTCTCTGCC AACAATCCAG TTTTCATTTA GCCCCAACAT TTTATTTTGG 1320
AAAACTTTGG AAAAACCAAC AGAGAAGTTG GAGTTACCAG TTGTTAGTGT TTACCACTCT 1380
CCTGTATATC TGTGTCTGTG ATTTCCTGAC CCATTTGCAG TTCACCCCTG AGTACTTCAG 1440
CCTGTGTCTC TTGATAGGAA CGAGGATGCT CCCACATCAC CTCCACCCCC TGCCGTGCTC 1500
CAGGCACTCC AGGATAGGAC CTGAGGCACT CAGTGAGGTC TCAGATGGGT GGACTGCACT 1560
TCCTAGGGAA GGGATCCAGG AGCCAGTCAA GGATCACGTG TTGTGTCTGG TTGTCATGTC 1620
AATTTCAATC CAGAACAGTC CCTCTGCCTT TTATTATTAC TGTTCTTAAA TCTGTCAGCA 1680
TTGTCTTCTG AAGGTTTAGG GCCAGTGGTC TTGCATGGAG ACTCCATCTG GATCTGTGTG 1740
GTGTTTCTTT TTTTTCTTGA GGGAGTCTTG CTCTGTCTCC TAGACTGGAG TGCAGTGGTG 1800
TGATCTTGGC TCACTGGAAC CCTCTTGGGT TCAAGCGATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCGA 1860
GTAGCTGGGA TTTATAGGTG TACACCACCA TGCCCAGCTA AGTTTTGTAT TTGTAGTAGA 1920
GACGGGGTTT CACCATCTTG CCCAAGTTGG TCTTGAACTC CTGACCTCAG GTGATCTGCC 1980
TGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTAGGATTAT AGGCATGAGC CACTGCCCGG CCCTGTGTGG 2040
TGTTTCTGTA CGACCGTGTG AGGTCGTGCA TTCCTGGCTC GGGTGCTGCA TGTGTAGGTC 2100
AGATCCGGCT AGGCTGGTCC CTGTGGGGGC CCTAGAGGAA GTCAGAGTGC TGTTATTAAG 2160
AAATGACCAT GCTCACGTCA GTGGGGCACC ACTGTATACT CTAGAGGCAT ATTGGCTTCC 2220
TGAGAGGGAG GTGCTGTGAT TCCCCCCTCA GTAAAGTTTC CCAGTTTACT AAGGAGGAAA 2280
CTGAGGTACA GGAAAATACA AGATGTTGTC CTGTACACCC AGGCAGCCAG GGGCTGAGTG 2340
GGGACCTGCA TAGCCTAAGG GGTTGTGGTG CAGCTTGAGG AGGGTGGACT GCAGGCTCCG 2400
GTGGTTCTGG GCCTCAGGAT CGCCCAGCTC CCTCCTCCCT TTGGGTGCCT GAGGCACCTG 2460
AGCTGGAACT GCCCCGCCTC TGAGTTAGGT TGAGTGGTTG ATGCTAACAG GACTTGCTGT 2520
CAGCCTTGAG GGAGCTGAGC GGCTGCAGTT TCCCCAGGCA GGCGGGGCTT GCTGGCAGGA 2580
GGAGGCTGAT GGGGACCCAC CTGTTGCCCA TCCAGCTGCT TTGGGTGGGG CCCCTCCTCA 2640
GGCCTCACAG GGAGCCCTGC TTACCCCGGT AGGGCGTAGG GGCAGGGCTA TGTTGTTCCT 2700
CCTACCTGCC AGCCCTGGAC CAGCCTTGTT GAGTTGGGGG AGTGTGCCCG GGCATTGGGT 2760
TTCATGGGGA TGGCCACTGT GGAGGGGATG CTTCCTGGGG AAGATGACAT GATGGACATG 2820
GAAGCCTGAC AGAGGAGGAG CTGTCCACAG CCTCCATCCT CTGATGTGGC AGTTTTCACT 2880
TTGGTATATG CCCTTCTTAG CTTGTTTTTT ATACTCTTGG GCATTTTTGC TAAGTCATGA 2940
TCATAGCGTC TGCGCTGATA TGTGCAGTGA CAGTGAATAG CCCAGACTGC CTCTGGGCCC 3000
CCACTCCCTG CCCAGCTCTG GCCCTGCTGC CCCCTTTTCC AGCCCTGCCC TCTTGCCCCA 3060
TTGTCCTTCT ACCCCTGGCC TTGCTGCCCA AGACCTGCAG TTGAGCTGGG CAGCTTTGGT 3120
GCAGTCTCGA GCTCGGGGCC TCCTCGGGTG TGAGTCAGGC CTGGGTCAGA CCCACTTGTC 3180
ATCCTCTCGC TGGCTCGGTT CGGGGTGGGT GGAGGCCTGC TCAGTCCCAG CCTGGCCCCC 3240
TCCAGCTGGA CCCAGGTTCC CACACACCCT GCATGCCTCC ATGCTGTCCC CTGTGACTGG 3300
AGGTCCTTGT GTGGGCCTGA GACGTGTGAG CAAGTCCCCT TGCCCTCTGT GGGGTGCGGC 3360
TTCTCAGCCT GGCTGTGCTG GGGTCACACA GGCCTCCCAG AAGGAAGATG ACCGATGCCT 3420
GGGGTCTCAG TGGGCCACCT CTCTCCCATT CTGGTGGCAC CAGGACTGAG CCGAGATGCT 3480
TGCCCCTGAT TTTCTTGTTT TCAGGCTTCC CCCAATGTCA AGGATAGTCC TGGGCTCTGG 3540
ACCTGGTGAC CTCCTACCTT AGCCCTGCCC AGGTTGGTGA CTCTAGGCTA CCTTCCTCCA 3600
CCTGCTGGCG GCTGGGCTTG GCGTCAGGTG GTGGGAGATG CCCTAGGCCT CCTATCTGGC 3660
CCTGTCCTGT GTCTTCAAGT TAGGCAACCA TCTTCCTGGG TCAGCCAGCT GCAAGGCTGT 3720
TGACATCTGC CCGGACAGGT CTCTTGGAAT TTCTTGTCTT 3760